《中國海洋湖沼學報》(英文版, SCI-E收錄)

Chinese Journal of Oceanology and Limnology

2012年第5期論文導讀

EST-derived SNP discovery and selective pressure analysis in Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei)

柳承璋, 相建海等: 通過對凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)表達序列標簽的分析預測了17225個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點, 包括9546個轉(zhuǎn)換、5124個顛換以及 2481個插入/缺失突變; 發(fā)現(xiàn)了4262個非同義SNP突變。篩選了250個與重要生經(jīng)濟性狀相關(guān)的非同義SNP作為可用于遺傳選育的候選分子標記。KaKs分析顯示, 多數(shù)基因承受負選擇壓力, 而與先天性免疫和雄性配子發(fā)生相關(guān)的基因承受正選擇壓力。作者首次對一種對蝦進行了轉(zhuǎn)錄組水平上的遺傳選擇壓力分析。

Extract ofMeretrix meretrixLinnaeus induces angiogenesisin vitroand activates endothelial nitric oxide synthase

劉明, 林秀坤等: 文蛤(Meretrix meretrix)作為中藥應(yīng)用在中國有悠久的歷史。本研究利用 HUVECs模型研究了文蛤促進新生血管生成的活性。文蛤肉勻漿后, 分別以丙酮、乙醇提取, 再經(jīng)Sphadex G-25凝膠柱進行初步分離。活性成分AFG-25能夠明顯促進HUVECs的增殖、遷移、血管擬態(tài)的形成。其作用機制可能是活化NO合成酶, 促進NO的生成, 激活eNOS/NO途徑進而促進新生血管的生成。本研究表明文蛤提取物中含有促進新生血管生成的活性物質(zhì), 值得進一步分離純化、鑒定, 為缺血性疾病提供先導化合物。

A real time PCR targeted to the upstream regions of HlyB protein for specific detection ofEdwardsiella tarda

謝國駟, 黃倢等: 根據(jù)遲緩愛德華氏菌(Edwardsiella tarda)HlyB蛋白的上游區(qū)域基因序列,設(shè)計引物和TaqMan探針, 建立了遲緩愛德華氏菌的實時定量 PCR檢測方法。研究結(jié)果表明, 該方法快速、靈敏、特異、重復性好, 并能進行臨床樣品中該病原的定量檢測, 該方法的建立對遲緩愛德華氏菌的快速臨床診斷及疫情監(jiān)測具有重要意義。

Biochemical responses in the musselMytilus coruscusexposed in vivo to sub-lethal copper concentrations

李一峰, 顧忠旗等: 本實驗研究了銅離子(Cu2+)對厚殼貽貝(Mytilus coruscus)內(nèi)臟、鰓和肌肉SOD、CAT、ACP、AKP、GOT和GPT的酶活力影響。結(jié)果表明, 隨著 Cu2+濃度的升高, 厚殼貽貝死亡率逐漸增大。不同組織間不同酶活力存在差異性。

Screening of marine fungus from Nanji Island offshore and the activity of their metabolites against pathogeneticVibriofromPseudosciaena crocea

趙淑江, 李書平等: 以7種水產(chǎn)病原菌為指示菌,初篩獲得有抑菌活性的菌株19株。對其發(fā)酵液進行抑菌活性復篩, 有 9個菌株的次級代謝產(chǎn)物對指示菌有抑制作用, 其中菌株NJ0104抑菌活性最強。對該菌株次級代謝產(chǎn)物進行初步研究, 發(fā)現(xiàn): 其抑菌活性物質(zhì)在80℃以下、紫外照射40 min時穩(wěn)定性良好, pH穩(wěn)定范圍在4.0～7.0。采用傳統(tǒng)形態(tài)鑒定方法結(jié)合 ITS-5.8SrDNA片段 PCR擴增和序列測定,NJ0104鑒定為節(jié)菱孢屬Arthriniumsp.。

Disparity of Intestinal Bacterial Communities in Grass CarpCtenopharyngodon idellusfrom Two Different Habitats

倪加加, 余育和等: 作者通過 PCR-DGGE指紋分析技術(shù)分析了池塘養(yǎng)殖草魚(Ctenopharyngodon idellus)和湖泊生長的草魚腸道菌群結(jié)構(gòu), UPGMA聚類和PCA排序都顯示兩種生境下的草魚腸道菌群結(jié)構(gòu)存在明顯差異, 而這種差異與草魚自身的遺傳差異沒有相關(guān)性(Mantel 單尾檢驗,R= 0.157,P=0.175)。這種差異可能是造成池塘養(yǎng)殖草魚易患細菌性疾病的重要原因。

First record of generaRutilariaandTrigonium(Bacillariophyta) and 11 marine diatom taxa (species and varieties) in South China Sea

吳瑞, 高亞輝等: 作者對南海表層沉積物中的硅藻進行了研究, 供研究的表層沉積物樣品是由“海洋四號”船于2000年、2001年及“實驗三號”船于2007年在南海采集的, 表層樣品采用箱式取樣器或抓斗采集的表層1 cm的沉積物。觀察到我國的兩個新記錄屬—舟輻藻屬(RutilariaGreville)和三角藻(TrigoniumCleve), 11個新記錄種和變種Rutilaria radiateGrove & Sturt,Asterolampra grevillei(Wall.)Greville,Biddulphia turrigeraMann,Cocconeis cyclophoravar.decoraA S,Cocconeis ocellataMann,Dictyoneis marginata(F. W. Lewis) Cleve,Entogonia davyanaGreville,Tryblionella campechianaGrunow,Plagiogramma KinkeriA S,Plagiogramma nankoorenseGrunow, andTrigoniumcf.contumaxMann, 這些種類主要是現(xiàn)生種(兩個是化石種), 分布在東太平洋、西太平洋和印度洋, 在菲律賓分布的最多。作者對其分類特征和分布進行了描述并配有相應(yīng)的光鏡照片。

IdentificationSargassum thunbergiicompounds toxic to red tide microalgae

王仁君, 唐學璽等: 作者以鼠尾藻(Sargassum thunbergii)、海黍子(Sargassumpallidum)和海蒿子(Sargassum kjellmanianum)為大型海藻(褐藻)的代表,以赤潮異彎藻(Heterosigma akashiwo)、中肋骨條藻(Skeletonema costatum)和海洋原甲藻(Prorocentrum micans)為目標微藻, 研究了不同濃度的 3種大型褐藻組織甲醇提取物對3種赤潮微藻的生長抑制作用。結(jié)果表明鼠尾藻組織甲醇提取物對 3種赤潮微藻均具有最高的生長抑制活性。通過對鼠尾藻甲醇提取物進行GC/MS分析, 表明不飽和脂肪酸可能是鼠尾藻組織內(nèi)抑制赤潮微藻生長的克生物質(zhì)。

A new simple screening method for the detection of paralytical shellfish poisoning toxins in shellfish

程金平, 皮帥帥等: 我國目前對麻痹性貝毒(PSP)的檢測采用的是國際公認的小白鼠生物試驗法(mouse bioassay, MBA), 為緩解動物保護組織者的不滿情緒, 本研究采用活體抽血方法替代傳統(tǒng)的以“死亡”為標準的宏觀判斷方法, 通過分析血液中神經(jīng)遞質(zhì)的含量可以快速檢測PSP毒素。

A new method for the estimation of fine-sediment resuspension ratios in estuaries

沈志良: 作者根據(jù)保守物質(zhì)在河口遷移、混合、稀釋的原理, 提出了一種計算具有細顆粒懸浮沉積物河口再懸浮比率的新方法, 并利用這一新方法計算得到2005年長江口最大渾濁帶表層水中沉積物再懸浮比率為(18.7%±27.9%)–(73.9%±22.5%), 年平均再懸浮比率為48.5%, 以冬季再懸浮比率最大。最大渾濁帶顆粒物接近一半來自于沉積物的再懸浮, 表明沉積物的再懸浮是長江河口最大渾濁帶形成的主要機理之一。與河口沉積物再懸浮比率的傳統(tǒng)計算方法比較, 新方法考慮了徑流夾帶的懸浮體含量在輸送過程中的動態(tài)變化, 計算結(jié)果高于傳統(tǒng)方法約20%, 從而更加接近實際。新方法為進一步計算河口各種顆粒物質(zhì)的再懸浮通量提供了新途徑。

Flume simulation of wave induced release of internal dissolved nitrogen in Lake Taihu, China

吳挺峰, 秦伯強等: 本文使用波浪水槽模擬太湖內(nèi)源溶解性氮釋放, 結(jié)果顯示波浪擾動可以引起內(nèi)源氨氮大量釋放。同步間隙水氨氮和溶解氧濃度變化證明波浪引起的孔隙水運動可以通過增大濃度差而大幅提高內(nèi)源氨氮釋放速率。在太湖, 約15 cm厚度的表層底泥活躍層的形成也與此有關(guān)。

Remote sensing retrieval of inherent optical properties in the Bohai Sea

青松, 崔廷偉等: 作者利用渤海 77個站位的實測數(shù)據(jù)和 QAA(半分析方法)方法, 反演了水體總吸收系數(shù)和后向散射系數(shù)。在680–730 nm波段范圍之內(nèi)選取了 QAA算法的最佳參考波段。最后結(jié)合QAA-685和QAA-715算法, 反演水體吸收和后向散射系數(shù), 平均誤差分別為18.8%和19.6%。此算法還應(yīng)用于MERIS數(shù)據(jù), 獲取了渤海吸收系數(shù)和散射系數(shù)。

A background error covariance model of significant wave height via Monte Carlo simulation

郭衍游, 侯一筠等: 在海浪資料同化中, 許多研究結(jié)果表明海浪背景誤差協(xié)方差(BEC)具有各向異性和流依賴性, 但是, 準確描述這種性質(zhì)仍然非常困難, 在業(yè)務(wù)部門, 海浪同化系統(tǒng)仍然采用與距離呈負指數(shù)相關(guān)的模型。我們通過 Monte Carlo模擬,指出可以在 BEC模型中加入一個與波向有關(guān)的參數(shù),這比單純考慮距離這一個因子要更為合理。作者應(yīng)用新模型開展了 2000年 8月同化試驗, 結(jié)果表明:新模型對同化效果有明顯的改善。Energy dissipation through wind-generated breaking waves

張書文, 曹瑞雪等: 波浪破碎過程被認為是控制海洋上表層的湍流屬性和熱通量、物質(zhì)通量交換的主要因素。就能量輸入、風生波譜和波成長率而言, 波浪破碎產(chǎn)生的海洋表層單位面積的能量耗散可以表達為能量耗散率, 此參數(shù)表征能量耗散率很強的依賴于風速和海洋狀態(tài)。對比以往的工作, 我們的模型計算結(jié)果位于Hwang and Sletten’s (2008) 和Thorpe’s (1993) 的模型結(jié)果之間, 與 Hanson and Phillips’s (1999)的模型結(jié)果非常接近, 并最終給出波浪破碎下湍流動能的垂直分布。

Future projection of East China Sea temperature by dynamic downscaling of the IPCC_AR4 CCSM3 model’s result

于曉林, 王凡等: 對IPCC_AR4中CCSM3的結(jié)果進行動態(tài)降尺度模擬來研究中國近海的未來海溫。降尺度流場中東海黑潮流量增加。平均百年溫度增長在B1中為1.2～2℃, A2中為2.5～4.5℃。模擬顯示平流熱輸運是增暖分布不同的原因, 次表層黃海冷水團區(qū)增暖最明顯。

Simulation of phytoplankton biomass in Quanzhou Bay using a back propagation network model and sensitivity analysis for environmental variables

鄭偉, 石洪華等: 在分析近海浮游植物生物量影響因素的基礎(chǔ)上, 以廣西沿海為例, 根據(jù) 2006～2007年海洋環(huán)境監(jiān)測資料為訓練和檢驗樣本, 建立了一個多輸入單輸出的三層BP型人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò), 采用8項水質(zhì)參數(shù)預測浮游植物生物量(Chl-a)的變化。檢驗結(jié)果表明, 檢測集網(wǎng)絡(luò)預測值與觀測值相關(guān)系數(shù)為 93.5%, 網(wǎng)絡(luò)的平均相對誤差為 2.3%, 相對誤差絕對值的均值為15.74%。為進一步剖析浮游植物生物量對環(huán)境因子變化的響應(yīng), 構(gòu)建了靈敏度分析模型, 采用全局靈敏度分析的方法, 計算了各類環(huán)境指標對浮游植物生物量的相對影響程度, 研究發(fā)現(xiàn)廣西沿海浮游植物生物量對溶解氧、活性硅酸鹽、總氮和總磷是敏感的。Energetics and temporal variability of internal tides in Luzon Strait: a nonhydrostatic numerical simulation

李明杰, 侯一筠等: 本文利用一個三維非線性、非靜力近似模式(MITgcm), 探討了呂宋海峽中內(nèi)潮的時空分布特征及能量轉(zhuǎn)化、輸運機制。模式結(jié)果顯示, 大小潮周期變化會改變內(nèi)潮產(chǎn)生源地, 但巴坦群島附近無論大小潮均為主要源地。此外內(nèi)潮呈現(xiàn)明顯的季節(jié)性變化, 夏季最強, 冬季最弱。

Inversion of two-dimensional tidal open boundary conditions of M2constituent in the Bohai and Yellow Sea

曹安州, 呂咸青等: 本文利用二維潮汐伴隨同化模型, 通過同化高度計資料, 反演了渤、黃海 M2分潮的開邊界條件, 在反演時采用了獨立點方案。孿生實驗對該方法的可行性和有效性進行了驗證。在實際實驗中, 同化100步后, 采用7種獨立點方案都能使代價函數(shù)能夠下降到初始值的百分之一以下,模擬值和觀測值的振幅差和遲角差都在 5 cm和 5°以內(nèi), 數(shù)值模擬結(jié)果都很好地刻畫了渤、黃海M2分潮的特征。

Accumulation and exploration of gas hydrate in deep-sea sediments of northern South China Sea

張光學, 沙志彬等: 本文利用南海北部深水地震、重力活塞取樣和鉆孔資料, 分析沉積異常體的地震特征、沉積特征及其內(nèi)部天然氣水合物藏之特征,探討深水沉積對天然氣水合物藏的控礦作用。結(jié)果表明, 南海北部深水區(qū)具有形成多類型沉積波(或異常體)等有利于天然氣水合物成藏的優(yōu)越沉積條件,資源潛力巨大, 具有良好勘探前景。

Morphodynamic evolution of the Xiaoqing River mouth: a Huanghe River-derived mixed energy estuary

黃海軍, 劉艷霞等: 作者探討了小清河口的地貌演化和動力機制。表明其地貌發(fā)育受 NE向波浪和NE-E向的徑潮流混合的作用, 河口淺灘泥沙輸運主要是由北向南的局地搬運, 淺灘經(jīng)歷大、下兩個循環(huán)過程,但河口兩側(cè)海岸變遷不受淺灘直接堆積作用影響。

(文/《中國海洋湖沼學報》(英文版); 編輯/譚雪靜)