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        雞致病性大腸桿菌的分離鑒定及耐藥基因的檢測(cè)

        2010-11-18 06:29:18張文娟田召芳
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2010年7期
        關(guān)鍵詞:致病性耐藥性質(zhì)粒

        柳 林,張文娟,田召芳

        (煙臺(tái)市動(dòng)物疫病預(yù)防與控制中心,山東煙臺(tái) 264003)

        大腸桿菌是Escherich在1885年發(fā)現(xiàn)的,是各種動(dòng)物的腸道常駐菌,分布非常廣泛。后來(lái),人們才發(fā)現(xiàn)一些特殊血清型的大腸桿菌對(duì)人和動(dòng)物的致病性。

        禽大腸桿菌病(Avian colibacillosis)是由致病性大腸桿菌(Escherichia coli)引起的局部或全身性疾病,包括急性敗血癥、氣囊炎、肝周炎、心包炎、卵黃性腹膜炎、輸卵管炎、滑膜炎、眼炎、關(guān)節(jié)炎、臍炎、肉芽腫以及肺炎等,最常見(jiàn)的為氣囊炎、肝周炎、心包炎、卵黃性腹膜炎、輸卵管炎等[1]。在臨床上往往不單獨(dú)發(fā)病,一般繼發(fā)于一些病毒病如新城疫、馬立克氏病、傳染性只氣管炎等。這類疾病在雞群中發(fā)病率一般為11%~69%,死亡率為3.2%~72.9%,且感染后的畜禽對(duì)沙門氏菌、新城疫、法氏囊病等細(xì)菌病和病毒病的易感性增高。各種品種及不同日齡的畜禽均可感染發(fā)病,該病給養(yǎng)禽業(yè)帶來(lái)了巨大經(jīng)濟(jì)損失[1]。

        雖然通過(guò)改善養(yǎng)殖條件及使用針對(duì)性的疫苗可以減少大腸桿菌病的發(fā)生,但最主要的防治措施仍然是使用抗菌藥物。然而由于抗生素的大量使用,導(dǎo)致細(xì)菌耐藥性的廣泛產(chǎn)生。隨著大腸桿菌耐藥菌株的不斷增多,大腸桿菌感染及其食品污染有不斷上升的趨勢(shì),使人類食物中毒和胃腸炎不斷暴發(fā),己成為全球關(guān)注的焦點(diǎn)[2],因此,控制耐藥菌的傳播和防治大腸桿菌感染已成為一個(gè)世界性難題。目前,國(guó)內(nèi)對(duì)致病性大腸桿菌氨基糖苷類的耐藥性研究不多,而對(duì)雞源大腸桿菌的aad類基因的檢測(cè)研究尚未見(jiàn)有報(bào)道。本試驗(yàn)通過(guò)藥敏試驗(yàn),調(diào)查規(guī)?;u場(chǎng)致病性大腸桿菌對(duì)氨基糖苷類的耐藥情況,用PCR技術(shù)對(duì)規(guī)?;u胚中分離的雞致病性大腸桿菌的鏈霉素、卡那霉素耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)研究,調(diào)查和了解規(guī)?;u場(chǎng)鏈霉素、卡那霉素、慶大霉素的耐藥基因的分布和流行情況,建立大腸桿菌對(duì)氨基糖甙類代表性藥物鏈霉素、卡那霉素耐藥基因的PCR檢測(cè)技術(shù),為我國(guó)控制大腸桿菌感染,制定用藥規(guī)范,減少抗生素殘留、降低耐藥性的擴(kuò)散和傳播及氨基糖苷類抗生素耐藥性的分子流行病學(xué)調(diào)查等提供科學(xué)依據(jù),對(duì)保證我國(guó)畜禽業(yè)養(yǎng)殖的健康發(fā)展,保證食品安全和人類的健康有重要意義。

        1 實(shí)驗(yàn)材料

        1.1 儀器

        電子天平 FA1004A,上海精天電子儀器有限公司;手提式高壓蒸汽消毒鍋YXQG02,山東新華醫(yī)療器械股份有限公司;超凈工作臺(tái)SW-CJ-1F,蘇州集團(tuán)蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;電熱恒溫培養(yǎng)箱YY0027-90,龍口電器有限公司;高速離心機(jī) TGL-16G,上海安亭科學(xué)儀器廠;數(shù)顯恒溫水浴鍋 HH-2,國(guó)華電器有限公司;低速離心機(jī) TDL-5-A,上海安亭科學(xué)儀器廠;超速離心機(jī)85P-72,日本日立公司;紫外分光光度計(jì) UV-2012C,尤尼柯(上海)儀器有限公司。

        1.2 試劑

        營(yíng)養(yǎng)瓊脂、普通肉湯、麥康凱瓊脂、三糖鐵瓊脂、各種糖發(fā)酵及生化鑒定培養(yǎng)基,均按常規(guī)方法配制;生化試管,購(gòu)于杭州天和微生物試劑有限公司;藥敏紙片:鏈霉素,卡那霉素,四環(huán)素,氯霉素,復(fù)合磺胺,呋喃妥因,萬(wàn)古霉素,頭孢呋新,頭孢噻污,頭孢派酮等購(gòu)自上海伊華醫(yī)科有限公司;DNA回收試劑盒,購(gòu)自寶泰克生物工程公司;Taq DNA 聚合酶(5 U/μL)、dNTP、MgCl2、10×buffer,購(gòu)于大連寶生物工程公司。

        1.3 菌株

        由本實(shí)驗(yàn)室分離自山東省滕州市某種雞場(chǎng)死亡雞胚及出殼弱雛

        2 實(shí)驗(yàn)方法

        2.1 細(xì)菌的分離培養(yǎng)

        無(wú)菌采取死胚的肝臟或肺臟,直接劃線接種于麥康凱瓊脂平板,37℃培養(yǎng)24 h,挑取單個(gè)菌落,同時(shí)進(jìn)行革蘭氏染色鏡檢。純化后置4℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>

        2.2 細(xì)菌生化特性鑒定

        按常規(guī)方法對(duì)致病菌進(jìn)行11項(xiàng)生化反應(yīng)鑒定[3]。

        2.3 藥敏實(shí)驗(yàn)

        將分離到的細(xì)菌涂布接種于麥康凱瓊脂平板上,間隔一定距離貼上各種抗生素藥敏試紙,于37℃培養(yǎng)24 h后觀察各抗生素抑菌情況[4-5]。

        2.4 引物設(shè)計(jì)

        選用4對(duì)源于馬孟根、王洪寧等的論文(豬源致病性沙門氏菌耐藥基因的檢測(cè)結(jié)果)的引物(氨基糖甙類的aph3'-2,addB和四環(huán)素類的tetA,tetC)(表1),由上海生物工程有限公司合成,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明引物設(shè)計(jì)可靠。

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        2.5 大腸桿菌耐藥基因的PCR擴(kuò)增和檢測(cè)

        PCR擴(kuò)增體系:ddH2O 24.5μL,5×PCRbuffer(Mg2+)5.0 μL,MgCl25.0μL,dNTP 5.0μL,上、下游引物各2.5μL(25 pmol/μL),模板3.0 μL,Taq聚合酶 0.5μL(5 U/μL),總體積50μL。

        PCR擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變溫10 min;94℃變性30 s,退火溫度aph3-Ⅱ、tetC是54℃30 s,tetA是55℃30 s,aadB 58 ℃30 s,72 ℃延伸 30 s,共35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10 min。然后電泳檢查結(jié)果[6]。

        2.6 耐藥基因的檢測(cè)及測(cè)序

        2.6.1 回收DNA

        用MO BIO公司Ultra CleanTM15DNA Purification Kit回收PCR產(chǎn)物。

        2.6.2 DNA片段與載體DNA的連接

        (1)連接體系DNA片段0.3 mL,載體 DNA 0.03-0.1 mL,T4DNA ligase 1 mL,10 T4DNA ligase buffer 2.5 mL,再加dH2O到25μL。

        (2)在16℃下過(guò)夜連接。

        (3)次日加2.5 mL3M NaAC和62.5 mL冷水乙醇,置-20℃30~60 min,再以12 000 r/min離心10 min后回收沉淀。

        (4)用70%冷水乙醇清洗沉淀,干燥后用25~50μL的TE溶液。取10~20μL轉(zhuǎn)至100μL感受態(tài)。

        2.6.3 感受態(tài)細(xì)胞的制備

        參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》(第二版)所述方法用CaCl2制備新鮮的大腸桿菌TG1菌株的感受態(tài)細(xì)胞[7]。

        2.6.4 重組DNA的轉(zhuǎn)化

        將10μL連接產(chǎn)物加到200μL新鮮制備的TG1感受態(tài)細(xì)胞中,混勻內(nèi)容物,冰浴上放置30 min。然后將離心管放入42℃循環(huán)水浴中90 s,快速將管轉(zhuǎn)移到冰浴中,使之冷卻2~3 min。每管加LB培養(yǎng)基800μL,用水浴將培養(yǎng)基加溫至37℃,然后轉(zhuǎn)移至37℃搖床上溫育45 min以上,使細(xì)菌復(fù)蘇。取80~150μL菌液涂布到含有100μLg/mL AMP的LB瓊脂平板上。倒置平皿于37℃溫箱中培養(yǎng)過(guò)夜,次日挑取單個(gè)菌落進(jìn)行質(zhì)粒DNA的制備及鑒定[8]。

        2.6.5 質(zhì)粒DNA的酶切鑒定

        將上述所提質(zhì)粒各取3μL于0.8%瓊脂糖凝膠中90 V電泳30 min,在凝膠成像系統(tǒng)下觀察并記錄結(jié)果,挑選DNA條帶相對(duì)滯后的質(zhì)粒DNA進(jìn)行EcoR I和salI雙酶切。酶切體系如下:質(zhì)粒DNA 5.0μL,ddH2O 12.0 μL,10×H Buffer 2.0 μL,EcoR I 0.5 μL,sal I 0.5 μL,總體積20.0μL。

        混勻后,稍微離心,37℃酶切1.5 h,然后于0.8%瓊脂糖凝膠中90 V電泳45 min,在凝膠成像系統(tǒng)下觀察并記錄結(jié)果。

        2.6.6 序列測(cè)定

        由上海生物科技有限公司完成。

        3 結(jié)果

        3.1 細(xì)菌分離培養(yǎng)

        在麥康凱等培養(yǎng)基上呈現(xiàn)光滑、濕潤(rùn)有光澤的紅色菌落。

        3.2 細(xì)菌的生化特性

        生化反應(yīng)結(jié)果:吲哚陽(yáng)性;MR陽(yáng)性;V-P陰性;枸椽酸鹽陰性;H2S陰性;尿素陰性;分解乳糖、葡萄糖、麥芽糖、甘露糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣、蔗糖不產(chǎn)酸產(chǎn)氣。所得生化試驗(yàn)結(jié)果證明所分離到的細(xì)菌為大腸桿菌。

        3.3 藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明6株大腸桿菌對(duì)氨基糖甙類和四環(huán)素類藥物的耐藥性最高,對(duì)磺胺類藥物次之,硝基呋喃類和氯霉素類藥物的耐藥性最低(表2)。

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        3.4 PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

        以質(zhì)粒 DNA為模板對(duì)6株致病性大腸桿菌的aph(3')-Ⅱ、addB、te tA、tetC基因進(jìn)行擴(kuò)增,用1.0%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果見(jiàn)圖1。

        只有2-3和2-5兩種細(xì)菌電泳條帶的大小和要擴(kuò)增的aph(3')-Ⅱ的基因片段大小一致,其余的均沒(méi)有結(jié)果。

        3.5 酶切目的DNA片段的電泳結(jié)果,如圖2。

        3.6 耐藥基因的序列測(cè)定

        序列結(jié)果顯示,共有582個(gè)堿基。A、G、C、T 四種堿基的分布為:A -24.91%(145/582)、G -24.24%(141/582)、C-21.48%(125/582)、T-29.38%(171/582)。

        4 討論

        4.1 關(guān)于大腸桿菌病的防治

        氣候、環(huán)境和飼養(yǎng)方式的變化,特別是雞群較擁擠,是大腸桿菌病重要的誘發(fā)因素。所以要給予優(yōu)良的飼養(yǎng)環(huán)境如注意衛(wèi)生、通風(fēng),減少應(yīng)激是預(yù)防該病的重要因素[9]。對(duì)于預(yù)防和治療該病,根據(jù)上述藥敏試驗(yàn)的結(jié)果,可避免幾種藥的使用,但由于該病病原對(duì)抗菌藥物極易產(chǎn)生抗藥性,使用敏感抗菌藥雖有一定療效但很容易復(fù)發(fā)。因此,一個(gè)療程后,必須注意更換抗菌藥物,且用藥劑量要足,以防形成抗藥性[1]。

        4.2 關(guān)于藥敏試驗(yàn)結(jié)果

        氨基糖甙類作為一類抗生素,因其價(jià)格低廉、作用范圍廣泛等優(yōu)點(diǎn),曾廣泛地應(yīng)用于人醫(yī)、獸醫(yī)細(xì)菌性感染的防治,導(dǎo)致規(guī)?;u場(chǎng)大腸桿菌對(duì)氨基糖甙類藥物產(chǎn)生了較為廣泛的耐藥性[10]。

        藥敏試驗(yàn)結(jié)果表明:規(guī)?;B(yǎng)雞場(chǎng)對(duì)氨基糖甙類普遍存在耐藥性,耐藥率達(dá)到100%,而且大腸桿菌對(duì)除氨基糖甙類以外的多種抗生素也都產(chǎn)生了很強(qiáng)的耐藥性,這些都為我們臨床用藥提供了理論依據(jù),建議在規(guī)?;u場(chǎng)中在進(jìn)行細(xì)菌性疾病的防治時(shí),減少不敏感藥物的使用,要根據(jù)藥敏試驗(yàn)的結(jié)果選用合適的藥物。

        4.3 關(guān)于耐藥基因PCR檢測(cè)技求

        PCR技術(shù)以微量、重復(fù)性好、快捷等特點(diǎn)已在人醫(yī)及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中得到了廣泛應(yīng)用,在醫(yī)學(xué)疾病診斷方面由于其特異、敏感、準(zhǔn)確、快速亦倍受青睞;在獸醫(yī)臨床上,常用此法進(jìn)行病原特異基因的檢測(cè)及克隆。既然基因突變及基因轉(zhuǎn)移是耐藥性存在的重要內(nèi)因,這就決定了檢測(cè)與抗生素耐藥性相關(guān)的基因具有重要意義。國(guó)外用此技術(shù)對(duì)部分細(xì)菌的耐藥機(jī)制進(jìn)行了深入探討,使耐藥質(zhì)粒的演變規(guī)律逐漸明了[11-12]。本實(shí)驗(yàn)用 PCR擴(kuò)增獲得aph(3')-Ⅱ的基因片段,成功建立了大腸桿菌aph(3')-Ⅱ基因的PCR檢測(cè)技術(shù),從分子水平上檢測(cè)雞源致病性大腸桿菌的耐藥基因aph(3')-Ⅱ,克服了藥敏試驗(yàn)只能檢測(cè)耐藥表型的缺點(diǎn),可用于大腸桿菌對(duì)氨基糖甙類耐藥性的分子水平檢測(cè)。

        本研究用PCR技術(shù)分別對(duì)6株耐藥的大腸桿菌的耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,在6株耐藥的大腸桿菌的質(zhì)粒上擴(kuò)出的基因aph3'-2,與藥敏試驗(yàn)結(jié)果陽(yáng)性符合,具有較高的檢出率;其余5株耐藥大腸桿菌質(zhì)粒上擴(kuò)出的基因與藥敏試驗(yàn)陽(yáng)性不符合,檢出率較低。

        4.4 關(guān)于序列分析

        核苷酸序列分析能從分子水平上分析大腸桿菌對(duì)氨基糖甙類的耐藥性,了解其遺傳和生化機(jī)制。一方面,通過(guò)同源性比較,可了解來(lái)源相同和不同菌株核苷酸的變異情況;另一方面還可以根據(jù)已知序列,推定其編碼氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)和高級(jí)結(jié)構(gòu),了解其耐藥性的生化機(jī)制,為抗生素工業(yè)中開(kāi)發(fā)新的抗生素提供理論依據(jù)。

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