劉小林,李曉婷,龔國勇,黃 磊,黃卓烈,伍志權(quán),黎春怡
(1.宜春學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,江西 宜春 336000;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣東 廣州 510642;3.江西宜春中學(xué),江西 宜春 336000)
有機(jī)溶劑對多聚半乳糖醛酸酶催化動(dòng)力學(xué)的影響
劉小林1,2,李曉婷1,龔國勇1,黃 磊3,黃卓烈2,伍志權(quán)2,黎春怡2
(1.宜春學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,江西 宜春 336000;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣東 廣州 510642;3.江西宜春中學(xué),江西 宜春 336000)
以水溶性低分子質(zhì)量殼寡糖作為修飾劑對已純化的多聚半乳糖醛酸酶進(jìn)行化學(xué)修飾,得到化學(xué)修飾酶。再以有機(jī)溶劑甲醇、乙醇、丙酮、四氫呋喃為效應(yīng)物,果膠為反應(yīng)底物,研究其在緩沖液和不同有機(jī)溶劑中多聚半乳糖醛酸酶(PG)及其化學(xué)修飾酶(COS-PG)的動(dòng)力學(xué)性質(zhì)。結(jié)果表明:修飾后,在緩沖液中COS-PG的Km值有所下降,Vmax上升。在2%的甲醇、乙醇處理后,PG和COS-PG的Km和Vmax均下降。在2%四氫呋喃處理后,PG和COS-PG的Km和Vmax均上升。在2%丙酮處理后,PG和COS-PG的Km上升,而Vmax下降。
多聚半乳糖醛酸酶;有機(jī)溶劑;動(dòng)力學(xué)
多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,EC3.2.1.15,PG)是降解植物果膠骨架結(jié)構(gòu)的主要酶之一[1],能隨機(jī)地從多聚半乳糖醛酸內(nèi)部打開α-1,4-糖苷鍵,產(chǎn)生聚合度為10~14的寡聚半乳糖醛酸[2],與植物果實(shí)的軟化,脫落和種子成熟,植物組織的抗病性有關(guān)[3-6]。此外,PG在食品工業(yè)、農(nóng)業(yè)、化妝品業(yè)、造紙業(yè)等領(lǐng)域也有廣泛的應(yīng)用,是當(dāng)今國際研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。
酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)是研究酶促反應(yīng)速度的規(guī)律及某些因素對酶促反應(yīng)速度影響的科學(xué)。這對于了解酶的作用機(jī)制、確定有效的酶促反應(yīng)環(huán)境有著十分重要的作用。Km值是酶的特征性常數(shù),測定Km值是研究酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的一種重要方法。有機(jī)相中酶促反應(yīng)的過程、機(jī)制與水相中是相同的,符合米氏方程、乒乓反應(yīng)機(jī)制[7-8]。研究表明,影響有機(jī)介質(zhì)中酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)變化的因素涉及底物和溶劑的性質(zhì)[7-9]。酶和溶劑競爭底物,如果底物與溶劑的親和性高,則底物與酶的親和力低,Km值就大;如果底物與溶劑的親和力低,酶和底物的親和力高,Km值就小。
近10幾年來,多聚半乳糖醛酸酶的分子生物學(xué)研究進(jìn)展很快,主要集中在多聚半乳糖醛酸酶及其序列特征、多聚半乳糖醛酸酶基因及其序列特征、多聚半乳糖醛酸酶的表達(dá)調(diào)控以及與病原真菌致病力之間的關(guān)系等方面[10-13]。孫沈魯?shù)萚14]探討了高壓脈沖電場(pulsed electric fields,PEF)對多聚半乳糖醛酸酶活性及構(gòu)象影響,研究表明,PEF處理可以有效地抑制PG的活性,隨著電場強(qiáng)度和脈沖個(gè)數(shù)的增加,酶活下降幅度增大。同時(shí),PEF作用使酶的三級結(jié)構(gòu)發(fā)生了明顯的變化。程桂平等[15]研究了pH值、溫度和金屬離子對內(nèi)切多聚半乳糖醛酸酶(endo-PG)降解香蕉果膠多糖的影響。劉小林等[16]研究了EDTA和金屬離子對多聚半乳糖醛酸酶酶活力及其動(dòng)力學(xué)的影響。但至今少見有報(bào)道有機(jī)溶劑對PG及其化學(xué)修飾酶動(dòng)力學(xué)的影響研究。
本實(shí)驗(yàn)主要研究PG和PG用水溶性低分子質(zhì)量殼寡糖(chitosan oligosaccharide,COS)進(jìn)行化學(xué)修飾后得到的化學(xué)修飾酶COS-PG在水溶性有機(jī)溶劑中的動(dòng)力學(xué)參數(shù)變化,旨在為了解PG和COS-PG在水溶性有機(jī)溶劑中酶促催化反應(yīng)變化的機(jī)理提供依據(jù)。
1.1 試劑與儀器
多聚半乳糖醛酸酶(PG)、考馬斯亮藍(lán)G-250 美國Fluka公司;橘子果膠(純度99%) 美國Sigma公司;其他試劑是國產(chǎn)分析純。
HWS24型電熱恒溫水浴渦 上海益恒實(shí)驗(yàn)儀器有限公司;LRH-150生化培養(yǎng)箱 上海一恒科學(xué)儀器有限公司;UV2000紫外-可見分光光度計(jì) 上海Unico公司。
1.2 方法
1.2.1 蛋白質(zhì)含量測定
參照Bradford[17]的方法,以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)。
1.2.2 酶活力測定
參照王小敏等[18]的方法進(jìn)行改進(jìn):酶促反應(yīng)體系為pH4.0,反應(yīng)溫度55℃,反應(yīng)時(shí)間30min,采用DNS法測定生成的半乳糖醛酸量,在上述反應(yīng)條件下,每分鐘產(chǎn)生1μg半乳糖醛酸的酶量定義為1個(gè)單位多聚半乳糖醛酸酶酶活力(U)。
1.2.3 多聚半乳糖醛酸酶(COS-PG)的活化及制備
參照Gomez等[19]的方法,采用高碘酸鈉氧化法對酶進(jìn)行活化。稱取80mg多聚半乳糖醛酸酶溶于磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖液(pH4.0)中,將一定量的高碘酸鈉溶于5mL蒸餾水中。上述活化體系置于一定溫度培養(yǎng)箱內(nèi)避光反應(yīng)30min后,加入400μL乙二醇,迅速混勻后靜置2h,用3.0L緩沖液(pH4.0)透析過夜,得到活化的PG。
將活化后的多聚半乳糖醛酸酶中加入150mg殼寡糖,置于活化溫度下避光攪拌反應(yīng)12h,不斷攪拌,緩慢加入20mg NaBH4終止反應(yīng),靜置2h后,用3.0L緩沖液(pH4.0)透析過夜。得到殼寡糖修飾的COS-PG。
1.2.4 動(dòng)力學(xué)參數(shù)測定
參照林建成等[20]的方法,將PG置于含有磷酸氫二鈉-檸檬酸的緩沖液(pH4.0)中和含有不同體積分?jǐn)?shù)有機(jī)溶劑(包括甲醇、乙醇、丙酮、四氫呋喃)的磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖液(pH4.0)中,55℃水浴預(yù)保溫5min,加入0.1mL PG和COS-PG,并使反應(yīng)體系中有機(jī)溶劑的終體積分?jǐn)?shù)達(dá)到2%,參照1.2.2節(jié)方法,在磷酸氫二鈉-檸檬酸緩沖液(pH4.0)中,55℃條件下測定其酶活力,以底物質(zhì)量濃度的倒數(shù)(1/[S])為橫坐標(biāo),以酶促反應(yīng)速率的倒數(shù)(1/V)為縱坐標(biāo),繪制Lineweaver-Burk曲線,計(jì)算出Km值和Vmax值。果膠的質(zhì)量濃度設(shè)置為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4mg/mL和1.6mg/mL。
2.1 緩沖液中PG和COS-PG的動(dòng)力學(xué)
圖1 PG和COS-PG在緩沖液中的Lineweaver-Burk曲線Fig.1 Lineweaver-Burk curves of PG and COS-PG in buffers
經(jīng)在緩沖液中保溫1h后測定,PG和COS-PG的Lineweaver-Burk曲線見圖1,根據(jù)雙倒數(shù)作圖法計(jì)算求出PG的Km為3.68mg/mL,Vmax為526.32U/mg pro。COS-PG的Km為2.80mg/mL,Vmax為555.56U/mg pro。修飾后,COS-PG的Km下降,Vmax上升,可見,修飾后酶對底物的親和力和最大反應(yīng)速率都上升。
2.2 PG和COS-PG在2%甲醇中的動(dòng)力學(xué)
圖2 PG和COS-PG在2%甲醇中的Lineweaver-Burk曲線Fig.2 Lineweaver-Burk curves of PG and COS-PG in 2% methanol
在2%甲醇中PG和COS-PG的Lineweaver-Burk曲線如圖2所示。根據(jù)雙倒數(shù)作圖法計(jì)算求出PG的Km為2.17mg/mL,Vmax為434.78U/mg pro。COS-PG的Km為2.50mg/mL,Vmax為500.00U/mg pro。與緩沖液中相比,在2%甲醇中,PG和COS-PG的Km和Vmax下降??梢?,在2%的甲醇中,PG和COS-PG與底物的親和力上升,最大反應(yīng)速率下降。
2.3 PG和COS-PG在2%乙醇中的動(dòng)力學(xué)
圖3 PG和COS-PG在2%乙醇中的Lineweaver-Burk曲線Fig.3 Lineweaver-Burk curves of PG and COS-PG in 2% ethanol
在2%乙醇中PG和COS-PG的Lineweaver-Burk曲線見圖3。根據(jù)雙倒數(shù)作圖法計(jì)算求出PG的Km為3.25mg/mL,Vmax為294.12U/mg pro。COS-PG的Km為2.17mg/mL,Vmax為434.79U/mg pro。與緩沖液中相比,在2%乙醇中,PG和COS-PG的Km和Vmax下降。可見,在2%的乙醇中,PG和COS-PG與底物的親和力上升,最大反應(yīng)速率下降。
2.4 PG和COS-PG在2%丙酮中的動(dòng)力學(xué)
圖4 PG和COS-PG在2%丙酮中的Lineweaver-Burk曲線Fig.4 Lineweaver-Burk curves of PG and COS-PG in 2% acetone
在2%丙酮中PG和COS-PG的Lineweaver-Burk曲線見圖4。根據(jù)雙倒數(shù)作圖法計(jì)算出PG的Km為4.28mg/mL,Vmax為357.14U/mg pro。COS-PG的Km為4.34mg/mL,Vmax為434.78U/mg pro。與緩沖液中相比,在2%丙酮中,PG和COS-PG的Km上升,而Vmax下降。可見,在2%的丙酮中,PG和COS-PG與底物的親和力下降,最大反應(yīng)速率下降。
2.5 PG和COS-PG在2%四氫呋喃中的動(dòng)力學(xué)
在2%四氫呋喃中PG和COS-PG的Lineweaver-Burk曲線見圖5。根據(jù)雙倒數(shù)作圖法計(jì)算求出PG的Km為5.00mg/mL,Vmax為625.00U/mg pro。COS-PG的Km為3.75mg/mL,Vmax為625.00U/mg pro。與緩沖液中相比,在2%四氫呋喃中,PG和COS-PG的Km和Vmax均上升??梢?,在2%的四氫呋喃中,PG和COS-PG與底物的親和力下降,最大反應(yīng)速率上升。
Km值是酶的特征性常數(shù),一般只與酶的性質(zhì)有關(guān),而與酶的濃度無關(guān)。Km值的大小反映了酶和底物親和力的強(qiáng)弱,如果修飾Km值變大,說明酶與作用底物的親和力減小,Km值變小,說明酶與底物的親和力增強(qiáng)。
本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,COS-PG的Km值有所下降,Vmax有較大幅度的上升,可見,修飾后酶活性的提高主要是由于酶的最大反應(yīng)速率和酶分子對底物的親和力增加共同作用而引起的。這可能是由于一方面偶聯(lián)到蛋白質(zhì)表面的殼寡糖與蛋白質(zhì)分子上的-OH基團(tuán)形成氫鍵,使維持蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的氫鍵受到部分的破壞,使亞基肽鏈結(jié)構(gòu)趨于松散,從而降低了酶催化反應(yīng)過程中酶分子構(gòu)象改變所需要的化學(xué)能[21],因此表現(xiàn)為Vmax大幅度上升;另一方面,殼寡糖引入酶蛋白表面后,增加酶分子表面的-,從而影響了整個(gè)酶活性中心的電荷分布,更有利于酶分子結(jié)合底物分子,因而表現(xiàn)為Km值有所下降,酶對底物的親和力上升。
在有機(jī)溶劑中,酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù)受有機(jī)溶劑的制約,與有機(jī)溶劑的濃度以及底物溶劑化有很大關(guān)系。有機(jī)溶劑可以通過改變底物和產(chǎn)物在有機(jī)溶劑與酶活性部位微水相之間的分配來影響酶的活力。這種分配效應(yīng)可以用來解釋當(dāng)酶從水溶液轉(zhuǎn)移到有機(jī)溶劑中時(shí)引起的表觀Km值增大。酶的催化效率與底物(疏水性與電荷性質(zhì))和溶劑(疏水性與極性)的理化性質(zhì)有關(guān)[23-24]。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在2%的甲醇中,PG和COS-PG的Km和Vmax均下降。在2%的四氫呋喃中,PG和COS-PG的Km和Vmax均上升。說明2%的甲醇引起PG和COS-PG酶活力上升主要是通過酶對底物的親和力上升實(shí)現(xiàn)的,而2%的四氫呋喃引起PG和COS-PG酶活力上升主要是通過Vmax上升實(shí)現(xiàn)的。由此可以推斷,在2%的甲醇和四氫呋喃處理后,增加了酶分子的柔性,改變了酶催化中心的微環(huán)境,從而使底物更加容易進(jìn)入酶的活性中心,并導(dǎo)致表觀的酶活性提高。在2%的乙醇處理后,PG和COS-PG的Km和Vmax下降,表明2%的乙醇引起PG和COS-PG酶活力下降主要是通過最大反應(yīng)速率下降實(shí)現(xiàn)的,并且其反應(yīng)機(jī)制類似于反競爭性抑制。在2%的丙酮處理后,PG和COS-PG的Km上升,而Vmax下降,表明2%的丙酮引起PG和COS-PG酶活力下降主要是通過酶對底物親和力下降和最大反應(yīng)速率下降共同作用實(shí)現(xiàn)的,并且其反應(yīng)機(jī)制類似于混合競爭性機(jī)制。
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Effect of Organic Solvent on Catalytic Kinetics of Polygalacturonase
LIU Xiao-lin1,2,LI Xiao-ting1,GONG Guo-yong1,HUANG Lei3,HUANG Zhuo-lie2,WU Zhi-quan2,LI Chun-yi2
(1. College of Life Sciences, Yichun University, Yichun 336000, China;2. College of Life Sciences, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;3. Yichun Middle School, Yichun 336000, China)
Water-soluble chitosan with low molecular weight was employed to modify polygalacturonase (PG). After modification, the catalytic kinetics of PG and modified polygalacturonase (COS-PG) were investigated in buffer, methanol, ethanol, acetone and tetrahydrofuran solution using pectin as substrate. The results indicated thatKm of COS-PG revealed a slight decline, butVmax revealed an increase.Km andVmax of PG and COS-PG declined both in 2% methanol and 2% ethanol.Km andVmax of PG and COS-PG increased in 2% tetrahydrofuran solution. Conversely, in 2% acetone solution,Km increased butVmax declined.
polygalacturonase;organic solvents;dynamics
Q643.132
A
1002-6630(2012)05-0134-04
2011-04-14
劉小林(1966—),男,副教授,博士,研究方向?yàn)樯锘瘜W(xué)與分子生物學(xué)。E-mail:LXL7519@yahoo.com.cn