何涌泉,孟哲峰,張曉燕
上海市(復(fù)旦大學(xué)附屬)公共衛(wèi)生臨床中心,上海 201508
盡管高效抗反轉(zhuǎn)錄病毒治療(highly active antiretroviral therapy, HAART)抗人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染較成功,但其只能抑制(suppression)體內(nèi)病毒,要完全清除(eradication)病毒仍是一個(gè)遙遠(yuǎn)的目標(biāo),主要原因是病毒潛伏庫(latent viral reservoir)的存在[1]。病毒潛伏庫是指在體內(nèi)免疫系統(tǒng)和外來藥物的高壓下,病毒選擇隱藏于宿主的細(xì)胞或解剖學(xué)場所(一般位于二級淋巴結(jié)、中樞神經(jīng)系統(tǒng)、睪丸等部位)。對HIV感染者來說,此時(shí)的病毒不復(fù)制或只有低水平復(fù)制能力,通常的抗病毒治療方法無法有效攻擊潛伏庫中的病毒。而一旦停止用藥,潛伏庫的病毒將有機(jī)會(huì)再次復(fù)制和擴(kuò)增,導(dǎo)致體內(nèi)病毒載量迅速反彈[2]。因此,深入研究HIV潛伏庫的形成機(jī)制,有助于探索有效的病毒潛伏庫清除或控制方法,減緩艾滋病疾病進(jìn)展,提升臨床抗病毒治療的效果。
當(dāng)進(jìn)入宿主細(xì)胞后,HIV通過將病毒RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA形成整合前復(fù)合體(preintegration complex, PIC),整合到宿主基因組后,多數(shù)成為前病毒(provirus),隨宿主細(xì)胞基因組復(fù)制而產(chǎn)生子代病毒。小部分則由于所在宿主細(xì)胞處于G0期而潛伏,只有受某種刺激后才重新開始復(fù)制。這種細(xì)胞非常少,大約占整個(gè)外周血單核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)總數(shù)的百萬分之一,卻是HIV難以根除的關(guān)鍵原因。
潛伏形成后,HIV大致有3種存在形式:一種是以PIC的形式存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),并未整合入細(xì)胞核內(nèi),該狀態(tài)下PIC可能會(huì)被細(xì)胞降解,然而一旦細(xì)胞在PIC降解之前被活化,會(huì)導(dǎo)致HIV整合與復(fù)制;第2種是PIC進(jìn)入細(xì)胞核,但沒有整合到人類基因組內(nèi),而是在核內(nèi)呈游離狀態(tài),大多數(shù)通過重組形成只有一個(gè)長末端重復(fù)序列(long terminal repeat, LTR)區(qū)的1-LTR HIV環(huán),極少部分在DNA連接酶作用下將兩端LTR連接形成類似質(zhì)粒結(jié)構(gòu)的2-LTR HIV環(huán)[3, 4];第3種是成功將自己整合進(jìn)人類基因組中[5],但概率很低。雖然HIV形成這3種狀態(tài)的機(jī)制不相同,但都成功逃避了宿主免疫系統(tǒng)攻擊及藥物清除,與細(xì)胞共生;同時(shí),這些細(xì)胞一般都處于G0期,為靜息細(xì)胞,一旦受抗原、細(xì)胞因子等刺激,會(huì)成為效應(yīng)細(xì)胞,使病毒具有復(fù)制活性并產(chǎn)生病毒顆粒(圖1)。
病毒潛伏的形成可能與染色體的結(jié)構(gòu)變化有關(guān)系。有研究發(fā)現(xiàn),核小體在其中扮演重要角色。當(dāng)HIV DNA整合進(jìn)常染色質(zhì)時(shí),nuc-0、nuc-1和nuc-2會(huì)被其5′ LTR包裹,由于這些核小體與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)重疊,阻止轉(zhuǎn)錄因子接近,使轉(zhuǎn)錄無法進(jìn)行。轉(zhuǎn)錄激活蛋白(transactivator protein, Tat)能結(jié)合染色質(zhì)改構(gòu)復(fù)合物SWI/SNF,使染色體結(jié)構(gòu)變化,暴露出相應(yīng)位點(diǎn)而進(jìn)行轉(zhuǎn)錄[6, 7]。SWI/SNF在HIV潛伏周期中所發(fā)揮作用的具體機(jī)制尚不明確。
圖1 HIV-1 DNA基因整合及調(diào)控示意圖Fig.1 Genome integration and regulation schematic diagram of HIV-1 DNA
不同的核因子κB( nuclear factor κB,NF-κB)/Rel家族在維持HIV-1潛伏中也起重要作用。P50蛋白能招募組蛋白去乙?;傅紿IV-1的LTR區(qū),促進(jìn)染色質(zhì)凝聚并抑制RNAPolII靠近[8, 9]。在白細(xì)胞介素7(interleukin 7,IL-7)誘導(dǎo)的記憶CD4+T細(xì)胞自我更新時(shí),低水平NF-κB分子活化及T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)信號通路均能促進(jìn)bcl-2、bclxl等抗凋亡基因表達(dá)[8]。此外,IκB激酶能磷酸化轉(zhuǎn)錄因子FOXO3a,阻斷對凋亡基因的誘導(dǎo)[10, 11]。這些分子的混合作用使記憶CD4+T細(xì)胞長久生存,并維持病毒潛伏庫的存在。
HIV潛伏庫有2種來源,一種是HIV DNA未整合入人類基因組,而是游離于細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中,尤其是游離于細(xì)胞核中的1-LTR HIV和2-LTR HIV能進(jìn)行穩(wěn)定的低水平復(fù)制[12]。體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),抑制整合酶可增加細(xì)胞內(nèi)2-LTR HIV比例,最多可達(dá)600拷貝/100萬PBMC。另一種是完全整合的細(xì)胞庫,有較高的穩(wěn)定性和隱蔽性,是完全清除HIV感染的主要障礙。由游離HIV DNA組成的潛伏庫在病毒復(fù)制中扮演主要角色,由于一直保持著低水平復(fù)制活性,在停止治療后,可能會(huì)通過激活細(xì)胞來喚醒其余HIV[4]。
HIV潛伏的細(xì)胞包括記憶CD4+T細(xì)胞、純真CD4+T細(xì)胞、神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞、星形膠質(zhì)細(xì)胞[5]、自然殺傷細(xì)胞及多功能造血干細(xì)胞等[13]。其中記憶CD4+T細(xì)胞的2種亞型是潛伏庫最主要的部位,分為中央記憶T細(xì)胞(central memory T cell)和過渡性記憶T細(xì)胞(transitional memory T cell)。大部分HIV潛伏于中央記憶T細(xì)胞,但過渡性記憶T在體內(nèi)存在的時(shí)間更長且不斷更新[5]。這些潛伏細(xì)胞來源大概分為3類:一類為感染的效應(yīng)細(xì)胞存活下來并轉(zhuǎn)化為記憶細(xì)胞;一類是在各種趨化因子作用下HIV直接感染純真CD4+T細(xì)胞等而形成;最后一類則是由潛伏細(xì)胞繁殖或分化形成[14-16]。
HIV潛伏庫的控制主要涉及整合酶抑制劑的應(yīng)用、潛伏病毒的識別、潛伏病毒的激活及病毒潛伏細(xì)胞激活后的識別等。主要采用組蛋白去乙酰化酶抑制劑(histone deacetylase inhibitor, HDACi)、蛋白激酶C(protein kinase C,PKC)調(diào)節(jié)劑、甲基化抑制劑等激活潛伏病毒復(fù)制,使之暴露于外源性抗病毒藥物及免疫系統(tǒng)攻擊之下。
染色質(zhì)的組蛋白乙?;腿ヒ阴;钦{(diào)節(jié)基因表達(dá)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),而異?;虮磉_(dá)是遺傳和代謝疾病發(fā)生的分子生物學(xué)基礎(chǔ)。組蛋白的乙酰化程度由組蛋白乙?;负腿ヒ阴;竻f(xié)調(diào)控制[17]。組蛋白的乙?;芨淖?nèi)旧w結(jié)構(gòu),使轉(zhuǎn)錄因子接近HIV LTR區(qū)域而啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄活動(dòng);而組蛋白去乙?;改苷{(diào)節(jié)染色體構(gòu)象,抑制基因表達(dá),有利于HIV處于潛伏狀態(tài)。
第1個(gè)通過美國食品藥品管理局(Food and Drug Administration,F(xiàn)DA)審查的HDACi藥物是伏立諾他(vorinostat),即辛二酰苯胺異羥肟酸(suberoylanilide hydroxamic acid, SAHA),用于治療皮膚T細(xì)胞淋巴癌。雖然SAHA會(huì)引起體內(nèi)DNA損傷,但能被正常細(xì)胞修復(fù)[18, 19];同時(shí),在長期接受SAHA刺激的細(xì)胞中沒有觀察到DNA突變[20]。體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),該藥物能在不活化細(xì)胞的情況下激活HIV復(fù)制活性,使病毒感染細(xì)胞能被免疫系統(tǒng)或藥物識別并清除[21]。目前,已有文獻(xiàn)為SAHA作為藥物使用提供了“概念型”(proof-of-concept)的依據(jù),該實(shí)驗(yàn)采用分離自持續(xù)治療患者的靜息CD4+T細(xì)胞,證明SAHA能有效激活HIV RNA表達(dá),且體內(nèi)實(shí)驗(yàn)顯示增加SAHA濃度(200 mg→400 mg)時(shí)機(jī)體表現(xiàn)出良好的耐受能力[20]。但在其他實(shí)驗(yàn)中觀察到,CD4+T潛伏細(xì)胞活化后不會(huì)因?yàn)镠IV復(fù)制而引發(fā)由病毒導(dǎo)致的細(xì)胞病變效應(yīng)(cytopathic effect, CPE),也不會(huì)被普通CD8+細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)識別并清除,只能被經(jīng)特殊抗原刺激過的CD8+CTL清除[22]。而體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,HIV特異性的CD8+T細(xì)胞所介導(dǎo)的清除對HIV潛伏細(xì)胞識別程度并不高,其殺傷能力也有所下降[23]。因此,對CD8+T細(xì)胞殺傷機(jī)制的研究有助于理解清除HIV潛伏細(xì)胞的方式。
目前,帕比司他(panobinostat)、恩替諾特(entinostat)及ITF2357(givinostat)等HDACi藥物正以治療癌癥為目的進(jìn)行2期或3期臨床試驗(yàn)。最近研究表明,在HIV潛伏的T細(xì)胞模型中,這些藥物都能激活潛伏HIV的復(fù)制,其中ITF2357能減少CD4+T細(xì)胞CXCR4和CCR5的表達(dá)[24]。還有一些新開發(fā)的HDACi在體外實(shí)驗(yàn)中能激活潛伏HIV的活性,包括MCT-1、MCT-3、CG05和CG06,但需更多、更深入的動(dòng)物模型來驗(yàn)證。
PKC能通過多種方法啟動(dòng)HIV轉(zhuǎn)錄。首先,PKC可活化轉(zhuǎn)錄因子NF-κB來誘導(dǎo)HIV轉(zhuǎn)錄,PKC激活后將誘導(dǎo)NF-κB的抑制蛋白IκB-α磷酸化和不完全降解,使NF-κB與IκB解離,解離出來的NF-κB與HIV LTR區(qū)的多個(gè)位點(diǎn)結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄進(jìn)行。其次,PKC能激活活化蛋白1(activator protein 1,AP-1),使其與HIV啟動(dòng)子結(jié)合。最后,通過促進(jìn)Tat轉(zhuǎn)錄因子與細(xì)胞反式激活應(yīng)答(trans-activation response,TAR)元件結(jié)合,促使HIV轉(zhuǎn)錄開始[25-27]。
體外實(shí)驗(yàn)中,酪氨酸激酶抑制劑(prostratin)不僅通過激活PKC而激活潛伏HIV的復(fù)制,還能與HDACi類藥物發(fā)揮良好的協(xié)同作用[28]。半合成酪氨酸激酶抑制劑已研制成功[29],但酪氨酸激酶抑制劑不能特異性針對HIV產(chǎn)生激活作用,目前也缺乏臨床數(shù)據(jù)來證明其功效。
作為酪氨酸激酶抑制劑結(jié)構(gòu)類似物的格尼迪木任(又稱尼地嗎啉, gnidimacrin),是從瑞香狼毒中分離得到的二萜類化合物[30],目前主要作為抗腫瘤藥物進(jìn)行研究。有研究表明,其能在部分細(xì)胞系中展現(xiàn)出比酪氨酸激酶抑制劑更高的激活病毒復(fù)制的能力,也能通過下調(diào)CCD5表達(dá)來抑制R5病毒株感染[31]。但其在MT4細(xì)胞系中的表現(xiàn)不太理想,同時(shí)抑制的病毒株過于單一,是否能擴(kuò)大作用范圍,包括細(xì)胞系、病毒株等,仍缺乏實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
最近發(fā)現(xiàn)苔蘚抑素(bryostatin)能激活PKC和AMP活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)途徑以再度激活潛伏HIV的DNA[25],尤其當(dāng)其與CD4抗體包裹形成納米顆粒后,能高效定位到CD4+T細(xì)胞并激活潛伏病毒[32]。
PKC抑制劑如卡馬拉素(rottlrein)能抑制PKCθ在T細(xì)胞中表達(dá),最終抑制HIV復(fù)制[33]。然而對該類藥物的研究不多,能否應(yīng)用于臨床還有待進(jìn)一步評估。
DNA甲基化是指DNA甲基轉(zhuǎn)移酶將S-腺苷甲硫氨酸的甲基轉(zhuǎn)移給胞嘧啶的過程。研究表明,DNA甲基化是維持HIV潛伏的主要機(jī)制之一。在HIV 5′ LTR的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)有2處CpG島甲基化修飾序列,抑制轉(zhuǎn)錄因子接近目標(biāo)DNA的啟動(dòng)子[34],使HIV進(jìn)入潛伏狀態(tài)。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑(DNA methyltransferase inhibitor,DNMTi)可能具有激活HIV的能力。有資料表明,記憶CD4+T細(xì)胞中出現(xiàn)大量過度甲基化情形,而靜息CD4+T細(xì)胞沒有該現(xiàn)象發(fā)生[35]。這可能因?yàn)榧谆前l(fā)生在HIV-1 DNA整合之后并加強(qiáng)基因沉默效果的機(jī)制,而非推動(dòng)HIV-1在核細(xì)胞內(nèi)主動(dòng)進(jìn)入潛伏期。
最近對5-脫氧氮雜胞苷(5-aza-2′-deoxycytidine, 5-Aza-dC)的研究表明,該藥物在不同細(xì)胞系中發(fā)揮不同作用[36]。當(dāng)5-Aza-dC與HDACi共同作用分離自HARRT治療患者的CD4+T細(xì)胞時(shí),顯示有高效激活作用。因此,需對該類藥物進(jìn)行更多的HIV甲基化研究,從而明確其特異作用靶點(diǎn),有效識別HIV DNA重組位點(diǎn),為HIV潛伏庫清除研究提供科學(xué)依據(jù)。
位點(diǎn)特異性重組是遺傳重組的一類,該重組發(fā)生僅需一小段同源序列即特異性位點(diǎn)(又稱附著點(diǎn),attachment site,att)和識別該位點(diǎn)的特異重組酶參與,并不需要Rec蛋白[37]。當(dāng)一段基因存在2個(gè)特異位點(diǎn)時(shí),根據(jù)這2個(gè)位點(diǎn)方向,重組酶能決定位點(diǎn)之間DNA發(fā)生整合、倒位、易位或切除的4種結(jié)果。當(dāng)特異位點(diǎn)方向相同,位點(diǎn)之間的DNA將發(fā)生易位、整合或切除;當(dāng)特異位點(diǎn)方向相反,則發(fā)生DNA倒位。其中,切除和倒位由于動(dòng)力學(xué)原因更易發(fā)生[38]。目前研究者期望通過在細(xì)胞內(nèi)表達(dá)一種能特異識別HIV序列的重組酶,敲掉整合到人類基因組的HIV DNA。
研究發(fā)現(xiàn),噬菌體P1的Cre/loxP體系的識別位點(diǎn)與HIV LTR區(qū)具有相似性。Sarker等因此構(gòu)建了Tre/loxLTR體系,通過新構(gòu)建的Tre重組酶(Tre-recombinase)識別一段34對堿基序列的loxLTR區(qū)域[39]。目前研究使用從HIV Tat中分離的一段蛋白轉(zhuǎn)導(dǎo)域(protein transduction domain, PTD)肽段[40]或從乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)PreS2蛋白分離的一段細(xì)胞滲透轉(zhuǎn)運(yùn)基序(cell-penetrating translocation motif)作為載體[41],將Tre轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)細(xì)胞。雖然在細(xì)胞水平實(shí)驗(yàn)中獲得較高效率,能有效將HIV DNA從基因組清除[42],但目前并沒有更多的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)證實(shí)其在體內(nèi)的效果,且Tre重組酶的活性仍是個(gè)問題。
細(xì)胞因子被提出作為HIV治療藥物已有15年歷史。目前加強(qiáng)對HIV感染者免疫效率的研究更關(guān)注于多種細(xì)胞因子的聯(lián)合使用,包括IL-2、IL-7、IL-15等。單一細(xì)胞因子或作用微弱,或靶細(xì)胞太少,無法發(fā)揮較為全面的療效。其中占主要地位的可能是IL-7,這是因?yàn)镮L-7比IL-2更能增強(qiáng)HIV的復(fù)制活性,且單獨(dú)使用IL-2可使調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(regulatory T cell, Treg)增殖并抑制CD8+T細(xì)胞的活化和殺傷能力[43]。IL-7能誘導(dǎo)來自患者PBMC中的HIV復(fù)制。在SCID-hu小鼠實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),在病毒治療期使用最大劑量IL-7(>10 μg/kg),能檢測到明顯的病毒信號(viral blip)[44]。但在部分體外實(shí)驗(yàn)中,IL-7僅表現(xiàn)出微弱效果,這可能與HIV感染的不同細(xì)胞系有關(guān),且IL-7可能增加血清中HIV RNA含量[45]。IL-15能通過誘導(dǎo)記憶細(xì)胞分化來激活HIV的復(fù)制活性,但具體應(yīng)用仍面臨諸多問題,包括誘導(dǎo)強(qiáng)度、靶細(xì)胞單一等。
HIV潛伏庫清除藥物研究中的問題大致有兩方面:一是無法做到特異性識別;二是激活效率不高。大多數(shù)機(jī)制是直接通過表觀遺傳學(xué)的方法進(jìn)行活化,或活化T細(xì)胞,或活化沉默基因,無法特異性識別HIV DNA結(jié)合位點(diǎn)。而位點(diǎn)特異性重組雖能識別HIV DNA結(jié)合位點(diǎn),但效率較低,可供參考的數(shù)據(jù)不多。作為最新研究HIV潛伏機(jī)制的熱點(diǎn),微小RNA(microRNA)最近多次出現(xiàn)在各種艾滋病大會(huì)議程中,但大多數(shù)研究尚處于進(jìn)展之中,未見相關(guān)發(fā)表文章,故不敘述。
目前,研究HIV如何長期存在于HARRT治療中的患者,有了不少進(jìn)展,但完全清除潛伏庫中的感染細(xì)胞或病毒仍是難題。雖然已有不少藥物在體外展現(xiàn)良好的作用,部分藥物甚至已批準(zhǔn)用于治療其他疾病,但沒有足夠數(shù)據(jù)證明其在HIV感染者中能發(fā)揮相應(yīng)的活性。
采用聯(lián)合用藥清除體內(nèi)HIV是最好的選擇,因?yàn)樵絹碓蕉嗟淖C據(jù)表明,一個(gè)有效的治療方法不僅在于對潛伏HIV的激活,還在于對HIV潛伏細(xì)胞的識別清除[46]。應(yīng)首先證明這些藥物在體內(nèi)能有效針對潛伏細(xì)胞產(chǎn)生作用,而這需更多臨床試驗(yàn)及相應(yīng)資金支持。因此,HIV潛伏庫是治療HIV感染中不能逃避的問題,同時(shí)也是最大的挑戰(zhàn)。
[1] Siliciano JD, Kajdas J, Finzi D, Quinn TC, Chadwick K, Margolick JB, Kovacs C, Gange SJ, Siliciano RF. Long-term follow-up studies confirm the stability of the latent reservoir for HIV-1 in resting CD4+T cells [J]. Nat Med,2003,9(6):727-728.
[2] Le T, Farrar J, Shikuma C. Rebound of plasma viremia following cessation of antiretroviral therapy despite profoundly low levels of HIV reservoir: implications for eradication [J]. AIDS, 2011,25(6):871-873.
[3] Reigadas S, Andréola ML, Wittkop L, Cosnefroy O, Anies G, Recordon-Pinson P, Thiébaut R, Masquelier B, Fleury H. Evolution of 2-long terminal repeat (2-LTR) episomal HIV-1 DNA in raltegravir-treated patients and in in vitro infected cells [J]. J Antimicrob Chemother,2010,65(3):434-437.
[4] Sharkey M, Babic DZ, Greenough T, Gulick R, Kuritzkes DR, Stevenson M. Episomal viral cDNAs identify a reservoir that fuels viral rebound after treatment interruption and that contributes to treatment failure [J]. PLoS Pathog,2011,7(2):e1001303.
[5] Chomont N, El-Far M, Ancuta P, Trautmann L, Procopio FA, Yassine-Diab B, Boucher G, Boulassel MR, Ghattas G, Brenchley JM, Schacker TW, Hill BJ, Douek DC, Routy JP, Haddad EK, Sékaly RP. HIV reservoir size and persistence are driven by T cell survival and homeostatic proliferation [J]. Nat Med,2009,15(8):893-900.
[6] Ho L, Crabtree GR. Chromatin remodelling during development [J].Nature,2010,463(7280):474-484.
[7] Hargreaves DC, Crabtree GR. ATP-dependent chromatin remodeling: genetics, genomics and mechanisms [J]. Cell Res,2011,21(3):396-420.
[8] Withers DR, Jaensson E, Gaspal F, Mcconnell FM, Eksteen B, Anderson G, Agace WW, Lane PJ. The survival of memory CD4+T cells within the gut lamina propria requires OX40 and CD30 signals [J]. J Immunol,2009,183(8):5079-5084.
[9] Tyagi M, Pearson RJ, Karn J. Establishment of HIV latency in primary CD4+cells is due to epigenetic transcriptional silencing and P-TEFb restriction [J]. J Virol,2010,84(13):6425-6437.
[10] Chomont N, El-Far M, Ancuta P, Trautmann L, Procopio FA, Yassine-Diab B, Boucher G, Boulassel MR, Ghattas G, Brenchley JM, Schacker TW, Hill BJ, Douek DC, Routy JP, Haddad EK, Sékaly RP. HIV reservoir size and persistence are driven by T cell survival and homeostatic proliferation [J]. Nat Med,2009,15(8):893-900.
[11] Riou C, Yassine-Diab B, Van Grevenynghe J, Somogyi R, Greller LD, Gagnon D, Gimmig S, Wilkinson P, Shi Y, Cameron MJ, Campos-Gonzalez R, Balderas RS, Kelvin D, Sekaly RP, Haddad EK. Convergence of TCR and cytokine signaling leads to FOXO3a phosphorylation and drives the survival of CD4+central memory T cells [J]. J Exp Med,2007,204(1):79-91.
[12] Wong JK, Hezareh M, Günthard HF, Havlir DV, Ignacio CC, Spina CA, Richman DD. Recovery of replication-competent HIV despite prolonged suppression of plasma viremia [J]. Science,1997,278(5341):1291-1295.
[13] Carter CC, Onafuwa-Nuga A, McNamara LA, Riddell J 4th, Bixby D, Savona MR, Collins KL. HIV-1 infects multipotent progenitor cells causing cell death and establishing latent cellular reservoirs [J]. Nat Med,2010,16(4):446-451.
[14] Coffin JM. HIV population dynamics in vivo: implications for genetic variation, pathogenesis, and therapy [J]. Science,1995,267(5197):483-489.
[15] Perelson AS, Essunger P, Cao Y, Vesanen M, Hurley A, Saksela K, Markowitz M, Ho DD. Decay characteristics of HIV-1-infected compartments during combination therapy [J]. Nature,1997,387(6629):188-191.
[16] Zhang L, Ramratnam B, Tenner-Racz K, He Y, Vesanen M, Lewin S, Talal A, Racz P, Perelson AS, Korber BT, Markowitz M, Ho DD. Quantifying residual HIV-1 replication in patients receiving combination antiretroviral therapy [J]. N Engl J Med,1999,340(21):1605-1613.
[17] Jenuwein T, Allis CD. Translating the histone code [J]. Science,2001,293(5532):1074-1080.
[18] Lee JH, Choy ML, Ngo L, Foster SS, Marks PA. Histone deacetylase inhibitor induces DNA damage, which normal but not transformed cells can repair [J]. Proc Natl Acad Sci USA,2010,107(33):14639-14644.
[19] Lee JH, Choy ML, Ngo L, Venta-Perez G, Marks PA. Role of checkpoint kinase 1 (Chk1) in the mechanisms of resistance to histone deacetylase inhibitors [J]. Proc Natl Acad Sci USA,2011,108(49):19629-19634.
[20] Archin NM, Liberty AL, Kashuba AD, Choudhary SK, Kuruc JD, Crooks AM, Parker DC, Anderson EM, Kearney MF, Strain MC, Richman DD, Hudgens MG, Bosch RJ, Coffin JM, Eron JJ, Hazuda DJ, Margolis DM. Administration of vorinostat disrupts HIV-1 latency in patients on antiretroviral therapy [J]. Nature,2012,487(7408):482-485.
[21] Contreras X, Schweneker M, Chen CS, Mccune JM, Deeks SG, Martin J, Peterlin BM. Suberoylanilide hydroxamic acid reactivates HIV from latently infected cells [J]. J Biol Chem,2009,284(11):6782-6789.
[22] Xing S, Bullen CK, Shroff NS, ShanL, Yang HC, Manucci JL, Bhat S, Zhang H, Margolick JB, Quinn TC, Margolis DM, Siliciano JD, Siliciano RF. Disulfiram reactivates latent HIV-1 in a Bcl-2-transduced primary CD4+T cell model without inducing global T cell activation [J]. J Virol,2011,85(12):6060-6064.
[23] Shan L, Deng K, Shroff NS, Durand CM, Rabi SA, Yang HC, Zhang H, Margolick JB, Blankson JN, Siliciano RF. Stimulation of HIV-1-specific cytolytic T lymphocytes facilitates elimination of latent viral reservoir after virus reactivation [J]. Immunity,2012,36(3):491-501.
[24] Matalon S, Palmer BE, Nold MF, Furlan A, Kassu A, Fossati G, Mascagni P, Dinarello CA. The histone deacetylase inhibitor ITF2357 decreases surface CXCR4 and CCR5 expression on CD4+T-cells and monocytes and is superior to valproic acid for latent HIV-1 expression in vitro [J]. J Acquir Immune Defic Syndr,2010,54(1):1-9.
[25] Mehla R, Bivalkar-Mehla S, Zhang R, Handy I, Albrecht H, Giri S, Nagarkatti P, Nagarkatti M, Chauhan A. Bryostatin modulates latent HIV-1 infection via PKC and AMPK signaling but inhibits acute infection in a receptor independent manner [J]. PLoS One,2010,5(6):e11160.
[26] Steinberg SF. Structural basis of protein kinase C isoform function [J]. Physiol Rev,2008,88(4):1341-1378.
[27] Mckernan LN, Momjian D, Kulkosky J. Protein kinase C: One pathway towards the eradication of latent HIV-1 reservoirs [J]. Adv Virol,2012,2012:805347.
[28] Burnett JC, Lim K I, Calafi A, Rossi JJ, Schaffer DV, Arkin AP. Combinatorial latency reactivation for HIV-1 subtypes and variants [J]. J Virol,2010,84(12):5958-5974.
[29] Wender PA, Kee JM, Warrington JM. Practical synthesis of prostratin, DPP, and their analogs, adjuvant leads against latent HIV [J]. Science,2008,320(5876):649-652.
[30] Feng W, Tetsuro I, Mitsuzi Y. The antitumor activities of gnidimacrin isolated from Stellera chamaejasme L[J]. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi,1995,17(1):24-26.
[31] Huang L, Ho P, Yu J, Zhu L, Lee KH, Chen CH. Picomolar dichotomous activity of gnidimacrin against HIV-1 [J]. PLoS One,2011,6(10):e26677.
[32] Kovochich M, Marsden MD, Zack JA. Activation of latent HIV using drug-loaded nanoparticles [J]. PLoS One,2011,6(4):e18270.
[33] López-Huertas MR, Mateos E, Díaz-Gil G, Gómez-Esquer F, Sánchez del Cojo M, Alcamí J, Coiras M.Protein kinase Ctheta is a specific target for inhibition of the HIV type 1 replication in CD4+T lymphocytes [J]. J Biol Chem,2011 286(31):27363- 27777.
[34] Blazkova J, Trejbalova K, Gondois-Rey F, Halfon P, Philibert P, Guiguen A, Verdin E, Olive D, Van Lint C, Hejnar J, Hirsch I. CpG methylation controls reactivation of HIV from latency [J]. PLoS Pathog,2009,5(8):e1000554.
[35] Blazkova J, Murray D, Justement JS, Funk EK, Nelson AK, Moir S, Chun TW, Fauci AS. Paucity of HIV DNA methylation in latently infected, resting CD4+T cells from infected individuals receiving antiretroviral therapy [J]. J Virol,2012,86(9):5390-5392.
[36] Fernandez G, Zeichner SL. Cell line-dependent variability in HIV activation employing DNMT inhibitors [J]. Virol J,2010,7:266.
[37] Grandjean M, Girod PA, Calabrese D, Kostyrko K, Wicht M, Yerly F, Mazza C, Beckmann JS, Martinet D, Mermod N. High-level transgene expression by homologous recombination-mediated gene transfer [J]. Nucleic Acids Res,2011,39(15):e104.
[38] Turan S, Bode J. Site-specific recombinases: from tag-and-target- to tag-and-exchange-based genomic modifications[J]. FASEB J,2011,25(12):4088-4107.
[39] Sarkar I, Hauber I, Hauber J, Buchholz F. HIV-1 proviral DNA excision using an evolved recombinase [J]. Science,2007,316(5833):1912-1915.
[40] Fonseca SB, Pereira MP, Kelley SO. Recent advances in the use of cell-penetrating peptides for medical and biological applications [J]. Adv Drug Deliv Rev,2009,61(11):953-964.
[41] Stoeckl L, Funk A, Kopitzki A, Brandenburg B, Oess S, Will H, Sirma H, Hildt E. Identification of a structural motif crucial for infectivity of hepatitis B viruses [J]. Proc Natl Acad Sci USA,2006,103(17):6730-6734.
[42] Mariyanna L, Priyadarshini P, Hofmann-Sieber H, Krepstakies M, Walz N, Grundhoff A, Buchholz F, Hildt E, Hauber J. Excision of HIV-1 proviral DNA by recombinant cell permeable Tre-recombinase [J]. PLoS One,2012,7(2):e31576.
[43] Sereti I, Imamichi H, Natarajan V, Imamichi T, Ramchandani MS, Badralmaa Y, Berg SC, Metcalf JA, Hahn BK, Shen JM, Powers A, Davey RT, Kovacs JA, Shevach EM, Lane HC. In vivo expansion of CD4CD45RO-CD25 T cells expressing foxP3 in IL-2-treated HIV-infected patients [J]. J Clin Invest,2005,115(7):1839-1847.
[44] Sereti I, Dunham R M, Spritzler J, Aga E, Proschan MA, Medvik K, Battaglia CA, Landay L, Pahwa S, Fischl MA, Asmuth DM, Tenorio AR, Altman JD, Fox L, Moir S, Malaspina A, Morre M, Buffet R, Silvestri G, Lederman MM, ACTG 5214 Study Team. IL-7 administration drives T cell-cycle entry and expansion in HIV-1 infection [J]. Blood,2009,113(25):6304-6314.
[45] Levy Y, Lacabaratz C, Weiss L, Viard JP, Goujard C, Lelièvre JD, Boué F, Molina JM, Rouzioux C, Avettand-Fénoêl V, Croughs T, Beq S, Thiébaut R, Chêne G, Morre M, Delfraissy JF. Enhanced T cell recovery in HIV-1-infected adults through IL-7 treatment [J]. J Clin Invest,2009,119(4):997-1007.
[46] Vandergeeten C, Fromentin R, Chomont N. The role of cytokines in the establishment, persistence and eradication of the HIV reservoir [J]. Cytokine Growth Factor Rev,2012,23(4-5):143-149.