冉 云 鄧 欣 楊大國 吳其愷 劉成海 陶艷艷 聶 廣
1.湖北中醫(yī)藥大學(xué)2010級博士班 (湖北 武漢,430065) 2.深圳市第三人民醫(yī)院 3.上海中醫(yī)藥大學(xué)肝病研究所
人肝癌HepG2細胞株能夠穩(wěn)定高表達甲胎蛋白(AFP)[1],AFP作為腫瘤標(biāo)志物,在肝癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。為進一步探討AFP的作用機制,我們采用RNAi技術(shù)構(gòu)建不表達或少表達AFP的HepG2模型細胞株?,F(xiàn)報道如下。
1.1 材料 SiRNA由英俊公司合成,pll 3.7載體由上海比昂生物醫(yī)藥科技有限公司提供,Agarose Gel DNA Purification Kit Ver2.0(TaKaRa)購自大連寶生物公司,293T細胞株購自中科院上海細胞所,DMEM、胎牛血清、胰蛋白酶、限制性內(nèi)切酶均購自Invitrogen公司,T4 DNA連接酶購自NEB公司,質(zhì)粒DNA提取試劑盒購自Axygen公司,凝膠回收試劑盒購自Qiagen公司,ladder購自Fermentas,PCR引物由大連寶生物公司設(shè)計合成,AFP一抗購自CST公司。
1.2 方法
1.2.1 RNA干擾靶點的選擇 靶點序列通過https://rnaidesigner.invitrogen.com/rnaiexpress/網(wǎng)站軟件設(shè)計,由英俊公司合成。模板中的loop結(jié)構(gòu)選用了TTCAAGAGA以避免形成終止信號。正義鏈模板的5'端添加T,與BbsI酶切后形成的粘端互補;反義鏈模板的5'端添加AGCT,與XhoI酶切后形成的粘端互補。正義鏈:5'-T-(GN18)-(TTCAAGAGA)-(N18C)-TTTTTTC-3',反義鏈:3'-A(CN18)-(AAGTTCTCT)-(N18G)-AAAAAAGAGCT-5'。按此規(guī)則選擇干擾靶 點 為:AFP-639:5'TGGTCTATCTCCAAATCTAAACTTCAAGAGTTTAGATTTGGAGATAACCTT TTTTC3';3'ACCAGATAGAAATTTGAAGTTCTCTCAAATCTAAACCTCTATCTGG AAAAAAGAGCT5'。
1.2.2 質(zhì)粒的構(gòu)建 取oligo溶液5ul,在PCR儀上處理后得到濃度為10 μM的 shRNA模板,將所得模板溶液稀釋為200nM,用于連接反應(yīng)。取 pPll3.7載體 10ug,10×Buffer R10ul,XhoI酶 5ul,Hpa I酶 2ul,加雙蒸水至 100ul體系,37℃酶切1小時,瓊脂糖電泳,使用Agarose Gel DNA Purification Kit Ver 2.0(TaKaRa) 回收。按 10×T4 Ligation Buffer 2ul,pll 3.7(XhoI+Hpa I),shDNA template(100nM),T4 DNA ligase各1ul,加水至20ul,22℃反應(yīng)1小時后轉(zhuǎn)染JM 109 competent cells進行連接反應(yīng),每個連接反應(yīng)挑取5個菌落,接種到含50 ug/ml Ampicillin的LB培養(yǎng)集中,使用堿裂解法抽提質(zhì)粒,所得質(zhì)粒分別用Xba I和Nhe I進行雙酶切鑒定,并進行測序鑒定。
1.2.3 病毒載體的包裝與純化 制備慢病毒包裝系統(tǒng)中4種質(zhì)粒DNA溶液,當(dāng)293 T細胞密度達60%~70%時將DNA和磷酸鈣混合液轉(zhuǎn)移至含單層細胞的培養(yǎng)液中混勻,培養(yǎng)12小時后棄去培養(yǎng)液,加PBS 15 ml輕搖后棄去,重復(fù)該步驟3次,加入含100 ml/L小牛血清的細胞培養(yǎng)液15ml,繼續(xù)培養(yǎng)72小時,收集細胞上清液,將上清液4℃、4000g離心10分鐘,收集上清液并以0.45 μm濾器過濾后,4℃、25000 r/min離心20分鐘,棄上清液,用500ul PBS重懸病毒沉淀于4℃保存過夜。
1.2.4 HepG2細胞病毒轉(zhuǎn)染 六孔板接種細胞,感染實驗分為空白對照組、陽性質(zhì)控組、模型細胞組 (AFP-639),細胞換液,吸棄培養(yǎng)基,分別添加1.0ml含2%FBS、不含抗生素的DMEM培養(yǎng)液;同時加入病毒粗提液500ul,24小時后棄上清液,換含10%FBS的DMEM培養(yǎng)液,倒置顯微鏡及熒光顯微鏡下觀察細胞,拍片。繼續(xù)培養(yǎng)96小時后,收集細胞,抽提RNA和蛋白。RT-PCR及Western blot檢測轉(zhuǎn)染后HepG2細胞 (模型細胞)內(nèi)AFP基因及蛋白的表達情況。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 12.0軟件進行統(tǒng)計分析,計量資料以(±s)表示,組間比較采用t檢驗。
2.1 質(zhì)粒用Xba I和Nhe I進行雙酶切鑒定結(jié)果 見圖1。
圖1 質(zhì)粒用XbaI和NheI雙酶切鑒定結(jié)果
2.2 測序鑒定結(jié)果 見圖2。
圖2 測序鑒定結(jié)果
2.3 轉(zhuǎn)染后大量HepG2細胞呈現(xiàn)綠色熒光 見圖3。
圖3 轉(zhuǎn)染后鏡下所見HepG2細胞
2.4 RT-PCR檢測轉(zhuǎn)染后HepG2細胞內(nèi)AFP基因表達情況
見圖4。如圖,與正常組NI組 (野生型HepG2細胞)比較,干擾后模型細胞AFP基因的表達顯著減少,顯著抑制了AFP基因表達。
圖4 RT-RCP檢測轉(zhuǎn)染后HepG2細胞內(nèi)AFP基因表達
2.5 實時熒光定量PCR檢測模型細胞及其傳代后細胞內(nèi)AFP基因表達 結(jié)果見表1。
表1 模型細胞AFP基因表達結(jié)果比較(±s)
表1 模型細胞AFP基因表達結(jié)果比較(±s)
與野生HepG2組比較,*P<0.01,與M1組比較,#P>0.05
組別 AFP/β-actin野生HepG2組1±0 M1(細胞傳1代) 0.157±0.025*M5(細胞傳5 代) 0.167 ±0.015*#
2.6 Western blot檢測模型細胞及其傳代后細胞內(nèi)AFP蛋白表達結(jié)果 見表2、圖5。
表2 模型細胞內(nèi)AFP蛋白表達結(jié)果比較(±s)
表2 模型細胞內(nèi)AFP蛋白表達結(jié)果比較(±s)
與野生HepG2組比較,*P<0.01,與M1組比較,#P>0.05
組別AFP/GAPDH野生HepG2組1.38 ±0.025 M1(細胞傳1 代) 0.24 ±0.119*M5(細胞傳5 代) 0.22 ±0.023*#
圖5 傳代后細胞內(nèi)AFP表達結(jié)果
RNAi是由作用于同源序列mRNA的雙鏈RNA所介導(dǎo)的序列特異性、轉(zhuǎn)錄后基因沉默機制[2];具有費用低廉、抑制效率高、容易篩選靶序列等特點,克服了以往反義核酸技術(shù)代價高昂、靶序列篩選困難等缺點[3]。siRNA表達載體有質(zhì)粒表達載體和病毒表達載體兩種,目前普遍認為腺病毒載體是一種高效的體內(nèi)轉(zhuǎn)染載體[4]。當(dāng)前在國內(nèi)有一些關(guān)于靶向AFP基因干擾的相關(guān)報道,或是構(gòu)建干擾質(zhì)粒[5],或是觀察RNA干擾對肝癌細胞的影響[6],但到目前為止還沒有關(guān)于靶向AFP基因干擾構(gòu)建不表達或少表達AFP的人肝癌HepG2細胞株的報道。在本研究中,我們通過軟件設(shè)計了4個靶序列,腺病毒少量包裝轉(zhuǎn)染后檢測AFP基因及蛋白的表達,靶點“639”干擾效率最高,故選此干擾靶點構(gòu)建細胞模型。此細胞模型傳代后仍能穩(wěn)定地沉默AFP表達,為進一步對AFP進行機制研究和藥理研究奠定了基礎(chǔ)。
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