2005年6月“中國科學(xué)出版集團(tuán)有限責(zé)任公司”完成工商注冊，正式成立。這是北京地區(qū)首家注冊的出版集團(tuán)有限公司。集團(tuán)公司完成工商注冊，是集團(tuán)改制試點(diǎn)工作邁出的關(guān)鍵性一步。中國科學(xué)出版集團(tuán)有限責(zé)任公司對(duì)所屬企業(yè)占用的經(jīng)營性國有資產(chǎn)行使出資人權(quán)利，對(duì)國有資產(chǎn)和國有股權(quán)依法進(jìn)行經(jīng)營、管理與監(jiān)督，并對(duì)有關(guān)經(jīng)營性國有資產(chǎn)承擔(dān)保值增值責(zé)任。

為了有效推動(dòng)整體轉(zhuǎn)制和有利于轉(zhuǎn)制后公司發(fā)展，集團(tuán)針對(duì)成員單位中國有資產(chǎn)及國有股份歸屬關(guān)系較為復(fù)雜的特點(diǎn)，將體制改革工作分為兩步操作:第一步，由中國科學(xué)院和中國科學(xué)院國有資產(chǎn)經(jīng)營有限責(zé)任公司（國科控股）共同出資注冊成立“中國科學(xué)出版集團(tuán)有限責(zé)任公司”;第二步，中國科學(xué)院和國科控股將擬進(jìn)入集團(tuán)公司的成員單位占用的國有資產(chǎn)（國有股權(quán)）經(jīng)營管理事項(xiàng)以《托管協(xié)議》方式委托集團(tuán)公司全權(quán)管理。

在堅(jiān)定不移積極推進(jìn)文化體制改革試點(diǎn)工作的同時(shí)，集團(tuán)十分注意抓好經(jīng)營工作。2005年，面對(duì)激烈的市場競爭環(huán)境和圖書市場銷售不景氣的局面，科學(xué)出版社科技圖書銷售仍然增長了17%?；仡?005年，集團(tuán)為體制改革工作取得較大進(jìn)展而感到欣慰，展望2006年乃至“十一五”發(fā)展，我們對(duì)集團(tuán)的未來充滿信心，但也感到巨大的壓力和緊迫感。集團(tuán)在未來的發(fā)展過程中，我們將面臨諸多挑戰(zhàn)。例如:數(shù)字化出版沖擊傳統(tǒng)出版業(yè)，數(shù)字內(nèi)容產(chǎn)業(yè)正在形成。數(shù)字出版已經(jīng)形成了強(qiáng)大的發(fā)展勢頭，正在日益影響和改變著人們的閱讀習(xí)慣、消費(fèi)結(jié)構(gòu)和認(rèn)知取向，它將改變我們的傳統(tǒng)紙質(zhì)出版形式、經(jīng)營模式和經(jīng)營理念、人才結(jié)構(gòu)等。

未來的發(fā)展，挑戰(zhàn)與機(jī)遇并存。集團(tuán)“十一五”期間，計(jì)劃建設(shè)“一個(gè)平臺(tái)、兩個(gè)中心”，即建立集團(tuán)科技內(nèi)容資源數(shù)據(jù)平臺(tái)，以適應(yīng)數(shù)字化出版和內(nèi)容產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需要，同時(shí)將集團(tuán)建設(shè)成為中國優(yōu)秀科技成果的發(fā)布中心和國外優(yōu)秀科技成果的引進(jìn)中心。

集團(tuán)的目標(biāo)是，經(jīng)過5年的努力，把中國科學(xué)出版集團(tuán)建設(shè)成為以科學(xué)、技術(shù)、醫(yī)學(xué)、教育為主要領(lǐng)域的高水平、綜合性、國際化的傳媒集團(tuán)，成為集圖書、期刊、報(bào)紙、文獻(xiàn)信息與服務(wù)、網(wǎng)絡(luò)出版、進(jìn)出口、印刷等為一體的中國科技出版旗艦。