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        一種基于高性能DSP的MRI梯度計(jì)算模塊設(shè)計(jì)

        2011-06-08 11:15:08潘文宇張富羅海周荷琴
        中國(guó)醫(yī)療器械雜志 2011年3期
        關(guān)鍵詞:渦流梯度磁場(chǎng)

        潘文宇,張富,羅海,周荷琴

        中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)自動(dòng)化系,合肥,230027

        磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)具有分辨率高、成像參數(shù)多、組織敏感性豐富、可任意層面斷層成像和對(duì)人體無(wú)電離輻射等特點(diǎn)[1],作為一種先進(jìn)的醫(yī)學(xué)成像方式被廣泛用于臨床診斷中。在MRI系統(tǒng)中,對(duì)成像物體的編碼定位是由梯度子系統(tǒng)在空間中施加X(jué)、Y、Z三維線性梯度磁場(chǎng)來(lái)實(shí)現(xiàn)的。梯度子系統(tǒng)由梯度計(jì)算模塊、數(shù)模轉(zhuǎn)換模塊、功率放大器和梯度線圈等組成。梯度計(jì)算是其中的關(guān)鍵模塊,作用是根據(jù)用戶設(shè)定的成像序列和參數(shù),計(jì)算得到實(shí)際輸出的梯度波形,它需要具備高速和高精度運(yùn)算的能力,并能實(shí)現(xiàn)角度旋轉(zhuǎn)變換、渦流補(bǔ)償和勻場(chǎng)補(bǔ)償?shù)裙δ?。因?yàn)樘荻却艌?chǎng)的線性度與磁共振成像定位的精確度直接相關(guān),定位不準(zhǔn)會(huì)在圖像中產(chǎn)生偽影,所以梯度計(jì)算模塊設(shè)計(jì)的優(yōu)劣對(duì)圖像質(zhì)量有著重要的影響。

        早期的梯度計(jì)算模塊由微處理器、數(shù)字乘法器和用于波形預(yù)加重的模擬電路組成[2],由于在設(shè)計(jì)中使用了模擬器件,系統(tǒng)穩(wěn)定性較差。近年來(lái)國(guó)內(nèi)研究機(jī)構(gòu)在梯度模塊的研發(fā)上也取得了一定的進(jìn)展,我們實(shí)驗(yàn)室曾提出一種用計(jì)算機(jī)進(jìn)行梯度計(jì)算的方法[3],在成像掃描前將序列中的全部梯度波形一次性計(jì)算完成,下載到梯度發(fā)生板卡的板載內(nèi)存中,再經(jīng)DAC輸出到梯度放大器。這種方案實(shí)現(xiàn)了梯度計(jì)算的全數(shù)字化,簡(jiǎn)化了硬件設(shè)計(jì),穩(wěn)定性好,但對(duì)于板載內(nèi)存的容量要求很高,且不利于參數(shù)的實(shí)時(shí)調(diào)整。文獻(xiàn)[4]提出了一種基于DSP的梯度計(jì)算方案,具有設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單、算法易于調(diào)整的優(yōu)點(diǎn),但受制于DSP的順序執(zhí)行架構(gòu)的影響,計(jì)算速度不高。文獻(xiàn)[5]提出的基于FPGA的設(shè)計(jì),在一定程度上提升了運(yùn)算能力,但在運(yùn)算過(guò)程中使用的是16bit和24bit的數(shù)據(jù),精度不夠高,且使用FPGA實(shí)現(xiàn)指數(shù)等浮點(diǎn)運(yùn)算不如DSP編程方便。

        針對(duì)上述問(wèn)題,本文提出了一種基于高性能DSP的MRI梯度計(jì)算模塊的設(shè)計(jì)。該設(shè)計(jì)具有以下特點(diǎn):充分運(yùn)用單指令多數(shù)據(jù)(Single Instruction Multiple Data,SIMD)功能,在算法上對(duì)計(jì)算程序進(jìn)行并行優(yōu)化,使得梯度計(jì)算的速度明顯提升;在計(jì)算過(guò)程中使用32bit/40bit的數(shù)據(jù)精度,提高了運(yùn)算精度;梯度波形的預(yù)加重可根據(jù)用戶需要靈活配置時(shí)間常數(shù)和幅度參數(shù)的個(gè)數(shù),通常使用4~6組預(yù)加重參數(shù),如有特殊需求,可以支持10組或更多的參數(shù)設(shè)置。此外,還支持多種梯度波形,包括常見(jiàn)的數(shù)學(xué)函數(shù)波形以及用戶自定義的波形。

        1 設(shè)計(jì)方法

        1.1 硬件結(jié)構(gòu)

        我們?cè)O(shè)計(jì)的MRI譜儀梯度子系統(tǒng)的硬件結(jié)構(gòu)如圖1所示,以DSP芯片為核心構(gòu)成的梯度計(jì)算模塊是其中的關(guān)鍵部件。DSP從脈沖序列控制模塊獲取梯度時(shí)序和相關(guān)參數(shù),經(jīng)過(guò)計(jì)算后得到X、Y、Z三路梯度數(shù)據(jù)和B0通道的補(bǔ)償數(shù)據(jù)。DSP輸出的數(shù)據(jù)以并行方式傳輸給FPGA,進(jìn)行各通道數(shù)據(jù)的分流和并-串轉(zhuǎn)換后再輸出給DAC,轉(zhuǎn)換得到的模擬信號(hào)經(jīng)梯度放大器后驅(qū)動(dòng)梯度線圈,產(chǎn)生所需的梯度磁場(chǎng)和B0勻場(chǎng)補(bǔ)償。采用這樣的硬件結(jié)構(gòu),梯度計(jì)算模塊使用單片DSP實(shí)現(xiàn),充分利用了DSP運(yùn)算速度快、精度高和編程方便的優(yōu)點(diǎn),且算法通用性好,具有良好的可移植性。

        圖1 MRI梯度子系統(tǒng)的硬件結(jié)構(gòu)圖Fig.1 Hardware structure diagram of the MRI gradient subsystem

        梯度計(jì)算模塊中選用了Analog Device公司的ADSP-21369[6]。這是一款SHARC架構(gòu)的高性能DSP,具有400MHz主頻,基于SIMD內(nèi)核,支持32bit定點(diǎn)和32bit/40bit浮點(diǎn)運(yùn)算,峰值性能可達(dá)2.4GFLOPS。ADSP-21369片上存儲(chǔ)器包括2Mb的SRAM和6Mb的ROM,還提供了32bit的外部存儲(chǔ)器接口,可以方便地與SDRAM、SRAM和FLASH等存儲(chǔ)器直接相連。我們?cè)贒SP上外接了2Mb的FLASH和512Mb的SDRAM,其中FLASH用來(lái)存儲(chǔ)DSP的啟動(dòng)程序,SDRAM用來(lái)緩存梯度參數(shù)和梯度計(jì)算的結(jié)果,梯度計(jì)算程序則存儲(chǔ)在DSP內(nèi)部的ROM中。

        1.2 算法設(shè)計(jì)

        在磁共振成像中,用戶編寫成像序列時(shí)使用的層選梯度(Slice Gradient,Gs)、相位梯度(Phase Gradient,Gp)和讀出梯度(Read Gradient,Gr)稱為邏輯梯度,而梯度子系統(tǒng)實(shí)際輸出的三維空間X、Y、Z通道的梯度Gx、Gy、Gz稱為物理梯度。梯度計(jì)算模塊的算法流程如圖2所示。

        圖2 梯度計(jì)算模塊的算法流程圖Fig.2 Algorithm flow chart of the gradient calculation module

        梯度計(jì)算模塊的輸入為邏輯梯度波形描述、梯度時(shí)序、幅度調(diào)節(jié)、旋轉(zhuǎn)變換、預(yù)加重、一階勻場(chǎng)等參數(shù)信息。梯度計(jì)算首先計(jì)算出邏輯梯度Gs、Gp和Gr的具體波形,再經(jīng)過(guò)邏輯比例縮放、旋轉(zhuǎn)變換、物理梯度增益調(diào)節(jié)而得到物理梯度基礎(chǔ)波形;然后再對(duì)波形進(jìn)行預(yù)加重和一階勻場(chǎng)處理;為保障系統(tǒng)的穩(wěn)定性和安全性,還需要對(duì)波形的幅度進(jìn)行溢出檢查,如果超出最大量程則進(jìn)行幅度限制,并產(chǎn)生中斷請(qǐng)求;最后得到實(shí)際輸出的物理梯度Gx、Gy、Gz和B0通道的勻場(chǎng)補(bǔ)償。

        1.2.1 物理梯度的基礎(chǔ)波形計(jì)算

        物理梯度的基礎(chǔ)波形計(jì)算包括邏輯梯度波形計(jì)算、邏輯梯度比例縮放、旋轉(zhuǎn)變換和物理梯度增益調(diào)節(jié)幾個(gè)部分。梯度計(jì)算模塊首先根據(jù)輸入的波形描述和時(shí)序要求計(jì)算得到MRI序列所需的邏輯梯度波形Gs、Gp和Gr,計(jì)算公式如下:

        其中n為當(dāng)前時(shí)刻,psi、ppi和pri為邏輯梯度描述參數(shù)i=1,2, ...k。

        然后根據(jù)用戶需要,使用設(shè)定的比例對(duì)邏輯梯度進(jìn)行縮放,比例因子記為L(zhǎng)s、Lp和Lr,分別對(duì)應(yīng)層選、相位和讀出梯度。邏輯梯度縮放的計(jì)算公式如下:

        式中L為邏輯比例矩陣,通過(guò)改變Ls可以調(diào)節(jié)成像的選層厚度,改變Lp和Lr則可以改變相位編碼方向或者讀出方向(也稱頻率編碼方向)的視野(Field of View,F(xiàn)OV)。使用這種比例縮放的方式,用戶可以在序列編寫完成后方便地調(diào)節(jié)層厚和FOV,而不用在序列中重新計(jì)算梯度。

        解剖學(xué)中定義了三個(gè)標(biāo)準(zhǔn)斷面:橫斷面、矢狀面和冠狀面。MRI的特點(diǎn)之一是可以任意方向斷層成像。當(dāng)成像層面不是標(biāo)準(zhǔn)斷面時(shí),物理梯度與邏輯梯度的方向不一致,則需要將邏輯梯度進(jìn)行旋轉(zhuǎn)變換,投影到物理梯度方向上。用戶給出的旋轉(zhuǎn)變換參數(shù)為邏輯梯度方向與物理梯度方向之間的夾角,設(shè)它們的夾角如表1所示。

        表1 邏輯梯度與物理梯度方向之間的夾角Tab.1 Angles between logical and physical gradient directions

        根據(jù)所給的夾角參數(shù),可以計(jì)算出梯度的旋轉(zhuǎn)投影矩陣,進(jìn)而計(jì)算出相應(yīng)的物理梯度,如式(3)所示,其中R為旋轉(zhuǎn)投影矩陣。

        以上的梯度計(jì)算均基于X、Y、Z三個(gè)通道梯度強(qiáng)度相等的假設(shè),即給予相同的輸入數(shù)據(jù)能產(chǎn)生同樣大小的梯度磁場(chǎng)。但在實(shí)際系統(tǒng)中,由于工藝和環(huán)境等因素的差別,三個(gè)通道的強(qiáng)度存在差異性,因此我們需要對(duì)物理梯度的強(qiáng)度進(jìn)行增益調(diào)節(jié),以平衡不同的梯度通道,計(jì)算公式為:

        式中P為增益調(diào)節(jié)矩陣,Px、Py、Pz分別為X、Y、Z通道的增益調(diào)節(jié)因子。

        由式(2)、(3)、(4)可得:

        其中矩陣M稱為總轉(zhuǎn)換矩陣,其計(jì)算公式為:

        在實(shí)際設(shè)計(jì)中,我們先根據(jù)輸入?yún)?shù)將M計(jì)算出來(lái),再與邏輯梯度[Gs,Gp,Gr]T相乘得到物理梯度的基礎(chǔ)波形。這與分別將三個(gè)矩陣P,R,L和邏輯梯度相乘比較,可以減少乘法運(yùn)算的次數(shù)。另外,在矩陣乘法運(yùn)算中,為了充分利用DSP在硬件結(jié)構(gòu)上對(duì)循環(huán)結(jié)構(gòu)、循環(huán)尋址、多操作數(shù)尋址(在一個(gè)時(shí)鐘周期內(nèi)同時(shí)存取兩個(gè)操作數(shù))、多運(yùn)算指令(在一個(gè)時(shí)鐘周期內(nèi)同時(shí)執(zhí)行一次加法、一次減法和一次乘法)的支持,我們使用匯編語(yǔ)言編程來(lái)直接實(shí)現(xiàn)矩陣乘法。與用C語(yǔ)言編程相比,采用匯編的實(shí)現(xiàn)方式優(yōu)化了程序的執(zhí)行效率,極大地提高了計(jì)算速度。

        1.2.2 預(yù)加重和勻場(chǎng)補(bǔ)償

        由于外部磁場(chǎng)環(huán)境的影響,將物理梯度的基礎(chǔ)波形直接輸出并不能夠在實(shí)際系統(tǒng)中得到理想的梯度磁場(chǎng)。根據(jù)法拉第電磁感應(yīng)定律,隨時(shí)間變化的磁場(chǎng)在其周圍的金屬體內(nèi)會(huì)激發(fā)變化的渦旋電場(chǎng),金屬中的載流子在該電場(chǎng)的作用下運(yùn)動(dòng)而形成電流,稱為渦流[7]。在MRI系統(tǒng)中,在梯度線圈上施加梯度電流產(chǎn)生時(shí)變的梯度磁場(chǎng)時(shí),必然在周圍的導(dǎo)體中感應(yīng)出渦流,渦流的存在會(huì)嚴(yán)重影響梯度磁場(chǎng)的變化,使其波形產(chǎn)生畸變,如果不進(jìn)行修正,則會(huì)在成像中形成偽影,影響圖像質(zhì)量。

        根據(jù)渦流的L-R電路模型[8],磁場(chǎng)中感應(yīng)出的渦流場(chǎng)可以表示為:

        上式中的e(t)為渦流的沖激響應(yīng),可以表示為多個(gè)指數(shù)函數(shù)的累加:

        式中H(t)為階躍函數(shù),如式(9)所示,Ai為幅度常數(shù),Ti為時(shí)間常數(shù),m是所包含的渦流環(huán)路個(gè)數(shù)。

        為了消除渦流的影響,在梯度計(jì)算中需要對(duì)梯度電流進(jìn)行預(yù)加重處理,在梯度上升沿和下降沿施加與渦流作用相反的過(guò)電流。將連續(xù)系統(tǒng)離散化后由式(7)和式(8)可以推導(dǎo)出預(yù)加重電流的形式為:

        其中yi(n)為補(bǔ)償單個(gè)渦流環(huán)路的預(yù)加重電流,x(n)為輸入的物理梯度基礎(chǔ)波形,將p(n)疊加到x(n)上即可得到預(yù)加重后的波形。一般來(lái)說(shuō),m的值越大,即幅度和時(shí)間常數(shù)的個(gè)數(shù)越多,渦流補(bǔ)償?shù)男Ч胶?,但運(yùn)算量也越大,通常情況下m的取值為4~6。當(dāng)用戶有特殊需求時(shí),本設(shè)計(jì)的運(yùn)算能力足以支持m取10或更大的值。

        在實(shí)際的MRI系統(tǒng)中,X、Y、Z任何一路梯度信號(hào)的輸出均會(huì)對(duì)主磁場(chǎng)B0產(chǎn)生影響,使主磁場(chǎng)產(chǎn)生一定的偏移,偏移的程度與梯度脈沖的強(qiáng)度、渦流的影響以及線圈的設(shè)計(jì)等因素有關(guān)。為了對(duì)梯度磁場(chǎng)造成的主磁場(chǎng)偏移進(jìn)行補(bǔ)償,我們需要計(jì)算補(bǔ)償信號(hào)Bp,用以驅(qū)動(dòng)B0勻場(chǎng)線圈。本文使用了一個(gè)補(bǔ)償函數(shù)pB(n)來(lái)定義Bp,在默認(rèn)的情況下pB(n)定義為X、Y、Z三路梯度渦流補(bǔ)償?shù)暮停缦率剿荆?/p>

        其中px(n)、py(n)、pz(n)的計(jì)算方法如式(10)所示。這樣的設(shè)計(jì)主要是考慮了渦流的影響。近年來(lái),出現(xiàn)了一些對(duì)B0補(bǔ)償?shù)男卵芯縖9]。本設(shè)計(jì)支持用戶修改式(11)中的幅度和時(shí)間常數(shù),也提供了用戶自定義補(bǔ)償函數(shù)pB(n)的接口,以便用戶根據(jù)實(shí)際情況考慮更多影響因素和優(yōu)化補(bǔ)償效果。

        在理想的磁共振成像中,主磁場(chǎng)的靜磁場(chǎng)強(qiáng)度應(yīng)該在成像范圍內(nèi)具有嚴(yán)格的均勻性,但是由于制造工藝和周圍環(huán)境的影響,靜磁場(chǎng)強(qiáng)度的均勻性往往存在一定的偏差,因此需要在梯度線圈中疊加直流偏置,起到一階勻場(chǎng)的作用。記在X、Y、Z和B0通道施加的直流勻場(chǎng)分量為Sx、Sy、Sz和SB,則上述對(duì)物理梯度波形的預(yù)加重和一階勻場(chǎng)補(bǔ)償?shù)挠?jì)算流程可以綜合用圖3表示,相應(yīng)的計(jì)算公式為:

        在上述預(yù)加重和勻場(chǎng)補(bǔ)償中,需要進(jìn)行大量的指數(shù)乘法和加法運(yùn)算,如果使用SISD(單指令單數(shù)據(jù))方式來(lái)編寫程序,則計(jì)算時(shí)間開(kāi)銷較大。在實(shí)際設(shè)計(jì)中,我們充分利用了ADSP-21369的SIMD內(nèi)核,在SIMD模式下進(jìn)行預(yù)加重?cái)?shù)值的計(jì)算。這樣兩個(gè)渦流環(huán)路的預(yù)加重可并行計(jì)算,明顯縮短了計(jì)算時(shí)間,改善了算法效率。

        圖3 梯度波形的預(yù)加重和一階勻場(chǎng)補(bǔ)償流程圖Fig.3 Flow chart of pre-emphasis and first-order shimming for gradient waveforms

        梯度計(jì)算模塊的最后一個(gè)環(huán)節(jié)是對(duì)每個(gè)通道將要輸出的梯度和勻場(chǎng)波形的幅值進(jìn)行檢查,如果超過(guò)了梯度和勻場(chǎng)功放的輸入量程,則將該通道的輸出限定為滿量程的最大值,同時(shí)向上層的序列控制器提出中斷請(qǐng)求。設(shè)梯度功放的量程為[-Gm,Gm],Gm>0,以X通道為例,則梯度計(jì)算模塊最后的輸出如式(16)所示。

        2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析

        為了驗(yàn)證本文設(shè)計(jì)的梯度計(jì)算模塊算法的有效性,我們使用ADI公司的VisualDSP++ 5.0來(lái)完成梯度計(jì)算程序的開(kāi)發(fā)和調(diào)試,并在ADSP-21369的開(kāi)發(fā)板上進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)。

        梯度計(jì)算的實(shí)驗(yàn)結(jié)果以圖形化的方式輸出。因?yàn)閷?shí)際系統(tǒng)中梯度波形會(huì)由驅(qū)動(dòng)接口電路將梯度電流轉(zhuǎn)換為電壓方式輸出,所以縱坐標(biāo)以電壓為單位。特殊梯度波形的輸出如圖4所示,(a)為正弦波形,(b) 的梯度下降沿包含一段雙曲線波形。圖5顯示的是單個(gè)物理梯度波形補(bǔ)償前后的對(duì)比,可見(jiàn)預(yù)加重和一階勻場(chǎng)補(bǔ)償算法對(duì)單通道數(shù)據(jù)的有效性。圖6顯示的是一個(gè)自旋回波(Spin Echo,SE)序列的物理梯度各通道輸出波形,圖中的Gx、Gy、Gz分別對(duì)應(yīng)Gr、Gp、Gs,Bp為B0補(bǔ)償通道的輸出,渦流補(bǔ)償使用4組預(yù)加重參數(shù),幅度常數(shù)為A1=4.5,A2=2.5,A3=1.4,A4=1.2,時(shí)間常數(shù)為T1=1.0ms,T2=0.1ms,T3=0.01ms,T4=0.001ms,一階勻場(chǎng)的參數(shù)設(shè)定為Sx= -1mV,Sy= 0,Sz=2mV,SB=1mV。圖6的結(jié)果表明,本算法可以計(jì)算MRI成像序列中所有通道的梯度數(shù)據(jù),并施加相應(yīng)的預(yù)加重和補(bǔ)償處理,在功能上滿足實(shí)際MRI系統(tǒng)對(duì)梯度計(jì)算模塊的要求。

        圖4 特殊梯度波形Fig.4 Special gradient waveforms

        圖5 預(yù)加重和勻場(chǎng)補(bǔ)償前后的梯度波形Fig.5 Gradient waveforms before/after pre-emphasis and shimming

        圖6 SE序列的梯度各通道輸出波形圖Fig.6 Waveform of each gradient channel in SE sequence

        為了提高計(jì)算速度,我們?cè)诰幊虒?shí)現(xiàn)時(shí)對(duì)梯度計(jì)算程序的各個(gè)環(huán)節(jié)進(jìn)行了優(yōu)化。實(shí)驗(yàn)中將DSP的主頻設(shè)為400 MHz,計(jì)算了所有通道的2000個(gè)波形點(diǎn),再取平均得到計(jì)算所有通道一個(gè)波形點(diǎn)的時(shí)間,優(yōu)化前后的計(jì)算時(shí)間對(duì)比如表2所示。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,優(yōu)化后的整體計(jì)算時(shí)間減少了約90%,計(jì)算速度大幅提升,實(shí)際計(jì)算一個(gè)梯度波形數(shù)據(jù)點(diǎn)的時(shí)間約為0.332μs,而目前所用的PCM1704(DAC)轉(zhuǎn)換一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的周期為1.302μs(對(duì)應(yīng)768 KHz的轉(zhuǎn)換率),這表示在DSP計(jì)算完一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)后,還有0.970μs的空閑時(shí)間,這給用戶提供了足夠的升級(jí)空間:可以更新梯度計(jì)算算法,計(jì)算更多的波形預(yù)加重參數(shù)(可支持10組以上)或者自定義新的計(jì)算功能,也可以隨著電子技術(shù)的發(fā)展升級(jí)使用轉(zhuǎn)化率更高的DAC(最高支持3 MHz)。另一方面,梯度計(jì)算模塊在輸入和內(nèi)部計(jì)算的過(guò)程中使用32 bit/40 bit的數(shù)據(jù)精度,最后輸出時(shí)才轉(zhuǎn)換成PCM1704所需的24 bit數(shù)據(jù),這使計(jì)算結(jié)果的精度更高。因此,本文的設(shè)計(jì)在速度和精度上都能滿足實(shí)際MRI系統(tǒng)的需求。

        表2 程序優(yōu)化前后的梯度計(jì)算時(shí)間對(duì)比Tab.2 Comparison of gradient calculation time before/after program optimization

        3 結(jié)論

        本文提出了一種基于SHARC DSP的MRI梯度計(jì)算模塊的設(shè)計(jì)方法。該模塊使用一片高性能DSP完成梯度計(jì)算有關(guān)的旋轉(zhuǎn)、預(yù)加重和勻場(chǎng)補(bǔ)償?shù)热抗δ?,能夠方便地與序列控制模塊和梯度輸出模塊相連接。在DSP開(kāi)發(fā)板上進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,所設(shè)計(jì)的模塊在功能、速度和精度上都能滿足MRI梯度計(jì)算的要求,且還有足夠的余量可供用戶實(shí)現(xiàn)更多的自定義功能和后續(xù)的系統(tǒng)升級(jí),為研制數(shù)字化MRI譜儀提供了一種實(shí)用的梯度計(jì)算解決方案。

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