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        普通小麥鎘吸收基因Cdu1組成的功能標(biāo)記檢測(cè)

        2012-04-29 00:44:03張樂(lè)陳為序董慧陳桂玲余利李興鋒
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年1期
        關(guān)鍵詞:小麥

        張樂(lè) 陳為序 董慧 陳桂玲 余利 李興鋒

        摘要:利用新開(kāi)發(fā)的功能型共顯性分子標(biāo)記usw47對(duì)86份供試普通小麥品種(系)的鎘吸收基因Cdu1組成進(jìn)行了檢測(cè)和分析,結(jié)果表明:59個(gè)材料具有低鎘吸收型對(duì)應(yīng)的375bp特異帶,占68.60%;27個(gè)材料具有高鎘吸收型對(duì)應(yīng)的225bp特異帶,占31.40%。在47份小偃6號(hào)的衍生材料中,有74.47%的衍生品種(系)在鎘吸收基因Cdu1基因位點(diǎn)上與小偃6號(hào)一致,具有低鎘吸收型的優(yōu)良等位變異;25.53%的衍生后代具有高鎘吸收型的等位變異類(lèi)型。山東省近年選育的小麥材料中多數(shù)具有低鎘吸收型的特異條帶。

        關(guān)鍵詞:小麥;鎘吸收基因;Cdu1;功能型分子標(biāo)記

        中圖分類(lèi)號(hào):Q754文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2012)01-0006-05

        鎘(Cd)是一種有毒金屬,以微量形式自然存在于幾乎所有的土壤中,被認(rèn)為是最重要的重金屬環(huán)境污染物之一。農(nóng)業(yè)、采礦業(yè)以及工業(yè)生產(chǎn)活動(dòng)使大量的鎘進(jìn)入環(huán)境中,并隨著污泥農(nóng)用及污灌等進(jìn)入農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng),造成土壤鎘污染日趨嚴(yán)重。當(dāng)鎘在土壤環(huán)境中含量達(dá)到或超過(guò)傷害閾值時(shí),就會(huì)抑制作物根系生長(zhǎng),降低其光合作用和葉綠素含量,破壞作物體內(nèi)保護(hù)酶系統(tǒng),干擾碳、氮代謝及水分和養(yǎng)分吸收,使質(zhì)膜透性加大等,表現(xiàn)出明顯的中毒癥狀,如植株矮小、葉片褪綠、生長(zhǎng)遲緩等,嚴(yán)重影響作物產(chǎn)量。更為嚴(yán)重的是,鎘能夠在作物體內(nèi),特別是籽粒中大量積累,并通過(guò)食物鏈傳遞和富集,從而危害人體健康,日本的骨痛病就是鎘污染大米所致。含鎘食物,尤其含鎘谷物和蔬菜是人體內(nèi)鎘的主要來(lái)源。因此,如何降低鎘在農(nóng)作物中的富集受到廣泛關(guān)注。目前,聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)和世界衛(wèi)生組織(WHO)的食品法規(guī)委員會(huì)已設(shè)定了小麥中鎘含量的標(biāo)準(zhǔn)值,為0.2mg/kg(CODEX STAN193-1995,2009)。

        部分硬質(zhì)小麥品種具有富集鎘元素使谷物中鎘水平超過(guò)上述標(biāo)準(zhǔn)值的基因潛力,該性狀由主效基因控制,該基因被定名為Cdu1,并被定位于5B染色體的長(zhǎng)臂上。了解小麥品種Cd吸收的遺傳基礎(chǔ)及其基因組成,可以為選育低鎘吸收型品種提供理論依據(jù)。分子標(biāo)記輔助選擇在育種中的應(yīng)用越來(lái)越受到重視。ScOpc20是一個(gè)SCAR標(biāo)記,已經(jīng)被成功用于培育低鎘吸收型的小麥新品種,但由于它是一個(gè)與高鎘含量相關(guān)的顯性標(biāo)記,因此限制了該標(biāo)記在回交育種中的應(yīng)用。Wiebe等(2010)開(kāi)發(fā)了一個(gè)與作物鎘吸收性狀基因變異共分離的EST衍生標(biāo)記(XBF474090),該標(biāo)記已經(jīng)被成功轉(zhuǎn)化為一個(gè)共顯性CAPS標(biāo)記,并被定名為usw47。在用限制性內(nèi)切酶Hpyl88 I對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行消化之后,經(jīng)電泳分析,該標(biāo)記可用于檢測(cè)鎘吸收性狀基因的兩個(gè)等位基因,并成功將96個(gè)小麥品系分成低鎘吸收型或高鎘吸收型。因此,usw47在低鎘吸收型小麥新品種的選育中具有廣闊的應(yīng)用前景。

        本試驗(yàn)利用鎘吸收基因Cdu1的功能型分子標(biāo)記usw47對(duì)86份小麥材料進(jìn)行檢測(cè),旨在明確這些材料中鎘吸收等位基因的基因組成,同時(shí)分析探討了其中的小偃6號(hào)及其衍生系的鎘吸收基因的等位變異,以期為培育低鎘小麥品種奠定一定的理論基礎(chǔ)。

        1.材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        所用材料共86份,見(jiàn)表1。其中1~52號(hào)包括小偃6號(hào)、其親本小偃96和鄭引4號(hào)、兩個(gè)姊妹系品種小偃4號(hào)和小偃5號(hào)及小偃6號(hào)的衍生材料,由中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所李振聲課題組提供;中國(guó)春、J-11、IKE、Wx1D、江蘇白火麥、Chancellor、銘賢169為遺傳材料;60~86號(hào)材料為山東省近年育成品種,由山東農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院提供。所有材料在2009~2010年國(guó)家小麥改良分中心泰安試驗(yàn)基地統(tǒng)一種植,田間常規(guī)管理。

        1.2DNA的提取

        每個(gè)品種選取幼嫩葉片5~6cm,經(jīng)液氮冷凍后研磨成粉末,放入2ml離心管中,采用SDS一酚法提取小麥基因組DNA,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的濃度和質(zhì)量,用于鎘吸收基因Cdu1位點(diǎn)的分子檢測(cè)。

        1.3特異性標(biāo)記

        鎘吸收基因相關(guān)標(biāo)記usw47序列參考網(wǎng)站http://maswheat.ucdavis.edu/protocols/Cadmium/index.htm,所用特異性引物由上海生工公司合成,分別為usw47-F:5'-GCTAGGACTTGAT-TCATTGAT-3',usw47-R:5'-AGTGATCTA-AACGTTCTTATA-3'。

        1.4PCR擴(kuò)增及酶消化

        PCR反應(yīng)體系均為20μl,含10×PCR buffer2.5μl,2mmol/L MgCl22μl,200mmol/L dNTPs1.5μl,每個(gè)引物1μl(約10ng),基因組DNA 3μl(30~100ng),TaqDNA聚合酶1U,其余由ddH20補(bǔ)齊。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,55℃復(fù)性30s,72℃延伸60s,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10min。

        PCR擴(kuò)增產(chǎn)物首先經(jīng)Hpy 188I限制性內(nèi)切酶消化,酶消化反應(yīng)體系均為15μl,含PCR產(chǎn)物4μl,NEB Hpyl88I 0.25μl,NEB buffer4 1.5μl,ddH20 9.25μl。酶消化程序?yàn)椋?7℃反應(yīng)1h;65℃酶變性20min;最后維持在10%。

        消化產(chǎn)物采用6%~8%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)檢測(cè),1×TE緩沖溶液,凝膠經(jīng)硝酸銀染色,顯影后采用天能GIS凝膠圖像處理系統(tǒng)掃描成像。

        2.結(jié)果與分析

        usw47為共顯性標(biāo)記,PCR產(chǎn)物經(jīng)限制性內(nèi)切酶Hpy l88 I消化后,電泳結(jié)果顯示出兩條差異帶,大小分別為375bp和225bp,分別對(duì)應(yīng)低鎘吸收型等位基因和高鎘吸收型等位基因。此標(biāo)記清晰易讀,重復(fù)性好,可用于檢測(cè)鎘吸收基因Cdu1位點(diǎn)上等位基因相應(yīng)的類(lèi)型。

        本試驗(yàn)所用86份小麥材料中,59份材料擴(kuò)增出375bp的特異性條帶,為低鎘吸收型,占68.60%;27份材料擴(kuò)增出225bp的特異性條帶,為高鎘吸收型,占31.40%(表1)。

        小偃6號(hào)及其親本小偃96和鄭引4號(hào)、姊妹系小偃4號(hào)和小偃5號(hào)均擴(kuò)增出375bp的特異性條帶,均為低鎘吸收型。47份小偃6號(hào)的衍生材料中,有35份材料擴(kuò)增出375bp的特異性條帶,占74.47%;有12份擴(kuò)增出225bp的特異性條帶,分別是白春5號(hào)、晉麥41、晉麥60、魯麥14、陜213、陜253、西農(nóng)2258、小偃15、鄭麥9023、鄭麥9405、鄭農(nóng)16、鄭優(yōu)7號(hào),占25,53%(表1)。部分小偃6號(hào)衍生材料的多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖1。

        遺傳材料中國(guó)春、Chancellor、J-11、IKE、江蘇白火麥和銘賢169及山東省重要的小麥品種如

        濟(jì)麥19、濟(jì)南17、山農(nóng)15、臨麥2號(hào)、臨麥4號(hào)、濰麥8號(hào)、煙農(nóng)19等擴(kuò)增出225bp的特異帶,為高鎘吸收材料;而濟(jì)麥20、濟(jì)麥21、濟(jì)麥22和多數(shù)山農(nóng)系列品種為低鎘吸收類(lèi)型(表1)。部分遺傳材料及山東省育成品種的多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖2。

        3.討論與結(jié)論

        鎘是一種重要的環(huán)境和工業(yè)毒物,也是一種半衰期很長(zhǎng)(長(zhǎng)達(dá)10~35年)的多器官、多系統(tǒng)毒物,隨著人類(lèi)生活生產(chǎn)活動(dòng),逐漸在土壤中及作物體內(nèi)積累,不僅對(duì)農(nóng)作物的生長(zhǎng)發(fā)育、光合特性、產(chǎn)量、品質(zhì)等理化性狀產(chǎn)生影響,而且可經(jīng)食物鏈進(jìn)入人體,嚴(yán)重影響人類(lèi)健康。植物硫代謝、抗氧化系統(tǒng)和Cd2+跨膜運(yùn)輸是植物對(duì)重金屬鎘響應(yīng)的主要途徑。但,李妍發(fā)現(xiàn),抗氧化酶未對(duì)鎘脅迫條件下的小麥幼苗起到明顯的保護(hù)作用。因此,分析作物的鎘耐受差異、緩解鎘對(duì)農(nóng)作物的毒害、培育低鎘吸收型作物品種成為研究的焦點(diǎn)。小麥?zhǔn)俏覈?guó)北方地區(qū)的主要糧食作物之一,了解現(xiàn)有小麥品種鎘吸收的遺傳基礎(chǔ)及其基因組成,對(duì)培育低鎘吸收型小麥品種意義重大。

        本研究利用鎘吸收基因的功能型分子標(biāo)記usw47對(duì)86份小麥品種(系)進(jìn)行分子檢測(cè),結(jié)果表明,大多數(shù)材料(68.60%)具有低鎘吸收型所對(duì)應(yīng)的等位變異。其中,小偃6號(hào)及其親本小偃96和鄭引4號(hào)、姊妹系小偃4號(hào)和小偃5號(hào)、35個(gè)衍生材料均為低鎘吸收型,說(shuō)明骨干親本小偃6號(hào)具有低鎘吸收型的優(yōu)良基因潛力,而其大多數(shù)衍生材料能很好地保存低鎘吸收型的優(yōu)良基因等位變異。遺傳材料除WxlD為低鎘吸收類(lèi)型外,中國(guó)春、J-11、IKE、江蘇白火麥、Chancellor和銘賢169均為高鎘吸收型,不宜用于低鎘吸收型小麥新品種的選育。

        在27個(gè)山東省育成的小麥品種中,18個(gè)為低鎘吸收型,占66.67%;9個(gè)為高鎘吸收型,占33.33%。一些育成年限稍長(zhǎng)的品種,如魯麥14、濟(jì)南17,多為高鎘吸收型;而大多數(shù)新育成的品種,如良星99、山農(nóng)14、山農(nóng)16、煙農(nóng)23、煙農(nóng)24、煙農(nóng)25、濟(jì)麥20和濟(jì)麥21等,均為低鎘吸收型品種,說(shuō)明這部分品種可以用作選育低鎘小麥的親本。值得注意的是山農(nóng)14和山農(nóng)15雖都是濟(jì)南17(高鎘吸收型)的后代,但一個(gè)為低鎘吸收型,一個(gè)為高鎘吸收型,這可能是由雜交組合的另一個(gè)親本不同造成的。

        本研究?jī)H是利用功能標(biāo)記usw47對(duì)普通小麥的鎘吸收基因類(lèi)型進(jìn)行初步鑒定,對(duì)于鑒定出的低鎘吸收型小麥品種,還需通過(guò)土培和水培相結(jié)合的方法進(jìn)一步驗(yàn)證。隨著小麥基因組學(xué)研究的進(jìn)展和研究技術(shù)的提高,將會(huì)有更多的功能標(biāo)記被開(kāi)發(fā)出來(lái)并用于準(zhǔn)確檢測(cè)相關(guān)基因位點(diǎn)的等位變異。

        參考文獻(xiàn):

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        [2]趙其國(guó),周炳中,楊浩,等.江蘇省環(huán)境質(zhì)量與農(nóng)業(yè)安全問(wèn)題研究[J].土壤,2002,34(1):1-8.

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