摘 要 以氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)為分析方法,比較了液氮和75%甲醇(-80 ℃)兩種溶液對副溶血性弧菌細胞的猝滅效果,以及氯仿、75%冰甲醇、水、甲醇-氯仿-水(10∶3∶1, V/V)、甲醇-氯仿-水(3∶1∶1, V/V)、甲醇-氯仿(1∶1, V/V)6種提取劑對副溶血性弧菌代謝物組的提取效果。結果表明,用75%甲醇(-80 ℃)猝滅副溶血性弧菌時,出現(xiàn)了代謝物泄漏現(xiàn)象,而液氮猝滅則不存在這個現(xiàn)象;檢索發(fā)現(xiàn),采用75%冰甲醇提取獲得了47種代謝物,峰面積標準偏差為8.02%,其它5種提取劑獲得代謝物種類少于40種,且重現(xiàn)性差。比較色譜峰數(shù)量、面積和重現(xiàn)性后發(fā)現(xiàn),液氮猝滅、75%冰甲醇提取適于副溶血性弧菌代謝物組提取。
關鍵詞 副溶血性弧菌; 猝滅方法; 代謝物組提取方法; 氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用
1 引 言
代謝組學通過定性與定量研究生物體內(nèi)代謝物的變化研究生物體代謝途徑,代謝組學主要關注分子量小于1000的小分子[1]。目前,代謝組學的研究已在藥物研發(fā)[2]、代謝成分研究、疾病檢測[3~5]、生物標志物尋找[6]等方面展開。近幾年代謝組學在微生物研究中迅速展開,已對部分微生物代謝物提取方法進行了優(yōu)化[7~9],并研究了猝滅過程中的冷休克現(xiàn)象[10]。
副溶血性弧菌是一種常見的食源性致病菌,由該菌引起的食物中毒事件占細菌性食物中毒事件60%以上[11]。代謝組水平研究是副溶血性弧菌的致病機理的重要研究內(nèi)容。本研究對副溶血性弧菌細胞猝滅及代謝物組提取方法進行了優(yōu)化,為副溶血性弧菌代謝組學分析奠定了基礎。2 實驗部分
2.1 儀器與試劑
5975B型質(zhì)譜、6890N型氣相色譜(美國Agilent公司); JY92-IIN超聲波細胞粉碎機(寧波新芝生物科技股份有限公司);Hermle Z36HK冷凍離心機(德國Hermle公司);真空干燥機(美國Eppendorf公司);1
2.4 數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計檢驗
本研究采用NIST、Origin 8.0、Past 1.79和SPSS 13.0對實驗結果進行分析,根據(jù)不同方法得到的色譜總離子圖中峰數(shù)量和峰面積判斷不同方法的優(yōu)劣。匹配度為樣品質(zhì)譜圖與標準圖譜的正檢索相似系數(shù)(0~1000),匹配度≥700為適合匹配度??赡苄詾闃悠焚|(zhì)譜圖與標準圖譜的正、反檢索相似系數(shù)的綜合,置信區(qū)間為≥80%。
3 結果與討論
3.1 細胞猝滅方法比較
比較75%甲醇(-80 ℃)與液氮兩種溶劑對副溶血性弧菌細胞的猝滅效果。用75%甲醇(-80 ℃)和液氮分別處理同一批樣品,用6種溶劑對代謝物進行提取。由較圖1和表1可見,用液氮猝滅后,以75%冰甲醇提取,獲得峰數(shù)量最多。75%甲醇(-80 ℃)猝滅時,細胞出現(xiàn)代謝物泄漏(圖2和表2)。液氮猝滅速度快,不存在代謝物泄漏問題,且操作簡便,因此,液氮更適合于副溶血性弧菌猝滅。
3.2 代謝物組提取方法比較
由圖1可見,以75%冰甲醇為提取劑時,獲得的代謝物種類最多;以甲醇-氯仿-水(3∶1∶1, V/V)為提取劑時,所提取代謝物量最多,但重現(xiàn)性較差。計算6種提取溶劑3個平行中峰面積的相對標準偏差,結果顯示,75%冰甲醇、氯仿、水、甲醇-氯仿-水(10∶3∶1, V/V)、甲醇-氯仿-水(3∶1∶1, V/V)和甲醇-氯仿(1∶1, V/V)的標準偏差依次為 8.02%, 4.79%, 27.00%, 71.33%, 13.10%和9.93%。6種提取溶劑的提取結果經(jīng)主成分分析(PCA)及聚類分析(CA)發(fā)現(xiàn),甲醇-氯仿-水(3∶1∶1, V/V)提取所得代謝物種類與前5種差異較大(圖3)。對75%冰甲醇提取所得總離子圖分析,根據(jù)峰面積、峰數(shù)量、相對標準偏差及物種數(shù)量,確定75%冰甲醇最適合于副溶血性弧菌代謝物組的提取(表3)。
3.3 方法穩(wěn)定性測定
樣品經(jīng)液氮猝滅、75%冰甲醇提取,衍生化后,進行GC-MS分析,比較所得圖譜的峰數(shù)量及峰面積。結果顯示,所有共有峰保留時間重現(xiàn)性良好,幾乎所有峰面積相對標準偏差均小于5%,總峰面積相對標準偏差為5.56%,說明此方法的穩(wěn)定性較好(圖4)。
3.4 放置時間對提取代謝物組的影響
樣品經(jīng)液氮猝滅、75%冰甲醇提取的代謝物組衍生化后,在-20 ℃放置48 h。對放置前后樣品進行分析。結果發(fā)現(xiàn),峰數(shù)量未發(fā)生變化,單個峰面積相對標準偏差小于5%,總峰面積相對標準偏差為7.84%。結果表明,放置前后樣品未發(fā)生明顯變化。
4 結 論
以GC-MS為代謝組分析方法,對副溶血性弧菌細胞猝滅及代謝物組提取方法進行優(yōu)化。用NIST質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫快速檢索代謝物,發(fā)現(xiàn)75%甲醇(-80 ℃)猝滅過程中磷酸、棕櫚酸和丙三醇等出現(xiàn)泄漏。比較6種提取劑提取所得總離子圖發(fā)現(xiàn),75%冰甲醇獲得峰數(shù)量最多,重現(xiàn)性較好。液氮猝滅,75%冰甲醇提取,適用于副溶血性弧菌代謝物組,為副溶血性弧菌代謝組學分析奠定了良好基礎。
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Comparison of Quenching and Extraction Methods for Metabolome
Analysis of Vibrio Parahaemolyticus
ZHAO Qiang, LIU Hai-Quan, LU Ying, SUN Xiao-Hong, PAN Ying-Jie, ZHAO Yong*
(Shanghai Ocean University, College of Food Science &Technology, Shanghai 201306)
Abstract A reliable cell quenching and metabolite extraction method was crucial for microbial metabolism analysis. For metabolism analysis of Vibrio parahaemolyticus, liquid nitrogen and 75% methanol (-80 ℃) were compared for their efficiency of cell quenching, and six different extraction solvents based on (i) chloroform, (ii) 75% cold methanol, (iii) water, (iv) methanol:chloroform:water=10∶3∶1 (V/V), (v) methanol:chloroform:water=3∶1∶1 (V/V) and (vi) methanol∶chloroform=1∶1 (V/V) were compared for their efficiency of metabolites extracting. The metabolites were detected by GC-MS. The results showed that leakage of metabolite occurred when quenched with 75% methanol (-80 ℃); however this phenomenon did not occur with liquid nitrogen. 47 metabolites were found when extracted with 75% cold methanol, and the relative standard deviation of peak area was 8.0%. In contrast, 40 or less metabolites were detected with other extraction methods, and the reproducibilities of those methods were unsatisfactory. For global analysis, quenching with liquid nitrogen and extraction with 75% cold methanol was very suitable for metabolomics studies of Vibrio parahaemolyticus.
Keywords Vibrio parahaemolyticus; Method for quenching; Method for metabolites extraction; Gas chromatography-mass spectrometry