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        水貂源牛分枝桿菌的分離與熒光PCR鑒定

        2010-11-18 06:29:20王春雨王全凱王海軍劉金華王振國吉林農業(yè)大學吉林長春308吉林出入境檢驗檢疫局吉林長春3006
        中國動物檢疫 2010年9期
        關鍵詞:水貂病料探針

        王春雨,楊 莉,王全凱,王海軍,劉金華,周 亮,王振國(.吉林農業(yè)大學,吉林長春 308;.吉林出入境檢驗檢疫局,吉林長春 3006)

        水貂作為主要毛皮動物,在我國北部地區(qū)廣泛養(yǎng)殖,每年產(chǎn)皮數(shù)百萬張,年經(jīng)濟產(chǎn)值達億元,是特種動物養(yǎng)殖業(yè)的主要支柱[1]。由于各地區(qū)養(yǎng)殖規(guī)模大小不一,管理水平良莠不齊,對水貂疾病的防治的能力和條件普遍較差,難以保證實際生產(chǎn)對疾病防控的要求。水貂結核病在上世紀就被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)報道[2],水貂的養(yǎng)殖密度較大,配種時需要人工協(xié)助,結核病一旦發(fā)生就可能大范圍流行,并威脅到養(yǎng)殖人員健康,進而影響社會公共衛(wèi)生安全。

        結核病是一種慢性人獸共患傳染病,其潛伏期長,檢疫和診斷的研究進展緩慢。目前結核病的診斷主要還是靠臨床癥狀和涂片染色以及細菌培養(yǎng)[3],由于結核桿菌生長速度慢,所以菌種的鑒定,費時、費力、敏感性差 ,不利于結核病的凈化。熒光探針PCR是近期開始流行的一種微生物檢測技術,具有準確性高、重現(xiàn)性好等特點,已廣泛用于基因表達、病原體檢測等諸多研究領域[4-6]。本研究采用熒光探針PCR對水貂源牛分枝桿菌進行鑒定,可以縮短檢測時間,有利于水貂群中結核病的及時控制。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 動物 大連某貂場死亡水貂10只,ELISA檢測結核陽性。

        1.1.2 標準菌株 人型結核分枝桿菌 H37Rv ((M.tuberculosis,ATCC25618)、牛分枝桿菌(M.bovis,ATCC19210)、草分枝桿菌(M.phlei,ATCC607)、恥垢分枝桿菌(M.smegmatis,ATCC607),胃分枝桿菌(M.gastri,ATCC15754),購自北京中原經(jīng)貿公司(ATCC菌種保存中心中國代理)。

        1.1.3 主要試劑與儀器 7H9培養(yǎng)基、7H10培養(yǎng)基、OADC增菌劑均購自美國BD公司;Ex 2×Taq酶購自寶生物工程(大連)有限公司;ABI7000實時熒光PCR儀為美國應用生物系統(tǒng)公司產(chǎn)品;超純水器Mill—Q Elix 10購自Millipore公司。

        1.1.4 引物、探針的設計與合成采用Primer Express2.0軟件,設計熒光PCR探針和引物。根據(jù)GenBank登錄的結核桿菌RD1編碼區(qū)設計合成引物及探針,5’端標記FAM熒光基團,3’端標記BHQ-1(上游引物GGCTTCTGACCCGCTAATAC,下游引物ACGTGACATTTCCCTGG ATT,探針 CCGCGAAATTCCACTG CTGC);根據(jù)牛分枝桿菌基因組中特有序列(GenBank No:AJ003103) 設計合成引物及探針,5’端標記HEX熒光基團,3’端標記BHQ-1(上游引物GTCATGACGCCTTCCTAACC,下游引物CTCCAAGAGTGTTGCG CTT,探針 TGAATTCATACAAGC CGTAGTCGTGCA)。

        1.2 方法

        1.2.1 細菌分離培養(yǎng) 采集水貂的肺、脾、淋巴結樣品,將樣品進行勻漿處理后使用4%NaOH進行消化處理,再用相同濃度的弱酸進行中和,將處理后的組織漿液接種于7H10培養(yǎng)基進行分離培養(yǎng),接種后3 d、7 d后分別觀察結果一次,以后每周定期觀察結果兩次。

        1.2.2 抗酸染色 取采集病料的觸片,用萋—尼二氏(Zehl-Neelson)染色法染色,光學顯微鏡觀察。

        1.2.3 細菌DNA的提取 取2-3個菌落的放入離心管中,加入200 μL TE緩沖液,85~90℃煮10 min后,立即-20℃冷凍15 min,加入40 μL(20 mg/mL)溶菌酶,混勻,37 ℃孵化2 h后迅速加熱到65℃。再加入250μg/mL蛋白酶K和終濃度1%SDS,震蕩30 min,加入終濃度為1%的 CTAB和 NaCl混合液(CTAB 10%;NaCl 0.7 M),65℃孵化 20 min。加入等體積的氯仿/異戊醇(24/1)提取,離心后取上清液,加入0.6體積的異丙醇沉淀,離心去掉上清,自然干燥,加入25μL無菌蒸餾水溶解DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.4 TaqMan熒光PCR擴增體系和反應條件 TaqMan熒光定量PCR反應體系為25μL,其中ddH2O 13 μL,10×Ex PCR buffer(含 5 mM MgCl2)5μL,dNTP(2.5 mM)2μL,引物 (10 pmol/μL) 和探針(10 pmol/μL)各 0.5 μL,Ex Taq 熱啟動酶(5 u/μL)0.5 μL,DNA3 μL。,按下列反應參數(shù)進行:95℃預變性4 min;95 ℃變性 15 s,60 ℃退火延伸30 s,40個循環(huán);退火延伸檢測熒光信號。

        2 結果

        2.1 鏡檢結果 采集病料的觸片經(jīng)萋—尼二氏染色,為短桿狀紅色抗酸桿菌(圖1)。

        2.2 分離培養(yǎng)結果 經(jīng)過堿處理的病料接種到7H10固體培養(yǎng)基,45 d后有一只水貂的肺臟和淋巴結樣本長出菌落,將菌落轉接到7H9和7H10固體培養(yǎng)基進行純化培養(yǎng)。

        2.3 熒光探針檢測結果

        2.3.1 結核分枝桿菌復合群檢測根據(jù)致病性結核桿菌復合群特有的RD1序列區(qū)域設計引物和探針,對所分離的病原菌進行檢測。以H37Rv、牛分枝桿菌為陽性質控菌株,BCG和其他分枝桿菌為陰性質控菌株。所分離的病原出現(xiàn)擴增曲線,證明所分離的菌株是致病性結核桿菌(圖2)。

        2.3.2 牛分枝桿菌檢測以牛分枝桿菌為陽性質控菌株,H37Rv、草分枝桿菌、恥垢核分枝桿菌為陰性質控菌株。對分離病原進行亞種鑒定,出現(xiàn)陽性擴增曲線,說明所分離的水貂結核病原菌屬于牛分枝桿菌亞種(圖3)。

        3 討論

        結核桿菌的分離培養(yǎng)對病料的前處理要求較高,我們處理了十只水貂的內臟樣品,但只從一只水貂樣本中分離得到牛分枝桿菌,原因可能是由于樣品處理時間不當。不同亞種分枝桿菌對培養(yǎng)基敏感性存在差異,通常使用的L-J培養(yǎng)基對于牛分枝桿菌的檢出率比較低[7],所以本研究使用7H10培養(yǎng)基添加OADC增菌劑進行初代分離培養(yǎng),菌落較L-J培養(yǎng)基小,但是菌落在整個培養(yǎng)基斜面分布更加均勻,菌落數(shù)量增多,有利于進一步純化培養(yǎng)。

        結核桿菌的常規(guī)檢測方法為生化鑒定等,屬于表型分類法,是以形態(tài)和理化特征為依據(jù),近年來變異株的出現(xiàn),導致了生化檢測的特異性降低,讓MTC物種級鑒定依然存在較大難度[8-9]。分子生物學技術應用在疾病的診斷逐漸被人們所認可,特別是對于體外培養(yǎng)困難的病原微生物的診斷具有重要的作用[10-11]。結核桿菌復合群熒光PCR檢測研究較多主要是IS6110插入序列,該序列在部分牛分枝桿菌中只存在單一拷貝[12],這就導致以IS6110片段為模板動物結核病病原檢測時存在弊端。本研究應用的結核桿菌RD1序列只存在于結核桿菌復合群致病株中,基于該位點的熒光PCR檢測技術可以增加檢測的特異性,能夠將致病性結核桿菌與BCG以及其他非致病性結核桿菌區(qū)別,根據(jù)牛分枝桿菌基因組中特有的229 bp序列設計引物與探針可以對結核桿菌復合群直接進行亞種鑒定,有利于結核桿菌的快速檢測,縮短動物檢驗檢疫時間,促進動物結核病的防治。

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