霍守俊 薛鋒 孔凡志 李芳 單遠(yuǎn)州* 周聯(lián)明* 張學(xué)利*
(1.蘇州大學(xué),江蘇蘇州 215006;2.上海市奉賢區(qū)中心醫(yī)院骨科,*普外科,上海 201400)
胃癌是全球高發(fā)的惡性腫瘤之一,胃癌患者的5年生存率僅約30%[1],目前胃癌的發(fā)病機(jī)制尚不清楚。本課題組在前期研究中首次發(fā)現(xiàn)miR-650在胃癌中表達(dá)異常升高,并初步探討了miR-650在胃癌發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后等方面的調(diào)控作用[2]。本研究旨在進(jìn)一步探討miR-650參與胃癌發(fā)生的相關(guān)機(jī)制。
1.1 胃癌細(xì)胞株及培養(yǎng) KATO III、NUGC4、NCI-N87、SGC-7901及 MKN-45胃癌細(xì)胞株的培養(yǎng)條件如下:KATO III培養(yǎng)液為 ATCC-formulated Iscove's Modified Dulbecco's Medium(IMDM)培養(yǎng)基(內(nèi)含20%胎牛血清);NUGC4、NCI-N87、SGC-7901及 MKN-45細(xì)胞株培養(yǎng)液均為RPMI-1640培養(yǎng)基(內(nèi)含10%胎牛血清);細(xì)胞孵育環(huán)境為:37℃且含95%空氣、5%CO2的培養(yǎng)箱。
1.2 臨床資料 根據(jù)美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)胃癌臨床實(shí)踐指南(2003版)中收錄的診療標(biāo)準(zhǔn),共收集68例于2005年6月—2010年1月在上海市奉賢區(qū)中心醫(yī)院就診的胃癌患者,所有患者在確診胃癌后,限期行標(biāo)準(zhǔn)胃癌根治術(shù)并輔助放化療,全部患者至少隨訪2年以上。該項(xiàng)研究在征得患者及家屬同意后簽署知情同意書,并征得上海市奉賢區(qū)中心醫(yī)院倫理委員會(huì)同意。
1.3 試劑及儀器 iTRAQ試劑盒(美國(guó)ABI公司),SYBR PCR試劑盒(日本TaKaRa公司),RNA提取試劑盒(德國(guó) QIAGEN公司),IVIS Spectrum成像系統(tǒng)(美國(guó)冷泉港生物科技股份有限公司),LC-MS/MS系統(tǒng)(美國(guó)ABI公司)。
1.4 實(shí)驗(yàn)方法
1.4.1 實(shí)時(shí)定量RT-PCR 從冰凍胃癌組織及其配對(duì)正常組織中以及5株胃癌細(xì)胞株中提取總RNA,檢測(cè)RNA純度,在miR分子末端加polyA尾,選擇Oligo dT引物,進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄及PCR反應(yīng),記錄每個(gè)反應(yīng)管中的熒光信號(hào)到達(dá)所設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)即Ct值,以U6snRNA作為內(nèi)參,以2-ΔΔCt表示胃癌組織中miR-650表達(dá)量相對(duì)于正常組織的變化倍數(shù),其中ΔΔCt=(Ct-CtU6)癌-(Ct-CtU6)正常。腫瘤組織中 miR-650的表達(dá)量為正常組織表達(dá)量的3倍以上時(shí)為miR-650在胃癌組織中高水平表達(dá)。
1.4.2 慢病毒包裝及滴度測(cè)定 按說(shuō)明書制備編碼慢病毒顆粒的重組病毒質(zhì)粒及其兩種輔助包裝原件載體質(zhì)粒,與Lipofectamine 2000混合后加入細(xì)胞培養(yǎng)瓶,置于CO2培養(yǎng)箱孵育,收集上清液,離心收集病毒濃縮液,分裝后取其中1支進(jìn)行病毒生物學(xué)滴度測(cè)定,其余置于-80℃保存。
1.4.3 miR-650模擬劑和抑制劑 合成成熟 miR-650的引物,序列如下:正向:5’-AGGAGGCAGCGCTCTCAGGAC-3’。反 向:5’-CGGGCGCGTT-TTTTTTTTTTT-TTGTCCTGAGAG-3’。 miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸序列如下:5’-GTCCTGAGAGCGCTGCCTCCT-3’。以上序列與病毒基因組融合后,通過(guò)Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染胃癌細(xì)胞株。
1.4.4 細(xì)胞增殖分析 SGC-7901及 NCI-N87胃癌細(xì)胞株在轉(zhuǎn)染成熟miR-650序列及miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸后,置于CO2培養(yǎng)箱孵育,分別于第1、2、3、4天加入CCK-8試劑后在分光光度計(jì)下檢測(cè)450nm的吸光率。
1.4.5 細(xì)胞凋亡分析 SGC-7901及 NCI-N87胃癌細(xì)胞株在轉(zhuǎn)染成熟miR-650序列及miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸后,孵育、離心收集細(xì)胞,采用流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡情況。
1.4.6 定量LC-MS∕ MS KATO III、NUGC4、NCI-N87、SGC-7901及 MKN-45胃癌細(xì)胞株在轉(zhuǎn)染成熟 miR-650序列及 miR-650抑制劑后,利用RIPA裂解液裂解細(xì)胞,將5種蛋白樣品分別進(jìn)行還原和烷基化,經(jīng)胰蛋白酶水解后,分別用不同的iTRAQ試劑進(jìn)行標(biāo)記,并將所有蛋白樣品混合,通過(guò)LC-MS/MS系統(tǒng)進(jìn)行蛋白質(zhì)定量分析以篩選靶蛋白。
1.4.7 蛋白質(zhì)印跡(Western blot) SGC-7901及NCI-N87胃癌細(xì)胞株在轉(zhuǎn)染成熟miR-650序列及miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸后,提取其細(xì)胞總蛋白,進(jìn)行western blot分析靶蛋白表達(dá)情況。
1.4.8 裸鼠異種移植模型 用含編碼綠色熒光蛋白基因的病毒轉(zhuǎn)染SGC-7901及NCI-N87胃癌細(xì)胞株后放入CO2培養(yǎng)箱孵育,取20只BALB/C裸鼠,隨機(jī)分為2組,每組10只,其中一組裸鼠腹腔注射SGC-7901細(xì)胞株,另一組裸鼠腹腔注射NCIN87細(xì)胞株,每周通過(guò)IVIS成像系統(tǒng)觀察腹腔腫瘤情況及裸鼠生長(zhǎng)情況,6周后處死并打開(kāi)腹腔觀察腫瘤大小、腹膜后淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及肝轉(zhuǎn)移情況。同時(shí),另取20只BALB/C裸鼠隨機(jī)分為2組,每組10只,其中一組裸鼠腹腔注射SGC-7901細(xì)胞株,另一組裸鼠腹腔注射NCI-N87細(xì)胞株。每組裸鼠標(biāo)記5只,每天腹腔給予miR-650抑制劑;同組中另5只裸鼠作為對(duì)照組,每天觀察腫瘤情況及裸鼠生長(zhǎng)情況。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 應(yīng)用SPSS 17.0軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(ˉx±s)表示,組間比較采用單因素方差分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 胃癌中miR-650表達(dá)水平與患者術(shù)后生存期密切相關(guān) 胃癌患者術(shù)后生存期長(zhǎng)短與miR-650表達(dá)水平密切相關(guān),而與性別、年齡、腫瘤位置、TNM分期、淋巴轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等因素?zé)o相關(guān)性。見(jiàn)表1。
表1 胃癌患者預(yù)后相關(guān)因素分析
2.2 miR-650異常高表達(dá)可促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖及轉(zhuǎn)移并抑制其凋亡 5株胃癌細(xì)胞株中,KATO III、NUGC4及SGC-7901細(xì)胞株高水平表達(dá)miR-650,而NCI-N87及MKN-45細(xì)胞株則僅微量表達(dá)miR-650(圖1)。細(xì)胞增殖分析結(jié)果顯示:與轉(zhuǎn)染了成熟miR-650序列的胃癌細(xì)胞株相反,當(dāng)轉(zhuǎn)染miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸后,胃癌細(xì)胞株的增殖能力顯著下降(圖2)。流式細(xì)胞儀對(duì)凋亡水平檢測(cè)顯示,轉(zhuǎn)染miR-650抑制劑后,胃癌細(xì)胞株凋亡數(shù)量顯著增多(圖3)。裸鼠異種移植模型結(jié)果同樣提示,miR-650高表達(dá)可促進(jìn)胃癌生長(zhǎng)及轉(zhuǎn)移;而抑制miR-650表達(dá)后,可抑制腫瘤生長(zhǎng)并抑制其遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移及淋巴轉(zhuǎn)移(圖4)。
2.3 RGS7蛋白是miR-650的下游靶點(diǎn)之一,并受到miR-650的負(fù)性調(diào)控 成熟 miR-650序列及miR-650抑制劑轉(zhuǎn)染5株胃癌細(xì)胞株后,采用LCMS/MS系統(tǒng)蛋白定量分析。結(jié)果顯示:miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸轉(zhuǎn)染高表達(dá)miR-650的3株細(xì)胞株后,5種蛋白質(zhì)的表達(dá)水平始終增加,分別是MMP2前體、SERBP1,DLL4,RGS7和PRDX1。然而,將成熟miR-650序列轉(zhuǎn)染入低表達(dá)miR-650的2株胃癌細(xì)胞后,有3種蛋白質(zhì)的表達(dá)水平始終偏低,分別為S100PBP,RGS7及PRDX1(圖5)。綜合以上結(jié)果,可將RGS7蛋白及PRDX1蛋白視為miR-650的潛在靶蛋白。結(jié)合miR靶點(diǎn)預(yù)測(cè)軟件-Targetscan的篩選結(jié)果,最終確定RGS7蛋白為miR-650的下游靶點(diǎn)之一。通過(guò)western blot進(jìn)一步證實(shí):轉(zhuǎn)染成熟 miR-650序列后,胃癌細(xì)胞株RGS7蛋白表達(dá)量較對(duì)照組顯著下降,而當(dāng)轉(zhuǎn)染了miR-650抑制劑-LNA寡核苷酸后,細(xì)胞中RGS7表達(dá)水平顯著上升(圖6),顯示出miR-650對(duì)RGS7蛋白的負(fù)性調(diào)控關(guān)系。
本研究發(fā)現(xiàn),胃癌患者術(shù)后生存期長(zhǎng)短與miR-650表達(dá)水平密切相關(guān)(P<0.05),但是,患者生存期與患者性別、年齡、腫瘤位置、TNM分期、淋巴轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等因素?zé)o顯著相關(guān)性,可能由于受到樣本量及研究對(duì)象確定標(biāo)準(zhǔn)等因素的影響,故需進(jìn)一步增加樣本量、重新制定研究對(duì)象納入標(biāo)準(zhǔn)及排除標(biāo)準(zhǔn)并改進(jìn)研究方法后進(jìn)行后續(xù)研究。
結(jié)合前期研究結(jié)果,我們假設(shè):胃癌中miR-650的異常高表達(dá)通過(guò)促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖及轉(zhuǎn)移并抑制其凋亡來(lái)促進(jìn)胃癌的進(jìn)展,進(jìn)而影響患者生存期及預(yù)后狀況。為了驗(yàn)證以上推論正確性,我們?cè)O(shè)計(jì)一系列實(shí)驗(yàn),研究結(jié)果提示:①抑制miR-650表達(dá)時(shí)胃癌細(xì)胞增殖能力受到抑制,而miR-650過(guò)表達(dá)后可促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖;②抑制miR-650表達(dá)后可促進(jìn)胃癌細(xì)胞的凋亡,反之,miR-650過(guò)表達(dá)可抑制胃癌細(xì)胞凋亡;③裸鼠胃癌異種移植模型結(jié)果同樣提示:miR-650可促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖及轉(zhuǎn)移,而抑制其表達(dá)可抑制腫瘤生長(zhǎng)并抑制遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移及淋巴轉(zhuǎn)移。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果與前期研究結(jié)果完全一致,但是仍不能明確miR-650下游除ING4以外的潛在靶點(diǎn)。我們綜合應(yīng)用LC-MS/MS系統(tǒng)以及Targetscan軟件,最后確定RGS7為miR-650的下游靶點(diǎn)之一。RGS7屬于RGS蛋白亞族,RGS7家族成員包括:RGS6、RGS7、RGS9及RGS11等,受G蛋白信號(hào)調(diào)控[3]。RGS7由3個(gè)不同的結(jié)構(gòu)域組成:①RGS區(qū)域:該區(qū)域相對(duì)保守,約120個(gè)氨基酸,存在于幾乎每個(gè)RGS家族成員結(jié)構(gòu)中,通過(guò)結(jié)合Gα亞基促進(jìn)GTP水解;②DEP區(qū)域:介導(dǎo)與膜錨定蛋白間相互作用;③GGL區(qū)域:與Gβ5亞基特異性結(jié)合,形成異二聚體調(diào)控視網(wǎng)膜細(xì)胞光反應(yīng)、中樞神經(jīng)元活動(dòng)等過(guò)程[4]。為了探討miR-650表達(dá)與RGS7表達(dá)之間的內(nèi)在聯(lián)系,我們通過(guò)western blot檢測(cè)miR-650對(duì)RGS7表達(dá)量的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩者之間存在負(fù)性調(diào)控關(guān)系。
我們的研究結(jié)果初步提示,miR-650→RGS7及miR-650→ING4信號(hào)通路在胃癌形成過(guò)程中發(fā)揮作用,但胃癌的形成是一個(gè)多因素、多步驟相互作用、相互影響的復(fù)雜過(guò)程。隨著對(duì)miR與胃癌關(guān)系研究的深入,將逐步明確miR是否可以作為用于胃癌的早期診斷、治療及預(yù)后監(jiān)測(cè)等的新型腫瘤標(biāo)志物。
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