侯睿智,安治國(guó),魏 君,毛靜濤,侯治富*
(1.吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院,吉林 長(zhǎng)春 130033;2.北京龍邁達(dá)科技有限公司,北京 100176)
大腸癌易感基因hMLH1、hMSH2的篩查
侯睿智1,安治國(guó)1,魏 君1,毛靜濤2,侯治富1*
(1.吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院,吉林 長(zhǎng)春 130033;2.北京龍邁達(dá)科技有限公司,北京 100176)
目的 探討hMLH1、hMSH2基因多態(tài)性與大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)的研究。方法采用大樣本隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn),運(yùn)用PCR和DNA直接測(cè)序方法,篩查外周血單個(gè)核細(xì)胞DNAhMLH1、hMSH2基因多態(tài)性。結(jié)果大腸癌組hMLH1-exon12 1151T→A的突變陽性率為12.20%,與對(duì)照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05);而hMSH2-exon1 IVS1+9C→G的突變陽性率為46.70%,與對(duì)照組(33.33%)相比差異顯著(P<0.05)。在各年齡組間,hMLH1-exon12、hMLH1-exon12突變無顯著性差異(P>0.05)。危險(xiǎn)性分析表明,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生大腸癌的相對(duì)危險(xiǎn)性為無基因突變組的1.75倍,若不攜帶基因突變,其腸癌發(fā)病率將降低42.9%;若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生,則大腸癌的發(fā)病率將降低20%。結(jié)論hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變可作為大腸癌發(fā)病的危險(xiǎn)因素,并可作為檢測(cè)指標(biāo)。
大腸癌;多態(tài)性;hMSH2
(ChinJLabDiagn,2012,16:0049)
hMSH 2基因位于染色體區(qū)域2p 21,在遺傳連鎖分析中,是最早被確定的影響遺傳性非息肉性大腸癌(HNPCC)綜合征的一個(gè)重要的候選基因。其編碼產(chǎn)物hMSH 2蛋白與hMSH 6或hMSH 3形成異二聚體,并以異二聚體復(fù)合物的形式識(shí)別、結(jié)合DNA復(fù)制中的錯(cuò)誤位點(diǎn),借以消除子代序列中的錯(cuò)誤,使DNA復(fù)制按照母模板序列正常復(fù)制。
hMLH1基因位于染色體3p 21-23,與hMSH 2基因一樣與HNPCC有關(guān)。其基因編碼產(chǎn)物hMLH1蛋白本身無酶活性,與hMLH3,hPMS2或hPMS1形成異二聚體,借以結(jié)合其他的DNA修復(fù)蛋白。
早期的研究表明,hMSH2基因的16個(gè)外顯子和hMLH1基因的19個(gè)外顯子都能發(fā)生致病性突變。目前尚沒有關(guān)于這兩個(gè)基因致病性突變、或是多態(tài)性的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。在本項(xiàng)研究中,試圖通過大樣本隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn),探索在大腸癌中這種突變的致病性或致病危險(xiǎn)性。
1.1 患者選擇與分組150例大腸癌患者均為2007年-2009年吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院住院病例。其中,男性86例,女性64例;平均年齡為49.5歲。診斷標(biāo)準(zhǔn)采用全國(guó)大腸癌病理研究協(xié)作組2002年制定的《全國(guó)大腸癌病理研究統(tǒng)一規(guī)范》。另選取150例健康體檢者作為對(duì)照,其中男性79例,女性71例;平均年齡47歲。
1.2 去靜脈全血,分離單個(gè)核細(xì)胞提取DNA,用QIAGEN旋轉(zhuǎn)柱純化樣本。
1.3 PCR擴(kuò)增目的基因片段由寶生物工程(大連)有限公司合成引物。hMLH1-exon12上游引物5′-ACAGACTTTGCTACCAGGACTTG-3′,下 游引 物 5′-TGTCTTATCCTCTGTGACAATGG-3′。hMSH2-exon1上游引物 5′-TCGCGCATTTTCTTCAACC-3′,下 游 引 物 5′-GTCCCTCCCCAGCACGC-3′。PCR循環(huán)參數(shù)為:充分變性95 ℃、5 mins,變性95℃、40s,退火55℃、40s,延伸72℃、60s。35個(gè)循環(huán),再充分延伸72℃、5mins。經(jīng)瓊脂糖電泳鑒定PCR產(chǎn)物。
1.4 DNA序列測(cè)定PCR反應(yīng)管內(nèi)加入1μl的3M醋酸鈉,1μl EDTA和25μl無水乙醇,吹打混合均勻。室溫放置15-30min,12 000rpm,4℃15-20min離心,小心吸棄溶液,加入70%的乙醇漂洗,12 000rpm,4℃8-10min離心,再次加入70%的乙醇漂洗,上述條件離心,開蓋閉光晾置,至殘余酒精徹底揮發(fā)干凈,使PCR產(chǎn)物純化。加入10μl hidi(甲酞胺),95℃變性2-3min,立即冰浴,即可上機(jī)。比較在測(cè)序圖上的相應(yīng)堿基序列峰型,如果出現(xiàn)峰型重疊,根據(jù)峰型的顏色、波幅,判定置換的堿基。
1.5 統(tǒng)計(jì)方法采用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件,對(duì)hMSH2基因IVS1+9C→G、hMLH1基因1151T→A多態(tài)性進(jìn)行危險(xiǎn)度(Risk)分析和等級(jí)相關(guān)分析。
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果對(duì)150例健康體檢者、150例大腸癌患者外周血單個(gè)核細(xì)胞DNA進(jìn)行hMLH1-exon12、hMSH2-exon1 擴(kuò) 增 后,分 別 在 216bp 和281bp處獲得了擴(kuò)增產(chǎn)物。其中有147例健康體檢者、82例大腸癌標(biāo)獲得hMLH1-exon12擴(kuò)增出結(jié)果;126例健康體檢者、90例大腸癌標(biāo)本獲得hMSH2-exon1擴(kuò)增出結(jié)果。
2.2 DNA序列分析結(jié)果對(duì)147例健康體檢者和82例大腸癌患者h(yuǎn)MLH1-exon12擴(kuò)增PCR產(chǎn)物進(jìn)行DNA序列分析(結(jié)果見表1,2)。
統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,大腸癌組的突變陽性率為12.20%,與對(duì)照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05)。
Tab.1 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer patients
Tab.2 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer of different ages
在各年齡組間,hMLH1-exon12 1151T→A突變陽性率的Kendall等級(jí)相關(guān)分析表明,無顯著性差異,χ2近似于零,P>0.05)。
對(duì)126例健康體檢者和90例大腸癌患者h(yuǎn)MSH2-exon1擴(kuò)增PCR產(chǎn)物進(jìn)行DNA序列分析(結(jié)果見表3,4)。
Tab.3 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer patients
結(jié)果表明,大腸癌組的突變陽性率為46.70%,與對(duì)照組(33.33%)相比差異顯著(P<0.05)。
危險(xiǎn)性分析表明,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生大腸癌的相對(duì)危險(xiǎn)性(OR)為無基因突變組的1.75倍;在對(duì)照組中,若不攜帶基因突變,其腸癌發(fā)病率將降低42.9%(特異危險(xiǎn)性百分比AR%);若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生,則大腸癌的發(fā)病率將降低20%(人群特異危險(xiǎn)性百分比PAR%)。
Tab.4 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer of different ages
在各年齡組間,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變陽性率的Kendall等級(jí)相關(guān)分析表明,無顯著性差異(χ2=0.139,P>0.05)。
大腸癌(Colorectal cancer,CRC)是全球第三個(gè)最常見的癌癥,位居肺癌和乳腺癌癌癥之后。60%發(fā)生在較發(fā)達(dá)地區(qū)。按年齡標(biāo)準(zhǔn)化率和累計(jì)計(jì)算,0-74歲人群中大腸癌的發(fā)病率和死亡率有明顯的地理變異。在世界各地,捷克發(fā)病率最高(43/10萬),非洲(3.6/10萬,除南非)和中南亞(4.5/10萬)發(fā)病率最低。歐洲CRC死亡率最高,中非地區(qū)死亡率最低。
根據(jù)中國(guó)衛(wèi)生部2002年的報(bào)告,結(jié)直腸癌的發(fā)病率已由70年代的第6位升至90年代的第3位,并且年死亡率上升至10.25/10萬,在世界范圍內(nèi)處于較低水平[1-4]。
大腸癌的確切病因仍不清楚,隨著人們對(duì)家族性腺瘤性息肉病、遺傳性非息肉性大腸癌認(rèn)識(shí)的深入,追尋遺傳標(biāo)志篩查大腸癌成為當(dāng)今的熱點(diǎn)。本課題組的前期研究也表明,大腸癌p53基因突變率為44%,并于ras基因協(xié)同突變[5,6]。揭示了大腸癌發(fā)生演變中的遺傳因素的作用。
關(guān)于MMR基因突變,國(guó)內(nèi)外有較多的文獻(xiàn)報(bào)道。特別是在遺傳性非息肉性結(jié)直腸癌(hereditary nonpolyposis colorectal cancer,HNPCC)的研究中,己有大量的錯(cuò)配修復(fù)基因突變資料的積累。在HNPCC中絕大多數(shù)的腫瘤是由hMSH2和hMLH1基因的胚系突變引起的,其中hMSH2基因的突變占31%,hMLH1占33%。在散發(fā)性結(jié)腸癌和胃癌中,己報(bào)道的hMLH1基因的突變(42%),較hMSH2基因高(8%)[7]。
有研究發(fā)現(xiàn),至少在白人中hMLH1的 WS14-19多態(tài)位點(diǎn)的A和G兩種基因型,預(yù)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)提示這種多態(tài)與部分直腸癌的發(fā)病有關(guān)。Hutter等報(bào)道,在結(jié)直腸癌患者中hMLH1的突變型IVS14-19G基因型較正常人群的高,分別為55.5%和39.2%,相關(guān)危險(xiǎn)性G是A的1.93倍。除了荷蘭患者組,其余各組亦得到相同結(jié)果。錯(cuò)配修復(fù)基因PMs2中的SNPs與MLH1之間存在蛋白水平的相互作用,可導(dǎo)致基因的改變,進(jìn)而影響表達(dá)蛋白的功能,這三種多態(tài)均增加了HNPCC發(fā)生危險(xiǎn)[7]。
本研究采用了PCR-DNA Direct sequencing技術(shù),針對(duì)大腸癌患者的外周血單個(gè)核細(xì)胞的DNA進(jìn)行了檢測(cè),進(jìn)一步深入研究hMSH2和hMLH1基因多態(tài)與大腸癌發(fā)病的相關(guān)性和危險(xiǎn)性。研究結(jié)果表明,hMLH1-exon12 1151T→A突變陽性檢出率,大腸癌組為12.20%,與對(duì)照組(6.10%)相比,無顯著差異(P>0.05)。在各年齡組間的Kendall等級(jí)相關(guān)分析結(jié)果無顯著性差異(χ2近似于零,P>0.05)。在hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變分析中,大腸癌組的突變陽性率為46.70%,顯著高于對(duì)照組(33.33%)(P<0.05)。進(jìn)一步的危險(xiǎn)性分析提示,攜帶hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生大腸癌的相對(duì)危險(xiǎn)性(OR)為無基因突變組的1.75倍;在對(duì)照組中,若不攜帶基因突變,其腸癌發(fā)病率將降低42.9%(特異危險(xiǎn)性百分比AR%);若在人群中無hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變發(fā)生,則大腸癌的發(fā)病率將降低20%(人群特異危險(xiǎn)性百分比PAR%)。在各年齡組間,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變陽性率的Kendall等級(jí)相關(guān)分析無顯著性差異(χ2=0.139,P>0.05)。
盡管這一結(jié)果與國(guó)外有關(guān)大腸腫瘤hMLH1基因和hMSH2基因變異的蛋白表達(dá)水平研究結(jié)果不完全一致,但結(jié)果提示,hMSH2基因突變不僅與HNPCC的發(fā)病有關(guān),而且與一定比例散發(fā)性大腸癌有關(guān),并且認(rèn)為hMSH2基因是誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡而導(dǎo)致腫瘤抑制的一個(gè)重要機(jī)制。因此,篩查hMSH2-exon1IVS1+9C→G突變,仍然可以作為大腸腫瘤篩查、早期診斷的參考指標(biāo)。
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Screening of susceptible gene hMLH1and hMSH2in Colorectal cancer
HOURui-zhi,ANZhi-guo,WEIJun,etal.(China-JapanUnionHospitalofJilinUniversity,Changchun130033,China)
ObjectiveTo explore the hMLH1,hMSH2gene polymorphisms and colorectal cancer risk.MethodsUsing large sample randomized controlled trials,hMLH1,hMSH2gene polymorphism of peripheral blood mononuclear cells DNA were screened by PCR and DNA direct sequencing.ResultshMLH1-exon12 1151T->A mutation in colorectal cancer group was 12.20%,there is no significant difference comparing with control group(6.10%)(P>0.05);hMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation(46.70%)was significantly higher than control group(33.33%)(P<0.05).But there is no significant difference in ages(P>0.05).Risk analysis shows that,the relative risk with hMSH2-exon1IVS1+9CG mutations in colorectal cancer is 1.75times of control group.The incidence of colorectal cancer will be reduced by 42.9%if it do not carry the gene mutation,and be reduced by 20%in population.ConclusionhMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation can be used as the pathogenesis of colorectal cancer risk factors,and can be used as the testing index.
Colorectal cancer;polymorphism;hMSH2
1007-4287(2012)01-0049-03
吉林省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(200705308,20090738)
*通訊作者
R735.3+4
A
2010-11-29)