黃慧雅,蘇震,薛向陽,謝媚媚,余業(yè)成
(溫州醫(yī)學(xué)院,浙江 溫州 325000,1.附屬第一醫(yī)院 腎內(nèi)科;2.微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室;3.仁濟學(xué)院 臨床醫(yī)學(xué)系)
腎間質(zhì)纖維化是各種腎臟疾病發(fā)展到終末期腎衰的公共通路。腎臟纖維化牽涉到細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrixc,ECM)的過度沉積和上皮間質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)分化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)過程。
microRNA(簡稱miRNA)是近年來新發(fā)現(xiàn)的長22個核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈小RNA分子,主要作用是抑制基因表達(dá),在轉(zhuǎn)錄水平上保證基因表達(dá)的準(zhǔn)確性。研究表明miRNAs能抑制三分之一以上的人類基因[1]。miRNAs在心臟[2-3]、肺[4]、肝臟[5]、皮膚[6-7]中作為組織纖維化的調(diào)節(jié)因子,在腎臟纖維化中,miRNAs通過轉(zhuǎn)化生長因子(transforming growth factor-β,TGF-β)信號通路來調(diào)節(jié)腎小管上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化[8-9]。目前已有研究報道在肝臟、心臟、肺、皮膚纖維化過程中,miR-29c表達(dá)均下調(diào)[2,5-6,10-11]。我們的前期研究通過建立單側(cè)輸尿管梗阻(UUO)大鼠模型及5/6大鼠腎大部切除模型,發(fā)現(xiàn)隨腎組織纖維化的進(jìn)展,miR-29c表達(dá)逐漸下調(diào)。
本研究中我們采用TGF-β1誘導(dǎo)腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)分化,觀察miR-29c及膠原I(Col I)表達(dá)變化,通過脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染的方式使miR-29c過表達(dá),檢測轉(zhuǎn)染的miR-29c對ECM的影響。
1.1 材料 大鼠腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞株(NRK-49F,美國模式培養(yǎng)物集存庫),含10%胎牛血清(FBS)的DMEM/F12培養(yǎng)基(GIBICO公司,美國),轉(zhuǎn)染試劑LipofectamineTM2000 Reagent(Invitrogen公司,美國),TGF-β1(R&D公司,美國),小鼠抗大鼠α-SMA單克隆抗體(Abcam公司,美國),兔抗大鼠Col I單克隆抗體(Merk公司,德國),小鼠抗大鼠β-actin單克隆抗體(Santa Cruz公司,美國),山羊抗小鼠IgG(Abcam公司,美國),山羊抗兔IgG(Santa Cruz公司,美國),Trizol reagent(Invitrogen公司,美國)。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及TGF-β1誘導(dǎo)轉(zhuǎn)分化:大鼠NRK-49F細(xì)胞用含10% FBS的DMEM/F12培養(yǎng)液,置于5%CO2、37 ℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),以1:3傳代。待細(xì)胞80%融合時,0.1% BSA培養(yǎng)16 h后,用TGF-β1刺激細(xì)胞轉(zhuǎn)分化:①用不同濃度(0.1、1、2、5、10 ng/mL)TGF-β1對NRK-49F進(jìn)行刺激,并且設(shè)空白對照組,各組細(xì)胞分別培養(yǎng)24 h;②用TGF-β12 ng/mL對NRK-49F進(jìn)行刺激,分別在培養(yǎng)0、6、12、24 h后收集細(xì)胞。
1.2.2 化學(xué)合成的miR-29c mimics轉(zhuǎn)染細(xì)胞:miRNA mimics是化學(xué)合成的miRNA,通過LipofectminTM2000脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染的方式將其轉(zhuǎn)染進(jìn)入細(xì)胞。轉(zhuǎn)染前1 d細(xì)胞傳代鋪板,待細(xì)胞生長至60%~80%,將LipofectminTM2000加入培養(yǎng)液中靜置5 min,再與miR-29c mimics/inhibitor(1:1)混勻后靜置15 min,將混合液加入細(xì)胞中8 h,換用0.1% BSA的DMEM/F12培養(yǎng)液饑餓8 h后收取細(xì)胞。分組如下:空白對照組、轉(zhuǎn)染miR-29c mimics 25 nmol/L組、mimics 50 nmol/L組、mimics 75 nmol/L組、miR-29c mimics陰性對照組、miR-29c inhibitor組、miR-29c inhibitor陰性對照組。
1.2.3 轉(zhuǎn)染miR-29c mimics后TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞株:按1.2.2轉(zhuǎn)染步驟將miR-29c mimics轉(zhuǎn)染入NRK-49F細(xì)胞中,8 h后換用0.1% BSA的DMEM/F12培養(yǎng)液再饑餓8 h,加入2 ng/mL TGF-β1刺激24 h后收集各組細(xì)胞。分:空白對照組、TGF-β1組、miR-29c mimics組、miR-29c mimics+TGF-β1組、miR-29c mimics陰性對照組、miR-29c mimics陰性對照+TGF-β1組、miR-29c inhibitor組、miR-29c inhibitor+TGF-β1組、miR-29c inhibitor陰性對照+TGF-β1組。miR-29c mimics及inhibitor濃度均為50 nmol/L。
1.2.4 Realtime PCR法檢測各組細(xì)胞miRNA、Col I和膠原III(ColIII)、纖連蛋白(FN)、α-平滑肌肌動蛋白(α-SMA)mRNA的表達(dá):采用Trizole一步法抽提總RNA。取1μL RNA溶液,紫外分光光度計分別測波長260 nm和280 nm的光密度(OD)值,并計算RNA的濃度。
cDNA反應(yīng)條件:70 ℃ 10 min 預(yù)變性,42 ℃60 min,70 ℃ 15 min,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,反應(yīng)產(chǎn)物用DEPC水稀釋2.5倍,于-20 ℃保存。以cDNA為模板,進(jìn)行Realtime PCR擴增。PCR反應(yīng)條件:預(yù)變性95 ℃ 2 min,變性95 ℃ 30 s,退火60 ℃30 s,40個循環(huán)。至少重復(fù)6次。
Realtime PCR數(shù)據(jù)分析采用定量PCR中的相對定量法,記錄各樣本熒光動力曲線圖和溶解曲線圖,記錄每個反應(yīng)管中的熒光信號到達(dá)所設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)即Ct值,目的基因的相對量=2-△△Ct,在該公式中,△△Ct=[Ct目的基因(待測樣品)-Ct內(nèi)參(待測樣品)]-Ct目的基因(校正樣品)-Ct內(nèi)參(校正樣品)]。
1.2.5 Western blot法檢測細(xì)胞α-SMA、Col I的表達(dá):收獲細(xì)胞,裂解后抽提總蛋白,BCA法測定蛋白濃度,聚丙烯酰胺凝膠電泳,上樣量50μg,轉(zhuǎn)膜后加入單抗[α-SMA單克隆抗體(1:250)、Col I單克隆抗體(1:1000)、β-actin單克隆抗體(1:1000)]4 ℃孵育過夜,洗滌,加入HRP標(biāo)記的二抗[辣根過氧化酶標(biāo)記的IgG(1:2000)]孵育2 h,化學(xué)發(fā)光法曝光。各組實驗至少重復(fù)3次。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理方法 采用SPSS16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。組間比較采用單因素方差分析,兩組均數(shù)之間采用t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 TGF-β1對NRK-49F細(xì)胞中Col I、Col III、α-SMA、FN mRNA和α-SMA蛋白的影響 不同濃度(0.1、1、2、5、10 ng/mL)TGF-β1刺激NRK-49F 24 h后,Realtime PCR分析Col I、ColIII、α-SMA、FN mRNA表達(dá),結(jié)果顯示,與空白對照組比較,2、5、10 ng/mL TGF-β1濃度組其ColI、ColIII、α-SMA mRNA表達(dá)明顯上調(diào),并呈濃度依賴性(P<0.05)。10 ng/mL TGF-β1濃度組FN表達(dá)上調(diào)(P<0.05),見表1。Western blot法檢測結(jié)果提示隨著TGF-β1刺激NRK-49F的濃度增加,α-SMA蛋白表達(dá)逐漸上調(diào),呈濃度依賴性增高(見圖1A)。TGF-β1在2 ng/mL濃度下,Col I及α-SMA蛋白表達(dá)均明顯升高(P<0.05,見圖2A-B)。2 ng/mL濃度TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞0、6、12、24 h,ColI、ColIII、α-SMA、FN mRNA表達(dá)上調(diào)(P<0.05,見表2);且α-SMA蛋白表達(dá)上調(diào),呈時間依賴性(見圖1B)。在TGF-β1刺激24 h時,ColI、ColIII、FN及α-SMA蛋白上調(diào)最為顯著。
表1 Realtime PCR檢測不同濃度TGF-β1刺激細(xì)胞24 h后ColI、ColIII、FN、α-SMA mRNA及miR-29c表達(dá)變化(n=4±s)
表1 Realtime PCR檢測不同濃度TGF-β1刺激細(xì)胞24 h后ColI、ColIII、FN、α-SMA mRNA及miR-29c表達(dá)變化(n=4±s)
與0 ng/mL組比:aP<0.05,bP<0.01
TGF-β1濃度(ng/mL)10 1.43±0.40b 3.08±0.94b 2.55±0.81a 1.51±0.32a 0.14±0.20b 0 0.1 1.13±0.17 1.61±0.67 1.04±0.06 0.98±0.12 1.05±0.25 1 2 5 ColI ColIII α-SMA FN miR-29c 1±0 1±0 1±0 1±0 1±0 1.21±0.24a 2.15±0.41 1.35±0.26a 1.21±0.18 0.59±0.30 1.58±0.75a 2.04±0.59b 1.8±0.51a 1.7±0.56 0.53±0.24b 1.53±0.39b 2.39±0.61b 1.82±0.27b 1.64±0.71 0.32±0.12b
表2 Realtime PCR檢測2 ng/mL TGF-β1刺激細(xì)胞不同時間后ColI、ColIII、FN、α-SMA mRNA及miR-29c表達(dá)變化(n=4±s)
表2 Realtime PCR檢測2 ng/mL TGF-β1刺激細(xì)胞不同時間后ColI、ColIII、FN、α-SMA mRNA及miR-29c表達(dá)變化(n=4±s)
與0 h組比:aP<0.05,bP<0.01
TGF-β1刺激時間(h)0 6 ColI ColIII α-SMA FN miR-29c 1±0 1±0 1±0 1±0 1±0 2.98±0.32 2.76±1.03 3.77±0.66 2.05±0.64 0.55±0.20b 12 4.01±0.05 2.97±1.18b 3.97±1.00b 4.02±1.50b 0.4±0.20b 24 4.14±1.5b 11.37±2.79a 4.78±0.75b 7.00±2.41b 0.51±0.24b
圖1 TGF-β1刺激NRK-49F后α-SMA表達(dá)變化
結(jié)果顯示,2 ng/mL TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞24 h后,促進(jìn)NRK-49F轉(zhuǎn)分化為肌成纖維細(xì)胞,促進(jìn)ECM合成及α-SMA表達(dá)上調(diào)。
2.2 TGF-β1對NRK-49F細(xì)胞中miR-29c的影響 不同濃度 TGF-β1(0、0.1、1、2、5、10 ng/mL)刺激NRK-49F細(xì)胞24 h,Realtime PCR分析結(jié)果顯示,隨著TGF-β1濃度增加,細(xì)胞內(nèi)miR-29c表達(dá)逐漸下降。TGF-β1濃度為2 ng/mL開始,同對照組相比差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見表1)。
2 ng/mL TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞0、6、12、24 h后,Realtime PCR分析結(jié)果顯示,隨著TGF-β1作用時間的延長,細(xì)胞內(nèi)miR-29c表達(dá)下調(diào),在TGF-β1作用6 h開始,同對照組相比差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見表2)。
2.3 過表達(dá)miR-29c后ColI表達(dá)下降 運用化學(xué)合成的miR-29c mimics(使miR-29c過表達(dá)),用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染的方法,轉(zhuǎn)染入NRK-49F細(xì)胞株。Realtime PCR分析顯示,在轉(zhuǎn)染入miR-29c mimics 8 h后,與空白對照組相比,NRK-49F細(xì)胞株中miR-29c的表達(dá)水平至少增加了243倍。在NRK-49F細(xì)胞株中過表達(dá)miR-29c導(dǎo)致了ColI、ColIII mRNA表達(dá)下調(diào),與miR-29c mimics呈明顯的濃度依賴性(P<0.05,見表3)。50 nmol/L miR-29c mimics轉(zhuǎn)染NRK-49F細(xì)胞株后,ColI蛋白表達(dá)較空白對照組下調(diào),提示了在miR-29c mimics作用下,ColI轉(zhuǎn)錄減少(見圖2A)。但是抑制miR-29c(miR-29c inhibitor 50 nmol/L)后,NRK-49F細(xì)胞株中,ColI的mRNA表達(dá)無明顯變化(P>0.05,見表3),而其蛋白表達(dá)升高(見圖2B)。
2.4 在NRK-49F中miR-29c與TGF-β1聯(lián)合作用對ColI、α-SMA表達(dá)的作用 TGF-β1能刺激NRK-49F細(xì)胞株表達(dá)ColI、α-SMA(P<0.05,見表1-2、圖2)。而在轉(zhuǎn)染miR-29c mimics 50 nmol/L后,用2 ng/mL TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞株24 h,發(fā)現(xiàn)ColI及α-SMA mRNA及蛋白表達(dá)(與對照組相比)不升高(P>0.05,見表4、圖2A)。
表3 轉(zhuǎn)染不同濃度miR-29c mimics/inhibitor對ColI及ColIII mRNA的影響(n=4±s)
表3 轉(zhuǎn)染不同濃度miR-29c mimics/inhibitor對ColI及ColIII mRNA的影響(n=4±s)
(A:空白對照組;B:25nmol/L mimics組;C:50nmol/L mimics組;D:75nmol/L mimics組;E:mimics陰性對照組;F:50 nmol/L inhibitor組;G:inhibitor陰性對照組)與A組比:aP<0.05,bP<0.01
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表4 轉(zhuǎn)染不同濃度miR-29c mimics/inhibitor后加入2 ng/mL TGF-β1刺激24 h對ColI及ColIII mRNA的影響(n=4±s)
表4 轉(zhuǎn)染不同濃度miR-29c mimics/inhibitor后加入2 ng/mL TGF-β1刺激24 h對ColI及ColIII mRNA的影響(n=4±s)
(A:空白對照組;B:25nmol/L mimics+TGF-β1組;C:50nmol/L mimics+TGF-β1組;D:75nmol/L mimics+TGF-β1組;E:mimics陰性對照+TGF-β1組;F:50nmol/L inhibitor+TGF-β1組;G:inhibitor陰性對照+TGF-β1組)與A組比:aP<0.05,bP<0.01
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圖2 轉(zhuǎn)染 miR-29c mimics/inhibitor對TGF-β1促轉(zhuǎn)分化的作用
腎間質(zhì)纖維化是以腎小管基底膜的增厚和間質(zhì)成分如I型、III型、IV膠原和FN的增多、基質(zhì)的堆積為特征。表達(dá)α-SMA的肌成纖維細(xì)胞不僅是ECM的主要來源,也是腎臟疾病進(jìn)展過程中的重要標(biāo)志[12]。TGF-β1促進(jìn)腎臟膠原蛋白的產(chǎn)生和沉積,促使腎小管上皮細(xì)胞和腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞向肌成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)分化,是腎臟纖維化啟動及進(jìn)展的主要細(xì)胞因子。肌成纖維細(xì)胞是導(dǎo)致腎臟纖維化的關(guān)鍵細(xì)胞,它具有很強的合成ECM能力,在腎臟纖維化中起主要作用。TGF-β1促使NRK-49F細(xì)胞株中ColI、ColIII、FN及α-SMA表達(dá)升高,并具有促進(jìn)NRK-49F細(xì)胞株增殖的作用,具有劑量依賴及時間依賴效應(yīng)[13-14]。
miR-29家族成員包括miR-29a、miR-29b-1、miR-29b-2和miR-29c[15]。在大鼠心、肝、脾、肺、腦、腎組織中均發(fā)現(xiàn)miR-29家族成員(miR-29a/b/c)表達(dá),尤其在大腦、肺、心及腎臟中miR-29c表達(dá)很高[2]。miR-29涉及到肺間質(zhì)上皮轉(zhuǎn)分化、骨骼肌細(xì)胞分化,抑制心肌纖維化及系統(tǒng)性硬化[2,6,15-18]。在鼻咽癌及心肌梗死導(dǎo)致的心臟纖維化中,miR-29的下調(diào)同膠原增加呈負(fù)相關(guān)[2,16]。miR-29家族能夠抑制ECM的產(chǎn)生[10,16,19-22]。miR-29家族可在肝臟星形細(xì)胞及心臟成纖維細(xì)胞中表達(dá),且均在TGF-β1的刺激下表達(dá)下降[22-23]。但是,目前尚鮮有關(guān)于miR-29家族(miR-29a/b/c)在腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞內(nèi)作用的研究報道。
本課題組前期用莖環(huán)Realtime PCR檢測5/6大鼠腎大部切除模型及UUO模型的腎組織中的miRNAs表達(dá)變化,用高通量測序技術(shù)(Solexa測序)檢測在術(shù)后1 d和術(shù)后3 d處死的UUO大鼠手術(shù)側(cè)與非手術(shù)側(cè)腎臟組織中miRNAs的表達(dá),均發(fā)現(xiàn)隨著腎間質(zhì)纖維化的進(jìn)展,miR-29c表達(dá)明顯下降,而miR-29a/b在腎間質(zhì)纖維化中變化不顯著,因此,我們在本研究中選用miR-29c作為研究對象。
查閱腎臟纖維化過程中與ECM產(chǎn)生積聚相關(guān)的一系列基因,它們均包含有多個miR-29c的種子序列相對應(yīng)的堿基(見圖3),說明miR-29c的下調(diào)同腎臟纖維化相關(guān)。本研究提示在TGF-β1誘導(dǎo)NRK-49F細(xì)胞纖維化過程中miR-29c表達(dá)下調(diào),miR-29c mimics通過有效抑制TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞株ColI表達(dá)起到抗纖維化作用,表明miR-29c為抑制纖維化的基因;人工合成的miR-29c mimics轉(zhuǎn)染NRK-49F細(xì)胞株能有效提高miR-29c表達(dá)量從而抑制ColI表達(dá)。
圖3 miR-29與其靶基因相對應(yīng)的種子序列
van Rooij等[2]人在心肌纖維化模型中發(fā)現(xiàn)miR-29家族表達(dá)下調(diào),構(gòu)建熒光素酶報告基因載體證實編碼ColI、ColIII及FN等多種ECM成分的mRNAs是miR-29家族的靶基因。Ogaw等將miR-29b的前體轉(zhuǎn)染到未激活的肝星狀細(xì)胞中,能夠顯著抑制ColI的表達(dá)[23]??梢?,ColI為miR-29c的靶基因,miR-29c能抑制其表達(dá)。在腎間質(zhì)纖維化發(fā)生時或發(fā)生前,維持細(xì)胞的miR-29表達(dá)可抑制或延緩纖維化進(jìn)展。因此,化學(xué)合成的miRNA mimics通過維持miR-29c的表達(dá)從而延緩或抑制纖維化過程;miR-29c對靶基因的轉(zhuǎn)錄及翻譯均有抑制作用,化學(xué)合成的單鏈RNA分子miR-29c inhibitor轉(zhuǎn)染至細(xì)胞后結(jié)合到成熟的miRNA上,特異性抑制miR-29c功能,使膠原蛋白翻譯增加,而不影響其轉(zhuǎn)錄。
總之,本研究發(fā)現(xiàn)miR-29c能作用于腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞,使得ColI表達(dá)下調(diào)。顯示了miR-29c在腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞中有抗纖維化作用:miR-29c mimics通過有效抑制TGF-β1刺激NRK-49F細(xì)胞株ColI表達(dá)起到抗纖維化作用,為治療腎間質(zhì)纖維化提供了一個新的靶點。
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