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        佳美苦瓜純度的SRAP鑒定

        2011-06-19 07:32:46許端祥高山林碧英傅睿清
        長(zhǎng)江蔬菜 2011年18期
        關(guān)鍵詞:佳美同工酶父本

        許端祥,高山,林碧英,傅睿清

        (福建福州市蔬菜科學(xué)研究所,350111)

        苦瓜(Momordica charantiaL.)為葫蘆科苦瓜屬一年生攀緣草本植物,起源于東南亞的熱帶地區(qū),廣泛分布于熱帶、亞熱帶及溫帶地區(qū),在中國(guó)、印度、日本、東南亞都有悠久的栽培歷史。佳美苦瓜是福州市蔬菜科學(xué)研究所繼佳玉苦瓜[1]之后培育的苦瓜新品種,其母本是強(qiáng)雌系43-C,父本為自交系59-W。佳美苦瓜植株生長(zhǎng)勢(shì)強(qiáng),分枝力強(qiáng),早中熟,主蔓第一雌花著生8~12節(jié),雌花率高;從開花到商品瓜成熟需15~20 d,商品瓜呈長(zhǎng)棒形,尾部鈍圓,瓜長(zhǎng)26~35 cm,橫徑5~7 cm,肉厚1.1 cm;瓜皮色綠有光澤,瓜面圓瘤與短縱瘤相間,瓜形美觀,成熟瓜不褪綠,肉質(zhì)甘脆微苦,品質(zhì)優(yōu)良,單瓜質(zhì)量400~500 g,667 m2產(chǎn)量3 000 kg左右。目前已在福建、廣東、湖北、四川等地示范推廣,表現(xiàn)反映良好,種植面積不斷擴(kuò)大。

        隨著種植面積的擴(kuò)大,其用種量逐步增大,種子質(zhì)量的控制就顯得尤為重要。種子純度是種子質(zhì)量的主要指標(biāo),種子純度的降低會(huì)明顯降低作物的產(chǎn)量和產(chǎn)品品質(zhì)。目前國(guó)內(nèi)外對(duì)農(nóng)作物品種的純度鑒定仍以形態(tài)指標(biāo)鑒定為主,其特點(diǎn)是準(zhǔn)確可靠,但檢測(cè)周期長(zhǎng),不能滿足當(dāng)年用種需要。為縮短鑒定周期,同工酶技術(shù)已應(yīng)用于瓜類蔬菜雜種純度的鑒定[2,3],但同工酶多態(tài)性不夠豐富,同時(shí)有組織和器官特異性,大大降低了鑒定結(jié)果的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展,以PCR為基礎(chǔ)的DNA 分子標(biāo)記技術(shù)如RAPD,SCAR,SSR,ISSR等得以發(fā)展與應(yīng)用。其中SRAP(sequence related amplified polymorphism)是一種新型的分子標(biāo)記技術(shù),其操作簡(jiǎn)便,無需預(yù)先知道基因組信息,且具有豐富的多態(tài)性[4]。

        本研究以佳美苦瓜及其親本為材料,采用SRAP分子標(biāo)記技術(shù),建立佳美苦瓜及其親本的DNA指紋圖譜,為其純度鑒定和知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        苦瓜品種佳美及其親本均由福州市蔬菜科學(xué)研究所苦瓜課題組提供。采用穴盤育苗,待幼苗長(zhǎng)到2片真葉時(shí)取嫩葉待用。SRAP引物、Taq酶和dNTP等購(gòu)自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司。

        1.2 試驗(yàn)方法

        ①DNA提取 以幼苗為材料,隨機(jī)抽取苦瓜品種佳美及其父母本各20株,剪取剛展開的健康嫩葉,于液氮中研磨,采用改良的CTAB法[5]提取總DNA,用紫外分光光度計(jì)在260nm和280nm下測(cè)定OD值,檢測(cè)DNA的質(zhì)量和濃度,并將其稀釋到30 ng/μL作為PCR擴(kuò)增的模板。

        ②PCR擴(kuò)增 擴(kuò)增反應(yīng)在PCR(Eppendorf Mastercyclergradient)儀上進(jìn)行。SRAP反應(yīng)參照Li等[4]的方法進(jìn)行。對(duì)9個(gè)上游引物(Me1~9)和12個(gè)下游引物(Em1~12)組成的108對(duì)引物進(jìn)行擴(kuò)增篩選。25 μL的反應(yīng)體系為:30 ng/μL DNA 模板,2.0 mmol/L MgCl2,200 μmol/L dNTPs,0.25 μmol/L 引物,0.75 U Taq酶。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性 5 min;94℃變性 1 min,35℃復(fù)性 1 min,72℃延伸 1 min,5 個(gè)循環(huán);94℃變性1 min,50℃復(fù)性 1 min,72℃延伸 1 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 10 min,4℃保存。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 特征引物的篩選

        按Li等[4]提出的原則設(shè)計(jì)引物,選用上海生工生物工程有限服務(wù)公司合成的SRAP的9個(gè)上游引物(Me1~9)和 12 個(gè)下游引物(Em1~12)組成的 108 個(gè)引物組合對(duì)材料進(jìn)行擴(kuò)增篩選。隨機(jī)提取佳美的父本、母本及F1代植株各20株,建立混合池,其中有2對(duì)引物擴(kuò)增的雜種譜帶與父本有差異;有2對(duì)引物擴(kuò)增的雜種譜帶與母本有差異。

        2.2 指紋圖譜的建立

        經(jīng)多次試驗(yàn),篩選出2對(duì)特征引物Me6(5'-BAAG-3')-Em9(3'-DCAG-5')(圖 1)、Me8(5'-BACT-3')-Em8(3'-DTGC-5')(圖 2),建立了佳美苦瓜的DNA指紋圖譜。篩選的2對(duì)特征引物能同時(shí)擴(kuò)增出F1代及其父母本的多態(tài)性條帶,其擴(kuò)增產(chǎn)物具有高度的穩(wěn)定性和重復(fù)性。

        圖2 引物Me8-Em8佳美苦瓜和父母本基因組DNA的SRAP擴(kuò)增

        圖1 引物Me6-Em9佳美苦瓜和父母本基因組DNA的SRAP擴(kuò)增

        2.3 雜種純度的鑒定

        將佳美雜交種種植于大田中,待幼苗長(zhǎng)至2片真葉時(shí),隨機(jī)抽取100株單株并編號(hào),按上述方法提取 DNA,選用 2 對(duì)特征引物 Me6(5'-BAAG-3')-Em9(3'-DCAG-5')、Me8(5'-BACT-3')-Em8(3'-DTGC-5')進(jìn)行SRAP的分子鑒定。結(jié)果檢測(cè)出3株單株無父本特異帶只有母本特異帶,說明這3株植株是母本苗,雜交種的純度為97%。成株期鑒定植株的生物學(xué)性狀,發(fā)現(xiàn)3株與母本性狀一樣,雜交率為97%,與SRAP鑒定結(jié)果一致。

        3 小結(jié)

        本試驗(yàn)通過優(yōu)化DNA提取程序,嚴(yán)格控制DNA模板質(zhì)量,優(yōu)化反應(yīng)體系。經(jīng)多次試驗(yàn),篩選出2對(duì)特征引物 Me6(5'-BAAG-3')-Em9(3'-DCAG-5')、Me8(5'-BACT-3')-Em8(3'-DTGC-5'),建立了佳美苦瓜的DNA指紋圖譜。在生產(chǎn)田中隨機(jī)抽取單株并編號(hào),苗期提取DNA進(jìn)行SRAP分子鑒定,試驗(yàn)結(jié)果與大田植株成株期的形態(tài)鑒定結(jié)果高度吻合,說明利用SRAP分子技術(shù)建立DNA指紋圖譜鑒定佳美品種的純度是可行的。

        [1]高山,林碧英,許端祥,等.苦瓜新品種佳玉的選育[J].中國(guó)蔬菜,2010(18):89-90.

        [2]孟祥波,張鳳麗.同工酶技術(shù)在瓜類蔬菜上的應(yīng)用研究[J].上海蔬菜,2010(1):19-20.

        [3]閆世江,張繼寧,劉潔.同工酶技術(shù)在瓜類育種中的應(yīng)用[J].蔬菜,2010(8):33-35.

        [4]Li G,Quiros C F.Sequence related amplified polymorphism(SRAP),a new marker system based on a simple PCR reaction:its application to mapping and gene tagging in Brassica[J].Theor Appl Genet,2001,103(2):455-461.

        [5]王關(guān)林,方宏筠.植物基因工程[M].北京:科學(xué)出版社,2002:742-744.

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