亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        顱內(nèi)動脈瘤患者血清差異蛋白質(zhì)譜表達模型的研究

        2012-10-10 12:16:18陳禮剛李定君黃昌仁劉洛同
        重慶醫(yī)學(xué) 2012年7期
        關(guān)鍵詞:診斷模型圖譜蛋白質(zhì)

        周 杰,陳禮剛,李定君,黃昌仁,劉洛同,明 揚,張 苓,李 昊

        (瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院神經(jīng)外科,四川瀘州646000)

        顱內(nèi)動脈瘤一旦破裂會帶來極嚴重后果,而在其破裂之前如能早期發(fā)現(xiàn)并給予積極治療,可明顯降低患者的致殘率和病死率,因此,對顱內(nèi)動脈瘤的篩查及治療具有重要意義。但目前這方面的研究尚少[1-2]。本實驗擬采用表面增強激光解吸/離子化飛行時間質(zhì)譜(surface-enhanced laser desorption/inionation-time of flight-mass spectra,SELDI-TOF-MS)技術(shù)篩選顱內(nèi)動脈瘤患者血清特異蛋白標(biāo)記物,建立人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型,為早期、無創(chuàng)篩選顱內(nèi)動脈瘤提供實驗依據(jù)。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 納入病例為2007年7月至2010年12月本院神經(jīng)外科收治的顱內(nèi)動脈瘤患者。將45例顱內(nèi)動脈瘤破裂患者作為破裂組,其中,男26例,女19例;年齡(45.1±7.1)歲。同時期收治的顱內(nèi)動脈瘤未破裂患者作為未破裂組,其中,男28例,女17例;年齡(46.2±6.5)歲。將45例同時期于本院門診部體檢的健康者作為對照組,其中,男23例,女22例;年齡(47.1±6.9)歲。所有顱內(nèi)動脈瘤患者經(jīng)計算機斷層掃描血管造影(computed tomography angiography,CTA)、數(shù)字減影血管造影(digital subtraction angiography,DSA)檢查證實,均無動脈瘤和蛛網(wǎng)膜下腔出血家族史、腦出血及遺傳性疾病史。

        1.2 主要試劑與儀器 芥子酸、乙腈、三氟乙酸、甲醇、Tris-HCl、磷酸鹽緩沖溶液(phosphate buffered solution,PBS)、丙酮及甲酸等均購自美國Sigma公司。金屬親和表面蛋白芯片、PBSⅡ/C型蛋白質(zhì)指紋圖譜儀系統(tǒng)均為美國Ciphergen公司產(chǎn)品。

        1.3 標(biāo)本收集 所有受試者清晨空腹,于前臂靜脈采血5mL,4℃下靜置30min,2h內(nèi)送本院檢驗科蛋白組學(xué)實驗室。4℃下離心5min(離心半徑8cm,3 000r/min),取上清液(即血清)放入-80℃冰箱保存。實驗時,從-80℃冰箱中取出樣本,冰上融解0.5~1.0h,4℃下離心2min(離心半徑8cm,10 000r/min),待用。

        1.4 芯片檢測 吸取10mL芥子酸溶液(芥子酸溶于50%乙腈和0.5%三氟乙酸所得的飽和溶液)與血清等量混合,芯片活化,吸取2mL混合液點樣,晾干后再加入1μL芥子酸,室溫下干燥,上機檢測。設(shè)定參數(shù):從相對分子質(zhì)量為1.0×106開始檢測,檢測最大相對分子質(zhì)量為1.0×108,相對分子質(zhì)量優(yōu)化范圍為2.0×106~2.0×107,激光強度為210,開始檢測靈敏度為9,集中在優(yōu)化中心,用定量的方法獲取數(shù)據(jù),設(shè)置SELDI參數(shù)位置為20,開始位置為20,結(jié)束位置為80,每個位置平均5次遞增。利用PBSⅡ/C型蛋白質(zhì)指紋圖譜儀對結(jié)合在芯片表面的血清蛋白質(zhì)進行檢測。

        1.5 數(shù)據(jù)處理和模型建立 采用Ciphergen Proteinchip軟件自動采集實驗數(shù)據(jù),采用Biomarker Wizard 3.1軟件分別分析未破裂組和對照組(各30例)、未破裂組和破裂組 (各30例)的血清蛋白質(zhì)指紋圖譜差異,對實驗數(shù)據(jù)進行聚類分析和統(tǒng)計學(xué)處理,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。運用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型對檢測數(shù)據(jù)進行分析及優(yōu)化,分別建立診斷模型。利用測試集樣本(各15例)對模型進行雙盲法驗證,評價模型的準(zhǔn)確性。

        2 結(jié) 果

        2.1 差異蛋白的檢測 (1)檢測未破裂組和對照組血清共獲得135個蛋白質(zhì)峰,兩組有54個蛋白質(zhì)峰表達的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其中8個蛋白質(zhì)峰荷質(zhì)比分布于2 000~20 000之間,兩組比較差異顯著(P<0.01)。在未破裂組與對照組血清中篩選差異表達的2個蛋白質(zhì)峰分別為3 367.7和5 857.5,兩組血清蛋白指紋圖譜及相應(yīng)的凝膠電泳圖比較見圖1。(2)檢測未破裂組和破裂組血清共獲得265個蛋白質(zhì)峰,兩組有79個蛋白質(zhì)峰表達的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其中14個蛋白質(zhì)峰荷質(zhì)比分布于2 000~20 000之間,兩組比較差異顯著(P<0.01)。在未破裂組與破裂組血清中篩選差異表達的2個蛋白質(zhì)峰分別為6 642.0和9 127.5,兩組血清蛋白指紋圖譜及相應(yīng)的凝膠電泳圖比較見圖2。

        2.2 建立篩選預(yù)測模型 (1)以荷質(zhì)比為2 540.6、3 367.7、5 857.5及8 231.0的4個蛋白質(zhì)峰作為輸入節(jié)點建立的模型,其模擬計算的網(wǎng)絡(luò)誤差值最低,其中,以荷質(zhì)比為2 540.6、3 367.7及5 857.5的差異蛋白對比正常血清表達顯著升高(P<0.01);荷質(zhì)比為8231.0的差異蛋白對比正常血清表達顯著降低(P<0.01),見表1。(2)以荷質(zhì)比為 2 938.2、4 065.3、6 642.0、9 127.5及16 021.6的5個蛋白質(zhì)峰作為輸入節(jié)點建立的模型,其模擬計算的網(wǎng)絡(luò)誤差值最低。其中,以荷質(zhì)比為2 938.2、16 021.6的差異蛋白對比破裂組血清表達顯著升高(P<0.01);荷質(zhì)比為4 065.3、6 642.0及9 127.5的差異蛋白對比破裂組血清表達顯著降低(P<0.01),見表2。

        圖1 未破裂組和對照組血清的蛋白指紋圖譜及凝膠電泳圖比較

        圖2 未破裂組和破裂組血清的蛋白指紋圖譜及凝膠電泳圖比較

        表1 4種差異蛋白質(zhì)在未破裂組和對照組中的質(zhì)譜峰值

        2.3 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型的雙盲法驗證 利用建立的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型對測試集中樣本(各15例)分別進行雙盲法測試。驗證結(jié)果顯示:(1)15例未破裂組患者的血清中(目標(biāo)輸出值0.5~1.0)有1例判錯;而在15例對照組患者的血清中(目標(biāo)輸出值0.0~0.5)有1例判錯。經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析處理,其靈敏度為93.3%,特異度為93.3%,陽性預(yù)測值為93.3%,陰性預(yù)測值93.3%。利用結(jié)果數(shù)據(jù)繪制受試者工作特征(receiver operator characteristic curve,ROC)曲線,ROC曲線下面積(area under ROC curve,AUC)為0.920(>0.7),說明該診斷模型準(zhǔn)確,見圖3。(2)15例未破裂組患者的血清中(目標(biāo)輸出值0.5~1.0)有1例判錯;而在15例破裂組患者的血清中(目標(biāo)輸出值0.0~0.5)有2例判錯。經(jīng)統(tǒng)計學(xué)分析處理,其靈敏度為93.3%,特異度為86.7%,陽性預(yù)測值為87.5%,陰性預(yù)測值92.9%。利用結(jié)果數(shù)據(jù)繪制的ROC曲線,AUC為0.858(>0.7),說明該診斷模型準(zhǔn)確,見圖4。

        表2 5種差異蛋白質(zhì)在未破裂動脈瘤和破裂動脈瘤組中的質(zhì)譜峰值

        圖3 未破裂組與對照組人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型的ROC曲線分析

        圖4 未破裂組與破裂組人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型的ROC曲線分析

        3 討 論

        目前,對于未破裂動脈瘤的篩選工作開展較少,尚缺乏快捷、行之有效的方法對顱內(nèi)動脈瘤進行早期篩選和預(yù)測。DSA和CTA是目前診斷顱內(nèi)動脈瘤的主要手段,但它們不能作為顱內(nèi)動脈瘤的大規(guī)模篩選手段[3-4]。近年來越來越多的顱內(nèi)動脈瘤在例行體格檢查或因其他原因行頭部磁共振成像、磁共振血管造影(magnetic resonance angiography,MRA)檢查時被發(fā)現(xiàn),因MRA無創(chuàng)、無輻射,且在顱內(nèi)動脈瘤的診斷方面具有一定價值,相對DSA、CTA而言,它更適合用于人群的篩查。但作為篩查手段,MRA存在檢查時間長、噪音大、費用高的弊端,且MRA可能漏診或誤診較小動脈瘤和大動脈瘤[5]。鑒于動脈瘤破裂后的嚴重后果,確立可靠的無創(chuàng)篩查手段具有重要意義。

        目前,尚不清楚顱內(nèi)動脈瘤的發(fā)病機制,它可能與遺傳、血流動力學(xué)以及后天退行性變等多種因素相關(guān)。研究表明基因突變、缺失以及表達異常在顱內(nèi)動脈瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮重要的作用,因此,從分子水平上研究顱內(nèi)動脈瘤的發(fā)病機制,進而對其進行基因診斷和治療成為該領(lǐng)域的最新研究方向[6]。蛋白質(zhì)組學(xué)的出現(xiàn)和發(fā)展極大地推動了疾病生物標(biāo)志物的研究,它可以從整體水平上對一個細胞、一種組織中所包含的全部蛋白質(zhì)進行時間和空間上的動態(tài)研究[7-8]。因此,對顱內(nèi)動脈瘤患者血清蛋白指紋圖譜的研究有可能發(fā)現(xiàn)特異性顱內(nèi)動脈瘤診斷的生物標(biāo)志。SELDI-TOF-MS技術(shù)檢測的基本原理是基于特殊芯片的表面加強吸附,芯池中的分析物經(jīng)激光脈沖輻射,解吸形成荷電離子,不同荷質(zhì)比的離子在儀器漂移管中飛行的時間不同,質(zhì)量越小,所帶電荷越多的離子,其荷質(zhì)比越小,飛行時間越短,檢測器可對其進行檢測并繪制成質(zhì)譜圖,經(jīng)計算機軟件處理后形成模擬圖譜[9],將對照組與某種疾病或疾病不同階段的圖譜進行比較,可發(fā)現(xiàn)和捕捉特異相關(guān)蛋白。該技術(shù)優(yōu)點在于:(1)可分析經(jīng)典技術(shù)無法分析的蛋白質(zhì),包括疏水蛋白質(zhì)、等電點過高或過低的蛋白質(zhì);(2)獲得的圖譜單一,重復(fù)性好,可用于定量分析;(3)樣品無需純化,可分析復(fù)雜的生物樣品,增加發(fā)現(xiàn)生物學(xué)標(biāo)志的機會;(4)樣品需要量少,檢測速度快,適合臨床診斷及大規(guī)模篩選。近年來,它已被廣泛用于生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和定義、蛋白質(zhì)功能分析、腫瘤標(biāo)志物篩選及藥學(xué)研究等領(lǐng)域,同時,對顱腦損傷和顱內(nèi)腫瘤進行的初步研究顯示其在這一領(lǐng)域也具有一定的臨床應(yīng)用價值,但目前尚無顱內(nèi)動脈瘤相關(guān)文獻的報道[10-14]。

        SELDI-TOF-MS技術(shù)的應(yīng)用為大規(guī)模人群篩選提供了可能。Zhang等[15]運用SELDI-TOF-MS技術(shù)建立的診斷模型檢測彌漫性大B細胞淋巴瘤的特異度和敏感度均為94%,檢測預(yù)后不良患者的特異度為92%,敏感度為94%。呂晶晶等[16]用結(jié)直腸腺瘤患者、結(jié)直腸良性疾病患者及正常人血清的3種表達差異蛋白質(zhì)的荷質(zhì)比建立診斷模型,該模型的診斷準(zhǔn)確率為87.70%、靈敏度為71.43%、總特異度為96.25%、陽性預(yù)測值為90.91%。本研究結(jié)果表明運用SELDI-TOF-MS技術(shù)檢測未破裂組、破裂組及對照組患者的血清標(biāo)本,獲取相應(yīng)血清蛋白表達指紋圖譜,經(jīng)統(tǒng)計分析以篩選未破裂組患者血清可能存在的特異蛋白是可行的,未破裂組、破裂組及對照組患者血清蛋白質(zhì)譜的表達具有顯著的差異性。根據(jù)不同分組的差異蛋白,運用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型分別建立其診斷模型,其AUC>0.7,說明該方法所建立的診斷模型準(zhǔn)確可靠,可以作為未破裂顱內(nèi)動脈瘤患者的潛在篩選手段。雙盲法驗證此診斷模型顯示其可在短時間內(nèi)較好地區(qū)分未破裂動脈瘤患者、破裂動脈瘤患者及健康者,說明該診斷模型適合于未破裂動脈瘤的篩選工作。

        利用SELDI-TOF-MS技術(shù)篩選的血清特異蛋白標(biāo)志物作為篩選顱內(nèi)動脈瘤實驗指標(biāo)具有重要的潛在價值和一定的應(yīng)用前景。首先,該方法血清樣本容易獲得,對患者創(chuàng)傷性小,檢查耗時短,費用低,有利于臨床高危人群篩選的應(yīng)用和推廣;其次,通過對顱內(nèi)動脈瘤的蛋白質(zhì)表達差異情況進行研究,進而對差異蛋白數(shù)量、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、相互關(guān)系和生物學(xué)功能進行全面分析,明確顱內(nèi)動脈瘤血清差異蛋白在此疾病發(fā)生、發(fā)展過程中的作用,從而對顱內(nèi)動脈瘤進行診斷和篩選,并可對這些“關(guān)鍵”蛋白進行干預(yù),為基因治療顱內(nèi)動脈瘤提供臨床和實驗資料。然而,本研究在諸多方面還需進一步深入,如對實驗方法學(xué)的完善以及實驗條件的標(biāo)準(zhǔn)化,以增強實驗可重復(fù)性,并進行多中心、大樣本的聯(lián)合研究。通過對這些潛在的生物標(biāo)志物進行精確鑒定,確定其在動脈瘤發(fā)生、發(fā)展、破裂過程中的具體作用,為顱內(nèi)動脈瘤的臨床篩選提供可靠的實驗依據(jù)。

        [1] Menghini VV,Brown RD Jr,Sicks JD,et al.Clinical manifestations and survival rates among patients with saccular intracranial aneurysms:population-based study in Olmsted County,Minnesota,1965to 1995[J].Neurosurgery,2001,49(2):251-256.

        [2] 翟寶進,劉欣民,李雙英,等.顱內(nèi)動脈瘤患者血清差異表達蛋白質(zhì)的研究[J].中華神經(jīng)外科雜志,2010,26(10):891-895.

        [3]Joo SP,Kim TS,Kim YS,et al.Clinical utility of multislice computed tomographic angiography for detection of cerebral vasospasm in acute subarachnoid hemorrhage[J].Minim Invasive Neurosurg,2006,49(5):286-290.

        [4] 林維斌,何理盛.顱內(nèi)動脈瘤診斷與治療的現(xiàn)狀及進展[J].福建醫(yī)藥雜志,2007,29(2):98-100.

        [5] Yang YJ,Chen WJ,Zhang Y,et al.Diagnostic value of CTA and MRA in intracranial traumatic aneurysms[J].Chin J Traumatol,2007,10(1):29-33.

        [6] 楊呈浩,李定君,詹書良.與顱內(nèi)動脈瘤發(fā)病機制相關(guān)基因研究現(xiàn)狀[J].瀘州醫(yī)學(xué)院學(xué)報,2007,30(6):541-543.

        [7] Lu HB,Zhou JH,Ma YY,et al.Five serum proteins identified using SELDI-TOF-MS as potential biomarkers of gastric cancer[J].Jpn J Clin Oncol,2010,40(4):336-342.

        [8] Araki Y,Yoshikawa K,Okamoto S,et al.Identification of novel biomarker candidates by proteomic analysis of cerebrospinal fluid from patients with moyamoya disease using SELDI-TOF-MS[J].BMC Neurol,2010,10:112.

        [9] 伍健,黃培林.SELDI蛋白質(zhì)芯片技術(shù)在腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的應(yīng)用[J].東南大學(xué)學(xué)報:醫(yī)學(xué)版,2004,23(5):347-350.

        [10]Lin YW,Lin CY,Lai HC,et al.Plasma proteomic pattern as biomarkers for ovarian can cer[J].Int J Gynecol Cancer,2006,16Suppl 1:S139-146.

        [11]譚小林,任興軍,王開正,等.食管癌血清差異蛋白質(zhì)組測定結(jié)果分析[J].重慶醫(yī)學(xué),2011.40(7):641-643.

        [12]張蓉,張莉.心理訓(xùn)練對心理應(yīng)激后陸軍特種兵血清蛋白質(zhì)譜特征的影響[J].解放軍醫(yī)學(xué)雜志,2011,35(9):985-987.

        [13]李杰,陳茂偉,周怡,等.乙肝肝纖維化血清標(biāo)記物篩選的初步研究[J].實用醫(yī)學(xué)雜志,2011,27(15):2724-2727

        [14]Dursun E,Monari E,Cuoghi A,et al.Proteomic profiling during atherosclerosis progression using SELDI-TOFMS:effect of darbepoetin treatment[J].Acta Histochem,2010,112(5):432-443.

        [15]Zhang MZ,Sun ZC,F(xiàn)u XR,et aI.Analysis of serum proteome profiles of non-Hodgkin lymphoma for biomarker identification[J].J Proteomics,2009,72(6):952-959.

        [16]呂晶晶,高春芳,王秀麗,等.SELDI-TOF-MS技術(shù)在結(jié)直腸腺瘤血清蛋白質(zhì)指紋圖譜篩查模型建立中的應(yīng)用[J].山東醫(yī)藥,2010,50(34):7-9.

        猜你喜歡
        診斷模型圖譜蛋白質(zhì)
        中樞性性早熟女童的診斷模型建立與驗證
        蛋白質(zhì)自由
        肝博士(2022年3期)2022-06-30 02:48:48
        人工智能與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
        海外星云(2021年9期)2021-10-14 07:26:10
        繪一張成長圖譜
        CD4細胞計數(shù)聯(lián)合IGRA預(yù)測AIDS/Ⅲ型TB影像診斷模型分析
        甘肅科技(2020年20期)2020-04-13 00:30:56
        一種電網(wǎng)通信網(wǎng)絡(luò)的故障檢測方法及系統(tǒng)
        補腎強身片UPLC指紋圖譜
        中成藥(2017年3期)2017-05-17 06:09:01
        蛋白質(zhì)計算問題歸納
        主動對接你思維的知識圖譜
        雜草圖譜
        中文字幕色婷婷在线视频| 国产精品一二三区亚洲| 国产精品亚洲二区在线看| 久久只精品99品免费久23| 色噜噜久久综合伊人一本| 免费观看又污又黄的网站| 欧美日韩中文亚洲另类春色| 国产高清自产拍av在线| 少妇无套裸按摩呻吟无呜| 国产女人高潮叫床免费视频| 日韩www视频| 99视频一区| 黄色三级视频中文字幕| 在线观看在线观看一区二区三区| 久久亚洲av午夜福利精品一区| 欧美黑人粗暴多交高潮水最多| 在线亚洲AV不卡一区二区| 亚洲国产一区一区毛片a| 亚洲综合中文字幕综合| 国产精品亚洲αv天堂无码| 日本高清色倩视频在线观看| 国产美女高潮流白浆在线观看| 国产精品爽爽VA吃奶在线观看| 粉嫩的极品女神尤物在线| 放荡的少妇2欧美版| 国产精品嫩草影院av| 亚洲成人福利在线观看 | 女优视频一区二区三区在线观看| 亚洲天堂精品成人影院| 中文字幕精品久久久久人妻红杏ⅰ | 五月婷婷俺也去开心| 国产91第一页| 蜜桃人妻午夜精品一区二区三区| 久久久久久夜精品精品免费啦| 特级做a爰片毛片免费看108| 青草蜜桃视频在线观看| 日韩精品免费av一区二区三区 | 国产成人精品三级91在线影院| 热re99久久精品国产66热6| 青青草好吊色在线观看| 国产aⅴ无码专区亚洲av麻豆 |