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        RT-PCR法克隆廣譜抗病基因TGA2及其植物表達(dá)載體構(gòu)建

        2012-08-08 12:23:20劉永光劉克鋒孫向陽(yáng)
        關(guān)鍵詞:廣譜抗抗病性擬南芥

        劉永光,劉克鋒,孫向陽(yáng)

        (1.北京林業(yè)大學(xué)水保學(xué)院,北京 100083;2.北京農(nóng)學(xué)院城鄉(xiāng)發(fā)展學(xué)院,北京 102206)

        系統(tǒng)獲得性抗性(Systematic acquired resistance,SAR)是植物抵御病原菌侵染的最有效手段[1],我們可以利用SAR信號(hào)傳導(dǎo)途徑中的關(guān)鍵功能基因來(lái)啟動(dòng)植物自然防御系統(tǒng),達(dá)到廣譜抗病的目的。NPR1基因在植物的SAR發(fā)生中起著重要的作用,通過(guò)NPR1基因的過(guò)量表達(dá)可以誘導(dǎo)植物SAR的起始,使植物產(chǎn)生對(duì)多種病原菌的廣譜抗病性[2]。TGA2轉(zhuǎn)錄因子能直接和NPR1及其他多個(gè)病程相關(guān)基因啟動(dòng)子結(jié)合,從而啟動(dòng)SAR下游抗病基因的表達(dá),增強(qiáng)病程相關(guān)蛋白的表達(dá)水平,特異的誘導(dǎo)植物產(chǎn)生SAR,從而啟動(dòng)植物的廣譜抗病[3-4]。

        TGA轉(zhuǎn)錄因子因?yàn)槠湫蛄兄泻蠺GACG/as-1元件而得名。近年來(lái),因其能夠識(shí)別和結(jié)合植物的SAR反應(yīng)的相關(guān)基因,促使SAR相關(guān)反應(yīng)的啟動(dòng),關(guān)于該轉(zhuǎn)錄因子家族的研究逐步深入,在模式植物擬南芥中,TGA家族現(xiàn)在共分離出六個(gè)成員,TGA1到TGA6,主要與植物的抗逆性和衰老等生理過(guò)程有關(guān)[5-6]。病原菌、傷害和植物激素類(lèi)物質(zhì)等多種外界因素均能誘導(dǎo)TGA基因的表達(dá)[7]。TGA轉(zhuǎn)錄因子可以和植物的廣譜抗病基因NPR1的錨定重復(fù)序列相互作用。轉(zhuǎn)錄因子TGA2還能直接和NPR1下游的PR1基因啟動(dòng)子感應(yīng)SA的調(diào)節(jié)元件結(jié)合[8]。

        轉(zhuǎn)錄因子TGA2還能直接和NPR1下游的PR1基因啟動(dòng)子感應(yīng)SA的調(diào)節(jié)元件結(jié)合[9]。TGA轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物抗病過(guò)程調(diào)節(jié)的原理總結(jié)如下[8-9]:

        圖1 TGA轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物抗病基因的調(diào)節(jié)Fig.1 Regulation pattern of TGA factors on plant disease-resistance gene

        在水稻中發(fā)現(xiàn),TGA2轉(zhuǎn)錄因子可以與PR1基因上有的啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合,將誘導(dǎo)信號(hào)轉(zhuǎn)變成細(xì)胞反應(yīng),從而啟動(dòng)SAR[10]。在擬南芥中發(fā)現(xiàn),TGA2、TGA5、TGA6對(duì)植物系統(tǒng)獲得性抗病性的啟動(dòng)非常重要[11]。當(dāng)對(duì)這三個(gè)基因分別進(jìn)行敲除的時(shí)候,擬南芥中可以誘導(dǎo)SAR的啟動(dòng),增強(qiáng)抗病性;全部進(jìn)行敲除的情況下,不能夠啟動(dòng)SAR和增強(qiáng)抗病性。這說(shuō)明這三個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能存在重疊[12]。在煙草中也發(fā)現(xiàn),過(guò)量表達(dá)TGA2轉(zhuǎn)錄因子可以有效的增加PR相關(guān)基因的表達(dá),增強(qiáng)植物的抗病性;而煙草TGA2失活突變體在SA處理后,不能夠誘導(dǎo)SAR的啟動(dòng),說(shuō)明TGA2轉(zhuǎn)錄因子在SAR中起正調(diào)控作用[13]。與此同時(shí),在轉(zhuǎn)基因擬南芥和煙草中,通過(guò)過(guò)量表達(dá)TGA轉(zhuǎn)錄因子或者將其基因沉默和敲除,發(fā)現(xiàn)TGA2和TGA5也存在一定的負(fù)調(diào)控作用[14];研究還發(fā)現(xiàn),TGA轉(zhuǎn)錄因子家族中TGA2、TGA3和NPR1基因的錨定結(jié)合力最強(qiáng),TGA5、TGA6相對(duì)較弱[15];TGA2可以在植物的所有組織中表達(dá),TGA1和TGA3主要在植物的由內(nèi)組織和合根中表達(dá)[16]。

        總之,TGA2轉(zhuǎn)錄因子能直接和多個(gè)病程相關(guān)基因啟動(dòng)子結(jié)合感應(yīng)SA的調(diào)節(jié)元件結(jié)合,能夠增強(qiáng)病程相關(guān)蛋白的表達(dá)水平,特異的誘導(dǎo)植物產(chǎn)生系統(tǒng)獲得抗病性,從而達(dá)到廣譜抗病的目的[17]。

        本文采用RT-PCR的方法從擬南芥基因組中克隆TGA2轉(zhuǎn)錄因子,并將其構(gòu)建入植物表達(dá)載體中,期望通過(guò)轉(zhuǎn)化誘導(dǎo)目標(biāo)植物的SAR反應(yīng)的啟動(dòng),相當(dāng)于使目標(biāo)植物體內(nèi)保持一種高抗病的免疫水平,從而達(dá)到廣譜抗病的目的,得到廣譜抗病植株。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        植物材料為本實(shí)驗(yàn)室所保存的擬南芥,反轉(zhuǎn)錄由TaKaRa公司的BcaBESTTM RNA PCR KitVer.1.1反轉(zhuǎn)錄試劑盒完成,限制性?xún)?nèi)切酶購(gòu)自大連TaKaRa有限公司,T載體為購(gòu)自Promega公司的pGEM-T Vector;引物由上海Sangon公司合成,測(cè)序由上海Sangon公司完成,T4DNA連接酶購(gòu)自NEB公司,大腸桿菌菌株為DH5α。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)

        根據(jù)GenBank上所提供的TGA2基因的全序列,設(shè)計(jì)一對(duì)引物。上游引物:5'T↓CTTAGACA TATGGCTGATACCAGTCCGAG 3';下游引物:5'CC C↓GGGTCACTCTCTGGGTCGA 3'。在上下游引物的5'端分別加上了XbaⅠ和SmaⅠ酶切位點(diǎn)。

        1.2.2 擬南芥基因組RNA的提取

        采用Invitrigen公司的Trizol Reagent提取擬南芥總RNA,方法參考《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》[18]和《現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手冊(cè)》[19]改良。

        1.2.3 RT-PCR擴(kuò)增

        以水代替植物RNA作為負(fù)對(duì)照,擬南芥總RNA為模板,選用TaKaRa公司的BcaBESTTM RNA PCR KitVer.1.1反轉(zhuǎn)錄試劑盒,進(jìn)行mRNA的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)以合成cDNA,再以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增出目的基因。

        PCR擴(kuò)增的反應(yīng)條件為:94℃3 min;94℃30 s,53 ℃ 45 s,72 ℃ 1 min 15 s(34個(gè)循環(huán));72℃10 min,4℃短期保存。

        1.2.4TGA2基因的切膠回收及與T載體的連接

        將目的條帶在紫外透射儀下切下,采用TaKaRa的膠回收試劑盒,按照操作步驟進(jìn)行膠回收,然后與pGEM-T載體連接。利用PCR產(chǎn)物在3'末端自動(dòng)加A及pGEM-T載體上多克隆位點(diǎn)處突出T的特點(diǎn),在10 μL連接體系中加入以下成分:PCR回收產(chǎn)物3 μL,pGEM-T vector 1 μL,2×buffer 5 μL,T4DNA連接酶1 μL,總反應(yīng)體系為10 μL,4℃連接過(guò)夜。

        1.2.5TGA2基因的測(cè)序

        將連接好的載體轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,在含有X-gal和IPTG的LB+Amp選擇抗性平板上篩選白色菌落。對(duì)重組子進(jìn)行PCR鑒定和酶切鑒定,選擇鑒定結(jié)果正確的送上海生工公司測(cè)序。

        1.2.6TGA2基因表達(dá)載體的構(gòu)建

        將TGA2基因與pGEM-T載體連接所得到的載體命名為pGEM-TGA2。將pGEM-TGA2載體和p35STnos載體分別進(jìn)行SmaⅠ/XbaⅠ雙酶切,回收含有TGA2的片斷和p35STnos載體片斷,用T4DNA連接酶連接得到目的載體p35ST-TGA2。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 所提取的擬南芥RNA

        從圖2中可以看出,通過(guò)TRIzol Reagent法所提取的擬南芥,28S、18S、5S三條帶都有,說(shuō)明RNA的完整性比較好;28S亮度雖然沒(méi)有達(dá)到18S亮度的2倍,但5S條帶并沒(méi)有明顯變亮,說(shuō)明RNA提取過(guò)程中沒(méi)有發(fā)生降解,可作為模板用于擴(kuò)增TGA2基因。

        圖2 所提取的擬南芥RNAFig.2 RNA of Arabidopsis thaliana

        2.2 TGA2基因的RT-PCR擴(kuò)增

        測(cè)序結(jié)果顯示所克隆基因全長(zhǎng)993 bp,用DNAman軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果和NCBI上所公布的序列進(jìn)行比對(duì)可知:所克隆基因與NCBI上所公布的序列99.80%同源。所克隆基因在317和500 bp處出現(xiàn)了兩個(gè)堿基的置換。對(duì)序列進(jìn)行翻譯后發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)置換并沒(méi)有導(dǎo)致TGA2基因氨基酸序列的改變,屬于正常的密碼子的第三位堿基的擺動(dòng)。所克隆基因含有TGA2轉(zhuǎn)錄因子的起始密碼子ATG和終止密碼子TGA,是完整的TGA2基因(見(jiàn)圖3)。

        圖3 所克隆TGA2序列與NCBI上所公布序列的比對(duì)Fig.3 Blast between the amplification of TGA2 and the original sequence of NCBI

        2.3 TGA2植物表達(dá)載體的構(gòu)建

        以EcoRⅠ/SacⅠ對(duì)pBI121酶切,回收T-nos片段,插入用同樣雙酶切的pCAMBIA3300中構(gòu)建中間載體p3300-Tnos;以HindⅢ/XbaⅠ酶切p3301-BI121,回收CaMV35S片段,插入用同樣酶切的p3300-Tnos中構(gòu)建中間載體p3300-35ST;質(zhì)粒pT-TGA2用XbaⅠ/SmaⅠ限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行雙酶切,回收含有TGA2基因的1.0 kb的目標(biāo)片段,插入以同樣酶切處理的p3300-35ST中,篩選陽(yáng)性克隆即得植物表達(dá)載體p35ST-TGA2(見(jiàn)圖4)。

        圖4 p35ST-TGA2植物表達(dá)載體構(gòu)建過(guò)程Fig.4 Construction of p35ST-TGA2 plant expression vector

        圖5 TGA2基因的反轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增Fig.5 RT-PCR amplification results of TGA2 gene

        2.4 TGA2基因植物表達(dá)載體的PCR及酶切檢測(cè)

        TGA2基因植物表達(dá)載體的PCR及酶切檢測(cè)具體結(jié)果見(jiàn)圖5、6。

        由圖5可以看出,以p35ST-TGA2質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到TGA2目的條帶。

        由圖6可以看出,將所構(gòu)建的p35ST-TGA2載體用XbaⅠ單酶切,得到一條帶,而且大小正確。

        將載體和基因內(nèi)部都含有的HindⅢ單酶切,得到兩條帶,大小正確;將載體用XbaⅠ/SmaⅠ雙酶切,得到兩條帶,大小正確。

        以上檢測(cè)證明,所得到的目的載體構(gòu)建正確。

        圖6 載體酶切鑒定Fig.6 Enzyme digestion results of plant expression vector p35ST-TGA2.Ⅵ

        3 討論

        植物抗病育種中缺乏可以直接利用的抗源,常規(guī)育種很難得到抗病品種。利用基因工程技術(shù)為植物抗病育種提供了新的途徑,但在以往的工作中,大部分的研究者將注意力集中于那些有直接抗菌活性的物質(zhì),例如幾丁質(zhì)酶和β-1,3-葡聚糖酶,它們盡管在體外有抑菌活性,并且也獲得了一些轉(zhuǎn)基因抗病性提高的植株,但是很難達(dá)到高抗水平。

        一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控多個(gè)與同類(lèi)性狀有關(guān)的基因的表達(dá),在提高作物對(duì)環(huán)境脅迫抗性的分子育種中,與導(dǎo)入或者改良個(gè)別功能基因來(lái)提高某種抗性的傳統(tǒng)方法相比,從改良或者增強(qiáng)一個(gè)關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控能力著手,也許是提高作物抗逆性的更為有效的方法和途徑,增強(qiáng)一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的作用,就可以通過(guò)它促使多個(gè)基因發(fā)揮作用,從而是植株性狀獲得綜合改良的效果[20]。

        對(duì)于廣譜抗病基因工程,盡管沒(méi)有明確的概念提出,但是目前越來(lái)越多的研究者注意到改造植物本身的防御水平和對(duì)病原菌的敏感程度可以達(dá)到提高植物抗病性的目的[21]。生產(chǎn)上向作物直接噴施水楊酸來(lái)防治病害就是一個(gè)明證。利用基因工程技術(shù)改造植物SAR發(fā)生進(jìn)程也取得了許多有益的進(jìn)展,例如,過(guò)量表達(dá)NPR1基因的擬南芥和轉(zhuǎn)基因高含量SA的煙草都表現(xiàn)出了不同程度的廣譜抗病結(jié)果[22]。東北農(nóng)業(yè)大學(xué)車(chē)代弟教授將NPR1基因成功轉(zhuǎn)入唐菖蒲和百合中,并獲得轉(zhuǎn)基因植株,但后續(xù)的轉(zhuǎn)基因植株的田間試驗(yàn)未見(jiàn)報(bào)道[23-24]。

        與此同時(shí),國(guó)內(nèi)很多科研工作者注意到TGA轉(zhuǎn)錄因子家族在SAR中所起到的重要作用,多篇文獻(xiàn)綜述都予以大量關(guān)注,相信國(guó)內(nèi)的植物廣譜抗病育種將會(huì)逐步開(kāi)展該基因的轉(zhuǎn)化和應(yīng)用工作。

        4 結(jié)論

        本文在國(guó)內(nèi)首次將克隆到的擬南芥TGA2轉(zhuǎn)錄因子構(gòu)建植物表達(dá)載體,以期轉(zhuǎn)入植物獲得廣譜抗病植株。

        *孫向陽(yáng)為本文的同等貢獻(xiàn)者。

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