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        病理信息系統(tǒng)的數(shù)據(jù)交換設計

        2010-10-09 08:24:02李桂祥陳蜀虎
        中國醫(yī)療設備 2010年9期
        關鍵詞:報告數(shù)據(jù)庫信息

        李桂祥,陳蜀虎

        第三軍醫(yī)大學西南醫(yī)院 信息科,重慶400038

        病理信息系統(tǒng)的數(shù)據(jù)交換設計

        李桂祥,陳蜀虎

        第三軍醫(yī)大學西南醫(yī)院 信息科,重慶400038

        病理信息系統(tǒng)將病理檢查的病理圖像、報告數(shù)據(jù)采集、保存到網(wǎng)絡上的數(shù)據(jù)庫中,在網(wǎng)上進行病理涂片圖像的判讀、書寫診斷報告,進行病理檢查流程的環(huán)節(jié)控制和質(zhì)量控制,它與醫(yī)院HIS系統(tǒng)的數(shù)據(jù)交換是系統(tǒng)成功應用的前提之一。本文采用數(shù)據(jù)庫觸發(fā)器、同步程序?qū)崿F(xiàn)數(shù)據(jù)間交換,前端程序同時連接HIS和病理信息系統(tǒng)實現(xiàn)數(shù)據(jù)實時交換,滿足了檢查申請單、費用、檢查報告等數(shù)據(jù)在病理信息系統(tǒng)與醫(yī)院HIS系統(tǒng)中的共享數(shù)據(jù)要求,實現(xiàn)了兩個系統(tǒng)的無縫連接,使得病理信息系統(tǒng)在醫(yī)院順利投入運行。

        病理信息系統(tǒng);HIS;數(shù)據(jù)交換;觸發(fā)器

        病理學診斷為臨床醫(yī)師進行疾病診斷、制定治療方案、評估疾病預后和總結(jié)診治疾病經(jīng)驗等提供重要的、有時是決定性的依據(jù),并在疾病預防,特別是傳染病預防中發(fā)揮重要作用。它是病理醫(yī)師應用病理學知識、有關技術(shù)和個人專業(yè)實踐經(jīng)驗,對送檢的患者標本(或稱檢材,包括活體組織、細胞和尸體等)進行病理學檢查,結(jié)合有關臨床資料,通過分析、綜合后,作出的關于該標本病理變化性質(zhì)的判斷和具體疾病的診斷。病理診斷報告不是影像學的描述,而是明確的疾病診斷,臨床醫(yī)師主要根據(jù)病理報告決定治療原則、估計預后以及解釋臨床癥狀和明確死亡原因,病理診斷在所有診斷手段中具有核心作用和權(quán)威性。病理學診斷報告書(或稱病理診斷報告)是關于疾病診斷的重要醫(yī)學文書。在醫(yī)、患間醫(yī)療爭議時,相關的病理學診斷報告書具有法律意義。

        病理信息系統(tǒng)(Pathology Information System,PIS), 作為醫(yī)院信息系統(tǒng)(Hospital Information Sysytem,HIS)的重要部分,它屬于實驗室信息系統(tǒng)范疇。早期的病理信息系統(tǒng)重點圍繞圖文診斷報告的形式來組織數(shù)據(jù)和功能,一般為單機版本。當前的病理信息系統(tǒng)主要圍繞病理檢查工作流程,成本、質(zhì)量控制來組織數(shù)據(jù)和功能,主要實現(xiàn)了病理檢查申請、病理標本登記、取材信息登記、切片信息登記、圖文診斷報告、特檢信息登記、檔案管理、病理檢查工作流程的管理和科室管理。使得標本進入科室后與之發(fā)生的所有活動都成為電子數(shù)據(jù),為病理診斷、科研和教學提供了良好的工作平臺,同時也在質(zhì)量管理的各個層次,如質(zhì)量控制中的流程管理、診斷管理、檔案管理;質(zhì)量保證中報告的及時性,診斷的錯誤率,冰凍切片診斷的準確性,病理報告中有關腫瘤分期的內(nèi)容(如腫瘤的大小、切緣情況)是否完整等;以及相應的質(zhì)量改進中發(fā)揮著重要的作用。但還存在著忽略以大體標本檢查、拍攝、取材為核心的規(guī)范化操作實現(xiàn),忽略環(huán)節(jié)質(zhì)量控制對信息系統(tǒng)的要求,忽略病理檢查業(yè)務流程與外部網(wǎng)絡平臺的交互缺陷。

        未來病理信息系統(tǒng)將是外部病理會診、內(nèi)部工作平臺的結(jié)合,以互聯(lián)網(wǎng)為工作平臺,具有標準結(jié)構(gòu)和編碼,實現(xiàn)智能管理的信息系統(tǒng)。

        病理信息系統(tǒng)作為醫(yī)院信息系統(tǒng)的子系統(tǒng),在系統(tǒng)設計和建設如何與醫(yī)院其它信息系統(tǒng)融合,實現(xiàn)流程上與上、下游系統(tǒng)銜接,數(shù)據(jù)共享,預留未來升級的數(shù)據(jù)接口都是需要解決的問題。

        1 問題分析

        病理檢查工作主要圍繞患者標本進行,標本又稱檢材,它可能是活體組織、細胞和尸體等。要完成一次病理檢查主要操作步驟有:

        開病理檢查申請單→取材并完善申請單內(nèi)容→大體標本照相→標本登記并收費→取樣并制作切片→讀片并書寫檢查報告→簽發(fā)(確認)報告→報告閱讀。

        病理檢查申請單主要包含患者基本情況,如姓名、性別、年齡、送檢單位(醫(yī)院、科室)、床位、門診號/住院號、送檢日期、取材部位、標本數(shù)量等。患者臨床情況如病史(癥狀和體征)、化驗/影象學檢查結(jié)果、手術(shù)(包括內(nèi)鏡檢查)所見、既往病理學檢查情況(包括原病理號和診斷)和臨床診斷等。為了提高手術(shù)醫(yī)生的開單速度,允許手術(shù)前開出檢查申請單,發(fā)出申請單時補錄手術(shù)所見。大體標本照相使用CCD攝像機對手術(shù)取材的大體標本進行照相,采集的圖像保存到影像服務器中,供后續(xù)檢查過程核對,避免大體標本差錯,在大體標本不再保存期間作為核查原始信息的依據(jù)。

        病理檢查的每一進展狀態(tài)、確認后的診斷報告等信息,通過接口程序回填到HIS系統(tǒng)中,所采集的病理影像歸檔到PACS服務器中,供臨床醫(yī)生閱讀。

        臨床醫(yī)生通過住院醫(yī)生工作站、門診醫(yī)生工作站開出病理檢查申請后,對于手術(shù)病人在手術(shù)過程中取得標本材質(zhì)并補充手術(shù)所見,然后發(fā)出申請;非手術(shù)病人的取材,主要通過活檢方式。尸檢病人的申請需相關部門批準,登記較為特殊,仍以手工申請為主,病理信息系統(tǒng)進行備案。臨床醫(yī)生通過醫(yī)生工作站查閱病理檢查狀態(tài)和病理報告,通過PACS瀏覽工作站查閱病理檢查圖像。

        病理醫(yī)生通過取材工作站完成標本取材登記,對取材部位及相關信息進行標記;通過圖文報告工作站完成病理涂片圖像的采集、書寫診斷報告,在需要時出診斷補充報告,提出進一步的檢查申請等。

        病理技師通過切片工作站,按切片列表完成涂片的制作,并打印標識條碼,制作合格的病理涂片。

        管理工作站提供環(huán)節(jié)控制和質(zhì)量控制信息,可追蹤每一檢查申請的進展情況,查詢每一檢查的完成時間、完成人、完成內(nèi)容,統(tǒng)計工作人員的工作數(shù)量和質(zhì)量。

        2 系統(tǒng)組成

        病理信息系統(tǒng)由硬件部分、網(wǎng)絡部分和軟件部分組成,如圖1所示。硬件部分主要由服務器、檢查申請工作站、登記工作站、取材工作站、切片工作站工作站、圖文報告工作站、特檢工作站工作、檔案管理工作站、維護工作站構(gòu)成。收費工作融入登記過程中,不單獨設立收費工作站。

        數(shù)據(jù)庫使用大型關系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng),采用C/S結(jié)構(gòu)。

        軟件可劃分為服務器端部分和客戶端部分,客戶端部分主要由檢查申請模塊、標本登記模塊、取材管理模塊、切片管理模塊、特檢管理模塊、檔案管理模塊、費用管理模塊、圖文報告管理模塊、科室管理模塊、統(tǒng)計查詢模塊、細胞學管理模塊、尸檢管理模塊、會診管理模塊及流程、質(zhì)量控制部分等。

        圖 1 病理信息系統(tǒng)的組成

        大體標本攝像工作站由帶有標尺的攝像臺、CCD攝像機、圖像采集卡、計算機等組成。其中,CCD攝像機為動態(tài)200萬像素,靜態(tài)500萬像素。圖像采集卡分辨率最高達1600×1200,腳動觸發(fā),自動保存;對采集卡可編程控制圖像尺寸、圖像質(zhì)量、亮度、增益、曝光時間、對比度、飽和度、清晰度等。使用該工作站對取材前的大體標本攝像,使組織直觀可視;在標本組織圖片上,可快速準確測量樣本尺寸,準確指示出取樣區(qū)(點),并對取樣區(qū)(點)做標記;具備放大功能,可以更清晰的了解組織的表面結(jié)構(gòu);支持口頭描述,具有定標及標注功能;可對病理圖像的長度、周長、面積、形態(tài)學參數(shù)進行測量。

        圖文報告工作站由病理醫(yī)生使用,圖文報告管理模塊通過掃描玻片上條碼提取病理檢查的信息如申請單信息、檢查所見、取材記錄、標本原始影像、歷次病理檢查等;采集涂片影像、書寫診斷報告、向二線醫(yī)生提交、報告的確認;通過對標本的圖文報告管理模塊醫(yī)生可提出進一步的檢查要求,如深切、補取、重切、特染、免疫組化、分子病理、電鏡等,提供玻片歸檔功能。

        3 需交換的數(shù)據(jù)

        病理信息系統(tǒng)作為醫(yī)院信息系統(tǒng)范疇,在架構(gòu)上是一個獨立系統(tǒng),不可避免地要與醫(yī)院其他信息系統(tǒng)交換和共享病人信息、費用信息、檢查文字信息和圖像信息。交換數(shù)據(jù)的目的是為了最大限度地共享信息,減少數(shù)據(jù)的重復錄入,及時在不同崗位之間傳遞信息,使得工作流程順暢。在交換中既要滿足存儲格式要求,還要滿足語義不變的要求,在交換時間點的選擇上要滿足應用需求。在醫(yī)院信息系統(tǒng)中,PACS統(tǒng)一存儲、管理、應用醫(yī)學圖像,病理信息系統(tǒng)應能傳輸病理圖像到PACS系統(tǒng),并從PACS系統(tǒng)中調(diào)用醫(yī)學圖像。

        病理信息系統(tǒng)和HIS系統(tǒng)的數(shù)據(jù)都是以表的形式存儲在不同的關系型數(shù)據(jù)庫中。

        需共享的病人信息有病人自然信息,如病人ID、姓名、性別、出生日期等;費用信息有收費價表、收費項目、費別類型、計費金額等;檢查信息有申請項目、申請科室、檢查所見、檢查報告等。其中,病人信息、檢查申請單、檢查項目、收費價表信息由HIS系統(tǒng)的掛號工作站、醫(yī)生工作站產(chǎn)生,在病理系統(tǒng)的相關工作站使用。病理圖報告信息由圖文報告工作站形成,在HIS的醫(yī)生工作站需要調(diào)閱。

        需要交換的數(shù)據(jù)主要涉及HIS系統(tǒng)中的PATS_IN_ HOSPITAL、PAT_MASTER_INDEX、EXAM_APPOINTS、EXAM_PATHOLOGY_EXTENSION、EXAM_MASTER、EXAM_ITEMS、PRICE_LIST、INP_BILL_DETAIL八 張 表中,病理系統(tǒng)的PATH_TEST_MASTER、PATH_ITEMS、PATH_BILL_ITEMS 、PATH_SPECIAL_ITEMS 、EXAM_ PATHOLOGY_EXTENSION、PATH_ITEM_DICT六張表中。

        數(shù)據(jù)的交換時機應選擇在兩個系統(tǒng)的流程交接處。在進行標本登記時,將HIS中的相關信息提取并寫入到病理信息系統(tǒng)中,在病理檢查報告確認后將病理報告提取并寫入到HIS系統(tǒng)中,檢查費用信息在產(chǎn)生后即寫入HIS系統(tǒng)。

        病理信息系統(tǒng)與PACS交換影像數(shù)據(jù)使用DICOM3協(xié)議。

        4 數(shù)據(jù)交換方法

        數(shù)據(jù)交換示意圖如圖2所示。

        圖2 數(shù)據(jù)交換示意圖

        數(shù)據(jù)庫鏈接(DataBase Link,DBLINK)是數(shù)據(jù)庫之間的連接,它建立了用戶注冊數(shù)據(jù)庫到另外一個數(shù)據(jù)庫的存取路徑,使得用戶注冊到本地數(shù)據(jù)庫后可以透明地訪問多個遠程數(shù)據(jù)庫。透過DBLINK注冊到病理數(shù)據(jù)庫的用戶可以像存取病理信息數(shù)據(jù)庫中的表一樣存取HIS數(shù)據(jù)庫中的表,通過DBLINK的定義可以屏蔽HIS數(shù)據(jù)庫內(nèi)部的實現(xiàn)細節(jié),保證HIS數(shù)據(jù)庫的安全。

        同義詞(SYNONYM)的引用,使得數(shù)據(jù)庫用戶可以通過同義詞使用不同數(shù)據(jù)庫中的表,在客戶程序中屏蔽了遠程數(shù)據(jù)庫表與本地數(shù)據(jù)庫表的引用差異,數(shù)據(jù)庫鏈接和同義詞的聯(lián)合使用使得軟件的開發(fā)不用考慮同步數(shù)據(jù)的表所在數(shù)據(jù)庫,都作為本地數(shù)據(jù)庫表處理。

        觸發(fā)器是一組預先定義并編譯好的PL/SQL語句,作為數(shù)據(jù)庫的一部分存儲在服務器端,用來對表中數(shù)據(jù)的某種變化進行自動響應,實現(xiàn)保護表中的數(shù)據(jù)或按一定規(guī)則同步表之間數(shù)據(jù)的目的。表上可以定義三種操作類型的觸發(fā)器:Insert觸發(fā)器、Delete觸發(fā)器、Updata觸發(fā)器,觸發(fā)時機有操作發(fā)生前或發(fā)生后。

        存儲過程(Stored Procedure)是預先定義并編譯好的一組PL/SQL語句,作為數(shù)據(jù)庫的一部分存儲在數(shù)據(jù)庫的服務器端,它作為在數(shù)據(jù)庫后臺運行的可編程代碼,具有運行速度快、可共享等優(yōu)點。

        觸發(fā)器的使用可以跟蹤表中記錄數(shù)據(jù)的變化,并且將變化記錄下來保存到相應數(shù)據(jù)庫表中,同步交換程序定時同步變化的數(shù)據(jù)到其它數(shù)據(jù)庫中。

        登記、記費程序從HIS系統(tǒng)中提取相關記錄,完成記費數(shù)據(jù)錄入后,將登記數(shù)據(jù)和費用數(shù)據(jù)寫入HIS數(shù)據(jù)庫和病理數(shù)據(jù)庫中。

        5 數(shù)據(jù)交換的實現(xiàn)

        在病理數(shù)據(jù)庫服務器上建立別名Orcl,用于客戶端訪問HIS數(shù)據(jù)庫的通信,該別名指向HIS數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)絡地址;在病理數(shù)據(jù)庫上建立數(shù)據(jù)庫鏈接Orcl,建立中間表Path_ Bespeak_Tmpbof,在表Path_Report上建立Insert觸發(fā)器、Updata觸發(fā)器、Delete觸發(fā)器。編制交換同步程序Path_ SwithData,在病理系統(tǒng)的客戶端程序中實現(xiàn)登記和收費程序的數(shù)據(jù)同步。數(shù)據(jù)交換處理流程如下。

        檢查申請項目處理:在病理檢查標本送到病理科登記室進行登記時,在客戶端登記模塊中,通過病理號提取HIS系統(tǒng)Exam_Appoints表中的檢查申請單記錄,完成標本登記后,將檢查申請單信息轉(zhuǎn)記為檢查主記錄(EXAM_ MASTER)、檢查病人主索引(EXAM_PAT_MI)、檢查項目(EXAM_ITEMS);同時填寫病理數(shù)據(jù)庫中的病理檢查主索引(PATH_PAT_MASTER_INDEX)、病理檢查主記錄( PATH_TEST_MASTER)、病理申請擴展表(EXAM_ PATHOLOGY_EXTENSION)。

        檢查費用處理:在計費模塊中,通過病理號提取HIS系統(tǒng)的病人信息、費別信息、檢查項目及相關的價表,形成收費項目、計價金額、實收金額,存入HIS系統(tǒng)的病人住院費用明細表(INP_BILL_DETAIL)、檢查計價項目表(EXAM_BILL_ITEMS)中;同時, 存入病理數(shù)據(jù)庫中的病理計價項目表(PATH_BILL_ITEMS)中。

        檢查報告處理:在病理系統(tǒng)中,醫(yī)生通過報告管理模塊創(chuàng)建、修改和確認病理檢查報告,報告內(nèi)容和報告狀態(tài)保存在病理診斷記錄表(PATH_DIAGNOSIS_RECORD)、病理檢查報告表(PATH_REPORT)、病理報告擴展表(PATH_REPORT_TYPESETED_RECORD)、圖像索引表(EXAM_IMAGE_INDEX)等相關表中。在寫入、改變病理報告后,建立在Path_Report表上的觸發(fā)器將病理號寫入中間表Path_Bespeak_Tmpbof中,同步程序Path_SwithData定時將Path_Report表中未同步或未同步成功的病理檢查報告記錄轉(zhuǎn)換、寫入HIS數(shù)據(jù)庫中的檢查圖像索引表(EXAM_ IMAGE_INDEX)、檢查報告表(EXAM_REPORT)中,并將同步成功的檢查記錄從中間表(Path_Bespeak_Tmpbof)中刪除,對同步過程中成功與否都記錄在同步日志表中。

        在接口程序設計中,將同步間隔時間、數(shù)據(jù)庫用戶等作為配置參數(shù);同時對接口程序發(fā)生掛起故障時,在圖文報告工作站進行提示,方便管理員及時發(fā)現(xiàn)問題。在網(wǎng)絡中斷后,能自動重新連接并恢復數(shù)據(jù)同步。

        6 結(jié)束語

        隨著醫(yī)院信息化的深入,不同信息系統(tǒng)在醫(yī)院的應用,系統(tǒng)之間的數(shù)據(jù)交換是系統(tǒng)成功應用的前提。要實現(xiàn)系統(tǒng)之間在流程、功能和操作平臺的無縫連接,在正確的時間進行正確的數(shù)據(jù)交換是基礎。本文論述了通過創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫的存儲過程及觸發(fā)器、數(shù)據(jù)庫鏈接等完成數(shù)據(jù)庫間的數(shù)據(jù)交換,具有交換時機易選擇、易實現(xiàn)、效率高、連接用戶數(shù)可控等優(yōu)點。通過前端程序同步數(shù)據(jù)的方法具有設計簡單,實時同步等優(yōu)點。在到病理信息系統(tǒng)與HIS的數(shù)據(jù)交換中,兩種方法的綜合應用,成功實現(xiàn)了兩個系統(tǒng)的無縫連接,取得了良好的社會效益和經(jīng)濟效益。

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        Data Exchange Design of Pathology Information System

        LI Gui-xiang,CHEN Shu-hu
        Information Department, Southwest Hospital,Third Military Medical University, Chongqing 400038, China

        TP393.03

        A

        10.3969/j.issn.1674-1633.2010.09.011

        1674-1633(2010)09-0033-04

        2009-02-02

        2010-07-05

        作者郵箱:lgx@mail.tmmu.com.cn

        Abstract:The pathology information system (PIS) captures pathology data and stores it in a database on network. Pathology data analysis,writed diagnosticate reports,examine flow control and quility control are running on the network. Data exchange between PIS and HIS is the foundation of successful PIS application. In this paper, a method of using stored procedures, triggers, database links to implement data exchange is presented. By the method,the data sharing between PIS and HIS has been realized.

        Key words:pathology information system;HIS;data exchange;trigger

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