在過(guò)去的30多年,人們開(kāi)發(fā)了多種原核和真核表達(dá)系統(tǒng)生產(chǎn)外源重組蛋白。和其它表達(dá)系統(tǒng)相比,大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)具有遺傳背景清楚、表達(dá)水平高、操作容易和成本低等優(yōu)點(diǎn),成為表達(dá)外源蛋白最常用的表達(dá)系統(tǒng)之一。
近年來(lái),隨著固定化細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的研究者關(guān)注于固定化大腸桿菌細(xì)胞。固定化大腸桿菌細(xì)胞具有如下優(yōu)勢(shì):首先,相較于游離細(xì)胞,固定化細(xì)胞在催化反應(yīng)過(guò)程中,其質(zhì)粒更加穩(wěn)定,目的基因產(chǎn)物的活力較高[1,2],產(chǎn)物易于分離純化;其次,和其它重組菌相比,大腸桿菌更易操作、發(fā)酵成本低、可快速大規(guī)模催化反應(yīng)物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物[3]。自1959年Hattori首次將大腸桿菌細(xì)胞吸附在樹(shù)脂上實(shí)現(xiàn)了大腸桿菌細(xì)胞固定化以來(lái),固定大腸桿菌活細(xì)胞或稱為固定化增殖大腸桿菌細(xì)胞的研究工作相繼展開(kāi)。
目前,固定化重組大腸桿菌細(xì)胞已經(jīng)廣泛地應(yīng)用于小分子藥物生產(chǎn)、工業(yè)廢水處理、能源開(kāi)發(fā)以及大宗化學(xué)品生產(chǎn)等方面[4,5]。
從理論上講,任何一種限制細(xì)胞自由流動(dòng)的技術(shù),都可以用于大腸桿菌細(xì)胞的固定化。但目前使用最普遍的固定化大腸桿菌細(xì)胞的方法是包埋法和吸附法。
包埋法的原理是將微生物細(xì)胞截流在水不溶性的凝膠聚合物孔隙的網(wǎng)絡(luò)空間中或埋于半透膜聚合物的超濾膜內(nèi),通過(guò)聚合作用、離子網(wǎng)絡(luò)形成、沉淀作用,以及通過(guò)改變?nèi)軇囟取H值來(lái)阻止細(xì)胞的泄漏,同時(shí)能讓底物滲入和產(chǎn)物擴(kuò)散出來(lái)。目前應(yīng)用最為廣泛的是凝膠包埋法固定大腸桿菌細(xì)胞,其特點(diǎn)如下[6]:
(1)操作簡(jiǎn)便。將大腸桿菌細(xì)胞與單體或聚合物一起聚凝,細(xì)胞被包埋在形成的聚合物中。
(2)條件溫和??蛇x用不同的聚合物載體、不同的包埋系統(tǒng)和條件,以保持大腸桿菌的酶催化活性。
(3)穩(wěn)定性好。大腸桿菌細(xì)胞不易滲漏。
(4)細(xì)胞容量高。大腸桿菌細(xì)胞在聚合體中含量可高達(dá)50%~70%。
(5)可以反復(fù)利用。與液體發(fā)酵相比,包埋的大腸桿菌生產(chǎn)周期短、產(chǎn)物分離方便、能耗低、設(shè)備投資少且可大大改善操作條件。
20世紀(jì)80年代末,趙景聯(lián)[7]利用海藻酸鈉包埋重組大腸桿菌細(xì)胞合成了高純度的γ-氨基丁酸,間歇反應(yīng)轉(zhuǎn)化率可達(dá)100%。隨后,由英才等[8]利用固定的大腸桿菌AS1.881合成了L-天門(mén)冬氨酸,固定化菌株在pH值9.0、40℃的條件下反應(yīng)48 h,產(chǎn)物量達(dá)到最高。張曉梅等[9]通過(guò)固定化重組大腸桿菌JM109(pHsh-dhaB-dhaG-dhaF-yqhD)發(fā)酵生產(chǎn)1,3-丙二醇,成功地克服了底物抑制作用,產(chǎn)率大幅提高。
包埋法的優(yōu)點(diǎn)使其在大腸桿菌細(xì)胞固定化研究中占有較大的優(yōu)勢(shì),但包埋法仍存在一些不足,如包埋材料對(duì)細(xì)胞的毒性作用、材料本身阻礙大分子底物和氧的擴(kuò)散、使用過(guò)程中的雜菌污染等,這些還需要進(jìn)行更深入的研究。
吸附法又稱載體結(jié)合法,是利用帶電的微生物細(xì)胞和載體之間的靜電、表面張力和粘附力等作用,而使微生物細(xì)胞固定在載體表面和內(nèi)部的方法。該方法操作簡(jiǎn)單、大腸桿菌細(xì)胞活力損失小。
Torre等[10]分別利用多孔玻璃、網(wǎng)狀聚氨酯、合成海綿吸附大腸桿菌JM109/pBB1催化阿魏酸鹽合成香蘭素,發(fā)現(xiàn)合成海綿吸附后,催化效果最好,香蘭素的終濃度達(dá)到0.080 g·L-1,產(chǎn)率達(dá)0.019 g·L-1·h-1。
吸附法操作簡(jiǎn)單、成本較低,但所固定的大腸桿菌數(shù)目受所用載體的種類及其表面積的限制,并且大腸桿菌與載體作用力小,易脫落,只有通過(guò)與其它材料混合使用或者用交聯(lián)劑進(jìn)行交聯(lián),才能得到更廣泛的應(yīng)用。
理想的大腸桿菌細(xì)胞固定化載體應(yīng)具備以下條件:機(jī)械強(qiáng)度高、壽命長(zhǎng)、容量大、價(jià)格低、性質(zhì)穩(wěn)定、不易被生物降解、固定化過(guò)程簡(jiǎn)單、常溫下易于成形;對(duì)于固定化活體細(xì)胞,固定化過(guò)程及固定化后對(duì)微生物無(wú)毒,生化及熱力學(xué)穩(wěn)定性好,基質(zhì)通透性好,沉淀分離性好,具有惰性,不干擾生物分子的功能。此外,還要根據(jù)具體的使用環(huán)境,來(lái)選擇大腸桿菌細(xì)胞固定化載體,或者優(yōu)化載體性能。目前應(yīng)用較多的大腸桿菌細(xì)胞固定化載體有葡聚糖類、海藻酸鹽、聚丙烯酰胺和聚乙烯醇、無(wú)機(jī)載體等。
應(yīng)用較廣的葡聚糖類材料主要有瓊脂糖凝膠、卡拉膠、黃原膠,它們的生物相容性良好,具有較大孔隙,可以允許高分子物質(zhì)的擴(kuò)散,并且不帶電荷,不會(huì)與底物或產(chǎn)物形成離子鍵,不影響大腸桿菌生長(zhǎng),因此成為近年來(lái)研究最熱門(mén)的固定化載體材料之一[11]。
童群義等[12]用PVA-卡拉膠混合載體固定化大腸桿菌-酵母菌混合體系生產(chǎn)谷胱甘肽,產(chǎn)率達(dá)446.7 mg·L-1,成功降低了生產(chǎn)成本,固定化細(xì)胞連續(xù)使用10批次,其酶活力無(wú)顯著下降,也未見(jiàn)明顯的膨脹和破碎。Trelles等[13]固定化EscherichiacoliBL21催化合成腺嘌呤和次黃嘌呤核苷,分別對(duì)比了海藻酸鈉、瓊脂、瓊脂糖和聚丙烯酰胺包埋材料對(duì)產(chǎn)率的影響,發(fā)現(xiàn)在連續(xù)進(jìn)行30批次反應(yīng)后,相較于其它材料,固定在瓊脂糖上的大腸桿菌細(xì)胞在前26批次反應(yīng)均沒(méi)有酶活損失;在相同的時(shí)間內(nèi),1 g瓊脂糖固定化菌株能合成182 g腺苷,相當(dāng)于73 g游離菌的產(chǎn)率;并且固定化大腸桿菌細(xì)胞在4℃存放6個(gè)月后酶活沒(méi)有明顯的下降。
但是葡聚糖類材料強(qiáng)度較低,容易溶脹、破碎,因此若要工業(yè)化應(yīng)用,還需要在提高機(jī)械強(qiáng)度、改善力學(xué)性能等方面進(jìn)一步探索,如與某些人工高分子材料混合使用,來(lái)提高其強(qiáng)度。
海藻酸鹽是一種天然線性高聚物固定化介質(zhì),其二價(jià)以上的鹽(Ca2+、Al3+) 為水不溶性鹽,因此可形成耐熱的凝膠,而且其易與蛋白質(zhì)、明膠等多種物質(zhì)共溶,并可與大腸桿菌混合形成均勻的懸浮液,具有機(jī)械性能較高、化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定、無(wú)毒、包埋效率高且價(jià)格低廉等優(yōu)點(diǎn),因此近年來(lái)應(yīng)用廣泛。
Lu等[14]用海藻酸鈉固定化E.coliBL21-P450-BM3細(xì)胞,成功催化吲哚合成靛藍(lán),在pH值7.0、50℃時(shí),合成靛藍(lán)的活性達(dá)到了游離細(xì)胞的94%,并且固定化細(xì)胞重復(fù)使用6批次后,產(chǎn)率沒(méi)有明顯的下降。Birgisson等[15]用海藻酸鈣固定化重組大腸桿菌細(xì)胞水解柚皮苷來(lái)生產(chǎn)α-L-鼠李糖,在50℃完全降解7.9 mmol·L-1的柚皮苷速率能達(dá)到1 mL·min-1,并且固定化細(xì)胞能連續(xù)使用3 d,第4 d降解能力下降10%~15%。牛衛(wèi)寧等[16]用海藻酸鈣包埋重組大腸桿菌E.coliJM109 (pBR322-MAT)細(xì)胞催化合成S-腺苷蛋氨酸,對(duì)比研究了聚乙烯醇和海藻酸鈣的包埋效果,發(fā)現(xiàn)用海藻酸鈣包埋重組大腸桿菌細(xì)胞合成S-腺苷蛋氨酸產(chǎn)率更高,包埋后小球的力學(xué)性能和傳質(zhì)效率較好。
然而在細(xì)胞生長(zhǎng)所必需的高濃度磷酸鹽和Mg2+、K+、Na+等陽(yáng)離子溶液中,海藻酸鈉與CaCl2形成的海藻酸鈣凝膠小球不穩(wěn)定,容易破碎和溶解,因此,近年來(lái)展開(kāi)了對(duì)該載體的改性研究。海洪等[17]用聚乙烯亞胺溶液處理海藻酸鈣凝膠,發(fā)現(xiàn)用聚乙烯亞胺-戊二醛交聯(lián)和聚乙烯亞胺-高碘酸鈉來(lái)強(qiáng)化凝膠顆粒,能提高其抗磷酸鹽的能力和機(jī)械強(qiáng)度,并且酶活力沒(méi)有變化,操作穩(wěn)定性較好。
海藻酸鹽作為一種無(wú)毒、低成本的固定化載體,隨著其改性研究的深入,應(yīng)用會(huì)更加廣泛。
聚丙烯酰胺(PAM)由丙烯酰胺單體聚合而成,是一種水溶性線型高分子物質(zhì),具有良好的機(jī)械、化學(xué)和熱穩(wěn)定性能。Prabhune等[18]將具有青霉素?;D(zhuǎn)移酶活性的大腸桿菌細(xì)胞固定于聚丙烯酰胺凝膠珠中,其水解活性顯著提高,且在使用90批次后,其酶活也沒(méi)有明顯損失。但是由于交聯(lián)過(guò)程中會(huì)放熱,細(xì)胞在固定化過(guò)程中酶活損失很大,因此對(duì)大腸桿菌表達(dá)的重組酶選擇性較高,使得其在大腸桿菌細(xì)胞的固定化中使用較少。
聚乙烯醇(PVA)是一種水溶性高分子聚合物,是目前國(guó)內(nèi)外研究較為廣泛的包埋固定化載體,其凝膠強(qiáng)度高、化學(xué)穩(wěn)定性好、抗微生物降解性能強(qiáng)、毒性很小、細(xì)胞的活性損失小,具有很大的開(kāi)發(fā)利用價(jià)值。Huang等[19]用含硼硅酚醛樹(shù)脂PSB固定化E.coliATCC-11303細(xì)胞合成L-天冬氨酸,發(fā)現(xiàn)用聚乙烯亞胺處理的PSB固定化細(xì)胞后,細(xì)胞中L-天冬氨酸合成酶活性具有一定的特異性,而且底物的傳輸速率更快、凝膠強(qiáng)度更高,為L(zhǎng)-天冬氨酸的大規(guī)模生產(chǎn)提供了更優(yōu)越的條件。
由于PVA凝膠顆粒具有非常強(qiáng)的附聚傾向,不易制備成珠體,限制了其工業(yè)化應(yīng)用。為了增強(qiáng)其傳質(zhì)和成球能力,需要在材料混合改性方面進(jìn)行更深入的研究。
多孔陶瓷、氧化鋁、活性炭、微孔玻璃、高嶺土、硅藻土等無(wú)機(jī)載體,大多具有多孔結(jié)構(gòu),可以利用其吸附作用和電荷效應(yīng)將微生物或細(xì)胞固定。無(wú)機(jī)載體具有機(jī)械強(qiáng)度大、對(duì)細(xì)胞無(wú)毒性、不易被微生物降解、耐酸堿、成本低、壽命長(zhǎng)等特性,是一類重要的吸附法固定化大腸桿菌細(xì)胞載體材料。
陳文謀等[20]用多孔陶瓷和浮石固定化重組大腸桿菌細(xì)胞合成β-葡聚糖,發(fā)酵液的酶活力分別達(dá)到97 U·mL-1和73 U·mL-1,比無(wú)載體液體發(fā)酵 (32 U·mL-1) 分別提高了3倍和2.3倍,并且固定化細(xì)胞具有良好的重復(fù)使用能力,在連續(xù)10批次實(shí)驗(yàn)后,多孔陶瓷和浮石固定化發(fā)酵液的酶活力分別不低于91 U·mL-1和71 U·mL-1。
由于菌株與無(wú)機(jī)材料之間的結(jié)合力弱,易脫落,用無(wú)機(jī)載體固定化的細(xì)胞不適宜在流化床中長(zhǎng)時(shí)間參與催化反應(yīng),但可以利用無(wú)機(jī)載體孔隙大、傳質(zhì)容易等優(yōu)點(diǎn),將其與其它傳質(zhì)效果差的材料混合使用,以提高產(chǎn)率。
近年來(lái),隨著固定化細(xì)胞技術(shù)的日趨成熟,一些固定化大腸桿菌細(xì)胞的研究成果已經(jīng)應(yīng)用于制藥工業(yè)、環(huán)境保護(hù)、能源開(kāi)發(fā)等領(lǐng)域。
很多小分子藥物是利用重組大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行生產(chǎn)的,如果采用游離細(xì)胞發(fā)酵生產(chǎn),存在產(chǎn)物分離純化困難、不易操作、生產(chǎn)成本較高等缺點(diǎn)。如果將重組大腸桿菌進(jìn)行固定化培養(yǎng),可以簡(jiǎn)化目的產(chǎn)物的分離純化步驟,生產(chǎn)成本大幅降低。
谷胱甘肽(Glutathione,GSH)廣泛存在于動(dòng)植物和微生物中,是生物體內(nèi)最重要的非蛋白巰基化合物之一,廣泛用于治療肝臟疾病、腫瘤、氧中毒、衰老和內(nèi)分泌疾病。沈立新等[21]構(gòu)建了重組E.coliBL21 (pTrc-gsh) 菌,利用卡拉膠固定化后催化合成谷胱甘肽,采用延緩甘氨酸加入的方法,控制GSH的合成分階段進(jìn)行,有效削弱了GSH的反饋抑制作用,GSH 的產(chǎn)率提高17.5%;在填充床中對(duì)催化合成GSH進(jìn)行了考察,GSH合成量達(dá)1.24 g·L-1,比直接加入ATP提高24.2%。
γ-氨基丁酸(γ-Aminobutyric acid,GABA)是一種非蛋白質(zhì)組成的天然氨基酸,是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中有效的抑制性神經(jīng)遞質(zhì),具有降血壓、保持神經(jīng)安定、改善腦機(jī)能、保肝護(hù)腎等作用。早在1883年γ-氨基丁酸就被人工合成。趙景聯(lián)[7]用海藻酸鈉固定化大腸桿菌細(xì)胞得到γ-氨基丁酸,并在間歇反應(yīng)、連續(xù)攪拌式反應(yīng)及連續(xù)柱式反應(yīng)等擴(kuò)大生產(chǎn)中獲得了轉(zhuǎn)化率達(dá)85%以上的γ-氨基丁酸。隨后,沈俞等[22]又用卡拉膠與明膠復(fù)合載體固定化E.coli-AS1-505,結(jié)果表明,在卡拉膠與明膠質(zhì)量比為1.5∶1時(shí), 12 g·L-1的混合膠在60 g·L-1的 KCl溶液中固定化80 g·L-1的菌體,3 h后,酶活回收率最高;包埋量為100 g·L-1的固定化細(xì)胞重復(fù)反應(yīng)7批次,可將40 g·L-1的底物完全轉(zhuǎn)化為γ-氨基丁酸。
牛衛(wèi)寧等[16]對(duì)固定化E.coliJM109(pBR322-MAT)催化合成S-腺苷蛋氨酸的大腸桿菌細(xì)胞固定化方法和材料、反應(yīng)條件等進(jìn)行了比較深入的研究。結(jié)果表明,采用2%海藻酸鈣固定化細(xì)胞連續(xù)反應(yīng)5批次后,固定化細(xì)胞酶活力為初始酶活力的91%;固定化細(xì)胞在35℃反應(yīng)8 h,底物轉(zhuǎn)化率超過(guò)95%。
大腸桿菌細(xì)胞固定化技術(shù)以其微生物密度高、耐毒害能力強(qiáng)、微生物流失少、處理設(shè)備小型化等優(yōu)點(diǎn)在廢水處理領(lǐng)域中引起了普遍關(guān)注。
謝珊等[23]利用固定化基因工程菌E.coliBL21/pET2opd2b1處理有機(jī)磷混合農(nóng)藥廢水,結(jié)果表明,固定化大腸桿菌細(xì)胞的降解速率與懸浮工程菌細(xì)胞相比有所降低,主要是受底物傳質(zhì)過(guò)程的限制和固定化過(guò)程對(duì)細(xì)胞活性的損害的影響,但固定化細(xì)胞比懸浮細(xì)胞有更高的比降解速率,工程菌細(xì)胞的穩(wěn)定性較好(在50 d內(nèi)活性保持良好),而且與懸浮細(xì)胞相比,工程菌細(xì)胞不易流失,單位反應(yīng)體積內(nèi)的細(xì)胞密度增加了,工程菌細(xì)胞的耐毒害能力也大大增強(qiáng),因此更適宜于實(shí)際廢水處理和大規(guī)模應(yīng)用。
萬(wàn)瓊等[24]用固定化重組大腸桿菌細(xì)胞處理尿素廠廢水,中試研究發(fā)現(xiàn),反應(yīng)21 h后,廢水中總氮、氨氮和尿素的去除率可達(dá)90%以上,該法工藝簡(jiǎn)單經(jīng)濟(jì),基本不產(chǎn)生污泥,對(duì)高濃度氨氮和有機(jī)氮有較強(qiáng)的抗抑制作用。
由于化石燃料的燃燒已對(duì)全球環(huán)境造成嚴(yán)重污染,甚至對(duì)人類生存造成威脅。氫能作為理想的清潔能源之一,引起了人們的廣泛重視。目前,氫氣的工業(yè)化生產(chǎn)大都采用物化法,需要消耗大量的電能和礦物原料,生產(chǎn)成本過(guò)高,從而限制了氫能的發(fā)展。
Yokoi等[25]以葡萄糖為底物對(duì)產(chǎn)氣腸桿菌E.aerogenesHO-39菌株進(jìn)行的非固定化實(shí)驗(yàn)中,產(chǎn)氫速率僅為120 mL·L-1·h-1;采用多孔玻璃作為載體對(duì)菌體細(xì)胞進(jìn)行固定化后,產(chǎn)氫速率提高到850 mL·L-1·h-1,較非固定化細(xì)胞產(chǎn)氫速率提高了7倍。
Chittibabu等[26]構(gòu)建了重組菌E.cloacaeIIT-BT-08,并對(duì)其進(jìn)行固定化,產(chǎn)氫量較野生型菌株提高了3.12 mol·(mol葡萄糖)-1,最高產(chǎn)氫速率為66 mmol·h-1,而相同條件下游離菌催化產(chǎn)氫速率僅為0.55 mmol·h-1。
1,3-丙二醇(1,3-Propanediol,1,3-PD)是一種重要的溶劑和化工原料。為了得到高產(chǎn)量的1,3-PD,張曉梅等[9]構(gòu)建了工程菌JM109 (pHsh-dhaB-dhaG-dhaF-yqhD),在最適培養(yǎng)條件下,1,3-PD的產(chǎn)量和生產(chǎn)能力分別達(dá)到43.1 g·L-1和1.54 g·L-1·h-1;將該菌細(xì)胞用海藻酸鈣固定化后,細(xì)胞對(duì)底物甘油和產(chǎn)物1,3-PD的耐受力有了明顯的提高,1,3-PD產(chǎn)量、轉(zhuǎn)化率及生產(chǎn)能力分別可達(dá)61.5 g·L-1、76.8%和2.57 g·L-1·h-1。
大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)已經(jīng)成為表達(dá)外源蛋白最常用的表達(dá)系統(tǒng)之一,而固定化大腸桿菌細(xì)胞因操作簡(jiǎn)單、成本低廉等優(yōu)點(diǎn)在工業(yè)化生產(chǎn)中具有廣泛的應(yīng)用前景。
大腸桿菌細(xì)胞固定化技術(shù)還需要在以下方面進(jìn)行更深入的研究:(1)利用磁性聚合物微球、超臨界技術(shù)、納米技術(shù)等改進(jìn)大腸桿菌細(xì)胞固定化方法。(2)尋找價(jià)廉、半衰期長(zhǎng)、底物易于擴(kuò)散、對(duì)大腸桿菌細(xì)胞毒性小的固定化載體材料,進(jìn)一步研究混合使用各種材料,令材料間優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。(3)對(duì)大腸桿菌催化反應(yīng)機(jī)理及動(dòng)力學(xué)進(jìn)行更深入的研究,完善高效的固定化反應(yīng)工藝,使其滿足大型化、自動(dòng)化和連續(xù)化生產(chǎn)的需要,充分體現(xiàn)固定化細(xì)胞生物反應(yīng)器的優(yōu)勢(shì)。(4)在多種菌株共生的固定化體系以及生物再生技術(shù)方面也有待更深入研究。
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