盧 麗,李樹(shù)峰,佟慧麗,馮 霞,徐婷婷,嚴(yán)云勤
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,哈爾濱 150030)
細(xì)胞凋亡(Apoptosis)是一種由基因控制的細(xì)胞自主性死亡方式,指細(xì)胞在一定的生理或病理?xiàng)l件下,遵循自身的程序,自己結(jié)束其生命的過(guò)程[1-2]。細(xì)胞凋亡研究一直以動(dòng)物細(xì)胞為模型,取得了很多成果。但由于動(dòng)物細(xì)胞代謝通路復(fù)雜且具有種屬和時(shí)空特異性,發(fā)展到一定階段給研究帶來(lái)了困難。
自1997年madeo等首次報(bào)導(dǎo)了酵母細(xì)胞的凋亡后,使人們認(rèn)識(shí)到,不僅多細(xì)胞真核生物可發(fā)生凋亡,單細(xì)胞真核生物也可發(fā)生凋亡,并且像酵母這樣的單細(xì)胞生命凋亡能很好地簡(jiǎn)化研究過(guò)程[3]。此后研究發(fā)現(xiàn),多種外源因素均能導(dǎo)致酵母細(xì)胞凋亡,如H2O2、次氯酸、阿司匹林、乙酸、NaCl、葡萄糖等。隨著研究的深入,人們發(fā)現(xiàn)酵母基因組編碼很多執(zhí)行細(xì)胞死亡基本分子機(jī)制的蛋白質(zhì),如凋亡蛋白抑制因子IAP(Bir1)和與線粒體相關(guān)聯(lián)的caspases、Aif、HtrA2/Om(iNma111)等[4-5],有的酵母凋亡中還涉及線粒體中的Fis1、Nuc1、Ndi1[6],活性氧(ROS)在酵母凋亡中也起著重要作用。由不同因素引起的酵母凋亡,可能具有不同的分子機(jī)制。由于酵母與多細(xì)胞動(dòng)物凋亡的相似性,酵母作為一種簡(jiǎn)單的生物模型體系,可能有助于闡明和發(fā)現(xiàn)新的凋亡調(diào)節(jié)機(jī)制。
乳酸是某些特殊酵母發(fā)酵的正常終產(chǎn)物,在釀造啤酒時(shí),加入適量乳酸既能調(diào)整pH促進(jìn)糖化,有利于酵母發(fā)酵,提高啤酒質(zhì)量,又能增加啤酒風(fēng)味,延長(zhǎng)保質(zhì)期。在白酒、清酒和果酒中乳酸可用于調(diào)節(jié)pH,防止雜菌生長(zhǎng),增強(qiáng)酸味和清爽口感。在某些方面,乳酸與酵母有著很大的關(guān)聯(lián),所以,研究乳酸對(duì)酵母凋亡的影響及其相關(guān)基因的表達(dá)變化,可指導(dǎo)生產(chǎn)實(shí)踐中對(duì)乳酸的應(yīng)用,同時(shí)為其凋亡通路的深入研究做鋪墊。
1.1.1 菌株
釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)菌株Y187由朱延明教授實(shí)驗(yàn)室惠贈(zèng)。
1.1.2 試劑
溶細(xì)胞(Lytiase酶)購(gòu)自Solarbio;Taq酶和其他PCR試劑(購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司);TUNEL試劑盒(購(gòu)自Promega公司);反轉(zhuǎn)錄試劑盒(購(gòu)自康為生物有限公司)。其他常規(guī)試劑均為進(jìn)口分裝或國(guó)產(chǎn)分析純。
首先使用水利普查基層登記臺(tái)賬管理系統(tǒng)菜單中的“對(duì)象清查清查瀏覽”功能,點(diǎn)擊業(yè)務(wù)分類(lèi)的每一項(xiàng),通過(guò)“導(dǎo)出EXCEL”功能,分別形成與Q201~Q803內(nèi)容對(duì)應(yīng)的24張瀏覽表,如表Q201(水庫(kù)工程)導(dǎo)出名為“VIEW_Q201_0.XLS”。為了避免數(shù)據(jù)的無(wú)序性和方便后面的操作,應(yīng)在軟件中先按水利普查自動(dòng)生成的編碼排序后再導(dǎo)出數(shù)據(jù)。
1.1.3 引物
所有引物均用primer5.0軟件設(shè)計(jì),上海生工公司合成,所設(shè)計(jì)引物序列、退火溫度和擴(kuò)增片段大小如下:
1.2.1 酵母生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
酵母生長(zhǎng)曲線的測(cè)定方法參照文獻(xiàn)[7]。
1.2.2 乳酸處理酵母
當(dāng)YPD液體培養(yǎng)基中的酵母細(xì)胞處于指數(shù)生長(zhǎng)前期(OD=0.6~0.9)時(shí),調(diào)pH 3.0后,分別加入0、200、250、300 mmol·L-1的終濃度乳酸培養(yǎng) 200 min,而250 mmol·L-1終濃度的乳酸分別培養(yǎng)120、200、260 min。
1.2.3 酵母細(xì)胞死亡與凋亡的檢測(cè)
酵母細(xì)胞死亡檢測(cè)采用美蘭染色法[7]。酵母細(xì)胞的檢測(cè)采用DAPI染色法、PI染色法、TUNEL染色法[8-10]。RT-PCR法檢測(cè)一些凋亡相關(guān)的基因表達(dá)按試劑盒指南操作。
1.2.4 數(shù)據(jù)處理與分析
RT-PCR結(jié)果經(jīng)Glyko BandScan4.3進(jìn)行OD值掃描后,數(shù)據(jù)采用DPS7.05軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析。
2.1.1 酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線
采用分光光度計(jì)法測(cè)量酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線,培養(yǎng)8 h左右,酵母生長(zhǎng)開(kāi)始進(jìn)入指數(shù)期,隨后培養(yǎng)到約18 h這個(gè)區(qū)間,酵母細(xì)胞生長(zhǎng)迅速,基本呈幾何級(jí)數(shù)生長(zhǎng)。培養(yǎng)20 h后,酵母細(xì)胞生長(zhǎng)極其緩慢,基本處于停滯狀態(tài),此時(shí),酵母細(xì)胞數(shù)達(dá)到最大值,處于穩(wěn)定生長(zhǎng)期,如圖1所示。
2.1.2 酵母細(xì)胞的死亡情況
根據(jù)前人試驗(yàn)結(jié)果可知,當(dāng)酵母細(xì)胞被外源刺激3 h后死亡率達(dá)到80%~90%時(shí),凋亡的程度最大。所以本試驗(yàn)通過(guò)一系列的試驗(yàn)選擇200、250、300 mmol·L-1三個(gè)乳酸終濃度進(jìn)行試驗(yàn)。
用美蘭溶液對(duì)酵母細(xì)胞進(jìn)行染色,普通光鏡下觀察到死細(xì)胞被染成藍(lán)色,而活細(xì)胞沒(méi)有被染上色。在本試驗(yàn)中乳酸的三個(gè)濃度處理的酵母細(xì)胞,酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)被完全抑制,隨著乳酸濃度的增加,死亡比率逐漸增加,200 mmol·L-1終濃度的乳酸處理酵母細(xì)胞200 min,約有30%左右的細(xì)胞發(fā)生死亡;250 mmol·L-1終濃度的乳酸處理120、200和260 min時(shí),酵母的死亡率在55%~62%之間;當(dāng)乳酸終濃度達(dá)到300 mmol·L-1時(shí),處理120 min后,死亡率基本達(dá)到90%,該濃度處理的前120 min內(nèi),酵母的死亡比率增長(zhǎng)很快(見(jiàn)圖2)。
圖1 酵母細(xì)胞在YPD培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線Fig.1 Growth curve of yeast cell in YPD culture medium
圖2 乳酸處理酵母細(xì)胞的死亡率曲線Fig.2 Mortality rate curve of lactic acid treatment yeast cells
2.2.1 DAPI染色情況
DAPI染色常用于細(xì)胞凋亡檢測(cè),正常的細(xì)胞核核形完整,染色質(zhì)均勻,當(dāng)細(xì)胞發(fā)生凋亡時(shí),染色質(zhì)固縮,向外周聚集,形成周邊化,緊接著染色質(zhì)進(jìn)一步固縮,形成很多顆粒物,最后細(xì)胞核破裂形成碎片,核解體。因本試驗(yàn)中300 mmol·L-1的終濃度乳酸處理200 min可引起90%左右的酵母細(xì)胞死亡,如果引起的死亡是以凋亡的形式進(jìn)行,那么這個(gè)條件的死亡率應(yīng)該凋亡程度最大。所以對(duì)可能引起最大凋亡程度的300 mmol·L-1乳酸終濃度處理的酵母進(jìn)行凋亡檢測(cè)。DAPI染色后,在熒光共聚焦顯微鏡下可觀察到酵母細(xì)胞發(fā)生核斷裂和核降解的凋亡表型(見(jiàn)彩版Ⅰ),核斷裂而產(chǎn)生核擴(kuò)散的狀態(tài),圖中染色的范圍比對(duì)照組的細(xì)胞大一些,可以初步確定乳酸能夠引起酵母細(xì)胞發(fā)生凋亡,但還需做進(jìn)一步的凋亡驗(yàn)證。
2.2.2 PI染色情況
酵母細(xì)胞進(jìn)行PI染色后,在熒光顯微鏡下觀察計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)如圖3所示,對(duì)照組的細(xì)胞,PI透膜率基本為零,即基本沒(méi)有細(xì)胞被染色;200 mmol·L-1乳酸處理200 min后PI透膜被染成紅色的細(xì)胞僅約2%~4%;引起90%左右死亡率的300 mmol·L-1乳酸處理200 min后的檢測(cè)結(jié)果僅有少于10%的細(xì)胞被染色。可見(jiàn),本試驗(yàn)設(shè)置的三種乳酸濃度的PI透膜率相比于細(xì)胞的死亡率是非常小的一部分,基本可以忽略。由于PI僅能透過(guò)壞死細(xì)胞的細(xì)胞膜而對(duì)核染色,但細(xì)胞發(fā)生死亡而沒(méi)有被PI染色,說(shuō)明大部分死亡細(xì)胞的細(xì)胞膜并沒(méi)有遭到破壞,這符合凋亡發(fā)生的情況,所以進(jìn)一步確定是凋亡作用的結(jié)果。
圖3 不同終濃度乳酸處理酵母細(xì)胞200 min的透膜率Fig.3 Through membrane rate of different densities of final lactic acid treatment yeast cells in 200 min
2.2.3 TUNEL染色情況
TUNEL是一種用來(lái)檢測(cè)細(xì)胞凋亡的分析方法,細(xì)胞凋亡時(shí)內(nèi)源性核酸內(nèi)切酶被激活,細(xì)胞自身的染色質(zhì)或DNA被切割,出現(xiàn)單鏈或雙鏈缺口,TUNEL可以有效的去探測(cè)DNA片段的產(chǎn)生。酵母細(xì)胞進(jìn)行TUNEL染色后,在共聚焦熒光顯微鏡下觀察,對(duì)照組的酵母細(xì)胞沒(méi)有顯示TUNEL陽(yáng)性。200 mmol·L-1終濃度乳酸處理酵母細(xì)胞200 min,TUNEL陽(yáng)性率不到30%,當(dāng)終濃度達(dá)到300 mmol·L-1時(shí),TUNEL陽(yáng)性率可達(dá)到80%以上,可見(jiàn)隨著乳酸濃度的增加TUNEL的陽(yáng)性率逐漸增加(見(jiàn)彩版Ⅱ)。由250 mmol·L-1的終濃度乳酸處理培養(yǎng)酵母細(xì)胞不同時(shí)間,不同培養(yǎng)時(shí)間在本試驗(yàn)設(shè)置的這3個(gè)時(shí)間梯度中內(nèi)TUNEL陽(yáng)性率基本都在60%作用左右,隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),TUNEL的陽(yáng)性率并沒(méi)有顯著變化。TUNEL檢測(cè)結(jié)果表明通過(guò)以上的凋亡檢測(cè)基本可以斷定,乳酸引起的酵母細(xì)胞死亡是以凋亡的形式進(jìn)行,其凋亡程度隨乳酸處理濃度的增加而增加,但與乳酸處理時(shí)間無(wú)明顯改變。
圖4 不同濃度乳酸對(duì)酵母細(xì)胞基因表達(dá)的影響Fig.4 Effect of different densities of lactic acid on gene expression of yeast cells
本試驗(yàn)選擇了線粒體中與凋亡相關(guān)的幾個(gè)蛋白基因(Yca1、Aif1、Nma111、Nuc1、Ndi1、Fis1、SOD1、SOD2)和酵母中唯一的凋亡蛋白抑制因子Bir1。通過(guò)RT-PCR法檢測(cè)這幾個(gè)基因的表達(dá)量變化,結(jié)果表明,隨著乳酸終濃度的增加及凋亡程度的增加,得到Fis1、Bir1、SOD1、SOD2四種基因的表達(dá)量隨之降低且差異顯著(P<0.05)(見(jiàn)圖4)。圖中第1泳道的對(duì)照組中,四種基因均有表達(dá),隨著乳酸處理濃度(即凋亡程度)的增加,這四種基因的表達(dá)都呈遞減趨勢(shì),而且1與2,2與3,3與4間的差異均顯著(P<0.05);當(dāng)乳酸終濃度達(dá)到300 mmol·L-1引起約80%以上的凋亡時(shí),這四種基因的表達(dá)量最低。但處理時(shí)間的增加對(duì)這四種基因表達(dá)并沒(méi)有顯著改變(P>0.05)。Yca1、Aif1、Nma111、Nuc1、Ndi1基因的表達(dá)隨著處理濃度和時(shí)間的增加都沒(méi)有顯著變化(P>0.05)。
醋酸、酒精等多種外源刺激可引起酵母凋亡,顯現(xiàn)與動(dòng)物相似的凋亡表型,乳酸作為酵母發(fā)酵的產(chǎn)物之一和工業(yè)添加劑影響酵母的作用價(jià)值,但其對(duì)酵母凋亡的影響還未見(jiàn)報(bào)道。近年來(lái)的研究表明,在酵母的凋亡過(guò)程中線粒體、Yca1和ROS具有中心作用[12],凋亡蛋白抑制因子Bir1具有重要調(diào)控作用,所以在乳酸引起的酵母凋亡中,檢測(cè)線粒體中的相關(guān)基因、ROS相關(guān)基因和Bir1基因表達(dá)變化,對(duì)細(xì)胞凋亡理論研究及指導(dǎo)生產(chǎn)實(shí)踐有一定的理論意義和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。
在本試驗(yàn)條件下,200 mmol·L-1的乳酸已經(jīng)完全抑制酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)并使細(xì)胞死亡,隨著處理濃度的增加,酵母細(xì)胞的死亡率隨之增加。DAPI染色可知,乳酸引起酵母細(xì)胞核斷裂和核降解,這是凋亡細(xì)胞的特征;能夠區(qū)分壞死和凋亡的PI染色表明,幾乎所有死亡的酵母細(xì)胞膜并沒(méi)有破壞,乳酸引起的酵母細(xì)胞死亡屬于細(xì)胞凋亡;TUNEL染色進(jìn)一步證明,乳酸引起的酵母細(xì)胞死亡是以凋亡的形式進(jìn)行,而且,隨著乳酸處理濃度的增加,酵母的凋亡程度也隨之增加。但是隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng),酵母細(xì)胞的死亡率和凋亡率都無(wú)顯著變化,這種無(wú)時(shí)間依賴(lài)性的原因可能是乳酸對(duì)酵母的損傷在處理的2 h內(nèi)乳酸的毒性已經(jīng)發(fā)揮作用,2 h后并沒(méi)有進(jìn)一步的損傷積累。
采用RT-PCR方法分析線粒體中的一些基因和酵母中唯一的凋亡蛋白抑制因子Bir1的基因表達(dá)變化,結(jié)果表明,隨著凋亡程度的增加Fis1、Bir1、SOD1、SOD2四個(gè)基因的表達(dá)量隨之降低。Fis1p在線粒體斷裂中起作用,也顯示抑制凋亡的功能,如Fis1酵母突變株經(jīng)H2O2處理后凋亡程度增加[6]。Fannjiang等研究表明,酵母Fis1p的抗凋亡功能能被Bcl-2或bcl-xl功能性替換,暗示Fis1p以類(lèi)Bcl-2方式作用[13]。而本試驗(yàn)中Fis1基因表達(dá)的降低,可能是其在凋亡的過(guò)程中起著一個(gè)類(lèi)Bcl-2的作用,具體作用機(jī)制有待深入研究。Bir1p是酵母中凋亡蛋白抑制因子IAP家族的唯一成員,抑制下游的caspase,Bir1p顯示抗凋亡功能,酵母細(xì)胞缺少Bir1p顯示典型的凋亡特征及ROS的產(chǎn)生[4]。本試驗(yàn)中Bir1基因表達(dá)的下降可能調(diào)節(jié)加強(qiáng)了Yca1p的激活從而促使凋亡發(fā)生;Yca1基因的表達(dá)沒(méi)有顯著變化,它對(duì)凋亡的作用還有待于深入檢測(cè)其蛋白活力變化。對(duì)線粒體中的Aif1(凋亡誘導(dǎo)因子)、Nma111(細(xì)胞凋亡核介導(dǎo)因子Htra2/Omi類(lèi)蛋白)、Nuc1(核酸內(nèi)切酶)、Ndi1(人類(lèi)細(xì)胞AMID的酵母同源物)的檢測(cè)并沒(méi)有得到顯著的變化,為進(jìn)一步闡明這些蛋白在乳酸誘導(dǎo)凋亡中的作用,還需進(jìn)一步檢測(cè)其蛋白活力,或采用構(gòu)建突變株的方法來(lái)進(jìn)行檢測(cè)。
本試驗(yàn)中在乳酸處理培養(yǎng)120~260 min酵母凋亡的黃金時(shí)間內(nèi),隨著凋亡程度的增加,SOD1(細(xì)胞質(zhì)超氧化物歧化酶)、SOD2(線粒體超氧化物歧化酶)基因的表達(dá)隨之降低。Fabrizio等研究在酵母中任意過(guò)表達(dá)SOD1或SOD2可增加其壽命,酵母的長(zhǎng)期生存需要這二者[14],但乳酸處理使酵母凋亡,壽命縮短,可能因此使SOD1和SOD2的表達(dá)降低。本試驗(yàn)所檢測(cè)的各基因在酵母凋亡過(guò)程中的相互關(guān)聯(lián)及其作用機(jī)制尚需深入研究。
a.乳酸引起的酵母細(xì)胞死亡具有劑量依賴(lài)性,無(wú)時(shí)間依賴(lài)性。
b.經(jīng)DAPI、PI、TUNEL染色證明,乳酸引起的酵母細(xì)胞死亡是以凋亡的形式進(jìn)行。
c.RT-PCR檢測(cè)表明,與凋亡相關(guān)的Fis1、Bir1、SOD1、SOD2基因的表達(dá)量隨著凋亡程度的增加而降低。
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