由中國、美國、荷蘭、以色列等 14個國家的 300多位科學家組成的“番茄基因組研究國際協(xié)作組”，經(jīng)過8年多的艱苦努力，完成了對栽培番茄全基因組的精細序列分析。該成果于2012年5月31日以封面文章發(fā)表在國際權威學術期刊《自然（Nature）》上。

茄科植物包含了世界上最多最重要的蔬菜作物，在世界農(nóng)業(yè)中的地位僅次于禾本科和豆科，選擇代表蔬菜和水果果實發(fā)育和成熟過程的模式植物并對其基因組進行精細序列分析是我國乃至世界農(nóng)業(yè)的迫切需求。而番茄作為茄科植物的代表，是研究果實發(fā)育和成熟過程的經(jīng)典模式植物。此次科學家通過國際合作獲得的高質量番茄基因組序列分析，解碼了栽培番茄與其祖先野生醋栗番茄的基因組，發(fā)現(xiàn)了栽培番茄果實發(fā)育和營養(yǎng)品質進化的基因組基礎，為番茄育種中利用野生資源的優(yōu)異基因提供了有力的工具，將極大地推動番茄乃至包括馬鈴薯、辣椒、茄子等在內(nèi)的茄科植物的功能基因組研究，為培育具有高產(chǎn)、優(yōu)質、抗病蟲害、抗逆等優(yōu)良性狀的番茄新品種打下了良好基礎，對推動全世界番茄生產(chǎn)具有重要意義。

在番茄基因組研究中，中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所李傳友研究員和薛勇彪研究員負責完成了第3號染色體的測序工作，中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員和杜永臣研究員負責完成了第 11號染色體的測序工作。中國科學家高質量完成了番茄基因組測序總任務的 1/6，標志著我國是番茄基因組學研究的強國之一，在國際蔬菜基因組研究領域具有國家優(yōu)勢地位。

目前，我國蔬菜種業(yè)面臨著強大的國際競爭，跨國種子公司已占據(jù)了相當一部分高端種子市場。如何把基礎科研的優(yōu)勢轉化為產(chǎn)業(yè)的優(yōu)勢，研究培育更多優(yōu)良品種，是我國面臨的主要挑戰(zhàn)。為此科學家建議，國家有關部門應給予大力支持，在進一步鞏固蔬菜基因組研究優(yōu)勢的基礎上，加強蔬菜作物分子設計育種體系建設，并與常規(guī)育種相結合，加速自主知識產(chǎn)權優(yōu)良品種的培育，支撐我國蔬菜產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展，提升我國蔬菜種業(yè)的國際競爭力。