石洞的盡頭有個瀑布，在藍色月光的照耀下，瀑布張開了一個漩渦，將笨笨他們，以及追趕而來的格格巫和阿茲貓卷了進去。待大家回過神來時，已經穿越了瀑布來到紐約的中央公園……

帕特先生在紐約一家護膚品公司工作，苛刻的女總裁奧黛爾剛剛提升帕特為營銷主管，條件是帕特在兩日后的品牌推廣會上拿出讓奧黛爾滿意的設計。帕特心事重重地從中央公園的會場拿回家一盒資料。他還不知道，六只藍色的小精靈為了躲避格格巫和阿茲貓，早已經藏身在盒子里。

晚飯后，帕特在盒子里發(fā)現了藍精靈，他簡直不敢相信，只在比利時傳說中聽過的精靈會出現在自己家中。六只精靈看到電飯煲煮飯也要興奮地大呼小叫，讓帕特越發(fā)心煩，可他的妻子格蕾絲卻非常歡迎這些可愛的客人。

躲在帕特的家里，暫時擺脫了格格巫的追捕，藍精靈們開始尋找回家的辦法。藍爸爸回憶，只要調配一種特殊的藥水，在圓月之夜念出咒語，就會讓月亮暫時變?yōu)樗{色。藍色月光能夠打開那個漩渦，讓他們回到森林。為了觀測月亮，他們需要一個高倍望遠鏡。

藍色的小家伙們跑到超市去偷望遠鏡。在超市里購物的孩子發(fā)現了試圖爬上電梯的笨笨，笨笨只好一動不動偽裝成玩偶。孩子們一窩蜂地爭搶這個可愛的“玩偶”，爭執(zhí)中抓痛了笨笨，笨笨一聲驚叫跳到地上，撒腿就跑。這下惹來了更多孩子們的注意，他們翻遍超市的角落尋找這個可愛的小家伙。

很快，正在玩具區(qū)偷芭比娃娃裙子的藍妹妹也被孩子們發(fā)現了。緊接著，藍爸爸、聰聰和勇勇也暴露了目標。更倒霉的是，在櫥窗前閑逛的厭厭被格格巫發(fā)現，這個惡巫師帶著他的阿茲貓殺進了超市。

帕特和格蕾絲、格格巫和阿茲貓，再加上一群孩子在超市里四處尋找藍精靈，超市里人仰馬翻亂成一團。幸好帕特略施小計，將格格巫關在電動門外，又用紙盒扣住阿茲貓，趁亂救走了藍精靈。

拿到了望遠鏡，離回家的路更近了一步，笨笨和藍妹妹他們幾個開心地在屋子里跳來跳去。他們給帕特夫婦描述藍色月亮的美麗，正忙著策劃廣告的帕特受到啟發(fā)，設計了一個以藍色月亮為主題的海報。海報非常漂亮，可是帕特卻沒有信心，因為這并不是老板奧黛爾喜歡的風格。

笨笨邊唱邊跳，在帕特的電腦鍵盤上絆了一跤，踩到了幾個按鍵，竟把沒有經過奧黛爾確認的藍月亮海報發(fā)給了公司的廣告部。第二天一早，全城的廣告海報還有各大商場的霓虹燈，都用藍色月亮替換了公司原來的“性感紅唇”海報。

帕特被奧黛爾痛罵，但卻來不及解釋，他要去尋找藍爸爸。藍爸爸為了掩護大家，落入格格巫的手里。他舍出了自己，為大家換取逃回森林的時間?？蓻]有藍爸爸，藍精靈們還能快樂地生活嗎？

藍爸爸被囚禁在格格巫的臨時城堡里。只需用一根藍爸爸的胡須，就可以使格格巫煉制出一滴神奇的藍色藥水，魔力足以瞬間毀掉一座房屋。若是藍爸爸全身都被用來煉制藥水，恐怕格格巫的魔法足以毀滅地球。

就在藍爸爸快要絕望時，帕特找到了格格巫的城堡。他們兵分幾路，聰聰代替藍爸爸念誦了開啟藍色月亮的咒語。月亮變?yōu)樗{色，隧道打開，整個村子的藍精靈都趕來解救藍爸爸。

但是，精靈們還是敵不過提升了魔法的格格巫。就在大家陸續(xù)被抓的時候，勇勇駕駛玩具飛機從空中沖下來，搶走格格巫的魔杖。魔杖刮到了勇勇的螺旋槳，被彈飛到空中，站在圍墻上的笨笨和格格巫爭搶著去接魔杖。

看見平時走路都會摔倒的笨笨想要搶奪魔杖，大家?guī)缀踅^望了。可是奇跡發(fā)生了，這一回，盡管笨笨再一次在關鍵時刻摔倒，卻緊緊抓著魔杖不放。魔杖發(fā)出藍色光線將格格巫彈出千米之外，不見了蹤影。這下子，笨笨成了英雄，盡管他的冒失害得大家頻陷危機，但最終還是沒放棄努力，解救了全村的精靈。

告別了藍精靈，帕特接到老板奧黛爾的電話。奧黛爾特地感謝他——在張貼藍色月亮海報的當晚，天空中就出現了藍色的月亮，這不僅讓推廣會上的奧黛爾大出風頭，也使得公司的品牌受到全城的關注，奧黛爾還要給帕特加薪呢。