《中國(guó)海洋湖沼學(xué)報(bào)》(英文版, SCI-E收錄)

Chinese Journal of Oceanology and Limnology

2012年第5期論文導(dǎo)讀

EST-derived SNP discovery and selective pressure analysis in Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei)

柳承璋, 相建海等: 通過(guò)對(duì)凡納濱對(duì)蝦(Litopenaeus vannamei)表達(dá)序列標(biāo)簽的分析預(yù)測(cè)了17225個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn), 包括9546個(gè)轉(zhuǎn)換、5124個(gè)顛換以及 2481個(gè)插入/缺失突變; 發(fā)現(xiàn)了4262個(gè)非同義SNP突變。篩選了250個(gè)與重要生經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的非同義SNP作為可用于遺傳選育的候選分子標(biāo)記。KaKs分析顯示, 多數(shù)基因承受負(fù)選擇壓力, 而與先天性免疫和雄性配子發(fā)生相關(guān)的基因承受正選擇壓力。作者首次對(duì)一種對(duì)蝦進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組水平上的遺傳選擇壓力分析。

Extract ofMeretrix meretrixLinnaeus induces angiogenesisin vitroand activates endothelial nitric oxide synthase

劉明, 林秀坤等: 文蛤(Meretrix meretrix)作為中藥應(yīng)用在中國(guó)有悠久的歷史。本研究利用 HUVECs模型研究了文蛤促進(jìn)新生血管生成的活性。文蛤肉勻漿后, 分別以丙酮、乙醇提取, 再經(jīng)Sphadex G-25凝膠柱進(jìn)行初步分離?；钚猿煞諥FG-25能夠明顯促進(jìn)HUVECs的增殖、遷移、血管擬態(tài)的形成。其作用機(jī)制可能是活化NO合成酶, 促進(jìn)NO的生成, 激活eNOS/NO途徑進(jìn)而促進(jìn)新生血管的生成。本研究表明文蛤提取物中含有促進(jìn)新生血管生成的活性物質(zhì), 值得進(jìn)一步分離純化、鑒定, 為缺血性疾病提供先導(dǎo)化合物。

A real time PCR targeted to the upstream regions of HlyB protein for specific detection ofEdwardsiella tarda

謝國(guó)駟, 黃倢等: 根據(jù)遲緩愛(ài)德華氏菌(Edwardsiella tarda)HlyB蛋白的上游區(qū)域基因序列,設(shè)計(jì)引物和TaqMan探針, 建立了遲緩愛(ài)德華氏菌的實(shí)時(shí)定量 PCR檢測(cè)方法。研究結(jié)果表明, 該方法快速、靈敏、特異、重復(fù)性好, 并能進(jìn)行臨床樣品中該病原的定量檢測(cè), 該方法的建立對(duì)遲緩愛(ài)德華氏菌的快速臨床診斷及疫情監(jiān)測(cè)具有重要意義。

Biochemical responses in the musselMytilus coruscusexposed in vivo to sub-lethal copper concentrations

李一峰, 顧忠旗等: 本實(shí)驗(yàn)研究了銅離子(Cu2+)對(duì)厚殼貽貝(Mytilus coruscus)內(nèi)臟、鰓和肌肉SOD、CAT、ACP、AKP、GOT和GPT的酶活力影響。結(jié)果表明, 隨著 Cu2+濃度的升高, 厚殼貽貝死亡率逐漸增大。不同組織間不同酶活力存在差異性。

Screening of marine fungus from Nanji Island offshore and the activity of their metabolites against pathogeneticVibriofromPseudosciaena crocea

趙淑江, 李書(shū)平等: 以7種水產(chǎn)病原菌為指示菌,初篩獲得有抑菌活性的菌株19株。對(duì)其發(fā)酵液進(jìn)行抑菌活性復(fù)篩, 有 9個(gè)菌株的次級(jí)代謝產(chǎn)物對(duì)指示菌有抑制作用, 其中菌株NJ0104抑菌活性最強(qiáng)。對(duì)該菌株次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行初步研究, 發(fā)現(xiàn): 其抑菌活性物質(zhì)在80℃以下、紫外照射40 min時(shí)穩(wěn)定性良好, pH穩(wěn)定范圍在4.0～7.0。采用傳統(tǒng)形態(tài)鑒定方法結(jié)合 ITS-5.8SrDNA片段 PCR擴(kuò)增和序列測(cè)定,NJ0104鑒定為節(jié)菱孢屬Arthriniumsp.。

Disparity of Intestinal Bacterial Communities in Grass CarpCtenopharyngodon idellusfrom Two Different Habitats

倪加加, 余育和等: 作者通過(guò) PCR-DGGE指紋分析技術(shù)分析了池塘養(yǎng)殖草魚(yú)(Ctenopharyngodon idellus)和湖泊生長(zhǎng)的草魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu), UPGMA聚類(lèi)和PCA排序都顯示兩種生境下的草魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)存在明顯差異, 而這種差異與草魚(yú)自身的遺傳差異沒(méi)有相關(guān)性(Mantel 單尾檢驗(yàn),R= 0.157,P=0.175)。這種差異可能是造成池塘養(yǎng)殖草魚(yú)易患細(xì)菌性疾病的重要原因。

First record of generaRutilariaandTrigonium(Bacillariophyta) and 11 marine diatom taxa (species and varieties) in South China Sea

吳瑞, 高亞輝等: 作者對(duì)南海表層沉積物中的硅藻進(jìn)行了研究, 供研究的表層沉積物樣品是由“海洋四號(hào)”船于2000年、2001年及“實(shí)驗(yàn)三號(hào)”船于2007年在南海采集的, 表層樣品采用箱式取樣器或抓斗采集的表層1 cm的沉積物。觀(guān)察到我國(guó)的兩個(gè)新記錄屬—舟輻藻屬(RutilariaGreville)和三角藻(TrigoniumCleve), 11個(gè)新記錄種和變種Rutilaria radiateGrove & Sturt,Asterolampra grevillei(Wall.)Greville,Biddulphia turrigeraMann,Cocconeis cyclophoravar.decoraA S,Cocconeis ocellataMann,Dictyoneis marginata(F. W. Lewis) Cleve,Entogonia davyanaGreville,Tryblionella campechianaGrunow,Plagiogramma KinkeriA S,Plagiogramma nankoorenseGrunow, andTrigoniumcf.contumaxMann, 這些種類(lèi)主要是現(xiàn)生種(兩個(gè)是化石種), 分布在東太平洋、西太平洋和印度洋, 在菲律賓分布的最多。作者對(duì)其分類(lèi)特征和分布進(jìn)行了描述并配有相應(yīng)的光鏡照片。

IdentificationSargassum thunbergiicompounds toxic to red tide microalgae

王仁君, 唐學(xué)璽等: 作者以鼠尾藻(Sargassum thunbergii)、海黍子(Sargassumpallidum)和海蒿子(Sargassum kjellmanianum)為大型海藻(褐藻)的代表,以赤潮異彎藻(Heterosigma akashiwo)、中肋骨條藻(Skeletonema costatum)和海洋原甲藻(Prorocentrum micans)為目標(biāo)微藻, 研究了不同濃度的 3種大型褐藻組織甲醇提取物對(duì)3種赤潮微藻的生長(zhǎng)抑制作用。結(jié)果表明鼠尾藻組織甲醇提取物對(duì) 3種赤潮微藻均具有最高的生長(zhǎng)抑制活性。通過(guò)對(duì)鼠尾藻甲醇提取物進(jìn)行GC/MS分析, 表明不飽和脂肪酸可能是鼠尾藻組織內(nèi)抑制赤潮微藻生長(zhǎng)的克生物質(zhì)。

A new simple screening method for the detection of paralytical shellfish poisoning toxins in shellfish

程金平, 皮帥帥等: 我國(guó)目前對(duì)麻痹性貝毒(PSP)的檢測(cè)采用的是國(guó)際公認(rèn)的小白鼠生物試驗(yàn)法(mouse bioassay, MBA), 為緩解動(dòng)物保護(hù)組織者的不滿(mǎn)情緒, 本研究采用活體抽血方法替代傳統(tǒng)的以“死亡”為標(biāo)準(zhǔn)的宏觀(guān)判斷方法, 通過(guò)分析血液中神經(jīng)遞質(zhì)的含量可以快速檢測(cè)PSP毒素。

A new method for the estimation of fine-sediment resuspension ratios in estuaries

沈志良: 作者根據(jù)保守物質(zhì)在河口遷移、混合、稀釋的原理, 提出了一種計(jì)算具有細(xì)顆粒懸浮沉積物河口再懸浮比率的新方法, 并利用這一新方法計(jì)算得到2005年長(zhǎng)江口最大渾濁帶表層水中沉積物再懸浮比率為(18.7%±27.9%)–(73.9%±22.5%), 年平均再懸浮比率為48.5%, 以冬季再懸浮比率最大。最大渾濁帶顆粒物接近一半來(lái)自于沉積物的再懸浮, 表明沉積物的再懸浮是長(zhǎng)江河口最大渾濁帶形成的主要機(jī)理之一。與河口沉積物再懸浮比率的傳統(tǒng)計(jì)算方法比較, 新方法考慮了徑流夾帶的懸浮體含量在輸送過(guò)程中的動(dòng)態(tài)變化, 計(jì)算結(jié)果高于傳統(tǒng)方法約20%, 從而更加接近實(shí)際。新方法為進(jìn)一步計(jì)算河口各種顆粒物質(zhì)的再懸浮通量提供了新途徑。

Flume simulation of wave induced release of internal dissolved nitrogen in Lake Taihu, China

吳挺峰, 秦伯強(qiáng)等: 本文使用波浪水槽模擬太湖內(nèi)源溶解性氮釋放, 結(jié)果顯示波浪擾動(dòng)可以引起內(nèi)源氨氮大量釋放。同步間隙水氨氮和溶解氧濃度變化證明波浪引起的孔隙水運(yùn)動(dòng)可以通過(guò)增大濃度差而大幅提高內(nèi)源氨氮釋放速率。在太湖, 約15 cm厚度的表層底泥活躍層的形成也與此有關(guān)。

Remote sensing retrieval of inherent optical properties in the Bohai Sea

青松, 崔廷偉等: 作者利用渤海 77個(gè)站位的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)和 QAA(半分析方法)方法, 反演了水體總吸收系數(shù)和后向散射系數(shù)。在680–730 nm波段范圍之內(nèi)選取了 QAA算法的最佳參考波段。最后結(jié)合QAA-685和QAA-715算法, 反演水體吸收和后向散射系數(shù), 平均誤差分別為18.8%和19.6%。此算法還應(yīng)用于MERIS數(shù)據(jù), 獲取了渤海吸收系數(shù)和散射系數(shù)。

A background error covariance model of significant wave height via Monte Carlo simulation

郭衍游, 侯一筠等: 在海浪資料同化中, 許多研究結(jié)果表明海浪背景誤差協(xié)方差(BEC)具有各向異性和流依賴(lài)性, 但是, 準(zhǔn)確描述這種性質(zhì)仍然非常困難, 在業(yè)務(wù)部門(mén), 海浪同化系統(tǒng)仍然采用與距離呈負(fù)指數(shù)相關(guān)的模型。我們通過(guò) Monte Carlo模擬,指出可以在 BEC模型中加入一個(gè)與波向有關(guān)的參數(shù),這比單純考慮距離這一個(gè)因子要更為合理。作者應(yīng)用新模型開(kāi)展了 2000年 8月同化試驗(yàn), 結(jié)果表明:新模型對(duì)同化效果有明顯的改善。Energy dissipation through wind-generated breaking waves

張書(shū)文, 曹瑞雪等: 波浪破碎過(guò)程被認(rèn)為是控制海洋上表層的湍流屬性和熱通量、物質(zhì)通量交換的主要因素。就能量輸入、風(fēng)生波譜和波成長(zhǎng)率而言, 波浪破碎產(chǎn)生的海洋表層單位面積的能量耗散可以表達(dá)為能量耗散率, 此參數(shù)表征能量耗散率很強(qiáng)的依賴(lài)于風(fēng)速和海洋狀態(tài)。對(duì)比以往的工作, 我們的模型計(jì)算結(jié)果位于Hwang and Sletten’s (2008) 和Thorpe’s (1993) 的模型結(jié)果之間, 與 Hanson and Phillips’s (1999)的模型結(jié)果非常接近, 并最終給出波浪破碎下湍流動(dòng)能的垂直分布。

Future projection of East China Sea temperature by dynamic downscaling of the IPCC_AR4 CCSM3 model’s result

于曉林, 王凡等: 對(duì)IPCC_AR4中CCSM3的結(jié)果進(jìn)行動(dòng)態(tài)降尺度模擬來(lái)研究中國(guó)近海的未來(lái)海溫。降尺度流場(chǎng)中東海黑潮流量增加。平均百年溫度增長(zhǎng)在B1中為1.2～2℃, A2中為2.5～4.5℃。模擬顯示平流熱輸運(yùn)是增暖分布不同的原因, 次表層黃海冷水團(tuán)區(qū)增暖最明顯。

Simulation of phytoplankton biomass in Quanzhou Bay using a back propagation network model and sensitivity analysis for environmental variables

鄭偉, 石洪華等: 在分析近海浮游植物生物量影響因素的基礎(chǔ)上, 以廣西沿海為例, 根據(jù) 2006～2007年海洋環(huán)境監(jiān)測(cè)資料為訓(xùn)練和檢驗(yàn)樣本, 建立了一個(gè)多輸入單輸出的三層BP型人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò), 采用8項(xiàng)水質(zhì)參數(shù)預(yù)測(cè)浮游植物生物量(Chl-a)的變化。檢驗(yàn)結(jié)果表明, 檢測(cè)集網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)值與觀(guān)測(cè)值相關(guān)系數(shù)為 93.5%, 網(wǎng)絡(luò)的平均相對(duì)誤差為 2.3%, 相對(duì)誤差絕對(duì)值的均值為15.74%。為進(jìn)一步剖析浮游植物生物量對(duì)環(huán)境因子變化的響應(yīng), 構(gòu)建了靈敏度分析模型, 采用全局靈敏度分析的方法, 計(jì)算了各類(lèi)環(huán)境指標(biāo)對(duì)浮游植物生物量的相對(duì)影響程度, 研究發(fā)現(xiàn)廣西沿海浮游植物生物量對(duì)溶解氧、活性硅酸鹽、總氮和總磷是敏感的。Energetics and temporal variability of internal tides in Luzon Strait: a nonhydrostatic numerical simulation

李明杰, 侯一筠等: 本文利用一個(gè)三維非線(xiàn)性、非靜力近似模式(MITgcm), 探討了呂宋海峽中內(nèi)潮的時(shí)空分布特征及能量轉(zhuǎn)化、輸運(yùn)機(jī)制。模式結(jié)果顯示, 大小潮周期變化會(huì)改變內(nèi)潮產(chǎn)生源地, 但巴坦群島附近無(wú)論大小潮均為主要源地。此外內(nèi)潮呈現(xiàn)明顯的季節(jié)性變化, 夏季最強(qiáng), 冬季最弱。

Inversion of two-dimensional tidal open boundary conditions of M2constituent in the Bohai and Yellow Sea

曹安州, 呂咸青等: 本文利用二維潮汐伴隨同化模型, 通過(guò)同化高度計(jì)資料, 反演了渤、黃海 M2分潮的開(kāi)邊界條件, 在反演時(shí)采用了獨(dú)立點(diǎn)方案。孿生實(shí)驗(yàn)對(duì)該方法的可行性和有效性進(jìn)行了驗(yàn)證。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中, 同化100步后, 采用7種獨(dú)立點(diǎn)方案都能使代價(jià)函數(shù)能夠下降到初始值的百分之一以下,模擬值和觀(guān)測(cè)值的振幅差和遲角差都在 5 cm和 5°以?xún)?nèi), 數(shù)值模擬結(jié)果都很好地刻畫(huà)了渤、黃海M2分潮的特征。

Accumulation and exploration of gas hydrate in deep-sea sediments of northern South China Sea

張光學(xué), 沙志彬等: 本文利用南海北部深水地震、重力活塞取樣和鉆孔資料, 分析沉積異常體的地震特征、沉積特征及其內(nèi)部天然氣水合物藏之特征,探討深水沉積對(duì)天然氣水合物藏的控礦作用。結(jié)果表明, 南海北部深水區(qū)具有形成多類(lèi)型沉積波(或異常體)等有利于天然氣水合物成藏的優(yōu)越沉積條件,資源潛力巨大, 具有良好勘探前景。

Morphodynamic evolution of the Xiaoqing River mouth: a Huanghe River-derived mixed energy estuary

黃海軍, 劉艷霞等: 作者探討了小清河口的地貌演化和動(dòng)力機(jī)制。表明其地貌發(fā)育受 NE向波浪和NE-E向的徑潮流混合的作用, 河口淺灘泥沙輸運(yùn)主要是由北向南的局地搬運(yùn), 淺灘經(jīng)歷大、下兩個(gè)循環(huán)過(guò)程,但河口兩側(cè)海岸變遷不受淺灘直接堆積作用影響。

(文/《中國(guó)海洋湖沼學(xué)報(bào)》(英文版); 編輯/譚雪靜)