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        CCL3L1基因拷貝數(shù)目變異與慢性乙肝的易感性相關(guān)*

        2011-08-02 07:38:48鄭靈燕裴元元李淼新黃瑋俊丁紅珂王一鳴
        中國病理生理雜志 2011年10期
        關(guān)鍵詞:趨化拷貝易感性

        鄭靈燕, 裴元元, 李淼新, 周 翔, 黃瑋俊, 丁紅珂, 王一鳴△

        (1中山大學中山醫(yī)學院醫(yī)學遺傳學教研室,廣東 廣州 510080;2香港大學精神病學系,腦與認知科學國家重點實驗室,中國 香港)

        乙型病毒性肝炎(乙肝)是由乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染而引起的以肝臟損害為主要表現(xiàn)的關(guān)系到全球公共衛(wèi)生的重大疾病,尤其在發(fā)展中國家。我國是乙肝的高發(fā)國家,據(jù)衛(wèi)生部2006年的統(tǒng)計,我國人群中乙肝表面抗原 (hepatitis B surface antigen,HBsAg)的陽性率為 7.18%(http://www.chinacdc.cn/n272442/n272530/n3479265/n3479303/37089.html)。

        拷貝數(shù)目變異(copy number variations,CNVs)是近年來新揭示的一類基因組變異,含相應(yīng)基因組節(jié)段的缺失、重復(fù)及復(fù)雜重排等[1],是疾病發(fā)生的重要遺傳學基礎(chǔ)??截悢?shù)目變異的基因組節(jié)段占整個人類基因組的12%[2],覆蓋人類基因組中13%的基因及5%以上的編碼序列[3]?,F(xiàn)已證明拷貝數(shù)目的變異與精神分裂癥[4]、自閉癥[5]等疾病相關(guān)。

        CCL3L1(chemokine CC motif ligand 3-like 1;RefSeq NM_02l006)基因編碼CCL3L1蛋白(UniProt ID∶P16619)。CCL3L1是一種強效的化學趨化性細胞因子,屬于趨化性因子β亞型(CC型)[6]。趨化性細胞因子是一類低分子量的多肽,其受體為7次跨膜的G蛋白偶聯(lián)受體超家族成員。趨化性細胞因子作為細胞間信號傳遞分子,可以調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答、參與免疫細胞分化發(fā)育、介導(dǎo)炎癥反應(yīng)等。科學家對57個不同人種的檢測表明,在各人種中CCL3L1基因均存在拷貝數(shù)目多態(tài)性,如其在白人中的中位數(shù)為2,而在非洲裔黑人中為6,這組學者檢測了45例中國漢族人群CCL3L1基因的拷貝數(shù)目,并報道我國漢族人群的中位數(shù)為4[7]。研究的新進展表明,CCL3L1拷貝數(shù)目變異與艾滋病的易感性及疾病進展、嚴重程度相關(guān)[7],也與丙型病毒性肝炎的易感性相關(guān)[8],2010年一項關(guān)于CCL3L1拷貝數(shù)目變異與靜脈吸毒者人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染相關(guān)關(guān)系的研究顯示HBV是一個協(xié)同因素,HBV血清學陽性能提高HIV的感染率[9]。但還沒有CCL3L1拷貝數(shù)目變異與乙肝相關(guān)關(guān)系的報道。因此,我們采用大樣本量研究了我國漢族人群中CCL3L1拷貝數(shù)的分布情況,及其與慢性乙肝間的易感性關(guān)系,并初步探討可能的機制。

        材料和方法

        1 研究對象

        收集2006年12月-2010年3月間在中山大學第三附屬醫(yī)院感染科住院的慢性乙肝病人。慢性乙肝的診斷按中華醫(yī)學會傳染病與寄生蟲病學分會,肝病學分會標準[10]。入選者均排除了其它肝炎病毒的感染、人類免疫缺陷病毒的感染、自身免疫性肝炎、酒精性肝炎、藥物性肝炎、脂肪肝及妊娠期、正在接受抗結(jié)核藥物治療的病人、靜脈吸毒者、不同意加入本項研究者等。最終有1477例乙肝患者入選本項研究。

        健康對照來自自愿參與本研究的知情同意者。入選條件為臨床和實驗室檢查證實為健康;所有健康對照均進行了乙肝兩對半(HBsAg,HBsAb,HBeAg,HBeAb,HBcAb)及丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(alanine aminotransferase,ALT)、天門冬氨酸基轉(zhuǎn)移酶(aspartate aminotransferase,AST)的檢測,且證實為非乙肝患者,也非乙肝病毒攜帶者。

        2 方法

        2.1 CCL3L1基因拷貝數(shù)目檢測 使用ABI 7500實時熒光定量PCR儀(ABI),用Taqman探針進行實時定量PCR(qPCR),檢測CCL3L1基因的拷貝數(shù)目。在絕對定量的模式下,選取A431細胞的DNA作為標準品(已知A431細胞雙倍體基因組含2個拷貝的CCL3L1基因),以2倍濃度差做梯度稀釋,每個濃度均重復(fù)3次,同時擴增目的基因CCL3L1及內(nèi)參照基因β-globin構(gòu)建標準曲線。CCL3L1基因與管家基因β-globin的引物與探針序列如文獻報道[7]。每一板均做標準品的標準曲線,同時檢測待測樣本的目的基因CCL3L1及內(nèi)參照基因β-globin,每個樣品均重復(fù)3次。利用ABISDS 1.4序列分析軟件,讀取每個樣品的初始模板量,同時計算每板結(jié)果的板間差異系數(shù)(板間差異系數(shù)為每一板中CCL3L1基因標準曲線與 β-globin基因標準曲線的斜率比)。CCL3L1的拷貝數(shù)目等于CCL3L1的起始模板量與β-globin的起始模板量的比值,乘以板間差異系數(shù),再乘以2。此檢測由2個獨立的研究者用雙盲法進行。

        2.2 CCL3L1拷貝數(shù)目與其mRNA、編碼蛋白CL3L1生成量及其趨化效力關(guān)系的研究 選取拷貝數(shù)為1(n=6),拷貝數(shù)為2(n=6),拷貝數(shù)為3(n=6),拷貝數(shù)為4(n=6),拷貝數(shù)為5(n=6),拷貝數(shù)為6(n=6),拷貝數(shù)為7(n=5),拷貝數(shù)為8(n=5)的標本(n表示標本例數(shù))。

        運用qPCR檢測mRNA的表達量。首先,用Trizol試劑盒(Invitrogen)提取總 RNA;然后用 Super-ScriptTMII RNase H逆轉(zhuǎn)錄酶(Invitrogen)進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng);最后,采用試劑盒2×Power SYBR Green Master Mix?(ABI),在相對定量模式下,選取一個cDNA樣本2倍濃度差做梯度稀釋,擴增目的基因CCL3L1及管家基因GAPDH構(gòu)建標準曲線,使用ΔΔCt法計算每個待測樣本的相對cDNA量。CCL3L1 cDNA,上游引物為 5'-TCTCTGCAACCAGGTCCTCTC -3',下游引物為 5'-GGAGGTGTAGCTGAAGCAGCA-3'。GAPDH cDNA,上游引物為 5'-CAGAACATCATCCCTGCC -3',下游引物為 5'- GGTGCTAAGCAGTTGGTG -3'。

        用Duoset ELISA development system(R&D Systems)對蛋白產(chǎn)物進行定量分析。先將標準品進行倍比稀釋,用Fluorstar fluorescent plate reader(Tecan)繪制標準曲線;然后通過標準曲線檢測待測樣本的A450,計算樣本的蛋白濃度。每個樣本檢測2次。

        用Transwell法檢測不同拷貝數(shù)目的趨化效力[6]。構(gòu)建Transwell小室,每個外室孔內(nèi)加入10% 含胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,PBS緩沖液可替代DMEM培養(yǎng)基作為陰性對照。用Calcein將活U973細胞染色,每個內(nèi)室小孔加入已染色的U973細胞約1×105。37℃、5%CO2孵育箱中孵育105 min后,用Fluorstar fluorescent plate reader(Tecan)檢測每個小孔的A490值,每個孔的A值減去陰性對照孔的A值后,計算相對趨化效力。

        假定拷貝數(shù)目為1樣品的相對表達量及趨化效力為1,以此計算其它各組樣品的相對表達量以及趨化效力。

        3 統(tǒng)計學處理

        用中位數(shù)進行統(tǒng)計描述,用Pearson's卡方檢驗檢測CCL3L1基因拷貝數(shù)目變異與乙肝易感性的相關(guān)關(guān)系。運用Logistic回歸校正性別與年齡后,進一步分析CCL3L1與乙肝易感性的相關(guān)關(guān)系。

        結(jié) 果

        1 研究對象

        表1顯示了病人組與正常對照組的基本臨床資料。收集1477例病人,男女比例為1093∶384。正常對照1023例,男女比例為508∶515。所有研究對象均為中國漢族人。

        表1 病人與正常對照的基本臨床資料Table 1.Clinical data of patients and controls

        2 我國漢族健康人及慢性乙肝患者CCL3L1拷貝數(shù)目的分布情況

        對50例隨機人群進行CCL3L1拷貝數(shù)目的檢測,結(jié)果顯示CCL3L1拷貝數(shù)目在我國漢族人群中呈常態(tài)分布,中位數(shù)為4,與美國學者報道的從45例中得到的數(shù)字相同。進一步檢測1477例慢性乙肝病人及1023例健康對照的CCL3L1拷貝數(shù)目,結(jié)果病人和健康對照的中位數(shù)均為3,但在較為極端,即拷貝數(shù)目很低及很高的個體中,兩組的分布顯然有差異,見圖1。

        3 CCL3L1拷貝數(shù)目與其mRNA、編碼蛋白CL3L1生成量及趨化效力相關(guān)關(guān)系

        圖2顯示了CCL3L1拷貝數(shù)目與其mRNA、編碼蛋白CL3L1生成量及趨化效力相關(guān)關(guān)系。假定拷貝數(shù)目為1的樣品相對量為1,得到結(jié)果如下:CCL3L1 mRNA的表達量與CCL3L1基因拷貝數(shù)目呈正相關(guān)(R2=0.97),CL3L1生成量與CCL3L1基因拷貝數(shù)目呈正相關(guān)(R2=0.97),CCL3L1基因拷貝數(shù)目與其趨化效力呈正相關(guān)關(guān)系(R2=0.94)。隨著拷貝數(shù)目的增加,mRNA、編碼蛋白CL3L1的生成量及趨化效力也增加,見圖2。

        Figure 2.Correlation between copy number of CCL3L1 and its mRNA,protein products and chemotactic effect.圖2 CCL3L1拷貝數(shù)目與其mRNA、CCL3L1蛋白生成量及趨化效力的相關(guān)關(guān)系

        4 CCL3L1基因拷貝數(shù)與乙肝易感性的相關(guān)性

        利用Pearson's卡方檢驗,在自由度為9的情況下,P<0.01,提示CCL3L1基因拷貝數(shù)與乙肝相關(guān)。運用Logistic回歸校正性別與年齡后,CCL3L1拷貝數(shù)變異依然與乙肝具有相關(guān)性(P<0.01)。

        討 論

        乙肝為多因素復(fù)雜性疾病,其易感性及感染后的轉(zhuǎn)歸受病毒載量,暴露時間,年齡,性別,父母患病狀況等因素的影響[11,12]。但正如 HIV 感染一樣,機體對乙肝病毒的免疫反應(yīng)及病毒在體內(nèi)的復(fù)制都受宿主遺傳因素的影響,故遺傳學因素在其易感性及疾病轉(zhuǎn)歸上起著重要作用[13]。在乙肝遺傳背景的研究中,HLA是最常被報道的基因[13]。

        CCL3L1的拷貝數(shù)目分布在各人種中不同,我們大樣本量的CCL3L1拷貝數(shù)目分析獲得了比美國學者基于45例個體的結(jié)果更接近真實的分布特點,即在我國漢族人群CCL3L1基因拷貝數(shù)目的中位數(shù)為3,而非美國科學家報道的 4[7]。

        CCL3L1是目前已知的存在拷貝數(shù)目變異的免疫基因之一[6,7]。Gonzalez 等[7]的研究發(fā)現(xiàn) CCL3L1拷貝數(shù)目變異與HIV/AIDS易感性相關(guān),低拷貝數(shù)的個體感染HIV的風險升高。相反,曾有報道指出高CCL3L1拷貝數(shù)目的個體,患風濕性關(guān)節(jié)炎與川崎病的風險升高[14,15]。此外,Ptacek 等[16]和Mamtani等[17]分別報道CCL3L1拷貝數(shù)目變異與系統(tǒng)性紅斑狼瘡存在相關(guān)。2010年,德國科學家報道了CCL3L1拷貝數(shù)目變異與丙型病毒性肝炎(hepatitis C)的相關(guān)關(guān)系[8]。同一年,愛沙尼亞科學家對CCL3L1拷貝數(shù)目變異與靜脈吸毒者HIV的相關(guān)關(guān)系研究中,發(fā)現(xiàn)HBV血清學陽性能提高HIV的感染率[9]。本實驗通過研究CCL3L1基因拷貝數(shù)目多態(tài)性與乙肝易感性的相關(guān)關(guān)系發(fā)現(xiàn),在中國漢族人群中,低CCL3L1基因拷貝數(shù)目是乙肝發(fā)病的一個危險因素。

        CCL3L1作為一種CC型強效的細胞因子,可通過與其受體(D6、CCR3、CCR5)的結(jié)合而產(chǎn)生生物學效應(yīng)[6]。其中CCR5為HIV進入細胞的重要受體之一,有學者提出,高CCL3L1拷貝數(shù)目者之所以不易感染HIV,是由于其編碼的CCL3L1與CCR5結(jié)合,封閉了HIV進入人體細胞的途徑。然而,HBV病毒進入人體肝細胞的機制尚未明確,也沒有研究報道肝細胞上有上述受體表達。本研究的實時熒光定量PCR、ELISA和 Transwell實驗結(jié)果顯示高拷貝CCL3L1能生成更多的mRNA、蛋白質(zhì),并且對淋巴細胞具有更強的趨化性。因此高拷貝的CCL3L1基因?qū)BV的保護作用可能是讓機體生成更多的趨化因子CCL3L1,從而有助于免疫細胞發(fā)揮其保護作用。

        由于我國目前還未有一套健全的乙肝疫苗注射登記系統(tǒng),所以本研究在健康對照的篩選中未排除注射過乙肝疫苗者,故部分人的保護性作用可能來自于乙肝疫苗。這種在病例-對照研究中使用與病例組交叉的對照(overlapped control)已得到科學界的認可,如英國多項由Wellcome Trust Sanger Institute進行的相關(guān)關(guān)系研究均使用了生于1958年的對照(即58 birth cohort),全然不計對照個體的患病狀態(tài)(http://www.wtccc.org.uk/)。由于本項目所采用的樣本量大,在這種情況下仍獲得了陽性結(jié)果,這進一步證實了CCL3L1基因拷貝數(shù)目變異與乙肝的相關(guān)關(guān)系??偠灾狙芯筷U明了中國漢族人群中CCL3L1基因在健康人群中的分布情況及與乙肝易感的相關(guān)關(guān)系,低拷貝數(shù)目者更易患慢性乙肝,而高拷貝數(shù)目有保護性作用,并對其可能的機制進行了初步的探討。

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