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        巨大革耳遺傳多樣性的ISSR分析*

        2012-09-19 11:18:36江玉姬謝寶貴劉新銳鄧優(yōu)錦陳東興
        中國食用菌 2012年6期

        江玉姬,謝寶貴,劉新銳,鄧優(yōu)錦,陳東興,朱 堅(jiān)

        (1.福建農(nóng)林大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院,福建 福州 350002;2.福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心,福建 福州 350002;3.福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院,福建 福州 350002)

        巨大革耳(Panus giganteus) 又名大杯傘、大杯蕈、大漏斗菌、豬肚菇、筍菇、大杯香菇等,隸屬真擔(dān)子菌門(Basidiomycota)、擔(dān)子菌綱 (Basidiomycetes)、多孔菌目(Polyporales)、多孔菌科(Polyporaceae)、革耳屬 (Panus)[1]。自然環(huán)境中夏、秋季節(jié)大量群生或叢生于林地腐枝層上,主要分布在我國的河北、山西、黑龍江、青海等地區(qū)。從自然界的生長習(xí)性和分布可以看出,巨大革耳(豬肚菇)是一種中高溫型的美味珍稀食用菌種類,菌肉肥厚,個(gè)體較大,味道鮮美,是一種很有發(fā)展前途的夏、秋季栽培食用菌[2]。人工栽培多進(jìn)行熟料袋栽,栽培方法與常規(guī)木腐生菌相同。但巨大革耳(豬肚菇)人工栽培歷史很短,目前栽培用種主要來源于野生資源的馴化和引種,存在著同種異名,同名異種的現(xiàn)象,給生產(chǎn)和育種帶來了混亂產(chǎn)生了嚴(yán)重的后果。本文應(yīng)用ISSR分子標(biāo)記對國內(nèi)不同地區(qū)收集或分離的9株巨大革耳進(jìn)行了分子遺傳多樣性研究,為巨大革耳菌種管理、遺傳資源的保護(hù)和充分利用、育種研究工作的開展等提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        1.1.1 供試菌種

        9株供試菌株,由福建食用菌株,質(zhì)資源保藏管理中心提供,試驗(yàn)編號及其它信息如表1所示。

        1.1.2 試劑

        20個(gè)ISSR引物為上海Sangon生物工程公司生產(chǎn);PCR kit、500 bp DNA Ladder Marker購自 TaKaRa公司,其它試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.1.3 供試培養(yǎng)基

        斜面固體培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂20 g,水1 000 mL,pH值自然。

        液體培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g,水1 000mL,pH值自然。

        表1 供試巨大革耳菌株及來源

        出菇培養(yǎng)基:棉籽殼85%、麥麩10%、玉米粉3%、碳酸鈣或石膏2%,含水量65%~70%,pH6.0。

        1.1.4 巨大革耳菌絲體制備

        供試菌株在PDA試管斜面培養(yǎng)基上培養(yǎng)7 d~10 d后,轉(zhuǎn)接到新鮮PDA試管斜面培養(yǎng)基上培養(yǎng)至滿管,用接種耙耙碎菌塊,接入250 mL三角瓶液體培養(yǎng)基中,每個(gè)菌株各接2瓶,置于120 r·min-1搖床上26℃恒溫培養(yǎng)10 d,用紗布過濾,蒸餾水沖洗干凈,濾紙吸干水分,稱取1 g菌絲用濾紙包好,保存于-20℃下備用。

        1.1.5 DNA提取

        取1 g菌絲放入研缽,加入液氮迅速研磨成粉末,轉(zhuǎn)入7 mL的離心管,采用CTAB法提取DNA,-20℃保存?zhèn)溆茫唧w操作參考文獻(xiàn)[3]、[4]。

        1.1.6 ISSR擴(kuò)增

        ISSR 反應(yīng)體系 25 μL:模板 DNA 1.2 ng·μL-1,引物0.4 μmol·L-1,dNTPs 0.2 mmol·L-1,MgCl22 mmol·L-1,Taq DNA聚合酶2 U,PCR緩沖液1×,具體操作參考文獻(xiàn)[3]、 [4],將重復(fù)性好、強(qiáng)度較高、清晰可辨無爭議、能體現(xiàn)菌株間差異的條帶確認(rèn)為標(biāo)記條帶,進(jìn)行相應(yīng)的統(tǒng)計(jì)和分析。

        1.1.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

        ISSR擴(kuò)增產(chǎn)物以0、1統(tǒng)計(jì)建立ISSR數(shù)據(jù)庫。將相同引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的標(biāo)記條帶確認(rèn)為同一條帶,擴(kuò)增陽性記錄為“1”,擴(kuò)增陰性記錄為“0”,利用SPSS10.0分析軟件的Jaccard方法計(jì)算樣品間的遺傳相似性,用類平均法(UPGMA) 對ISSR統(tǒng)計(jì)形成“0/1”表型數(shù)據(jù)矩陣進(jìn)行聚類分析,生成遺傳距離聚類圖[5,6]。

        1.1.8 出菇實(shí)驗(yàn)

        栽培出菇實(shí)驗(yàn)參考劉斌等[7]的方法。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ISSR結(jié)果與分析

        從20個(gè)引物篩選出4個(gè)多態(tài)性好的引物(表2),擴(kuò)增的結(jié)果見圖1。

        表2 ISSR引物序列

        圖1-1 引物ISSR5和ISSR12對巨大革耳菌株ISSR-PCR擴(kuò)增圖譜

        圖1-2引物ISSR13和ISSR15的擴(kuò)增電泳圖

        從圖1中可知,4個(gè)引物對9個(gè)菌株擴(kuò)增的片段大小在1.0 kb~3.0 kb之間,各個(gè)引物擴(kuò)增的位點(diǎn)數(shù)分別為7、8、5、7,平均位點(diǎn)數(shù)為6.25;平均每個(gè)引物產(chǎn)生個(gè)5.75個(gè)多態(tài)性條帶。ISSR共擴(kuò)增出27個(gè)位點(diǎn),多態(tài)性條帶總共為23,多態(tài)率為85.19%。經(jīng)過軟件處理后,建立樹狀圖 (圖 2)。

        圖2 9個(gè)菌株的ISSR聚類樹狀圖

        從圖2可以看出,5號、6號、7號、9號菌株聚為一類,它們的相異系數(shù)為0,可能為同種異名;3號、4號菌株及1號、8號菌株各聚為一類,2號菌株單獨(dú)一類;2號菌株與其它8個(gè)菌株的遺傳距離很遠(yuǎn),3號、4號、1號、8號菌株與5號、6號、7號、9號菌株有一定的遺傳距離。當(dāng)相異系數(shù)D為0.20水平上,9個(gè)菌株聚為2類:Ι類包括2號菌株;Π類包括1號、3號、4號、5號、6號、7號、8號、9號菌株。2號菌株與其它8個(gè)菌株的遺傳距離很遠(yuǎn),故對9個(gè)菌株進(jìn)行了栽培出菇實(shí)驗(yàn),以觀察子實(shí)體的形態(tài)是否有差異。

        2.2 子實(shí)體形態(tài)分析

        根據(jù)栽培出菇實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,C.m0002菌株的子實(shí)體(圖3)明顯不同于其它菌株,酷似多脂鱗傘(黃傘),是同名異種,單獨(dú)歸為Ι類;其它8個(gè)菌株均為巨大革耳,子實(shí)體的形態(tài)較一致,部分菌株的子實(shí)體形態(tài)見圖4、圖5和圖6,歸為第Π類。子實(shí)體特征分析的結(jié)果與ISSR分類的結(jié)果吻合。

        圖3 C.m002菌株的子實(shí)體圖

        圖4 C.m003菌株的子實(shí)體圖

        圖5 C.m001菌株的子實(shí)體圖

        圖6 C.m007菌株的子實(shí)體圖

        3 討論

        近年來,不斷快速發(fā)展的DNA分子標(biāo)記技術(shù)越來越多的被應(yīng)用在研究種質(zhì)資源的多樣性以及分子輔助遺傳育種上,顯示出了極大的優(yōu)越性。它不僅能快速的獲得分析結(jié)果,而且其結(jié)果不受外界環(huán)境因素和生長發(fā)育階段的影響;所以,分子標(biāo)記已經(jīng)成為分子水平的種質(zhì)資源親緣關(guān)系及檢測種質(zhì)資源多樣性和品種鑒定的有效工具[8]。

        ISSR是由 Zietkiewi CZ等[9]創(chuàng)建的一種簡單重復(fù)序列間擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記。ISSR技術(shù)與常規(guī)PCR有相同的反應(yīng)條件,該技術(shù)克服了限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性RFLP標(biāo)記、SSR標(biāo)記和隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo)記(RAPD)的技術(shù)限制,具有操作簡單、引物擴(kuò)增的結(jié)果重現(xiàn)性較好、模板DNA用量少等優(yōu)點(diǎn),且不需要知道基因組序列,可以檢測基因組許多位點(diǎn)的差異[6-8],已廣泛應(yīng)用于動植物種質(zhì)鑒定、遺傳作圖和基因定位,尤其在分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)貧乏的作物研究中顯示出極大的優(yōu)勢[10,11]。但在食用菌中的應(yīng)用還不多,在香菇[8]、杏鮑菇[12]、金針菇[13]、松口蘑及花鵝膏菌[11]、天麻[14]、側(cè)耳屬[10]等品種的鑒定及親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用已有報(bào)道,但用ISSR技術(shù)分析巨大革耳菌株間的親遠(yuǎn)關(guān)系目前沒有相關(guān)的文獻(xiàn)報(bào)道。

        9個(gè)菌株的 ISSR分析中,5號(C.m0005)、6號(C.m0006)、7號 (C.m0007)、9號 (C.m0009) 的遺傳距離為零,結(jié)合子實(shí)體的形態(tài)特征可認(rèn)定它們?yōu)橥N內(nèi)的菌株。C.m0003、 C.m0004、 C.m0005、 C.m0006、 C.m0007、 C.m0008、C.m0009七個(gè)栽培菌株分別來自武漢、湖北嘉魚、福州、三明4個(gè)不同的地方,其中C.m0008與其它6個(gè)菌株有一定的遺傳距離,說明有一定的遺傳多態(tài)性,但不豐富。而C.m0001和C.m0002菌株與其它7個(gè)菌株間的遺傳距離較遠(yuǎn)。出菇實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,C.m0002菌株的子實(shí)體似多脂鱗傘(黃傘),是同名異種;其它8個(gè)菌株均為巨大革耳。本研究的結(jié)果以及ISSR標(biāo)記在香菇、杏鮑菇、金針菇、側(cè)耳屬等的應(yīng)用,說明ISSR分子標(biāo)記在食用菌的種質(zhì)資源遺傳多樣性、親緣關(guān)系分析中的應(yīng)用是可信的。本研究結(jié)果也將為巨大革耳的生產(chǎn)和育種以及種菌管理提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

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