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        PLCε基因敲除小鼠微衛(wèi)星DNA遺傳監(jiān)測分析

        2012-01-30 09:46:14李曉娟白云峰戴廣海李瑞生
        中國比較醫(yī)學雜志 2012年10期
        關鍵詞:微衛(wèi)星雜合動物模型

        崔 智,李曉娟,白云峰,侯 俊,戴廣海,李瑞生

        (1.解放軍總醫(yī)院腫瘤綜合治療科,北京 100853;2.解放軍第302醫(yī)院實驗技術保障中心,北京 100039)

        隨著生命科學的不斷發(fā)展,越來越多的模型動物被廣泛地應用于臨床實驗研究中。2001年 Song C等[1]在哺乳動物中克隆出與 PLC210同源序列的PLC,由于與其他已知的PLC不同,因而被命名為PLCε,2003年采用基因打靶法成功建立了 PLCε基因敲除小鼠。該模型小鼠其繁殖后代中有敲基因型、雜合型和野生型等三種混合類型,但從外觀表型上很難鑒別其各自不同的基因類型。微衛(wèi)星DNA標記技術是采用多態(tài)性微衛(wèi)星DNA位點來對遺傳物質(zhì)DNA直接進行監(jiān)測,以分析其遺傳特性,該技術在大小鼠遺傳監(jiān)測中得到了廣泛應用,并驗證了它的準確性和可靠性[2]。因此,本研究應用所篩選的13個具有高度多態(tài)性的微衛(wèi)星DNA位點和2個通過敲除基因序列自行設計的引物,對PLCε基因敲除小鼠群體的遺傳背景進行有效地遺傳質(zhì)量監(jiān)測,旨在分析其遺傳背景特性和鑒別所生產(chǎn)繁殖的三種(敲基因型、雜合型和野生型)不同基因類型小鼠,為今后進行模型動物的研究和開發(fā)利用提供可靠的理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 實驗動物

        PLCε基因敲除小鼠來源于日本神戶大學,由解放軍第302醫(yī)院動物實驗中心生產(chǎn)繁殖,隨機選取6~8周齡小鼠28只,雌雄各半,編號1~14號為雌性,15~28號為雄性,單鼠體質(zhì)量為20g~25g,動物實驗室飼養(yǎng)條件為SPF級,實驗動物使用許可證號:SYXK(軍)-2007-010。剪小鼠尾巴,-20℃冰箱內(nèi)保存。

        1.2 藥品與生化試劑

        硝酸銀、冰醋酸、三羥甲基胺基甲烷、過硫酸銨、無水碳酸鈉、甲醛、無水乙醇,DNA提取緩沖液,Taq DNA聚合酶和10×buffer(寶生物公司),dNTP (Sangon公司),TEMED(Sigma公司)。

        1.3 引物合成

        選擇具有高度多態(tài)性的微衛(wèi)星 DNA位點:D1Mit365、D3Mit51、D4Mit235、D6Mit102、D7Mit281、D8Mit113、 D9Mit23、 D10Mit180、 D13Mit88、D16Mit145、D17Mit36、D18Mit94、D19Mit97、Dq(敲基因型)和Dy(野生型)等15個微衛(wèi)星基因座位點,這些位點引物序列均來自參考文獻[3,4],由上海生物工程技術有限公司合成。

        1.4 方法

        1.4.1 基因組DNA的提?。簩?8只小鼠尾巴各剪取1cm左右,剪細碎后放于2.0m L EP管內(nèi),加入30μL~35μL蛋白K及470μL DNA提取緩沖液,將其上下顛倒充分混勻后,置于 37℃水浴鍋內(nèi)過夜,待其全部消化溶解后,用等體積的Tris飽和酚和三氯甲烷分3次進行抽提DNA,用冰無水乙醇析出基因組DNA,干燥后用(50~200)μL TE全部溶解,然后用紫外分光光度計測其樣品的純度和濃度,配制成100ng/uL左右,置于4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4.2 PCR的擴增:每個PCR擴增體系為50μL,緩沖液 buffer 5μL,上下游引物各 0.2μmol/L,dNTP 200μmol/L,Taq酶1U,DNA模板為1μL。反應條件:95℃預變性3min,95℃變性30s,48℃ ~65℃退火30s,72℃延伸1min,循環(huán)25~30次,最后一個循環(huán)延伸 7 min,擴增產(chǎn)物于 4℃冰箱內(nèi)保存。

        1.4.3 電泳與銀染檢測;抽取已加入染料的PCR擴增產(chǎn)物10μL,注入8%聚丙烯酰胺凝膠樣品孔中,200V電泳1h~2h。電泳后的凝膠用10%冰醋酸固定,硝酸銀染色,碳酸鈉顯色,待條帶清晰后,用終止液停顯。然后進行圖帶拍照保存分析。

        1.4.4 結(jié)果判讀與分析:根據(jù)電泳后聚丙烯酰胺凝膠上的DNA圖帶,其泳動距離遠近進行判讀,按泳動距離遠近設定為阿拉伯字母1、2、3……N,如果DNA圖帶泳動距離一致,可判定為單態(tài)性,若有差異可判定為多態(tài)性[5]。對于 Dq和 Dy兩個位點的電泳圖帶,如果只有Dy位點有圖帶,而Dq位點沒有圖帶,可判定為野生型;如果Dq和Dy兩位點都有擴增圖帶,可判定為雜合型;若只有Dq位點有圖帶,而Dy位點沒有擴增圖帶,則可判定為敲基因型。

        2 結(jié)果

        2.1 15個微衛(wèi)星DNA位點PCR擴增條件分析

        利用1號小鼠DNA對所篩選的15個微衛(wèi)星DNA位點的各種濃度梯度條件進行了PCR擴增,通過對凝膠電泳圖帶的清晰程度、泳動距離進行了對比分析,獲得各個微衛(wèi)星DNA位點最佳Mg2+濃度、退火溫度、擴增片段大小和擴增循環(huán)次數(shù)等擴增條件(表1)。

        表1 15個微衛(wèi)星DNA位點最佳PCR擴增條件Tab.1 The best conditions of PCR amplification of 15microsatellite DNA loci

        圖1 D3Mit51位點擴增的DNA圖譜注:M:為marker,1-14:為1號-14號小鼠個體Fig.1 DNA mapping of amp lification of D3M it51locusNote:M:Marker;1-14:For 1-14individuals of mice

        2.2 13個多態(tài)性微衛(wèi)星DNA位點PCR擴增結(jié)果的分析

        利用所獲得的13個多態(tài)性微衛(wèi)星DNA位點的最佳PCR擴增條件對28只小鼠分別進行了擴增,結(jié)果每個微衛(wèi)星DNA位點的28只小鼠所擴增出來的圖帶其泳動距離一致,均呈單態(tài)性,其中D3Mit51位點單態(tài)性的擴增圖譜結(jié)果(圖1)。說明了此小鼠遺傳背景呈現(xiàn)一致性,沒有發(fā)生遺傳變異,保持了遺傳的穩(wěn)定性。

        2.3 Dq和Dy兩個位點三種基因型的鑒別分析

        利用Dq和Dy兩個位點對28只小鼠進行了PCR擴增,其電泳圖帶結(jié)果發(fā)現(xiàn)4,6,11,16,19和23號小鼠的Dq位點有圖帶,而Dy位點沒有圖帶,則可判定為敲基因型;5,9,14,17,21,22和28號小鼠的Dy位點有圖帶,而Dq位點沒有圖帶,則可判定為野生型;而1,2,3,7,8,10,12,13,15,18,20,24,25,26和27號小鼠的Dq和 Dy兩位點都有擴增圖帶,則可判定為雜合型。其中1-8號小鼠Dy和Dq兩位點的PCR擴增圖帶(圖2和圖3)。

        圖2 Dy位點擴增的DNA圖譜注:M:為Marker,1-8:為1-8號小鼠個體Fig.2 DNA mapping of amplification of Dy locusNote:M:Marker;1-8:For individuals 1-8of mice

        3 討論

        小鼠微衛(wèi)星基因座位點存在于整個基因組中,其核心序列為2~6bp的串聯(lián)重復序列,重復次數(shù)達幾次甚至幾十次,由于其重復次數(shù)的不同而呈現(xiàn)出微衛(wèi)星DNA位點的高度多態(tài)性。正是利用此特點可以對近交系、封閉群、雜合群及不同品系動物的遺傳背景進行有效地監(jiān)測分析,目前在小鼠基因圖譜中包含了7 377個微衛(wèi)星DNA位點,其中有6580個顯示多態(tài)性[6]。本實驗所選取的敲基因小鼠是來源于日本神戶大學實驗室[7],由302醫(yī)院動物實驗中心保種繁殖,沒有引入外來血緣。人們采用基因敲除技術已建立了許多人類疾病動物模型,如敲基因小鼠模型[8]、膀胱癌動物模型[9]、皮膚癌動物模型[10]、前列腺癌動物模型[11]等,但這些敲基因動物模型的遺傳背景是否發(fā)生了改變,以及變異的程度還不是很清楚。因此,本實驗利用所篩選的13個多態(tài)性高的微衛(wèi)星DNA位點對所選取的28只成年小鼠進行了遺傳背景的質(zhì)量監(jiān)測,結(jié)果顯示13位點均呈現(xiàn)一條圖帶且泳動距離一致,說明該位點純合且呈單態(tài)性,從而說明了該群體的遺傳背景均一,沒有發(fā)生遺傳污染或遺傳變異,符合實驗動物近交系的基本要求。因此,應用微衛(wèi)星DNA標記技術可以進行純合位點的判定,同時也能對位點的變異情況進行分析,適于近交系動物的遺傳質(zhì)量檢測[12]。這些高度多態(tài)性的微衛(wèi)星DNA位點曾在不同品系大小鼠的遺傳質(zhì)量監(jiān)測中得到過有效驗證[13,14]。

        圖3 Dq位點擴增的DNA圖譜注:M:為Marker,1-8:為1-8號小鼠個體Fig.3 DNA mapping of amplification of D3Mit51locusNote:M:Marker;1-8:For individuals 1-8of mice

        該群體小鼠是嚴格按照雜合型自交方式來進行繁殖,按照孟德爾遺傳學繁殖規(guī)律所產(chǎn)生的繁殖后代均會出現(xiàn)三種不同的基因型[15],但從外觀上很難鑒別。因此,本實驗利用2個特殊位點對所選取的28只成年小鼠進行了遺傳背景分析,鑒別出敲基因型小鼠6只,野生型小鼠7只和雜合型小鼠15只,該方法可以有效地鑒別出三種不同基因型小鼠,為今后該小鼠的應用和實驗研究提供了可靠的保障[16]。

        [1]Song C,Hu CD,Masago M,et al.Regulation of a novel human phospholipase C,PLC epsilon,through membrane targeting by Ras[J].J Biol Chem,2001,276(4):2752-2757.

        [2]歐陽兆和,陳振文,李瑞生,等.微衛(wèi)星DNA多態(tài)性在十種近交系小鼠遺傳監(jiān)測中的應用研究[J].中國比較醫(yī)學雜志,2004,14(2):71-74.

        [3]Mouse Genome Database(MGD),Mouse Genome Informatics Project,The Jakson Laboratory,Bar Harbor,ME.World Wide Web(URL:http//www.informatics.jax.org).

        [4]李瑞生,董罡,陳燕敏,等.微衛(wèi)星DNA監(jiān)控近交系小鼠的重組近交系培育研究[J].中國比較醫(yī)學雜志,2006,16(6):335-338.

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