李海存 單連慧 鐘華 黃家學(xué) 安新穎
干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)技術(shù)是生命科學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)重要前沿分支,隨著近年研究的深入發(fā)展,采用該技術(shù)策略治療多種疾病已成為21世紀(jì)生物醫(yī)藥領(lǐng)域尤為重要的研究方向。在國家“十二五”科學(xué)與技術(shù)發(fā)展規(guī)劃中,干細(xì)胞研究從發(fā)育與生殖醫(yī)學(xué)中單列出來,躋身六大國家重大科學(xué)研究計(jì)劃之一。重點(diǎn)支持細(xì)胞重編程及其調(diào)控機(jī)制研究,干細(xì)胞自我更新及多能性維持的機(jī)理及新物種多能干細(xì)胞的建系,干細(xì)胞的定向誘導(dǎo)分化及其調(diào)控機(jī)制研究,干細(xì)胞發(fā)育與微環(huán)境的相互作用,標(biāo)志物的發(fā)掘、識別與示蹤,干細(xì)胞臨床應(yīng)用基礎(chǔ)研究,植物細(xì)胞全能性與器官發(fā)生等方面的研究[1]。這也為國內(nèi)誘導(dǎo)性多潛能干細(xì)胞的研究發(fā)展提供了重大的機(jī)遇。
2007年,美國和日本科學(xué)家分別宣布獨(dú)立發(fā)現(xiàn)將普通皮膚細(xì)胞轉(zhuǎn)化為干細(xì)胞的方法,這樣得到的干細(xì)胞稱為誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞(induced?pluripotent?stem?cell,iPS)。iPS 細(xì)胞具有和胚胎干細(xì)胞類似的功能,卻繞開了胚胎干細(xì)胞研究一直面臨的倫理和法律等諸多障礙,因此在醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用前景非常廣闊[2]。2009年,Zhao等[3]在《Nature》發(fā)表文章,首次利用iPS細(xì)胞通過四倍體囊胚注射得到存活并具有繁殖能力的小鼠,從而在世界上第一次證明了iPS細(xì)胞的全能性[4];Kang等[5]也獨(dú)立成功培育出實(shí)驗(yàn)鼠。這兩項(xiàng)成果對干細(xì)胞全能性的機(jī)理研究以及器官移植、藥物篩選、基因治療等臨床應(yīng)用研究有重要價(jià)值。
筆者從科研投入及產(chǎn)出、臨床試驗(yàn)等多個(gè)角度對iPS細(xì)胞的研究現(xiàn)狀進(jìn)行了調(diào)研分析,系統(tǒng)把握iPS細(xì)胞研究的現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢,為國家免疫學(xué)領(lǐng)域科研政策制定及學(xué)科重點(diǎn)發(fā)展方向提供參考依據(jù)。
采用的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)來源于湯森路透集團(tuán)的科學(xué)引文索引擴(kuò)展版(SCIE)數(shù)據(jù)庫和德溫特創(chuàng)新索引(DII)數(shù)據(jù)庫;項(xiàng)目數(shù)據(jù)來源于美國國立衛(wèi)生研究院的RePORTER項(xiàng)目數(shù)據(jù)庫;臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)來自于Clinicaltrials數(shù)據(jù)庫。
iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域檢索詞的制定參考Pubmed數(shù)據(jù)庫醫(yī)學(xué)主題詞表中主題詞、下位主題詞和其入口詞,利用這些詞組成的關(guān)鍵詞在SCIE等以上數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)標(biāo)題中進(jìn)行檢索。
采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法和統(tǒng)計(jì)分析等信息分析方法,利用湯森路透集團(tuán)的Thomson?Data?Analysis(TDA) 和 Microsoft?Excel軟件,對上述來源的數(shù)據(jù)從時(shí)間分布、國家地區(qū)分布、機(jī)構(gòu)分布等方面進(jìn)行了分析,以揭示目前國際iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域的整體發(fā)展情況。
(一)科研投入分析
利用美國國立衛(wèi)生研究院(national?institutes?of?health,?NIH)RePORTER 項(xiàng)目數(shù)據(jù)庫[6],檢索iPS細(xì)胞相關(guān)項(xiàng)目,得到iPS細(xì)胞相關(guān)項(xiàng)目219個(gè)(表1)。從表中可以看出從2008年起,NIH資助的iPS細(xì)胞研究數(shù)量由4項(xiàng)增長到2010年的83項(xiàng),資助金額由172萬美元整漲到2010年的4295萬美元,但隨后2011年項(xiàng)目數(shù)量略微下降,為79項(xiàng),但項(xiàng)目資助金額下降更為明顯,為3053萬美元,這可能是數(shù)據(jù)庫更新不及時(shí)的原因。其中獲NIH資助項(xiàng)目數(shù)在5項(xiàng)以上的機(jī)構(gòu)情況見表2,哈佛大學(xué)、斯坦福大學(xué)、威斯康辛大學(xué)麥迪遜分校、約翰霍普金斯大學(xué)等機(jī)構(gòu)獲得項(xiàng)目數(shù)量都在10項(xiàng)以上,雖然戴維?格拉斯通研究所和國立心、肺、血液病研究所這兩個(gè)機(jī)構(gòu)獲得資助項(xiàng)目數(shù)量少(僅為5項(xiàng)),但資助金額卻大大高于項(xiàng)目數(shù)量第三的威斯康辛大學(xué)麥迪遜分校(項(xiàng)目數(shù)量為14項(xiàng)),可以看出這兩個(gè)機(jī)構(gòu)在iPS研究上實(shí)力不俗。
表1 ?2008至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域獲得NIH資助項(xiàng)目數(shù)及資助額度分布
表2 ?iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域獲得NIH資助的機(jī)構(gòu)情況
通過篩選中國國家自然科學(xué)基金(national?natural?science?foundation?of?china,?NSFC)項(xiàng)目數(shù)據(jù)庫,2008至2011年,共批準(zhǔn)資助68項(xiàng)iPS細(xì)胞領(lǐng)域研究項(xiàng)目,總金額為2986.5萬元(見注:檢索時(shí)間為2012年2月15日,表3)。從表中可以看出,iPS?研究領(lǐng)域獲得NSFC資助是從2008年開始,從2項(xiàng)迅速增長到2011年的27項(xiàng)。雖然項(xiàng)目數(shù)量增長較為迅速,但是資助額度卻有所下滑。2009年獲得資助項(xiàng)目雖然為17項(xiàng),但100萬以上的5個(gè)項(xiàng)目中有4項(xiàng)為2009年批準(zhǔn)資助,分別為中國科學(xué)院動(dòng)物研究所周琪負(fù)責(zé)的“核移植及iPS誘導(dǎo)體細(xì)胞重編程機(jī)制的研究”(200萬元)、第二軍醫(yī)大學(xué)錢其軍負(fù)責(zé)的“肝癌特異性誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的建立及肝癌發(fā)病新機(jī)制的研究”(200萬元)、北京大學(xué)鄧宏魁負(fù)責(zé)的“建立誘導(dǎo)的多潛能干細(xì)胞(iPS)的分子機(jī)理研究”(200萬元)和同濟(jì)大學(xué)康九紅負(fù)責(zé)的“誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS)形成中組蛋白修飾的功能及機(jī)制”(180萬元)項(xiàng)目。
表3 ?2008至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域獲得NSFC資助項(xiàng)目數(shù)及資助額度分布
1.科研產(chǎn)出:通過檢索SCIE和DII數(shù)據(jù)庫,分別從論文和專利兩方面分析iPS細(xì)胞相關(guān)研究產(chǎn)出現(xiàn)狀。檢索SCIE數(shù)據(jù)庫,檢索文獻(xiàn)類型為研究論文(Article)和綜述(Review),檢索結(jié)果為722篇;檢索DII專利數(shù)據(jù)庫,檢索結(jié)果為159件(檢索時(shí)間是2012年2月15日)。
(二)時(shí)間分析
2006年,日本京都大學(xué)Yamanaka等[7]在《Cell》發(fā)表文章,宣布通過逆轉(zhuǎn)錄病毒將Oct4、Sox2、c-Myc、Klf4四個(gè)轉(zhuǎn)錄因子基因?qū)氲叫∈笈咛コ衫w維細(xì)胞中,獲得了與胚胎干細(xì)胞相似的細(xì)胞系,被稱為iPS細(xì)胞。此后iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域論文量呈爆發(fā)式增長,從2006年的1篇增加到2011年的331篇(圖1)。由于專利申請到公開有18個(gè)月的時(shí)滯,因此2010年特別是2011年的數(shù)據(jù)不完整。雖然iPS細(xì)胞相關(guān)專利增長的數(shù)量和速度稍慢于論文,也是呈爆發(fā)式增長(圖2)。因此可以預(yù)見今后幾年內(nèi),iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域的科研產(chǎn)出將繼續(xù)保持高增長勢頭。
圖1 ?2006至2011年iPS細(xì)胞論文總體情況
圖2 ?2007至2011年基本專利年iPS細(xì)胞專利技術(shù)分布
(三)國家分析
對研究論文第一作者所在的國家進(jìn)行分析,有二十多個(gè)國家開展了iPS細(xì)胞相關(guān)的研究,其中排名前10位的國家發(fā)表的論文占總論文數(shù)的91.14﹪(表4)。美國在該領(lǐng)域發(fā)表的論文數(shù)量排在第1位,共發(fā)表論文301篇,占該領(lǐng)域論文總量的41.69﹪,篇均被引頻次為47.85,由此可見美國在領(lǐng)域內(nèi)的強(qiáng)大實(shí)力。日本的發(fā)文量排第2位,發(fā)表論文數(shù)量為137篇,占該領(lǐng)域論文總量的18.98﹪,篇均被引頻次排名第一,高達(dá)77.73,這與日本開創(chuàng)性地開辟iPS研究領(lǐng)域密不可分的。中國的發(fā)文量排在第3位,發(fā)表論文數(shù)量為78篇,占該領(lǐng)域論文總量的10.80﹪,但總被引頻次為1172,導(dǎo)致篇均被引頻次偏低,為15.03,中國在iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域相關(guān)研究論文的質(zhì)量有待提高。與論文國家排名情況類似,159件專利除5件為PCT專利外,優(yōu)先權(quán)國分布情況見表5:美國專利份額與論文接近,日本和中國專利份額相應(yīng)提高,分別提高了7.44和2.41個(gè)百分點(diǎn)。
表4 2006至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域論文產(chǎn)出前10國家
表5 2006至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域?qū)@麅?yōu)先權(quán)國分布
(四)機(jī)構(gòu)分析
對iPS細(xì)胞研究論文第一作者所在的機(jī)構(gòu)(文獻(xiàn)量10篇及以上)進(jìn)行分析(表6)。從論文數(shù)量來看,論文量排名靠前的13個(gè)機(jī)構(gòu)中,排在前五位的依次是:哈佛大學(xué)、京都大學(xué)、中國科學(xué)院、斯坦福大學(xué)、約翰霍普金斯大學(xué)。其中,美國機(jī)構(gòu)7家,日本機(jī)構(gòu)2家、中國、德國、西班牙和伊朗各1家。中國科學(xué)院發(fā)表論文21篇,其中廣州生物醫(yī)藥與健康研究院11篇,上海生命科學(xué)研究院6篇,動(dòng)物研究所4篇,篇均被引頻次為28.10;美國和日本的機(jī)構(gòu)不僅論文量高,篇均被引頻次數(shù)更高,其中哈佛大學(xué)的篇均被引頻次為111.03,京都大學(xué)高達(dá)259.58。iPS細(xì)胞專利量3件及以上機(jī)構(gòu)有14個(gè),如表7所示。其中美國和日本機(jī)構(gòu)均為6個(gè),中國機(jī)構(gòu)有2個(gè),分別是中國科學(xué)院和軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院。這14個(gè)機(jī)構(gòu)中,3個(gè)為公司:日本尼康公司、美國的國際細(xì)胞動(dòng)力學(xué)公司和iPierian公司。中國科學(xué)院的9件專利中,廣州生物醫(yī)藥與健康研究院5件,上海生命科學(xué)研究院3件,中國科學(xué)院動(dòng)物研究所1件。可見美國和日本在iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域已經(jīng)形成了占據(jù)主導(dǎo)地位的核心機(jī)構(gòu),對知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化也非常積極。
表6 ?2006至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域論文產(chǎn)出機(jī)構(gòu)情況
在Clinicaltrials[8]的主題分類中,暫無iPS細(xì)胞的直接分類,故利用iPS相關(guān)關(guān)鍵詞檢索,經(jīng)過篩選核對得到13項(xiàng)臨床試驗(yàn)(截止2012年2月15日),全部未標(biāo)明臨床試驗(yàn)階段(表8)。從表中可以看到,iPS相關(guān)臨床試驗(yàn)注冊最多的是2009年,有5項(xiàng)臨床試驗(yàn)。發(fā)起方最多的是美國,共有8項(xiàng),其他為以色列(4項(xiàng))和伊朗(1項(xiàng))。這些臨床試驗(yàn)涉及酒精使用關(guān)聯(lián)疾病、肌萎縮側(cè)索硬化癥、鐮狀細(xì)胞貧血神經(jīng)退變性疾病、嗜血細(xì)胞性淋巴組織細(xì)胞增生癥、創(chuàng)傷性脊髓損傷、孤獨(dú)癥、視網(wǎng)膜疾病、冠狀動(dòng)脈疾病等疾病。國際細(xì)胞動(dòng)力學(xué)公司已經(jīng)使用來自于人源iPS細(xì)胞的iCellTM心肌細(xì)胞,驗(yàn)證體外心臟毒性檢測試劑盒的有效性,結(jié)果與動(dòng)物模型心臟毒性研究數(shù)據(jù)相關(guān)性非常好[9]。斯克利普斯轉(zhuǎn)化科學(xué)研究所即將開展的“應(yīng)用誘導(dǎo)性多潛能干細(xì)胞評價(jià)心血管疾病顯形”臨床試驗(yàn)項(xiàng)目將iPS細(xì)胞更進(jìn)一步應(yīng)用到臨床上來。
表7 ?2006至2011年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域?qū)@麢C(jī)構(gòu)分布情況
iPS細(xì)胞不僅可用于定向分化和干細(xì)胞移植,還可以提供體外的疾病模型,以便于研究疾病的形成機(jī)制、新的治療方法和篩選新藥,但應(yīng)用iPS細(xì)胞來治療疾病是終極目標(biāo)。應(yīng)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法和網(wǎng)絡(luò)調(diào)研等信息分析方法,對iPS細(xì)胞領(lǐng)域研究現(xiàn)狀進(jìn)行了分析。研究結(jié)果表明:(1)?2008年至2011年,美國NIH中國NSFC對iPS細(xì)胞領(lǐng)域研究資助力度持續(xù)加大,但中國資助的項(xiàng)目數(shù)量和額度上與美國還有一定的差距;(2)美國和日本在iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域已經(jīng)形成了占據(jù)主導(dǎo)地位的核心機(jī)構(gòu),相比之下,中國雖然在iPS細(xì)胞領(lǐng)域論文和專利總量均位居第三,但還沒有形成諸如哈佛大學(xué)和京都大學(xué)等具有國際競爭力的核心科研機(jī)構(gòu);(3)美國和日本在對iPS細(xì)胞領(lǐng)域的知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上非常積極,中國需要引導(dǎo)產(chǎn)業(yè)界積極參與,加快iPS細(xì)胞領(lǐng)域產(chǎn)品產(chǎn)業(yè)化。
表8 ?2007至2012年iPS細(xì)胞研究領(lǐng)域開展臨床試驗(yàn)情況
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