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        冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的RAPD分析

        2010-08-10 02:22:42宋世威劉厚誠孫光聞陳日遠
        中國蔬菜 2010年22期
        關(guān)鍵詞:節(jié)瓜粉皮黑皮

        宋世威 李 珍 劉厚誠 孫光聞 陳日遠

        (華南農(nóng)業(yè)大學園藝學院,廣東廣州 510642)

        冬瓜(Benincasa hispidaCogn.)為葫蘆科一年生草本植物,起源于中國南部和印度,我國主要分布在廣東、廣西、湖南、福建、江蘇、浙江、四川、湖北、安徽、河南、河北等省。節(jié)瓜(Benincasa hispidavar.chieh-quaHow)又名毛瓜、毛節(jié)瓜,是我國的特產(chǎn)蔬菜,主要分布在廣東、廣西、海南等地,在北方部分地區(qū)作為特菜栽培。節(jié)瓜是冬瓜的一個變種,兩者的親緣關(guān)系較近。前人從生物學性狀研究了冬瓜和節(jié)瓜的種質(zhì)資源(李文嘉 等,1996;謝大森 等,2009),但由于兩者的遺傳背景較狹窄,同名異物或同物異名現(xiàn)象非常普遍,僅利用生物學性狀進行區(qū)分和鑒定有較大難度。

        RAPD分子標記技術(shù)由于產(chǎn)物的多態(tài)性較強,廣泛用于葫蘆科作物,如黃瓜(Horejsi & Staub,1999;李錫香 等,2004)、南瓜(Gwanama et al.,2000;李俊麗 等,2005)、西瓜(Zhang &Rhodes,1993;郭軍 等,2002)、絲瓜(夏軍輝和向長萍,2008)、瓠瓜(高山 等,2007)及西葫蘆(陳鳳真和何啟偉,2010)等的遺傳多樣性研究,而關(guān)于冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)遺傳多樣性的研究較少(陳清華 等,2003)。本試驗利用RAPD技術(shù)分析41份冬瓜和節(jié)瓜栽培品種的遺傳多樣性,探討其親緣關(guān)系,為冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)資源評價和良種選育提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        試驗于2008年3~6月在華南農(nóng)業(yè)大學蔬菜試驗基地進行。供試冬瓜和節(jié)瓜材料共41份,其中冬瓜18份,節(jié)瓜23份,均為商品種,供試材料名稱、來源及農(nóng)藝性狀見表1。供試種子用55~65 ℃溫水浸泡8 h后,置于30 ℃培養(yǎng)箱中催芽,待芽長0.5 cm時播于育苗盤中,植株長至4~6片真葉時取樣。

        表1 供試材料名稱、來源及農(nóng)藝性狀

        續(xù)表

        1.2 DNA提取和RAPD分析

        采用改良的CTAB法提取冬瓜和節(jié)瓜總DNA(Aljanabi & Martinez,1997),用紫外分光光度計在260 nm和280 nm處測定OD值,以檢測DNA的質(zhì)量和濃度,稀釋到5 ng·μL-1作為PCR擴增的模板。

        經(jīng)正交優(yōu)化確定冬瓜和節(jié)瓜RAPD的最佳體系:25 μL反應體系中含1×buffer,模板DNA 20 ng、Mg2+2.0 mmol·L-1、dNTPs 0.24 mmol·L-1、引物 0.3 μmol·L-1和Taq酶 1 U。最適宜的退火溫度是36.9 ℃。PCR擴增程序:94 ℃預變性5 min,94 ℃變性45 s,36.9 ℃退火45 s,72 ℃延伸90 s,共40個循環(huán),72 ℃延伸10 min。反應結(jié)束后,PCR產(chǎn)物在含0.5 μg·mL-1EB的1.8 %瓊脂糖凝膠中電泳2 h,用Bio-RAD凝膠成像系統(tǒng)進行拍照分析。

        1.3 聚類分析和主坐標分析

        將電泳圖譜清晰且可重復的DNA條帶記為1,同一位置上的弱帶且不重復或未出現(xiàn)條帶的記為0,形成1和0數(shù)據(jù)矩陣,利用NTSYSpc(2.10)數(shù)據(jù)分析軟件進行聚類分析和主坐標分析。用SimQual程序求相似性系數(shù)矩陣,用SAHN程序中的UPGMA方法進行聚類分析;用DCENTER程序進行系數(shù)矩陣轉(zhuǎn)換,并用EIGEN程序求特征值和特征向量進行主坐標分析,用Tree plot模塊生成聚類圖,構(gòu)建分子進化樹,用3Dplot生成主坐標圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 冬瓜和節(jié)瓜DNA的RAPD多態(tài)性分析

        從455條隨機引物中篩選出能夠產(chǎn)生穩(wěn)定、清晰多態(tài)性擴增譜帶的23條引物,23條引物對供試的41個冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)共產(chǎn)生143條擴增譜帶(引物序列及擴增結(jié)果見表2),其中多態(tài)性譜帶81條,多態(tài)性檢測率為56.6 %,平均每條引物產(chǎn)生6.2條譜帶。圖1、2分別為引物AX09和M16對41份種質(zhì)基因組DNA擴增的RAPD帶型。

        不同引物擴增的譜帶數(shù)不同,其中擴增譜帶數(shù)最多的引物是 E03,擴增出 11條,其中多態(tài)性譜帶7條;擴增譜帶數(shù)最少的引物是AT08,僅擴增出2條。引物F09擴增譜帶的多態(tài)性比例最高,達到88.9 %,AX05和AY16的最低,僅為20.0 %(表2)。

        表2 篩選出的引物序列及擴增結(jié)果

        圖1 引物AX 09對41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)基因組DNA擴增的RAPD帶型

        圖2 引物M16對41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)基因組 DNA擴增的RAPD帶型

        2.2 聚類分析

        利用143條RAPD擴增譜帶,用UPGMA法建立了41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)間的遺傳關(guān)系聚類分析圖(圖3)。聚類分析結(jié)果表明,41份種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)在0.60~0.99之間。25號材料粵農(nóng)豐節(jié)瓜和30號材料粵農(nóng)6號節(jié)瓜的相似系數(shù)達0.99,表明兩者的親緣關(guān)系非常近,田間農(nóng)藝性狀完全一致,說明這兩個品種是同物異名;3號和5號兩份材料商品名均為特大粉皮冬瓜,但兩者的相似系數(shù)較小,為0.72,田間農(nóng)藝性狀也有較大差別,說明這兩個品種是同名異物。在遺傳相似系數(shù)0.71處可將供試的41份種質(zhì)劃分為6大類群9個亞類。

        第Ⅰ類只有1份材料——特大粉皮冬瓜(3號),來源河北,早熟,大果類型,果實長筒形,果皮白綠色,密被毛刺和白色蠟粉。

        第Ⅱ類也只有1份材料——廣利粉皮冬瓜(19號),來源廣東,中晚熟,大果類型,果實扁圓柱形,果形指數(shù)小于1,果皮白綠色被厚粉。

        第Ⅲ類包括2份節(jié)瓜材料——長身黃毛節(jié)(16號)和5號黑毛節(jié)(17號),來源廣東,早熟,果實長圓柱形,果形指數(shù)大,果皮表面星點多。

        第Ⅳ類包括 5份材料,可分為兩個亞類。① 揚子江粉皮大冬瓜(2號)、粉皮冬瓜(4號)和特大粉皮冬瓜(5號),分別來源于江西、北京和河北,早熟和中晚熟,大果類型,果皮白綠色,蠟粉重。② 薊農(nóng)一串鈴冬瓜(6號)和一串鈴冬瓜(7號),分別來源于天津和北京,早熟,小果類型,果皮青綠色,果形指數(shù)較小。

        第Ⅴ類包括8份材料,可分為兩個亞類。① 臺灣特大黑皮冬瓜(1號)、廣東黑皮冬瓜(888)(13號)、碧玉出口節(jié)瓜(14號)、夏冠1號節(jié)瓜(15號)、廣優(yōu)1號節(jié)瓜(18號)和粵農(nóng)6號節(jié)瓜(30號)。兩份冬瓜分別來源于北京和廣東,早熟,大果類型,果皮墨綠色;4份節(jié)瓜均來源于廣東,果皮翠綠或深綠色。② 黑先鋒雜交大冬瓜(21號)和廣東黑皮冬瓜(22號),來源于廣東,早熟,大果類型,果實長圓柱形,果皮墨綠色。

        第Ⅵ類包括24份材料,可分為兩個亞類。① 一串鈴4號冬瓜(8號)和精選一串鈴冬瓜(35號),均來源于北京,小果類型,果實高樁形,果皮青綠色。② 其余22份材料,包括5份冬瓜和17份節(jié)瓜。

        圖3 41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)的RAPD標記聚類圖

        2.3 主坐標分析

        對RAPD標記所獲得相似系數(shù)矩陣進行主坐標分析,第一、第二和第三個主坐標方差貢獻率分別為32.06 %、9.17 %和7.52 %,累計方差貢獻率48.75 %。41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)在第一主坐標方向上被分為3類,在第二主坐標方向上被分為2類,將第一和第二主坐標作用綜合起來考慮可將41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)分為6大類群(圖4),這與聚類分析結(jié)果相近。

        第Ⅰ類,一串鈴4號冬瓜(8號)和精選一串鈴冬瓜(35號);第Ⅱ類,特大粉皮大冬瓜(3號);第Ⅲ類,揚子江粉皮冬瓜(2號)、粉皮冬瓜(4號)、特大粉皮冬瓜(5號)、薊農(nóng)一串鈴冬瓜(6號)和一串鈴冬瓜(7號);第Ⅳ類,臺灣特大黑皮冬瓜(1號)、廣東黑皮冬瓜(888)(13號)、黑先鋒雜交大冬瓜(21號)、廣東黑皮冬瓜(22號)、碧玉出口節(jié)瓜(14號)、夏冠1號節(jié)瓜(15號)、粵農(nóng)節(jié)瓜(20號)、長身黃毛節(jié)(16號)和 5號黑毛節(jié)(17號);第Ⅴ類,廣優(yōu) 1號節(jié)瓜(18號)和廣利粉皮冬瓜(19號);第Ⅵ類包括22份其余種質(zhì)。

        圖4 41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)二維主坐標圖

        在第一、第二主坐標分組的基礎(chǔ)上,結(jié)合第三主坐標,41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)可分為 6大類群10個亞類(圖5)。第Ⅰ類分為2個亞類:① 一串鈴4號冬瓜(8號);② 精選一串鈴冬瓜(35號)。第Ⅱ、第Ⅲ和第Ⅴ類在第三坐標方向上沒有再細分,說明第一、第二主坐標的信息足以將其區(qū)分開。第Ⅳ類分為2個亞類:① 長身黃毛節(jié)(16號)、5號黑毛節(jié)(17號)、粵農(nóng)節(jié)瓜(20號)、碧玉出口節(jié)瓜(14號)和廣東黑皮冬瓜(22號);② 臺灣特大黑皮冬瓜(15號)、廣東黑皮冬瓜(888)(13號)、黑先鋒雜交大冬瓜(21號)和夏冠1號節(jié)瓜(15號)。第Ⅵ類分為3個亞類:① 粵農(nóng)208節(jié)瓜(37號)、七星節(jié)瓜(38號)、新會七江黑毛節(jié)瓜(39號)、特選種黑毛節(jié)瓜(41號)和江門利隆8號雜優(yōu)連環(huán)節(jié)瓜(40號);② 旺優(yōu)七星節(jié)瓜(31號)、為農(nóng)高產(chǎn)節(jié)瓜(32號)、為農(nóng)節(jié)瓜(33號)和粵冠節(jié)瓜(34號);③ 其余13份材料。

        圖5 41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)的三維主坐標圖

        通過比較圖 3、4、5可知,對 41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)進行的系統(tǒng)聚類分析和主坐標分析的結(jié)果基本一致。

        3 結(jié)論與討論

        從本試驗結(jié)果來看,采用RAPD技術(shù)對冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)資源進行多態(tài)性分析,構(gòu)建了41份冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)的聚類分析圖和主坐標分析圖,表明RAPD技術(shù)能有效地檢測冬瓜和節(jié)瓜材料間的遺傳變異,對其遺傳多樣性分析是可行的。

        本試驗中采用聚類分析和主坐標分析所獲得的結(jié)果基本一致。特大粉皮冬瓜(3號)單獨為一類,揚子江粉皮冬瓜、粉皮冬瓜、特大粉皮冬瓜(5號)、薊農(nóng)一串鈴冬瓜和一串鈴冬瓜為一類,這與聚類分析結(jié)果一致;豐青1號是冬瓜和節(jié)瓜兼用品種,在主坐標分析中表現(xiàn)出與湖南的冬瓜種質(zhì)和部分節(jié)瓜品種較近的親緣關(guān)系;一串鈴4號冬瓜和精選一串鈴冬瓜在主坐標分析中也被分到2個亞類。冬瓜和節(jié)瓜的分子標記與種質(zhì)的果實大小、性狀和果皮顏色密切相關(guān)。

        系統(tǒng)聚類分析能提供豐富的數(shù)量信息,量化地體現(xiàn)冬瓜和節(jié)瓜種質(zhì)之間的關(guān)系。主坐標分析能從不同的方向和層面更直觀地提供更多的關(guān)于冬瓜和節(jié)瓜各種質(zhì)或群體的關(guān)系。因此,將聚類分析和主坐標分析結(jié)合起來使用,可以互相印證和補充。在遺傳距離計算方法一致的情況下,采用主坐標分析方法,對闡明冬瓜和節(jié)瓜間的親緣關(guān)系能提供更全面的信息。

        RAPD分析結(jié)果顯示,冬瓜和節(jié)瓜最終沒有聚成兩大類,而是互有交叉地分散到6大類群中。這表明冬瓜和節(jié)瓜的親緣關(guān)系很近,從分子水平上進一步證明其屬于同一個種的不同變種。冬瓜各品種的相似系數(shù)多集中在0.60~0.80之間,而節(jié)瓜各品種的相似系數(shù)多集中在0.80~0.99之間,表明冬瓜的遺傳多樣性大于節(jié)瓜。這與兩個物種材料的來源密切相關(guān),冬瓜分布范圍廣,供試的18份材料來源于7個??;而節(jié)瓜主要分布在華南地區(qū),供試的23份材料全部來自廣東,遺傳背景狹窄。

        陳鳳真,何啟偉.2010.西葫蘆種質(zhì)資源遺傳多樣性的RAPD分析.中國蔬菜,(16):26-31.

        陳清華,謝大森,何曉明.2003.節(jié)瓜性型基因的RAPD標記.廣東農(nóng)業(yè)科學,(5):19-21.

        高山,許端祥,林碧英,鐘開勤.2007.瓠瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的RAPD分析.分子植物育種,5(4):502-506.

        郭軍,許勇,壽森炎,張海英,康國斌.2002.西瓜種質(zhì)資源親緣關(guān)系的RAPD分析.植物遺傳資源學報,3(1):7-13.

        李俊麗,向長萍,張宏榮,楊靜.2005.南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的RAPD分析.園藝學報,32(5):834-839.

        李文嘉,方鋒學,黃如葵,鄧征宇.1996.廣西優(yōu)良冬瓜節(jié)瓜種質(zhì)資源.廣西農(nóng)業(yè)科學,(6):288-289.

        李錫香,朱德蔚,杜永臣,張廣平,沈鏑.2004.黃瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的 RAPD鑒定與分類研究.植物遺傳資源學報,5(2):147-152.

        夏軍輝,向長萍.2008.絲瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的形態(tài)和RAPD標記分析.中國蔬菜,(10):21-25.

        謝大森,何曉明,彭慶務.2009.冬瓜種質(zhì)資源的綜合鑒評.中國蔬菜,(8):36-41.

        Aljanabi S M,Martinez I.1997.Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques.Uncleic Acids Research,25(22):4692-4693.

        Gwanama C,Labuschagne MT,Botha A M.2000.Analysis of genetic variation in cucurbita moschata by randoMamplified polymorphic DNA(RAPD)markers.Euphytica,113:19-24.

        Horejsi T,Staub J E.1999.Genetic variation in cucumber(Cucumis sativusL.)as assessed by randoMamplified polymorphic DNA.Genetic Resources and Crop Evolution,46:337-350.

        Zhang X P,Rhodes B B.1993.RAPD molecular marker in watermelon.HortScience,18(5):223.

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