王全富,侯艷華,藺一飛,李富超
(1.哈爾濱工業(yè)大學(xué)化工學(xué)院,黑龍江哈爾濱150001;2.哈爾濱工業(yè)大學(xué)海洋學(xué)院,山東威海264209;3.中國科學(xué)院海洋研究所實驗海洋生物學(xué)開放研究實驗室,山東青島266071)
深海及深海沉積物中微生物的生存面臨高壓,低溫或高溫、黑暗及低營養(yǎng)水平等幾個主要極端環(huán)境,經(jīng)過長期的自然選擇,形成了極為特殊的生理結(jié)構(gòu)和代謝機制。因此深海微生物的多樣性和資源開發(fā)受到越來越多的關(guān)注,有許多新藥物和新酶等資源正有待于研究和開發(fā)[1]。脂肪酶作為廣泛應(yīng)用的一種工業(yè)用酶,目前使用的基本都是中溫酶,酶活性最適溫度一般都在50 ℃左右。同中溫酶相比,低溫酶在工業(yè)應(yīng)用上有以下優(yōu)勢:通過溫和的熱處理使低溫酶失活,快速而經(jīng)濟地終止反應(yīng);生產(chǎn)過程在低溫或室溫下進(jìn)行,無需加熱和冷卻,可以降低成本;生產(chǎn)過程便于監(jiān)控。因此,低溫脂肪酶在食品工業(yè)領(lǐng)域中得到越來越廣泛的應(yīng)用,如在酒類釀造、奶酪的批量生產(chǎn)、面包加工、肉類軟化和食品添加劑等方面[2]。由于深海微生物采樣、分離培養(yǎng)等多種因素的影響,國內(nèi)外對深海微生物的研究還處于起步階段。本研究通過從鄂霍次克海域深海沉積物中分離篩選高產(chǎn)胞外脂肪酶的菌株,對其進(jìn)行16 S rRNA 分子鑒定,并對酶學(xué)性質(zhì)予以初步研究,為深海微生物酶資源在食品工業(yè)上的應(yīng)用提供理論參考。
深海沉積物樣品采集于由俄、韓、日、中四國共同組織的“海底冷泉與生命過程”聯(lián)合調(diào)查航次(2006年5月),深海微生物依常規(guī)沉積物的菌種稀釋方法從鄂霍次克海域采獲沉積物柱狀樣品(lv39-06-06-04-18H)中分離獲得。
篩選培養(yǎng)基:蛋白胨10 g,酵母粉5 g,NaCl 30 g,MgSO41 g,(NH4)2SO41 g,K2HPO42 g,Tween80 10 mL,海水1 000 mL。10 ℃下150 r/min 搖床培養(yǎng)4 d,測其脂肪酶活性。
脂肪酶酶活力測定采用NaOH 滴定法進(jìn)行。在溫度為35 ℃,反應(yīng)時間為30 min 的條件下,每分鐘水解脂肪產(chǎn)生1 μmol 脂肪酸所需的酶量定義為一個脂肪酶活性單位(U)。
1.4.1 細(xì)菌總DNA 的提取
按照CTAB 方法[3]。
1.4.2 16S rRNA 基因序列的PCR 擴增
采用細(xì)菌16S rRNA 基因的通用引物,引物序列為:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′和5′-GGTTA CCTTGTTACGACTT-3′。PCR 反應(yīng)體系為20 μL,包括:1×PCR 緩沖液,1.6 mmol/L MgCl2,4×dNTP 混合物各100 μmol/L,引物各1.0 μmol/L,Taq DNA 聚合酶1個單位,模板DNA 1 μL。PCR 反應(yīng)條件為:93 ℃,5 min;93 ℃,1 min;52 ℃,1 min;72 ℃,1 min 30 s,30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。
1.4.3 16S rRNA 基因文庫的構(gòu)建
以上海華舜DNA 純化試劑盒對PCR 產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,克隆到pMD18-T 質(zhì)粒載體上,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌Top10 感受態(tài)細(xì)胞,然后進(jìn)行陽性克隆的篩選;用北京賽百盛質(zhì)粒純化試劑盒提取陽性克隆的質(zhì)粒并進(jìn)行酶切鑒定;酶切成功的質(zhì)粒送交上海華大基因測序公司完成測序工作。測序引物為通用引物。
1.4.4 16S rRNA 基因序列測定與系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系的分析
將所測定菌株130(EU913789)的16S rRNA 基因序列(大約1.3Kb),同GenBank 數(shù)據(jù)庫中選取的與菌株親源關(guān)系較近16S rRNA 基因序列,用BioEdit 軟件的多序列比對排列(Clustalw multiple alignment)進(jìn)行序列比對;用DNAStar 軟件進(jìn)行序列相似性比較;系統(tǒng)發(fā)育分析采用Mega2 軟件的鄰接法(neighborjoining method)進(jìn)行;通過自舉分析(boot-strap)進(jìn)行置信度檢測,自舉數(shù)據(jù)集為1 000 次。
1.5.1 最適溫度測定
設(shè)置0、10、20、30、35、40、45、50、60 ℃9 個溫度梯度,測定不同溫度下的酶活力,以確定其最適溫度。
1.5.2 最適pH 測定
將酶在各pH 緩沖液NaAC/HAC(pH 5.0);KH2PO4/Na2HPO4(pH6.0,7.0);Tris-HCl (pH 8.0,9.0);Na2HPO4/NaOH(pH 10.0,11.0)中于4 ℃保存2 h 后,測其脂肪酶活性。
1.5.3 熱穩(wěn)定性測定
將酶液分別在30、40、50、60 ℃4 個溫度條件下依次保溫10、20、30、40 min,然后放入冰水混合物中,與未被保溫處理的酶活性相比較,測其脂肪酶活性。
1.5.4 金屬離子對酶活力影響的測定
金屬離子配制濃度為5 mmol/L,添加至酶活測定緩沖液中,35 ℃保溫15 min,測其脂肪酶活性。
采用平板涂布法和平板劃線法從2216E 平板上分離純化到150 株深海細(xì)菌,對這些菌株產(chǎn)脂肪酶進(jìn)行了篩選,其中菌株130 產(chǎn)酶活性最高達(dá)到42 U/mL。
對菌株130 的16S rRNA 基因序列的相似性進(jìn)行比較,見圖1。
圖1 菌株130 和相關(guān)菌株序列的16S rRNA 基因序列的鄰接法系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1 Phylogenetic tree showing the relationships of strain 130 with the related species constructed by the neighbour-joining method and based on 16S rRNA gene sequences.(結(jié)點處數(shù)字為bootstrap 值括號內(nèi)為序列登錄號)
結(jié)果表明:菌株130 的序列與Bacillus hwajinpoensis SW-72(AF541966)的同源性為99%。從圖1 系統(tǒng)進(jìn)化樹可見,菌株130 屬于芽孢桿菌目(Bacillales),芽孢桿菌科(Bacillaceae),芽孢桿菌屬(Bacillus)。Bacillus是深海環(huán)境中常見的微生物物種,能分泌許多活性物質(zhì),如新型低溫酶類、具有新穎結(jié)構(gòu)的先導(dǎo)化合物等[4]。關(guān)于此屬菌株能夠產(chǎn)低溫脂肪酶的研究報道較少。
溫度是影響酶促反應(yīng)的重要因素。在0 ℃~60 ℃范圍內(nèi)測定酶活力隨溫度的變化情況見圖2。
圖2 溫度對脂肪酶活性的影響Fig.2 Effect of temperature on the activity of the lipase
結(jié)果表明,該脂肪酶最適作用溫度為35 ℃,在0 ℃可保持約33%的相對酶活力。Rashid 等(2001)報道的深海適冷假單胞菌(Pseudomonas sp.)KB700A 所產(chǎn)低溫脂肪酶的最適酶活溫度也為35 ℃[5]。據(jù)Margesin 的定義[6],通常把最適催化溫度在35 ℃左右、在0 ℃左右仍有一定催化效率的酶,稱為低溫酶。這表明該菌株分泌的胞外脂肪酶屬于低溫脂肪酶,有望應(yīng)用于低溫環(huán)境工業(yè)下的生物催化。
pH 對脂肪酶活性的影響見圖3。
圖3 pH 對脂肪酶活性的影響Fig.3 Effect of pH on the activity of the lipase
菌株130 所產(chǎn)低溫脂肪酶在pH 5~7 的范圍內(nèi)均存在著較高酶活力,最適pH 為6.0,在pH 為9.0~11.0時,幾乎沒有酶活??梢娫撝久笧樗嵝灾久?,這與大多數(shù)低溫脂肪酶的最適pH 8.0~9.0 有顯著區(qū)別[7-8]。這種特殊的酶學(xué)特性將在工業(yè)上有廣泛應(yīng)用前景。
脂肪酶的熱穩(wěn)定性的實驗見圖4。
圖4 表明,30 ℃和40 ℃對酶活性影響不大,但隨著處理溫度的升高,熱穩(wěn)定性較差,該酶半衰期為50 ℃保溫10 min,60 ℃下保溫10 min 后酶活性下降了70 %,該酶對熱較為敏感,是長期低溫生活對環(huán)境的一種適應(yīng),也是低溫酶的一個重要特征。
脂肪酶對金屬離子的影響情況列于表1 中。
EDTA 對脂肪酶活性沒有影響,表明該酶的催化作用不需要金屬離子的參與;某些金屬離子的存在會微弱抑制酶活,如Mg2+、Fe2+、Ca2+和K+,但Cu2+和Zn2+存在的條件下,酶活降至對照的19.20%、28.29%。
本文從鄂霍次克海域深海微生物中篩選到產(chǎn)脂肪酶活性較高的菌株130,經(jīng)16S rRNA 分子鑒定為Bacillus sp.130。該菌株分泌的胞外脂肪酶是一種新型的低溫酸性脂肪酶,其最適作用溫度在35 ℃左右,在0 ℃可保持33%的相對酶活力,最適作用pH 6.0,相對于中溫脂肪酶最適作用溫度較低,最適作用pH 偏酸性,因此在食品、輕化工和醫(yī)藥等領(lǐng)域有良好的應(yīng)用前景。
表1 金屬離子對脂肪酶活性的影響Table 1 Effect of metal ions on the activity of the lipase
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