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        種子純度鑒定的常用方法及其在甜菜上的應(yīng)用展望

        2010-02-09 15:29:09吳則東王華忠
        中國(guó)糖料 2010年1期
        關(guān)鍵詞:甜菜純度多態(tài)性

        吳則東,王華忠,韓 英

        (1.黑龍江省普通高等學(xué)校甜菜遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150080;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北方糖料作物資源與利用重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150080;3.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院甜菜研究所/黑龍江大學(xué)農(nóng)作物研究院,哈爾濱 150080))

        我國(guó)是農(nóng)業(yè)大國(guó),每年因生產(chǎn)銷售假劣種子造成的坑農(nóng)害農(nóng)事件時(shí)有發(fā)生,給種子使用者造成減產(chǎn)或不可挽回的經(jīng)濟(jì)損失,給種子經(jīng)營(yíng)者和國(guó)家造成較大的負(fù)面影響。因此種子純度鑒定就成為正確評(píng)定種子等級(jí)的主要依據(jù)。種子純度鑒定是種子檢驗(yàn)的中心,是對(duì)一批種子中個(gè)體與個(gè)體之間在特征特性方面典型一致性程度的檢驗(yàn)和種子真實(shí)性的鑒定。世界各國(guó)都對(duì)種子的純度鑒定給予高度的重視,而我國(guó)從2000年12月1日起開(kāi)始實(shí)施《中華人民共和國(guó)種子法》,該法的實(shí)施對(duì)我國(guó)的種子生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)者是一件具有歷史意義的大事,使我國(guó)的種子生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)有法可依,也為種子糾紛案件提供了法律依據(jù),但是這一切都要以科學(xué)的種子純度鑒定工作為依據(jù)。而種子純度鑒定工作是一項(xiàng)復(fù)雜的工作,它涉及生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)及分子生物學(xué)等多方面的知識(shí),而研究領(lǐng)域也從宏觀發(fā)展到微觀。本文主要對(duì)近些年來(lái)農(nóng)作物種子主要的純度鑒定方法作一綜述,并提出未來(lái)甜菜種子純度鑒定的發(fā)展方向。

        1 種子純度鑒定的常用方法

        1.1 田間小區(qū)種植鑒定法

        該方法是中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)農(nóng)作物種子檢驗(yàn)規(guī)程GB/T3543.5-1995規(guī)定的鑒定程序,是鑒定品種真實(shí)性和測(cè)定品種純度的最為可靠、準(zhǔn)確的方法。該方法能夠觀察、比較的性狀較多,結(jié)果準(zhǔn)確、可靠。是目前解決種子質(zhì)量糾紛中最具有法律效力的檢測(cè)方法。為使鑒定品種的特征特性充分表現(xiàn),試驗(yàn)田要選擇氣候環(huán)境適宜、土壤肥力中等、肥力均勻,并有適宜的栽培管理措施的田塊。小區(qū)設(shè)計(jì)采用符合田間統(tǒng)計(jì)要求的隨機(jī)小區(qū)設(shè)計(jì),設(shè)重復(fù),設(shè)對(duì)照。種植時(shí)鑒定品種和對(duì)照標(biāo)準(zhǔn)品種要盡量在同一田塊,株行距可適當(dāng)增加。要保持品種的差異和品種的特征特性,要求不能間苗。盡量少用除草劑及植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑。在植株的不同發(fā)育時(shí)期與標(biāo)準(zhǔn)樣品進(jìn)行比較對(duì)照,主要根據(jù)株形、株高、葉片數(shù)、葉色、葉片寬窄、花藥顏色等做出評(píng)判,從而對(duì)不同品種加以鑒別。田間小區(qū)種植鑒定方式多種多樣,可在當(dāng)?shù)赝尽?dāng)?shù)禺惣净虍惖禺惣痉N植鑒定。但該方法鑒定費(fèi)工、費(fèi)時(shí)且周期長(zhǎng),對(duì)鑒定人員、種植田塊及田間管理要求較高。要求田間種植小區(qū)需要具有能使鑒定性狀正常生長(zhǎng)發(fā)育的氣候、土壤及栽培條件,并對(duì)病蟲(chóng)害有相對(duì)的防護(hù)措施;要求鑒定人員具有豐富的經(jīng)驗(yàn),熟練掌握鑒定品種的特征特性,才能正確鑒別。

        1.2 同工酶電泳技術(shù)

        酶是生物代謝中的一種特殊蛋白質(zhì),同工酶是指同一生物體或同一組織中催化相同化學(xué)反應(yīng),結(jié)構(gòu)不同的一類酶。其結(jié)構(gòu)的差異來(lái)源于基因型的差異。在作物種子純度鑒定中,常用的是多態(tài)性較強(qiáng)的脂酶和過(guò)氧化物酶,所用方法多為聚丙烯酰胺凝膠電泳法。這種電泳利用電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng)和不連續(xù)系統(tǒng)的濃縮效應(yīng),將蛋白質(zhì)或由蛋白質(zhì)組成的同工酶進(jìn)行分離。該法分辨率高,不易與樣品相互作用,具有熱穩(wěn)定、無(wú)色透明、純度高等優(yōu)點(diǎn)。因此是目前種子純度鑒定中研究較多、應(yīng)用較廣的電泳方法。目前已經(jīng)應(yīng)用此法對(duì)向日葵[1]、玉米[2]、甜椒[3]等品種進(jìn)行純度鑒定。該方法在使用過(guò)程中對(duì)酶的提取和電泳條件要求嚴(yán)格,如分離膠的濃度、濃縮膠的高度、催化劑的濃度及用量、溫度等等都對(duì)電泳的最終結(jié)果產(chǎn)生影響,某些同工酶的種類易隨生活力和發(fā)育進(jìn)程的變化而變化,從而對(duì)種子純度鑒定產(chǎn)生不利的影響,因此需要不斷的實(shí)驗(yàn),找到適合某一作物的最好條件。

        1.3 蛋白質(zhì)電泳法

        蛋白質(zhì)電泳技術(shù)是從種子中提取蛋白質(zhì),在某些方面彌補(bǔ)了同工酶電泳的缺點(diǎn)。蛋白質(zhì)的提取容易且無(wú)需低溫條件,縮短了周期;蛋白質(zhì)成分?jǐn)?shù)量穩(wěn)定,不受外界環(huán)境條件的影響。目前該方法在小麥種子酸溶蛋白和玉米種子鹽溶蛋白的應(yīng)用中比較多,效果也比較好。

        1.4 DNA分子標(biāo)記鑒定技術(shù)

        通過(guò)對(duì)品種DNA的多態(tài)性即DNA堿基序列的差異進(jìn)行分析,從而鑒別不同品種。該方法檢測(cè)對(duì)象是品種的 DNA片段(基因),沒(méi)有器官的特異性,在植物體的各個(gè)組織、各個(gè)發(fā)育時(shí)期均可檢測(cè);不受環(huán)境的影響,因DNA分子標(biāo)記的數(shù)量極多,遍及整個(gè)基因組,這是同工酶和蛋白質(zhì)電泳技術(shù)所無(wú)法比擬的;完全遵守簡(jiǎn)單的孟德?tīng)栠z傳方式,并具有體細(xì)胞穩(wěn)定性。目前DNA分子標(biāo)記鑒定技術(shù)主要有以下幾個(gè)方面。

        1.4.1 RFLP 作為第一代分子生物學(xué)標(biāo)記,RFLP技術(shù)主要包括以下基本步驟:DNA提取→用限制性內(nèi)切酶酶切DNA→用凝膠電泳分開(kāi)DNA片段→把DNA片段轉(zhuǎn)移到濾膜上→利用放射性標(biāo)記的探針雜交顯示特定的DNA片段(Southern雜交)和結(jié)果分析。RFLP反映了DNA序列中核酸排列順序的差異性。一個(gè)物種的DNA在限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)上發(fā)生了單個(gè)堿基突變、結(jié)構(gòu)重排(包括缺失、重復(fù)、易位和插入)以及甲基化等,均可導(dǎo)致限制性片段長(zhǎng)度的多態(tài)性。理論上講,每一個(gè)品種就是一種基因型,通過(guò)分析大多可以找到相對(duì)應(yīng)的RFLP指紋圖譜,利用這個(gè)RFLP指紋圖譜就可將這個(gè)品種與其它品種或混雜株區(qū)分開(kāi)來(lái)。但該方法更費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,需要進(jìn)行DNA多種酶切、轉(zhuǎn)膜以及探針的制備等多個(gè)步驟,檢測(cè)周期長(zhǎng),成本高,還要用到放射性元素,因此在品種純度鑒定應(yīng)用上受到一定的影響,目前已經(jīng)很少使用。

        1.4.2 RAPD 該技術(shù)是1990年發(fā)明并發(fā)展起來(lái)的,RAPD是建立在PCR(Polymerase Chain Reaction)基礎(chǔ)之上的一種可對(duì)整個(gè)未知序列的基因組進(jìn)行多態(tài)性分析的分子技術(shù)。其以基因組DNA為模板,以單個(gè)人工合成的隨機(jī)多態(tài)核苷酸序列(通常為10個(gè)堿基對(duì))為引物,在熱穩(wěn)定的DNA聚合酶(Taq酶)作用下,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖或聚丙烯酰胺電泳分離、溴化乙錠染色后,在紫外透視儀上檢測(cè)多態(tài)性。擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性反映了基因組的多態(tài)性。RAPD技術(shù)現(xiàn)已廣泛地應(yīng)用于生物的品種鑒定上。但RAPD技術(shù)對(duì)反應(yīng)條件十分敏感,因此RAPD標(biāo)記檢測(cè)作物種子純度時(shí),必須使RAPD反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)化、程序化,這包括DNA的提取、RAPD反應(yīng)混合物中各成分的濃度、電泳條件、溴化乙錠染色等;另外還必須建立每種作物品種種子純度的RAPD檢測(cè)技術(shù)操作規(guī)程,這樣RAPD檢測(cè)結(jié)果才可靠、準(zhǔn)確。目前RAPD方法鑒定種子純度已經(jīng)在油菜[4]、西瓜[5]、南瓜[6]、水稻[7]等作物上進(jìn)行了應(yīng)用,取得了很好的效果。

        1.4.3 AFLP 該技術(shù)是基于PCR技術(shù)擴(kuò)增基因組DNA限制性片段,基因組DNA先用限制性內(nèi)切酶切割,然后將雙鏈接頭連接到DNA片段的末端,接頭序列和相鄰的限制性位點(diǎn)序列,作為引物結(jié)合位點(diǎn)。限制性片段用二種酶切割產(chǎn)生,一種是罕見(jiàn)切割酶,一種是常用切割酶。它結(jié)合了RFLP和PCR技術(shù)特點(diǎn),具有RFLP技術(shù)的可靠性和PCR技術(shù)的高效性。由于AFLP擴(kuò)增可使某一品種出現(xiàn)特定的DNA譜帶,而在另一品種中可能無(wú)此譜帶產(chǎn)生,因此,這種通過(guò)引物誘導(dǎo)及DNA擴(kuò)增后得到的DNA多態(tài)性可做為一種分子標(biāo)記。AFLP具有分析所需 DNA量少、可重復(fù)性好、多態(tài)性強(qiáng)、分辨率高、不需要 Southern雜交以及無(wú)放射性危害等特點(diǎn)。但是由于AFLP技術(shù)是一種專利技術(shù),受專利保護(hù),而且試劑盒價(jià)格昂貴,很難進(jìn)行批量鑒定,操作過(guò)程較為復(fù)雜,對(duì)操作人員技術(shù)要求高,并且對(duì)DNA提取純度和內(nèi)切酶質(zhì)量要求嚴(yán)格,一般人較難掌握,使其應(yīng)用受到一定的限制。目前應(yīng)用AFLP已經(jīng)成功地鑒定了茶樹(shù)[8]、白菜[8]及瓠瓜[10]等等。

        1.4.4 SSR 該技術(shù)也稱微衛(wèi)星DNA,其串聯(lián)重復(fù)的核心序列為1~6 bp,其中最常見(jiàn)是雙核酸重復(fù),即(CA)n和(TG)n,每個(gè)微衛(wèi)星DNA的核心序列結(jié)構(gòu)相同,重復(fù)單位數(shù)目10~60個(gè),其高度多態(tài)性主要來(lái)源于串聯(lián)數(shù)目的不同,通過(guò)PCR反應(yīng)擴(kuò)增微衛(wèi)星片段,由于核心序列串聯(lián)重復(fù)數(shù)目不同,因而能夠用PCR的方法擴(kuò)增出不同長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳,根據(jù)染色帶的差異來(lái)進(jìn)行純度鑒定。SSR具有以下一些優(yōu)點(diǎn):(1)復(fù)性溫度高,擴(kuò)增重復(fù)性好,結(jié)果穩(wěn)定可靠;(2)微衛(wèi)星呈共顯性遺傳,符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律。故可鑒別雜合子和純合子,對(duì)個(gè)體鑒定具有特殊意義;(3)SSR標(biāo)記技術(shù)所需的DNA量少,僅需要微量組織。即便DNA降解,其亦能有效分析鑒別。因此目前應(yīng)用SSR技術(shù)鑒定品種純度應(yīng)用比較廣泛,如黃瓜[11]、馬鈴薯[12]、大豆[13]、水稻[14]等等。

        1.4.5 SRAP 是一種新型的基于PCR的標(biāo)記系統(tǒng),該標(biāo)記通過(guò)獨(dú)特的雙引物設(shè)計(jì)對(duì)基因的ORFs(Open reading frames)的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,上游引物長(zhǎng)17bp,對(duì)外顯子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。下游引物長(zhǎng)18bp,對(duì)內(nèi)含子區(qū)域、啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。因不同個(gè)體以及物種的內(nèi)含子、啟動(dòng)子與間隔區(qū)長(zhǎng)度不同而產(chǎn)生多態(tài)性。該標(biāo)記具有簡(jiǎn)便、高效、產(chǎn)率高、共顯性高、重復(fù)性好、易測(cè)序、便于克隆目標(biāo)片段的特點(diǎn)。目前SRAP技術(shù)在西瓜[15]、水稻[16]及花生[17]等作物的純度鑒定上已經(jīng)取得了一定的成果。

        2 甜菜種子純度鑒定的常用方法

        目前甜菜種子純度鑒定的微觀方法還沒(méi)有開(kāi)展,對(duì)甜菜種子純度鑒定方法通常采取田間小區(qū)種植法。如2008年10月,新疆伊犁州種子檢測(cè)中心,首次開(kāi)展了KWS9103甜菜種子真實(shí)性和品種純度種植鑒定。以進(jìn)口的KWS9103做對(duì)照,并進(jìn)行了認(rèn)真細(xì)致的田間記錄和管理,保證了鑒定田植株長(zhǎng)勢(shì)良好。同時(shí)在甜菜幼苗期和成長(zhǎng)期進(jìn)行了鑒定。證明此方法可行。

        3 甜菜種子純度鑒定方法的展望

        無(wú)論是田間鑒定技術(shù)還是生化鑒定技術(shù),由于其鑒定的標(biāo)記數(shù)有限,不能滿足種子純度和種質(zhì)資源鑒定及育種工作的發(fā)展需要。目前國(guó)家加大了甜菜產(chǎn)業(yè)的投入,實(shí)施了甜菜現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè),隨著甜菜產(chǎn)業(yè)的繁榮,建立一套行之有效的甜菜種子純度鑒定方法尤為重要,而甜菜基因組DNA的快速提取方法已經(jīng)建立,相應(yīng)的分子標(biāo)記技術(shù)如RFLP、RAPD、SRAP、SSR等也已經(jīng)應(yīng)用成功,而SSR和SRAP具有信息含量高、遺傳釋義明確、重復(fù)性好、操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),在品種真實(shí)性及種子純度鑒定中具有良好的應(yīng)用前景。而目前已經(jīng)有數(shù)十個(gè)甜菜SSR位點(diǎn)被發(fā)現(xiàn),SRAP引物更是多達(dá)上百對(duì),因此在不久的將來(lái),可望構(gòu)建完全由SSR標(biāo)記或SRAP標(biāo)記組成的基因組圖譜,建立DNA圖譜檔案和品種特有的DNA數(shù)據(jù)庫(kù);同時(shí)降低實(shí)驗(yàn)成本,使質(zhì)檢部門易于接受以及更加簡(jiǎn)化種子DNA提取程序。進(jìn)一步推動(dòng)SSR及SRAP標(biāo)記在甜菜種子純度鑒定中的應(yīng)用,不久的將來(lái)會(huì)直接服務(wù)于農(nóng)業(yè)生產(chǎn),為甜菜種子糾紛仲裁作出科學(xué)的判斷。

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        [2]蘇菊萍,王圓榮,亢銀萍.酯酶同工酶電泳技術(shù)在玉米品種真實(shí)性和純度測(cè)定中的應(yīng)用研究[J].種子科技,1999(4):30.

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