徐梅芳
(天津師范大學 數(shù)學科學學院,天津 300387)
結(jié)構(gòu)決定性質(zhì),性質(zhì)是分子內(nèi)在結(jié)構(gòu)的反映,結(jié)構(gòu)與性質(zhì)的關系是化學研究中非常重要的課題之一。拓撲指數(shù)是分子結(jié)構(gòu)的數(shù)學描述符,通過描述分子的拓撲結(jié)構(gòu)——分子中所含原子種類、數(shù)目及其連接關系,能夠揭示分子的基本拓撲性。用拓撲指數(shù)研究定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)關系(QSPR)是當前非常活躍的領域[1-6],人們相繼提出了100余種拓撲指數(shù),如 Weiner指數(shù) W[7],Hosoya指數(shù) Z[8],Balaban指數(shù) J[9],Randic的分子連接性指數(shù)(nχ)[10]等。我們曾提出過一個拓撲指數(shù) X[5,13,14],并用其研究飽和烷烴、烯烴以及飽和脂肪醇的構(gòu)效關系,效果良好。目前對脂肪烴性質(zhì)的QSPR研究比較多[14-16],而雜原子體系的 QSPR研究則較少,對硫醇/硫醚體系的研究則更少[17,18]。本文針對硫醇/硫醚分子拓撲結(jié)構(gòu)特點,根據(jù)距離矩陣定義了一種新的拓撲指數(shù)A,通過對硫醇/硫醚進行的一些理化性質(zhì)的相關性回歸分析和預測,得到了良好的結(jié)果。
圖形G={V,E}表示一個隱氫圖,其中V為頂點集,E為邊集,則距離矩陣 D=[dij]n×n(n為頂點數(shù)),dij為沿頂點 i與j之間的最短路徑所包含的邊的數(shù)目。以1-丁硫醇為例,其隱氫圖為:
相應的距離矩陣D為
為了區(qū)別碳原子和硫原子,將硫原子進行染色,定義C和S原子之間的距離為rC-S/rC-C=1.16。則此矩陣的本征值為:
λ1=-5.36,λ2=-1.85,λ3=-0.80,λ4=-0.57,λ5=8.57則將矩陣D的最大本征值定義為拓撲指數(shù)A:
A=λ5=8.57
按照同樣的方法,計算了47個硫醇/硫醚的拓撲指數(shù)A,見表1。
表1 硫醇/硫醚的拓撲指數(shù)A值
表2 硫醇/硫醚的氣態(tài)標準生成熱(ΔHf, 2980)的實驗值[17]與計算值的比較
根據(jù)計算出的硫醇/硫醚的A值,將含有1~18個碳原子的28個硫醇/硫醚的氣態(tài)標準生成熱(ΔHf,2980)進行回歸分析(如圖1所示),其回歸方程為:
其中N為參與回歸的硫醇/硫醚的數(shù)目,RR為復相關系數(shù),SD 為標準偏差(下同)。方程(1)的復相關系數(shù)為 0.9936,表明硫醇/硫醚的ΔHf,2980與A之間關系密切。表2列出了根據(jù)方程(1)計算的硫醇/硫醚的ΔHf,2980與其實驗值。
圖1 硫醇/硫醚氣態(tài)標準生成熱ΔHf,2980的實驗值與計算值間的關系
由圖1可以發(fā)現(xiàn),大多數(shù)硫醇/硫醚的ΔHf,2980計算值與實驗值都比較接近,特別是不含支鏈的直鏈硫醇/硫醚,其ΔHf,2980實驗值與回歸曲線更符合;含支鏈的硫醇/硫醚,其 ΔHf,2980與回歸曲線的符合程度則要差一些。
表3 硫醇/硫醚的氣態(tài)標準生成自由能(ΔGf, 2980)和氣態(tài)標準熵(S2980)的實驗值[17]與計算值的比較
將含有1~18個碳原子的28個硫醇/硫醚的氣態(tài)標準生成自由能(ΔGf,2980)和氣態(tài)標準熵(S2980)分別進行回歸分析(如圖2、圖3所示),其回歸方程分別為:
方程(2)和(3)的 RR 非常接近 1,說明硫醇/硫醚的ΔGf,2980、S2980與A之間關系密切。表3列出了根據(jù)方程(2)和(3)計算的硫醇/硫醚的S2980和ΔGf,2980與其實驗值。由圖2、圖3及表3可以發(fā)現(xiàn),大多數(shù)硫醇/硫醚的S2980以及ΔGf,2980的計算值與實驗值都比較接近。倪彩華等[17]曾分別用拓撲指數(shù)S,Is對硫醚和硫醇的ΔHf,2980、ΔS2980、ΔGf,2980進行過 QSPR 研究,其回歸效果良好。
圖2 硫醇/硫醚氣態(tài)標準熵S2980的實驗值與計算值間的關系
圖3 硫醇/硫醚氣態(tài)標準生成生成自由能ΔGf, 2980的實驗值與計算值間的關系
圖4 硫醇/硫醚沸點BP的實驗值與計算值間的關系
將含有1~10個碳原子的40個硫醇/硫醚的沸點回歸分析(如圖3所示),其回歸方程為:
方程(4)的復相關系數(shù)為 0.9923,說明硫醇/硫醚的沸點與 A之間關系密切。王克強等[18]利用另外一組拓撲指數(shù)(Ws,Ps,S1,S2)對硫醇/硫醚的沸點關聯(lián),RR=0.9997,效果很好。需要指出的是,該研究同樣是對硫醇、硫醚分開來計算的,因此不能將其結(jié)果與本論文結(jié)果做簡單的比較。表4列出了根據(jù)方程(4)計算的硫醇/硫醚的沸點及其實驗值。由圖4及表 4可以發(fā)現(xiàn),不含支鏈的直鏈硫醇/硫醚,其沸點實驗值與回歸曲線更符合;而對含支鏈的硫醇/硫醚,其沸點實驗值與回歸曲線的符合程度要差一些。
表4 硫醇/硫醚的沸點(BP)實驗值[18]與計算值的比較
表5 硫醇/硫醚的Kováts保留指數(shù)(RI)實驗值與計算值的比較
對含有2~12個碳原子的硫醇的Kováts保留指數(shù)(RI)進行回歸分析(如圖5所示),回歸方程為:
方程(5)的RR非常接近1,說明RI與A屬于顯著相關。表5為根據(jù)方程(5)計算的RI與其實驗值的比較。由圖5及表5可見RI與A之間具有相當好的相關性。劉利等[19]曾采用4個拓撲指數(shù)對硫醇的Kováts保留指數(shù)(RI)進行拓撲分析,結(jié)果與本文相當。所以拓撲指數(shù) A簡化了計算,在使用上更為方便,并且性能良好。
圖5 硫醇/硫醚的Kováts保留指數(shù)(RI)的實驗值與計算值之間的關系
拓撲指數(shù)A對硫醇/硫醚的多種物理化學性質(zhì)的良好回歸分析結(jié)果表明,A是一個性能優(yōu)良的分子拓撲指數(shù)。硫醇/硫醚異構(gòu)體的數(shù)目隨著分子中碳原子數(shù)的增加而急劇增多,完全依靠實驗方法測定其物理化學性質(zhì)是相當困難的,因此采用拓撲指數(shù) A建立相應的構(gòu)效關系模型,不僅能夠合理表征硫醇/硫醚的物理化學性質(zhì)與分子結(jié)構(gòu)的關系,而且能夠?qū)α虼?硫醚的物理化學性質(zhì)進行預測。
但是也應該看到,拓撲指數(shù)A在預測含支鏈硫醇/硫醚的物理化學性質(zhì)方面還不能令人十分滿意,其主要原因是由于拓撲指數(shù) A只是分子一級結(jié)構(gòu)的表征,未能顧及其它因素如順反異構(gòu)、鍵長與鍵角等等,尚不能嚴格區(qū)分硫醇/硫醚的同分異構(gòu)體,而這些都是影響分子的物理化學性質(zhì)的因素。目前,越來越多的研究正在嘗試考慮諸如順反異構(gòu)、鍵長與鍵角等分子三維結(jié)構(gòu)的拓撲性質(zhì),從而提出更好的拓撲指數(shù)。