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        基因芯片篩查外周血中胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因

        2011-08-13 06:20:34黃素英陳華田俊應(yīng)敏剛郭福榕詹文青
        中國實用醫(yī)藥 2011年30期
        關(guān)鍵詞:外周血基因組標志物

        黃素英 陳華 田俊 應(yīng)敏剛 郭福榕 詹文青

        胃癌患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)和(或)轉(zhuǎn)移是影響胃癌患者生存期的重要因素。從分子水平探索胃癌轉(zhuǎn)移機制,尋找理想的胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)分子標志物,預(yù)測患者的預(yù)后情況,制定個體化治療方案,是進一步提高胃癌患者生存率的有效途徑。本文采用全基因組表達譜芯片技術(shù),分析出現(xiàn)轉(zhuǎn)移與未出現(xiàn)轉(zhuǎn)移的胃癌患者以及健康者之間外周血基因表達譜的差異,篩選與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的差異表達基因,并探討其生物學(xué)意義。

        1 資料與方法

        1.1 樣本收集 選擇經(jīng)臨床和組織病理檢查確診為胃癌,未化療且排除其他原發(fā)性腫瘤的胃癌患者10例,其中胃癌轉(zhuǎn)移組5例(轉(zhuǎn)移至肝臟),胃癌未轉(zhuǎn)移組5例;另選擇健康體檢自愿者5例為對照組。經(jīng)知情同意后,采集外周血5 ml,分離有核細胞,送上海康成生物工程有限公司進行phalanx人全基因組表達譜芯片(人32050個基因)檢測。

        1.2 胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因篩選 篩選全基因組表達譜芯片獲取的基因差異表達水平≥2,且經(jīng)T-test統(tǒng)計分析顯著差異表達的基因(P<0.05),判定為差異表達基因,采用Panther system分析與胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的陽性基因。

        2 結(jié)果

        根據(jù)在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中參與粘附、降解、移動的基因在上述不同組中的表達水平,在參與腫瘤轉(zhuǎn)移過程的1541個基因中篩選出顯著差異表達(表達量上調(diào)2倍或下調(diào)2倍)的陽性基因157個,其中,胃癌合并轉(zhuǎn)移組與胃癌未轉(zhuǎn)移組及健康對照組比較,有65個基因表達下調(diào),92個基因表達上調(diào)。結(jié)果見表1和表2。

        3 討論

        腫瘤的發(fā)生、發(fā)展是多階段、多種致瘤因子共同作用的結(jié)果。機體在不同的時間、空間生理機能的改變終將體現(xiàn)在一系列基因質(zhì)和量的變化上,從而構(gòu)成了機體在每一狀態(tài)時的特征性基因表達,因此,全基因組表達譜芯片檢測技術(shù)能用于比較腫瘤轉(zhuǎn)移與否狀態(tài)下的不同特征性基因表達圖譜,篩選腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因,尋找腫瘤轉(zhuǎn)移的分子標志物。

        本研究發(fā)現(xiàn),胃癌轉(zhuǎn)移組與胃癌未轉(zhuǎn)移組、健康對照組外周血之間存在大量差異表達基因,涉及到多條信號傳導(dǎo)通路,提示胃癌發(fā)生轉(zhuǎn)移是較為復(fù)雜的過程。經(jīng)Panther system進行生物學(xué)通路分析顯示,參與腫瘤轉(zhuǎn)移的1541個基因中,有中65個基因在胃癌轉(zhuǎn)移組明顯表達下調(diào),92個基因表達上調(diào),共計157個陽性基因,涉及粘附分子、細胞運動趨化因子、蛋白水解酶等基因。

        表1 篩選出的胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)陽性基因

        表2 胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的陽性基因分布

        CDH2基因在胃癌轉(zhuǎn)移組表達明顯上調(diào),CDH2編碼的N-cadherin,是依賴鈣離子介導(dǎo)的同種細胞與細胞粘附分子中的一員。它是由一段5個串聯(lián)重復(fù)單位組成的胞外區(qū)、一個跨膜區(qū)和一個很保守的胞質(zhì)區(qū)構(gòu)成的,通過胞質(zhì)區(qū)與β-連環(huán)蛋白相連結(jié),對上皮細胞在間質(zhì)中的遷移發(fā)揮作用,進而決定細胞的形狀與移動,當其上調(diào)時增強癌細胞的浸潤和轉(zhuǎn)移能力[1]。

        CD151是新近發(fā)現(xiàn)的癌基因,屬于跨膜四蛋白超家族,CD151通過與整合素特異性結(jié)合,參與調(diào)控細胞粘附、遷移和增殖等病理生理過程[2]。本實驗中胃癌轉(zhuǎn)移組CD151基因表達上調(diào),其在胃癌侵襲轉(zhuǎn)移中的作用尚待研究。

        TGFα(轉(zhuǎn)化生長因子-α)為EGFR配體,是生長因子自分泌系統(tǒng)的基本組成部分,它在調(diào)節(jié)細胞分化、增殖、維持上皮完整性中起重要的作用。有報道指出,TGFα在惡性實體瘤中呈顯著性高表達,尤其與胃腸道腫瘤關(guān)系密切[3]。本研究發(fā)現(xiàn),胃癌轉(zhuǎn)移組TGFA基因明顯高表達。

        CTNNB1基因編碼β-連環(huán)蛋白(β-catenin),是Wnt信號通路發(fā)揮促進腫瘤發(fā)生發(fā)展的直接原因。β-catenin異常表達可見于人類多種惡性腫瘤,如胃癌、直結(jié)腸癌、乳腺癌、肺癌、白血病等。黃悅等發(fā)現(xiàn)β-catenin表達的下調(diào)與胃癌的發(fā)生發(fā)展具有相關(guān)性,本實驗也顯示CTNNB1基因明顯低表達。

        在陽性基因中,屬于ADAM家族的ADAM23、ADAM17、ADAM33、ADAM19、ADAM8、ADAM9 等多個基因出現(xiàn)異常表達。目前,ADAMs與腫瘤的關(guān)系已成為腫瘤研究的熱點之一。新近研究表明ADAM家族基因參與了EGFR信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、腫瘤轉(zhuǎn)移和腫瘤血管新生等過程,在腫瘤發(fā)展中起到重要的作用。ADAMs通過去整合素和富半胱氨酸區(qū)與整合素、硫酸乙酰肝素蛋白聚糖相互作用,其金屬蛋白酶區(qū)能夠降解黏附分子和細胞外基質(zhì),調(diào)節(jié)細胞和細胞、細胞和細胞外基質(zhì)相互作用來影響腫瘤轉(zhuǎn)移[5]。ADAM8、ADAM9、ADAM19 等基因的異常表達在肺癌、子宮內(nèi)膜癌等腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移中的作用有文獻報道,但其在胃腸道腫瘤轉(zhuǎn)移中的表達情況報道較少,因此值得將其作為新的胃癌轉(zhuǎn)移候選分子標志物,在進一步的實驗中驗證其是否具有指示胃癌轉(zhuǎn)移的作用。

        本次研究顯示胃癌轉(zhuǎn)移過程涉及數(shù)量眾多不同功能基因表達的改變,應(yīng)用基因芯片技術(shù)快速篩選分析胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)差異表達基因,可為深入研究胃癌轉(zhuǎn)移的早期診斷與預(yù)后分子標志物提供線索。

        [1]Li K,He W,Lin N,et al.N-cadherin knock-down decreases invasiveness of esophageal squamous cell carcinoma in vitro,World J Gastroenterol,2009,15(6):697-704.

        [2]Nicole EW,Afshin V,Marit NM,et al.A critical role for tetraspanin CD151 in α3β1 and α6β4 Integrin-dependent Tumor Cell Functions on Laminin-5,Molecular Biology of the Cell,2006,17:2707-2721.

        [3]Choi JH,Kim HC,Lim HY,et al.Detection of transforming growth factor-alpha in the serum of gastric carcinoma patients,Oncology,1999:57(3):236-241.

        [4]黃悅,欒玉貴,樊克勤.β-catenin在胃癌中的表達及意義,實用腫瘤學(xué)雜志,2003,17(4):254-256.

        [5]Michael JD,Eadaoin M,Norma OD,et al.Role of ADAMs in Cancer Formation and Progression,Clin Cancer Res,2009,15(4):1140-1144.

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