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        微小隱孢子蟲含EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白家族的生物信息學(xué)研究*

        2012-09-26 02:54:58郭志云荊春霞付芹芹孫小會(huì)王穗湘李月琴周天鴻
        關(guān)鍵詞:信號(hào)

        郭志云,楊 光,荊春霞,付芹芹,孫小會(huì),王穗湘,李月琴,周天鴻

        隱孢子蟲(Cr yptosporidiu m spp.)是一種呈世界性分布的人獸共患寄生蟲,已成為世界范圍內(nèi)水源傳播疾病中的重要病原體,它能感染人和許多動(dòng)物,嚴(yán)重危害著人類的健康和畜牧業(yè)的發(fā)展[1]。隱孢子蟲機(jī)會(huì)性感染是AIDS病患者的重要致死原因,而目前還沒有有效的治療和預(yù)防方法[2]。近幾年,隨著全基因組測(cè)序計(jì)劃的不斷發(fā)展,隱孢子蟲已有3個(gè)分離株(C.parvu m Iowa II,C.hominis TU502和C.muris)的全基因組測(cè)序工作完成[3-4],圍繞隱孢子蟲基因結(jié)構(gòu)和功能的研究迅速成為熱點(diǎn)。

        EF-h(huán)and (Exchange Factor hand)結(jié) 構(gòu) 域(PROSITE entry:PDOC00018,Ex PASy)是一種含有鈣離子結(jié)合位點(diǎn)的α螺旋-中央環(huán)-α螺旋(alpha helix-loop-alpha helix)結(jié)構(gòu),兩股α螺旋分別稱為“E”和“F”,且?guī)缀跏谴怪钡?,這有利于中央環(huán)與Ca2+結(jié)合而發(fā)生構(gòu)象的改變,進(jìn)而暴露靶結(jié)合位點(diǎn)而發(fā)揮生物學(xué)功能[5-6]。EF-h(huán)and motif約含有 40個(gè)氨基酸殘基,常以成對(duì)形式出現(xiàn)在蛋白功能域中,與重要的鈣離子信號(hào)有著密切的關(guān)系[7]。

        我們?cè)趯?duì)隱孢子蟲進(jìn)行基因功能研究的過程中,發(fā)現(xiàn)C.par vu m Iowa II基因組中含有大量EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白。為了更好地分析這類含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白的功能及其對(duì)微小隱孢子蟲的重要意義,本文對(duì)微小隱孢子蟲該蛋白家族進(jìn)行了生物信息學(xué)相關(guān)分析,為進(jìn)一步基因功能研究提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)收集 在美國隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫(htt p://cr yptodb.or g/cr yptodb/)中 “Gene Text Search”信息欄輸入EF-h(huán)and,初步搜索C.par vu m Iowa II基因組中推定的含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白,結(jié)合 Gen Bank中的核酸數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nl m.nih.gov/)獲得各蛋白相應(yīng)的核苷酸序列及蛋白序列。

        1.2 結(jié)構(gòu)域和motif分析 將搜索獲得的蛋白序列輸入到NCBI的結(jié)構(gòu)域搜索網(wǎng)站CDD(http://www.ncbi.nl m.nih.gov/Str ucture/cdd/wrpsb.cgi)中進(jìn)行各蛋白的結(jié)構(gòu)域搜索,以進(jìn)一步確定和分析各蛋白含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域以及其他結(jié)構(gòu)域的情況。同時(shí)還進(jìn)行Sanger網(wǎng)站的Pfam搜索(http://pf am.sanger.a(chǎn)c.uk/)驗(yàn)證結(jié)構(gòu)域搜索結(jié)果。通過日本京都大學(xué)開發(fā)的Motif Search在線搜索工具(http://www.geno me.jp/tools/motif/),對(duì)每個(gè)蛋白進(jìn)行了motif搜索。

        1.3 序列比對(duì) 利用NCBI BLAST功能中的Blast-N和Blast-P對(duì)經(jīng)過結(jié)構(gòu)域搜索確定含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白進(jìn)行核苷酸和氨基酸序列比對(duì),以確保所收集得到的數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。在缺省值條件下使用Cl ustal W軟件(版本號(hào)是1.83)對(duì)每個(gè)蛋白的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域進(jìn)行多序列聯(lián)配分析,以進(jìn)一步了解微小隱孢子蟲中EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域間的相似性和研究EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域中的Ca2+binding site等重要?dú)埢嚓P(guān)信息。

        1.4 計(jì)算蛋白的分子量、等電點(diǎn)和氨基酸長度 將目的蛋白序列輸入到 Ex PASy(http://www.expasy.ch/t ools/pi_tool.ht ml)進(jìn)行蛋白的分子量和等電點(diǎn)計(jì)算,以比較EF-h(huán)and家族蛋白之間基本性質(zhì)的區(qū)別。

        1.5 蛋白功能分析 通過各蛋白所含有的結(jié)構(gòu)域情況,對(duì)C.par vum Iowa II中的 EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白進(jìn)行大致分類。利用結(jié)構(gòu)域畫圖軟件DOG 2.0(Do main Graph,version 2.0,(Do main Graph,version 2.0,http://dog.biocuckoo.org/soft ware.php)畫出上述蛋白所含有的結(jié)構(gòu)域以及鈣離子結(jié)合位點(diǎn)和其他相關(guān)重要位點(diǎn)情況,進(jìn)行蛋白之間的比較與分析,最后結(jié)合NCBI的Blast比對(duì)結(jié)果和文獻(xiàn)分析進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。

        2 結(jié) 果

        2.1 含EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白的初篩 在微小隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)收集過程中,在C.parvum Iowa II的全基因組中搜索獲得數(shù)據(jù)庫中注釋的含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的53個(gè)蛋白,經(jīng)過分析發(fā)現(xiàn)其中15個(gè)蛋白是假設(shè)蛋白,故將獲得的除去假設(shè)蛋白的38個(gè)含EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白作為進(jìn)一步分析的目標(biāo)蛋白。

        2.2 含EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白的確定 將這38個(gè)蛋白的蛋白序列輸入到NCBI的結(jié)構(gòu)域搜索網(wǎng)站中進(jìn)行CDD結(jié)構(gòu)域搜索與分析時(shí),發(fā)現(xiàn)這38個(gè)蛋白中只有18個(gè)蛋白真正含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域,其余20個(gè)蛋白均未發(fā)現(xiàn)EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的存在。將此未發(fā)現(xiàn)EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的20個(gè)蛋白序列輸入到sanger網(wǎng)站進(jìn)行Pfam結(jié)構(gòu)域搜索,結(jié)果仍未搜索到EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域,推測(cè)在微小隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫中的全基因組進(jìn)行注釋時(shí)并未精確分類這些蛋白。因此對(duì)這18個(gè)真正含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白進(jìn)行深入分析(表1)。

        2.3 蛋白的基本性質(zhì)分析 經(jīng)過Ex PASy的分子量和等電點(diǎn)分析,這18個(gè)蛋白之間的氨基酸長度、分子量大小以及等電點(diǎn)等都有很大的區(qū)別,它們的氨基酸長度從149-1042 AA,分子量從16.8-115.6k D,pI值從4.09-8.96,呈現(xiàn)著明顯的區(qū)別。EF-h(huán)and家族的染色體定位分析表明,該家族蛋白分布在C.par vu m Iowa II的1、2、3、5、7與8號(hào)染色體上,其中在3號(hào)染色體上1個(gè),1號(hào)染色體上有2個(gè),5號(hào)、7號(hào)和8號(hào)染色體上各有3個(gè),分布最多的是2號(hào)染色體6個(gè),4號(hào)和6號(hào)染色體上未發(fā)現(xiàn)此類蛋白的存在。而且,除cgd1-1370含有1個(gè)內(nèi)含子之外,其余17個(gè)蛋白未見內(nèi)含子的存在(表1)。

        2.4 結(jié)構(gòu)域和motif分析 通過CDD結(jié)構(gòu)域搜索發(fā)現(xiàn),在這18個(gè)蛋白中,有9個(gè)蛋白含有2個(gè)EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域,分別為cgd2-810、cgd8-1280、cgd5-60、cgd1-1370、cgd8-4120、cgd2-1240、cgd5-820、cgd7-1840和cgd2-1300。而另外9個(gè)蛋白只含有1個(gè) EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域,分別是cgd2-1700、cgd8-500、cgd5-3920、cgd3-3420、cgd2-3990、cgd1-3220、cgd7-40、cgd2-1060和cgd7-1260。除 EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域外,cgd5-820、cgd7-1260 和 cgd2-1300還含有PKC(protein kinase C)結(jié)構(gòu)域,cgd2-1060和 cgd7-1840 還 含 有 STKc-AGC〔serine/t hreonine kinases(STKs),AGC (pr otein kinases A,G and C f amily,catal ytic do main〕結(jié)構(gòu)域,且cgd7-1840還含有一個(gè)CBM20(The fa mil y 20 carbohydrate-binding module,also known as the starch-binding domain)結(jié)構(gòu)域(圖1)。

        表1 微小隱孢子蟲基因組中含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的18種蛋白的基本信息Tab.1 General infor mation about the 18 kinds of pr otein which containd EF-h(huán)and domains of the C.parvum Iowa II genome

        圖1 微小隱孢子蟲含有EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域蛋白的結(jié)構(gòu)域示意圖Fig.1 The domain condition of the 18 proteins containing EF-h(huán)and domains from the C.parvum Iowa IINote:This result was obtained in March 2011 online.Due to the update of the website,there is a certain difference in the results bet ween before and after search.EFh:EF-h(huán)and domain;EH:Eps15 homology domain(EFh superfamily).

        經(jīng)motif搜索發(fā)現(xiàn),18個(gè)蛋白都含有EF-h(huán)and-1 Motif,其一致模式為D-{W}-[DNS]-{ILVFY W }-[DENSTG ]-[DNQGHRK ]-{GP }-[LIV MC]-[DENQSTAGC]-x(2)-[DE]-[LIVMFY W](PROSITE entr y:PS00018;“{}”表示除了括號(hào)內(nèi)的任何一個(gè)氨基酸都可以,“[]”表示括號(hào)內(nèi)的任何一個(gè)氨基酸都可以,“x”表示所有氨基酸中的任何一個(gè),“x(2)”表示此位點(diǎn)兩個(gè)重復(fù)氨基酸,“-”為分隔符),包括了13個(gè)氨基酸殘基,其中,位點(diǎn)1、3、5、7、9和12(圖2)都是和Ca2+結(jié)合相關(guān)的重要位點(diǎn),尤其是位點(diǎn)12上固定不變的帶負(fù)電荷的Asp(D)或Glu(E)可以通過電荷之間的相互作用與帶正電荷的Ca2+結(jié)合,并提供2個(gè)氧給Ca2+以促進(jìn)Ca2+的 結(jié) 合 (http://pfam.sanger.a(chǎn)c.uk/family/PF00036.26)。通過 Clustal W 1.83軟件進(jìn)行的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域多序列聯(lián)配分析發(fā)現(xiàn),本文所分析的18個(gè)蛋白的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域均由一對(duì)EF-h(huán)and motif構(gòu)成,都符合EF-h(huán)and-1 Motif的一致模式,其中位點(diǎn)1上幾乎均為D(Asp)氨基酸,位點(diǎn)12上幾乎都是E(Glu)和D(Asp)氨基酸(圖2),這就揭示了EF-h(huán)and motif在氨基酸序列上的保守性,進(jìn)一步說明這些位點(diǎn)是結(jié)構(gòu)域的重要位點(diǎn)。

        還發(fā)現(xiàn),cgd2-3990的羧基末端還含有一個(gè)ER-TARGET motif (endoplas mic reticulu m-targeting signal sequence)RDE,稱為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)滯留信號(hào)的4肽信號(hào)序列,它的一致模式為[KRHQ-SA]-[DENQ]-E-L(PROSITE:PS00014),帶 有 此滯留信號(hào)的蛋白被稱為ER定居蛋白,在ER腔、高爾基體及其中間區(qū)分布有ER-TARGET motif的受體,ER定居蛋白一旦進(jìn)入高爾基體就會(huì)被高爾基體上的受體結(jié)合,形成回流小泡被轉(zhuǎn)運(yùn)回內(nèi)質(zhì)網(wǎng),從而將錯(cuò)誤轉(zhuǎn)運(yùn)到分泌囊泡中的ER定居蛋白重新轉(zhuǎn)運(yùn)回ER腔[8]。此外cgd5-820、cgd7-1840、cgd2-1300、cgd2-1060、cgd7-40和cgd7-1260這6個(gè)蛋白都含有一個(gè)PROTEIN_KINASE_ST motif(PROSITE:PS00108)和一個(gè)PROTEIN_KINASE_ATP motif(PROSITE:PS00107)。PROTEIN_KINASE_ST motif是一個(gè) Serine/Threonine protein kinases active-site signat ure,而 PROTEIN_KINASE_ATP motif是一個(gè)Pr otein kinases ATP-binding region signature,除 cgd7-40 之外,這些motif剛好是和它們所含有的PKc或STKc-AGC蛋白激酶催化結(jié)構(gòu)域相一致的。因此,我們可以發(fā)現(xiàn),motif和domain雖然是兩個(gè)不同的概念,但是兩者之間是密切相關(guān)的,正是因?yàn)閙otif這些保守性的殘基組成了do main。

        圖2 微小隱孢子蟲18個(gè)蛋白的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域多序列聯(lián)配分析Fig.2 Multiple sequence align ment of the EF-h(huán)and domain from the 18 proteins of the C.parvum Iowa IINote:The domain sequence is named according to the complete genome database’s gene names;the 1 and 2 represent t his pr otein’s t wo EF-h(huán)and do mains.

        2.5 蛋白分類情況 PKC結(jié)構(gòu)域是蛋白激酶催化結(jié)構(gòu)域(protein kinases catalytic domain),能夠催化ATP上的γ-磷酰基團(tuán)向蛋白底物的絲氨酸/蘇氨酸/酪氨酸殘基轉(zhuǎn)移,使絲氨酸/蘇氨酸/酪氨酸被磷酸化;而STKc-AGC結(jié)構(gòu)域?yàn)榻z氨酸/蘇氨酸激酶 (serine/t hreonine kinases,STKs)-蛋白激酶 A、G、C 家族 (protein kinases A,G,and C family,AGC)催化結(jié)構(gòu)域,是蛋白激酶超家族中A、G、C家族的絲氨酸/蘇氨酸激酶催化結(jié)構(gòu)域,只能催化ATP上的γ-磷酰基團(tuán)向蛋白底物的絲氨酸/蘇氨酸殘基的轉(zhuǎn)移,使絲氨酸/蘇氨酸發(fā)生磷酸化(http://www.ncbi.nl m.nih.gov/Str ucture/cdd/cddsrv.cgi);而成對(duì)出現(xiàn)的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域會(huì)比單一EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域更穩(wěn)定,且在對(duì)Ca2+的結(jié)合上起著協(xié)同作用[9]。因此基于所含有的結(jié)構(gòu)域情況可以簡單地把這18個(gè)蛋白分成a、b、c和d四大類(見圖1):a類為只含有1個(gè)EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的蛋白,b類為只含有2個(gè)EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域的,c類為同時(shí)含EF-h(huán)and和STKc-AGC兩種結(jié)構(gòu)域的,d類為同時(shí)含EF-h(huán)and和PKC兩種結(jié)構(gòu)域的蛋白。

        3 討 論

        自從微小隱孢子蟲(C.par vu m)8條染色體的全基因測(cè)序工作[3-4]完成之后,隱孢子蟲的研究已進(jìn)入了后基因組時(shí)代,大量新基因的發(fā)現(xiàn)為科研工作者提供了更多的研究方向。其中許多的序列信息只進(jìn)行了簡單的注釋,利用生物信息學(xué)相關(guān)知識(shí)來分析和預(yù)測(cè)蛋白的功能已成為很多課題研究的基礎(chǔ)。本研究從與蛋白功能密切相關(guān)的結(jié)構(gòu)域信息出發(fā),通過研究隱孢子蟲中EF-h(huán)and家族蛋白的結(jié)構(gòu)域情況去預(yù)測(cè)這些蛋白的功能,為后續(xù)進(jìn)行的微小隱孢子蟲中鈣離子代謝的研究提供了更多的方向。

        Ca2+信號(hào)是真核細(xì)胞中最廣泛存在的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制之一,細(xì)胞受到刺激后,儲(chǔ)存的Ca2+就會(huì)被快速釋放,引起下游一系列的效應(yīng),而這些效應(yīng)一般由EF-h(huán)and蛋白超家族通過各種途徑參與執(zhí)行[10]。EF-h(huán)and蛋白是一類同源蛋白,一般含有2到12個(gè)拷貝的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域,按功能可以分為兩類,一類為結(jié)合Ca2+后能發(fā)生構(gòu)象改變起到調(diào)控作用的信號(hào)蛋白,包括鈣調(diào)蛋白(cal modulin)、肌鈣蛋白C(tr oponin C)和S100B蛋白等;另一類為如鈣結(jié)合蛋白(calbindin)和小清蛋白(Parvalbu min)樣只起到緩沖胞內(nèi)Ca2+水平的結(jié)構(gòu)蛋白,它們不會(huì)發(fā)生Ca2+依賴的構(gòu)象改變[11]。對(duì)于本研究中的這18個(gè)蛋白,基于美國隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫的注釋和同源性分析,cgd2-810、cgd2-1700、cgd5-3920 和cgd3-3420屬于鈣調(diào)蛋白家族,因此它們屬于起到調(diào)控作用的信號(hào)蛋白;cgd8-500、cgd8-1280、cgd5-60和cgd8-4120屬于中心體蛋白家族(centrin,在某些生物又叫做鈣牽蛋白,caltractin),centrins在結(jié)合Ca2+之后發(fā)生的構(gòu)象改變,很有可能為紡錘極體(spindle pole body)的復(fù)制提供信號(hào),并提高了centrins對(duì)相互作用的目的蛋白的親和力[12],因此這類蛋白應(yīng)該都屬于信號(hào)蛋白;而cgd5-820、cgd7-1840、cgd2-1300、cgd2-1060、cgd7-40和cgd7-1260都屬于CDPK (calciu m/cal modulin-dependent protein kinase)蛋白,由于 EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域和protein kinase結(jié)構(gòu)域之間存在信息傳遞關(guān)系,也應(yīng)都屬于信號(hào)蛋白;cgd1-1370是磷酸酶B亞單位(calcineurin subunit B,Cn B),雖然在結(jié)合Ca2+之后并不經(jīng)歷Ca2+誘導(dǎo)的構(gòu)象改變,但它是一個(gè)獨(dú)立的Ca2+傳感器,能夠調(diào)控Ca2+依賴的和非Ca2+依賴的兩種形式磷酸酶[13],所以是一個(gè)信號(hào)蛋白;cgd2-1240和cgd1-3220,目前尚無相關(guān)功能研究的資料支撐其分類;cgd2-3990是一個(gè)膜相關(guān)的Ca2+依賴的ER定居蛋白,與Pl asmodiu m f alcipar u m的Pfs40蛋白結(jié)構(gòu)非常相似,而Pfs40是Pl asmodium f alcipar um 配子主要的Ca2+結(jié)合蛋白,Ca2+調(diào)控的結(jié)構(gòu)改變很有可能是其細(xì)胞識(shí)別和聚合所必須的分子相互作用[14],所以cgd2-3990也是一個(gè)信號(hào)分子。因此,我們推測(cè),此EF-h(huán)and家族除cgd2-1240和cgd1-3220尚未有相關(guān)資料來支撐分類之外,其余的16個(gè)蛋白都屬于信號(hào)蛋白,但這只是基于生物信息學(xué)的初步分類,而進(jìn)一步的確定還需要對(duì)各個(gè)蛋白進(jìn)行如Ca2+放射自顯影等相關(guān)的體外實(shí)驗(yàn)來說明。

        Ca2+信號(hào)控制著頂復(fù)門寄生蟲生活史中很多重要的過程,如粘附素的分泌、蟲體的滑行運(yùn)動(dòng)、對(duì)宿主細(xì)胞的入侵和逃出等,而蛋白激酶是下游Ca2+水平變化的效應(yīng)器,Ca2+向胞質(zhì)的快速釋放將會(huì)活化Ca2+依賴的蛋白激酶家族(CDPKs)[15]。在植物和一些原生動(dòng)物中已發(fā)現(xiàn),CDPKs能夠接收Ca2+信號(hào)而在細(xì)胞中扮演著非常重要的角色,經(jīng)典的CDPKs結(jié)構(gòu)域含有一個(gè)能對(duì)靶蛋白進(jìn)行磷酸化作用的激酶催化區(qū)(kinase catalytic region)和大量的C末端EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域(通常為4個(gè)EF-h(huán)and motifs),它們中間是一個(gè)短的自動(dòng)抑制結(jié)構(gòu)域,正常情況下,這個(gè)自動(dòng)抑制結(jié)構(gòu)域充當(dāng)假底物的身份,和蛋白激酶結(jié)構(gòu)域結(jié)合在一起從而抑制蛋白激酶結(jié)構(gòu)域的功能,當(dāng)Ca2+結(jié)合到EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域之后,這種自動(dòng)抑制作用就會(huì)被解除,從而發(fā)揮Ca2+依賴的蛋白激酶家族蛋白各種功能[16-17]。本文中含有CDPKs結(jié)構(gòu)域(PKc和STKc-AGC)的5個(gè) EF-h(huán)and蛋白中,有3個(gè)蛋白在蛋白激酶催化結(jié)構(gòu)域后面緊跟著2個(gè) EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域即4個(gè) EF-h(huán)and motifs,且PKc和STKc-AGC結(jié)構(gòu)域都具有活化位點(diǎn)(active site)、ATP結(jié)合位點(diǎn)(ATP binding site)以及底物結(jié)合位點(diǎn)(substrate binding site)。CDPKs作為一切生命活動(dòng)的基礎(chǔ),控制著細(xì)胞內(nèi)如轉(zhuǎn)錄、新陳代謝、離子泵與離子通道和細(xì)胞骨架的構(gòu)建等一系列的過程[18],所以在C.par vu m Iowa II中應(yīng)該是這類EF-h(huán)and家族蛋白起著最重要的作用,且它們這種強(qiáng)大功能的發(fā)揮是依賴于這些蛋白激酶催化結(jié)構(gòu)域的。

        大量的研究還證明,Ca2+調(diào)控著瘧原蟲不同的生物過程,如裂殖子對(duì)紅細(xì)胞的入侵,動(dòng)合子和子孢子的運(yùn)動(dòng)與細(xì)胞侵襲,分泌細(xì)胞器的脫落,以及在蚊體內(nèi)的性分化過程[19-20]。Toxopl asma gondii 的體外試驗(yàn)也證明,寄生蟲侵入宿主細(xì)胞前的細(xì)胞附著作用是與頂復(fù)門特有的微線體黏附蛋白(micr oneme proteins)密切相關(guān)的,而微線體黏附蛋白的分泌又受到胞質(zhì)Ca2+水平的調(diào)控[15]。還有實(shí)驗(yàn)證明,C.par vu m子孢子侵入宿主細(xì)胞之前需要進(jìn)行Ca2+依賴的頂復(fù)器的脫落是[20],因此C.parvu m對(duì)宿主細(xì)胞的侵襲與胞內(nèi)的Ca2+信號(hào)有著非常重要的關(guān)系。在隱孢子蟲基因組中EF-h(huán)and蛋白家族如此地龐大,暗示著鈣離子信號(hào)在隱孢子蟲的整個(gè)生命活動(dòng)中起著非常重要的作用,EF-h(huán)and蛋白很有可能成為今后隱孢子蟲病治療的一個(gè)藥物靶點(diǎn)。鑒于本文前面的討論,cgd5-820、cgd7-1840、cgd2-1300、cgd2-1060、cgd7-1260、cgd1-1370和cgd2-3990這7個(gè)蛋白很有可能在隱孢子蟲的生活史中起著關(guān)鍵的作用。尤其是cgd2-3990和cgd1-1370兩個(gè)蛋白,cgd2-3990很有可能與隱孢子蟲配子體的形成和作用有著密切的關(guān)系[14],而cgd1-1370作為Calcineurin的一個(gè)調(diào)節(jié)亞基,且已有研究證明Calcineurin B對(duì)免疫系統(tǒng)有明顯的刺激作用,是T細(xì)胞的活化過程必不可少的,在老鼠身上也證明了Calcineurin B的顯著抗癌效應(yīng),所以cgd1-1370很有可能成為隱孢子蟲病治療的藥物靶點(diǎn)[13],這7個(gè)蛋白將會(huì)成為今后深入研究的方向。

        [1]O'Donoghue PJ.Cr yptosporidiu m and Cr yptosporidiosis in man and animals[J].Int J Parasitol,1995,25(2):139-195.DOI:10.1016/0020-7519(94)E0059-V

        [2]Diao ZL,Yin ZH,Chen XH.The research progress of Cr yptosporidiosis[J].Chin J Intern M,2008,47(6):521-522.(in Chinese)刁宗禮,陰禎宏,陳小華.隱孢子蟲病研究進(jìn)展[J].中華內(nèi)科雜志,2008,47(6):521-522.

        [3]Abrahamsen MS,Templeton TJ,Eno moto S,etal.Co mplete genome sequence of the apicomplexan,Cr yptosporidiu m parvu m[J]. Science, 2004, 304: 441-445. DOI: 10.1126/science.1094786

        [4]Xu P,Wid mer G,Wang Y,etal.The genome of Cr yptosporidiu m ho minis[J].Nat ure,2004,431:1107-1112.DOI:10.1038/nat ure02977

        [5]Taylor DA,Sack JS,Maune JF,etal.Structure of a recombinant cal modulin from Drosophil a mel anogaster refined at 2.2-? resol ution[J].J Biol Chem,1991,266(32):21375-21380

        [6]Persechini A,Moncrief ND,Kretsinger RH.The EF-h(huán)and family of calciu m-modulated pr oteins[J].Trends Neur osci,1989,12(11):462-467.DOI:10.1016/0166-2236(89)90097-0

        [7]Francesco C,F(xiàn)ederica C,Claudio L.EF-h(huán)and protein dynamics and evolution of calciu m signal transduction:an NMR view[J].Biol Inorg Chem,2006,11:949-962.DOI:10.1007/s00775-006-0163-0

        [8]Griffit hs G,Ericsson M,Krijnse LJ,etal.Localization of the Lys,Asp,Glu,Leu tetrapeptide receptor to the Golgi co mplex and the inter mediate co mpart ment in ma mmalian cells[J].J Cell Biol,1994,127(6):1557-1574.DOI:10.1083/jcb.127.6.1557

        [9]Lewit-Bentley A,Réty S.EF-h(huán)and calciu m-binding proteins[J].Curr Opin Struct Biol,2000,10:637-643.DOI:10.1002/9780470015902.a(chǎn)0003056.pub2

        [10]Nagamune K,Moreno SN,Chini EN,etal.Calciu m regulation and signaling in apicomplexan parasites[J].Subcell Biochem,2008,47:70-81.

        [11]Kawasaki H,Nakayama S,Kretsinger RH.Classification and evol ution of EF-h(huán)and proteins[J].Biometals,1998,11:277-295.DOI:10.1023/A:1009282307967.

        [12]Schiebel E,Bor nens M.In search of a f unction for centrins[J].Trends Cell Biol,1995,5(5):197-201.DOI:10.1016/0962-8924(95)80011-5.

        [13]Li J,Jia ZG,Zhou WC,etal.Calcineurin regulator y subunit B is a unique calciu m sensor that regulates calcineurin in bot h calciu m-dependent and calciu m-independent manner[J].Pr oteins,2009,77:612-623.DOI:10.1002/prot.22474.

        [14]Rawlings DJ,Kaslo w DC.A novel 40-k Da membrane-associated EF-h(huán)and calciu m-binding protein in Pl asmodiu m f alcipar u m[J].J Biol Chem,1992,267(6):3976-3982.

        [15]Bill ker O,Lourido S,Sibley LD.Calciu m-dependent signaling and kinases in apico mplexan parasites[J].Cell Host Micr obe,2009,5(6):612-622.DOI:10.1016/j.cho m.2009.05.017.

        [16]Har per JF,Har mon A.Plants,sy mbiosis and parasites:a calciu m signalling connection[J].Nat Rev Mol Cell Biol,2005,6:555-566.DOI:10.1038/nr m1679.

        [17]Moreno SN,Doca mpo R.Calciu m regulation in protozoan parasites[J].Curr Opin Micr obiol,2003,6:359-364.DOI:10.1016/S1369-5274(03)00091-2.

        [18]Har mon AC,Gribskov M,Har per JF.CDPKs-a kinase for ever y Ca2+signal[J].Trends Plant Sci,2000,5:154-159.DOI:10.1016/S1360-1385(00)01577-6.

        [19]Ishino T,Orito Y,Chinzei Y,etal.A calciu m-dependent protein kinase regulates Pl asmodiu m ookinete access to the midgut epithelial cell[J].Mol Micr obiol,2006,59:1175-1184.DOI:10.1111/j.1365-2958.2005.05014.x.

        [20]Vaid A,Tho mas DC,Shar ma P.Role of Ca2+/cal modulin-Pf PKB signaling pat h way in er yt hr ocyte invasion by Pl asmodiu m f alcipar u m[J].Biol Chem,2008,283:5589-5597.DOI:10.1074/jbc.M708465200.

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