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        木薯MePCS1基因的克隆、表達(dá)分析及功能驗(yàn)證

        2024-12-31 00:00:00梁寶娟葛玉建侯靜怡張慧敏任治欣耿夢(mèng)婷王亞杰郭建春姚遠(yuǎn)
        熱帶作物學(xué)報(bào) 2024年11期
        關(guān)鍵詞:文獻(xiàn)標(biāo)志碼

        摘""要:植物絡(luò)合素合酶(PCS)是催化植物絡(luò)合素(PC)合成的關(guān)鍵酶,PC可通過(guò)絡(luò)合作用減輕重金屬對(duì)植物的毒害。土壤重金屬污染增加木薯食用安全風(fēng)險(xiǎn),對(duì)木薯絡(luò)合素合酶基因MePCS1進(jìn)行功能分析,對(duì)木薯重金屬減控研究具有重要意義。本研究通過(guò)PCR技術(shù)克隆了SC8木薯品種的MePCS1基因的編碼區(qū),全長(zhǎng)為1512"bp,共編碼503個(gè)氨基酸。蛋白序列分析表明:MePCS1蛋白為親水性蛋白,含有41個(gè)磷酸化位點(diǎn)和2個(gè)糖基化位點(diǎn),不含有信號(hào)肽。構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),木薯MePCS1蛋白與橡膠樹的PCS蛋白親緣關(guān)系最近。利用qPCR技術(shù)分析表明,MePCS1基因在莖中表達(dá)量最高;在木薯塊根發(fā)育過(guò)程中,MePCS1基因在塊根膨大期的表達(dá)量最高;鉛(Pb)脅迫誘導(dǎo)MePCS1基因表達(dá)。MePCS1基因能提高BY4741酵母對(duì)Pb的耐受能力。本研究結(jié)果為進(jìn)一步解析MePCS1基因功能特性及其對(duì)木薯的Pb減控機(jī)制提供新的信息。

        關(guān)鍵詞:植物絡(luò)合素合酶;重金屬Pb脅迫;酵母表達(dá)中圖分類號(hào):S533""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        Cloning,"Expression"Analysis,"and"Functional"Verification"of"the"MePCS1"Gene"in"Cassava

        LIANG"Baojuan1,2,3,"GE"Yujian1,2,3,"HOU"Jingyi1,2,"ZHANG"Huimin1,2,3,"REN"Zhixin1,2,3,"GENG"Mengting1,"WANG"Yajie2,3,"GUO"Jianchun2,3*,"YAO"Yuan2,3*

        1."College"of"Tropical"Agriculture"and"Forestry,"Hainan"University,"Haikou,"Hainan"570228,"China;"2."Institute"of"Tropical"Bioscience"and"Biotechnology,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences"/"Key"Laboratory"of"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops,"Ministry"of"Agriculture"and"Rural"Affairs"/"Hainan"Institute"for"Tropical"Agricultural"Resources"/"Key"Laboratory"for"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops"of"Hainan"Province,"Haikou,"Hainan"571101,"China;"3."Sanya"Research"Institute,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences"/"National"key"Laboratory"for"Tropical"Crop"Breeding,"Sanya,"Hainan"572000,"China

        Abstract:"Phytochelatin"synthase"(PCS)"is"a"key"enzyme"that"catalyzes"the"synthesis"of"phytochelatin"(PC)."PC"can"reduce"the"toxicity"of"heavy"metals"to"plants"through"complexation."Heavy"metal"pollution"in"soil"increases"the"risk"of"cassava"food"safety."It"is"of"great"significance"to"study"the"reduction"and"control"of"heavy"metals"in"cassava"by"analyzing"the"function"of"MePCS1"gene."In"this"study,"the"coding"region"of"MePCS1"gene"in"cassava"variety"SC8"was"cloned"by"PCR."The"full"length"was"1512"bp,"encoding"503"amino"acids."Protein"sequence"analysis"showed"that"MePCS1nbsp;protein"was"a"hydrophilic"protein,"containing"41"phosphorylation"sites"and"2"glycosylation"sites,"without"signal"peptide."The"phylogenetic"tree"showed"that"the"cassava"MePCS1"protein"had"the"closest"relationship"with"the"PCS"protein"of"the"rubber"tree."The"qPCR"analysis"showed"that"the"MePCS1"gene"had"the"highest"expression"level"in"the"stem."During"the"development"of"cassava"roots,"the"expression"level"of"MePCS1"gene"was"the"highest"in"the"root"enlargement"period."Lead"(Pb)"stress"induced"MePCS1"gene"expression."MePCS1"gene"can"improve"the"tolerance"of"BY4741"yeast"to"Pb."The"results"of"this"study"provide"new"information"for"further"analysis"of"the"functional"characteristics"of"the"MePCS1"gene"and"its"mechanism"for"reducing"Pb"in"cassava"tuber"roots.

        Keywords:"phytochelatin"synthases;"heavy"metal"Pb"stress;"yeast"expression

        DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.11.001

        木薯(Manihot"esculenta"Crantz),又稱樹薯、南洋薯、木番薯,為大戟科多年生作物,是世界上10億人口的主要食物[1]。隨著人類工業(yè)化進(jìn)程的發(fā)展,土壤重金屬污染已經(jīng)成為全球的重大問(wèn)題,危害著人類的身體健康和作物的糧食安全。木薯作為熱帶地區(qū)重要的經(jīng)濟(jì)作物與糧食作物,具有淀粉含量高、耐貧瘠等特點(diǎn)。塊根為木薯淀粉的主要貯藏器官,木薯受到重金屬污染后,金屬離子容易在木薯塊根中積累,導(dǎo)致木薯生長(zhǎng)受限,產(chǎn)量降低。因此解析木薯響應(yīng)重金屬關(guān)鍵的基因,減少重金屬在木薯塊根的積累,對(duì)創(chuàng)制木薯新種質(zhì)、提高木薯食用的安全性具有十分重要的意義。

        植物受到金屬脅迫后,植物絡(luò)合素(phytochelatins,"PC)可與金屬結(jié)合形成較穩(wěn)定的復(fù)合物,減輕金屬的毒害。植物絡(luò)合素的結(jié)構(gòu)一般為(γ-Glu-Cys)n-X(n=2~11,X為Gly、Clu、Cln、Ser和β-Ala的形式存在),以(γ-Glu-Cys)n-Gly的結(jié)構(gòu)較為常見,其中半胱氨酸Cys中(-SH)巰基可以與重金屬結(jié)合具有解毒功能。植物絡(luò)合素合酶(phytochelatin"synthases,"PCS)可催化GSH合成PC。目前對(duì)擬南芥[2]、豆類[3]、煙草[4]、水稻[5]的PCS研究較為深入,過(guò)表達(dá)PCS基因可增強(qiáng)植物對(duì)重金屬的耐受性。通過(guò)分析不同物種中PCS基因的啟動(dòng)子,發(fā)現(xiàn)其含有多個(gè)順式作用的元件,說(shuō)明PCS基因的表達(dá)受多種因素調(diào)控[6]。如轉(zhuǎn)錄因子MYB40可以誘導(dǎo)AtPCS1的表達(dá),在As2+脅迫條件下擬南芥中AtMYB40被誘導(dǎo)表達(dá),AtMYB40正調(diào)控AtPCS1表達(dá)[7];水稻中Hg2+和Pb2+金屬離子可以誘導(dǎo)OsPCS7表達(dá),Cd2+與Zn2+金屬離子可以誘導(dǎo)OsPCS9表達(dá)[8];番茄葉片在Pb脅迫下,SlPCS1基因表現(xiàn)出較高的表達(dá)水平[9]。

        為了研究木薯MePCS1基因在金屬脅迫下的功能,本研究克隆了木薯MePCS1基因,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析、基因表達(dá)的組織特異性分析、不同發(fā)育時(shí)期的塊根表達(dá)模式分析、重金屬Pb脅迫條件下的表達(dá)分析以及在酵母中的功能驗(yàn)證分析。為進(jìn)一步研究MePCS1基因參與金屬Pb脅迫的耐受性,減少重金屬脅迫對(duì)木薯的危害提供新的依據(jù)。

        1""材料與方法

        1.1""材料

        供試材料華南8號(hào)木薯(SC8)由中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院提供;酵母感受態(tài)BY4741、大腸桿菌感受態(tài)DH5α均購(gòu)自上海唯地生物技術(shù)有限公司;RNA提取試劑盒購(gòu)自成都福際生物技術(shù)有限公司;MonScript?"RTIII"Super"Mix"with"dsDNase(Two-Step)反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自莫納生物科技有限公司;PrimeSTAR"HS"(Premix)DNA"Polymerase高保真酶購(gòu)自TaKaRa公司。

        1.2""方法

        1.2.1""MePCS1基因的克隆""提取SC8木薯總RNA,利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。根據(jù)木薯MePCS1基因CDS區(qū)設(shè)計(jì)特異性引物(表1),以SC8木薯cDNA為模板,利用PrimeSTAR"HS(Premix)DNA"Polymerase高保真酶擴(kuò)增MePCS1基因。反應(yīng)體系為:PrimeSTAR"HS(Premix)DNA"Polymerase"25"μL,MePCS1-F/R引物1"μL,cDNA模板2"μL,ddH2O補(bǔ)充至總體積為50"μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?4"℃預(yù)變性4"min;98"℃變性20"s,61"℃退火30"s,72"℃延伸1"min"40"s,35個(gè)循環(huán)。PCR產(chǎn)物于4"℃下保存。

        1.2.2""木薯MePCS1蛋白理化性質(zhì)分析""對(duì)MePCS1的蛋白序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,所用軟件見表2。

        1.2.3""MePCS1基因的表達(dá)模式分析""以田間種植6個(gè)月的SC8木薯塊根、須根、莖、葉柄、成熟葉、嫩葉、頂芽、腋芽等8個(gè)組織部位為材料,提取其總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,熒光定量PCR(qRT-PCR)分析MePCS1基因的表達(dá)模式?;诒緦?shí)驗(yàn)室前期的SC8木薯塊根形成期(種植后的80"d)、塊根膨大期(種植后的130、180"d)、塊根成熟期(種植后的230、280"d)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),對(duì)MePCS1基因在塊根不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式進(jìn)行分析。

        利用1.2"mmol/L"Pb(NO3)2處理種植60"d的SC8木薯組培苗移栽幼苗,分別脅迫處理0、3、6、12、24、48"h。提取處理后材料的總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,熒光定量PCR(qRT-PCR)分析MePCS1基因的表達(dá)模式,反應(yīng)體系和程序參照LU等[10]的方法。使用SPSS"26軟件進(jìn)行鄧肯單因素多樣本差異顯著性方差分析。

        1.2.4""MePCS1基因功能驗(yàn)證""(1)MePCS1基因酵母表達(dá)載體構(gòu)建。以擴(kuò)增出MePCS1基因PCR產(chǎn)物為模板,根據(jù)pYES2載體多克隆位點(diǎn)與MePCS1基因CDS序列設(shè)計(jì)含有同源重組接頭引物PYES2-MePCS1-F/R(表1),通過(guò)PCR將重組接頭引入該基因CDS區(qū)的兩端,純化回收目的片段。利用同源重組方法將純化MePCS1目的片段與線性化的酵母表達(dá)載體pYES2進(jìn)行重組,利用pYES2載體檢測(cè)引物PYES2-檢測(cè)-F/R進(jìn)行菌液PCR鑒定,選取陽(yáng)性的大腸菌液進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序比對(duì)正確的陽(yáng)性克隆菌液進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)提取重組質(zhì)粒,新質(zhì)粒命名pYES2-MePCS1。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到酵母感受態(tài)BY4741中,PCR鑒定選出陽(yáng)性菌斑,用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

        1.2.5""MePCS1基因在酵母中的功能驗(yàn)證""將含有pYES2-MePCS1酵母菌液與空載pYES2酵母菌液分別在SD-Ura液體培養(yǎng)基中擴(kuò)大培養(yǎng)后,將初始OD600調(diào)至0.4,并逐級(jí)稀釋5個(gè)濃度梯度(10–1、10–2、10–3、10–4、10–5);各取4"μL在含有50"mmol/L"Pb2+的SD-Ura(含有2%葡萄糖)固體培養(yǎng)基上進(jìn)行點(diǎn)板,30"℃倒置培養(yǎng)3"d,觀察含pYES2-MePCS1與空載pYES2酵母菌的生長(zhǎng)情況。

        2""結(jié)果與分析

        2.1""木薯MePCS1基因的克隆

        通過(guò)Blast搜索木薯基因組數(shù)據(jù)庫(kù),獲得木薯MePCS1基因序列,設(shè)計(jì)特異性引物克隆該基因的編碼區(qū)(CDS)。以SC8木薯組培苗的cDNA為模板,PCR擴(kuò)增獲得預(yù)期大小目的條帶(圖1)。將目的條帶進(jìn)行Sanger測(cè)序,發(fā)現(xiàn)MePCS1基因的CDS序列全長(zhǎng)為1512"bp,共編碼503個(gè)氨基酸。

        2.2""MePCS1蛋白的理化性質(zhì)分析

        對(duì)木薯MePCS1蛋白的基本理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),其原子組成為C2456H3890N670O730S33,理論等電點(diǎn)為6.04,分子質(zhì)量為(Mw)55.54"kDa。該蛋白含有20種氨基酸殘基,Leu(L)的含量最高(58個(gè)),占11.5%;Trp(W)的含量最低(8個(gè)),占1.6%。在氨基酸正/負(fù)總殘基中,帶負(fù)電荷殘基(Asp+Glu)總數(shù)為61個(gè),帶正電荷殘基(Arg+Lys)總數(shù)為53個(gè)。

        MePCS1蛋白的總親疏水性平均值為0.136,推測(cè)該蛋白為親水性蛋白。磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),該蛋白含有41個(gè)磷酸化位點(diǎn),其中Ser位點(diǎn)含量較高,為27個(gè)。糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),MePCS1蛋白可能含有2個(gè)糖基化位點(diǎn)。信號(hào)肽分析發(fā)現(xiàn),MePCS1含有信號(hào)肽的可能性為0.0021,因此推測(cè)該蛋白不含有信號(hào)肽。

        2.3""系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

        為了分析MePCS1蛋白與不同物種的PCS蛋白的親緣關(guān)系,使用DNAMAN軟件分析MePCS1與橡膠樹(Hevea"brasiliensis,"XP_021678313.2)、麻瘋樹(Jatropha"curcas,"XP_012085275.1)、蓖麻(Ricinus"communis,"XP_015581239.2)、烏桕(Triadica"sebifera,nbsp;ARV78463.1)、南歐大戟(Euphorbia"peplus,"WCJ38289.1)、楊柳(Salix"brachista,"kAB5527907.1)、毛楊果(Populus"trichocarpak,"AI5566116.1)、毛白楊(Populus"tomentosa,"kAG6750280.1)、大棗(Ziziphus"jujuba,"XP_015891301.1)、苦楝(Melia"azedarach,"kAJ4726927.1)、柑橘(Citrus"sinensisk,"DO60421.1)、芒果(Mangifera"indica,"XP_044491381.1)、長(zhǎng)葉黃麻(Corchorus"olitorius,"OMP11136.1)、傘花草(Herrania"umbratica,"XP_021281249.1)、木槿(Hibiscus"syriacus,"XP_039005780.1)、棉花(Gossypium"barbadense,"kAB2057009.1)等其他16個(gè)物種的PCS蛋白序列進(jìn)行比對(duì),其氨基酸序列一致性為90.1%~"78.9%,其中N端區(qū)域高度保守(圖2)。MePCS1蛋白與橡膠樹PCS蛋白的同源性最高,達(dá)到90.1%。使用MEGE軟件進(jìn)行1000次的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn),構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明,木薯MePCS1蛋白與橡膠樹的PCS蛋白親緣關(guān)系較近,其次為麻瘋樹、蓖麻、烏桕等植物,同棉花、木槿等植物的PCS蛋白親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖3)。2.4""MePCS1基因在SC8木薯中的表達(dá)模式分析

        2.4.1""MePCS1基因在不同組織器官的表達(dá)模式分析""采用熒光定量PCR技術(shù)分析MePCS1基因在木薯不同組織中的表達(dá)情況。結(jié)果表明,木薯MePCS1基因在莖中的表達(dá)量最高,在塊根、須根、葉柄、成熟葉、嫩葉、頂芽、腋芽中的表達(dá)量無(wú)顯著差異(圖4)。

        2.4.2""MePCS1基因塊根發(fā)育不同時(shí)期的表達(dá)模式分析""基于實(shí)驗(yàn)室前期的塊根發(fā)育不同時(shí)期轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),分析MePCS1基因在塊根中的表達(dá)模式。結(jié)果表明,MePCS1基因主要在塊根膨大期(種植后的130、180"d)的表達(dá)量最高,在成熟塊根期(種植后的230、280"d)的表達(dá)量最低(圖5)。

        2.5""MePCS1基因在Pb脅迫條件下表達(dá)水平分析

        為了探究MePCS1基因表達(dá)對(duì)Pb脅迫的響應(yīng),本研究采用1.2"mmol/L"Pb(NO3)2"脅迫處理木薯SC8幼苗,并通過(guò)熒光定量PCR分析根系中MePCS1基因在處理0、3、6、12、24、48"h時(shí)的表達(dá)變化。結(jié)果發(fā)現(xiàn),MePCS1基因快速響應(yīng)在Pb2+脅迫,3"h的表達(dá)量顯著高于對(duì)照組,且在6和12"h的表達(dá)量逐步提高,然后24"h和48"h的表達(dá)量顯著降低(圖6)。此結(jié)果表明MePCS1基因參與木薯對(duì)Pb2+脅迫的響應(yīng)。

        2.6""MePCS1基因功能驗(yàn)證

        2.6.1""MePCS1基因的酵母表達(dá)載體構(gòu)建""為了驗(yàn)證MePCS1基因的功能,本研究通過(guò)PCR將重組接頭引入該基因編碼區(qū)的兩端(圖7A),并通過(guò)同源重組將MePCS1與線性化的酵母表達(dá)載體pYES2連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸,菌液PCR篩選

        陽(yáng)性克隆,獲得正確的pYES2-MePCS1質(zhì)粒(圖7B)。將pYES2-MePCS1質(zhì)粒轉(zhuǎn)化BY4741酵母,在SD-Ura固體培養(yǎng)基中培養(yǎng)獲得單菌落后進(jìn)行酵母菌斑PCR鑒定。結(jié)果發(fā)現(xiàn)PCR擴(kuò)增獲得與預(yù)期片段大小相同的條帶(約1500"bp),表明pYES2-"MePCS1質(zhì)粒成功轉(zhuǎn)化到BY4741酵母中(圖7C)。

        2.6.2""MePCS1基因在酵母中的功能驗(yàn)證""將含有pYES2-MePCS1、pYES2質(zhì)粒的酵母菌液,梯度稀釋后點(diǎn)在含有Pb2+的SD-Ura(含有2%半乳糖)固體培養(yǎng)基上,分析酵母的生長(zhǎng)情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在不含有Pb2+的培養(yǎng)基上,2種酵母菌的長(zhǎng)勢(shì)一致,而在含有50"mmol/L"Pb2+的培養(yǎng)基上,含有pYES2-MePCS1的酵母菌株長(zhǎng)勢(shì)優(yōu)于空載pYES2酵母菌株(圖8)。結(jié)果表明MePCS1基因可提高酵母對(duì)Pb2+的抗性。

        3""討論

        Pb是一種重金屬污染物,對(duì)植物和人體均有嚴(yán)重危害。在植物體內(nèi),Pb可以抑制多種酶的活性,干擾光合作用和水分吸收,導(dǎo)致生長(zhǎng)受阻和生理功能紊亂[11]。此外,Pb還可以通過(guò)干擾礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)吸收,影響植物的營(yíng)養(yǎng)平衡[12]。對(duì)人體而言,Pb主要通過(guò)食物鏈累積,長(zhǎng)期攝入會(huì)對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)產(chǎn)生毒性,特別是對(duì)兒童可能導(dǎo)致學(xué)習(xí)障礙和身心活動(dòng)受限等問(wèn)題[13]。Pb還可以損害腎臟功能,增加心血管疾病風(fēng)險(xiǎn)[14]。PCS1基因是植物體內(nèi)合成植物螯合素的關(guān)鍵酶,在減輕Pb的毒性效應(yīng)方面具有重要作用[15]。本研究克隆了木薯MePCS1基因,基因編碼區(qū)為1512"bp,共編碼503個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析表明,MePCS1蛋白為親水性蛋白,無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)且不含有信號(hào)肽。木薯MePCS1蛋白與橡膠樹、麻風(fēng)樹PCS蛋白的親緣關(guān)系較近,以上3個(gè)物種均為大戟科植物。MePCS1基因主要在木薯莖中表達(dá),以及在塊根形成期和塊根膨大期表達(dá)。植物受到Pb、Cd等重金屬脅迫時(shí),PCS1基因的表達(dá)通常會(huì)上調(diào),以增強(qiáng)植物對(duì)重金屬的耐受性。Cd脅迫可誘導(dǎo)雀稗PvPCS1和PvPCS2[16]、大麻BnPCS1基因表達(dá)上升[17]。藍(lán)藻CaPCS基因被AS脅迫誘導(dǎo)[18];馬鈴薯StPCS受重金屬Pb、Cd、Cu、Zn誘導(dǎo)表達(dá)[19];Pb脅迫木薯幼苗發(fā)現(xiàn),脅迫6、12"h后MePCS1基因的表達(dá)量顯著上升,24"h后表達(dá)量降低,表明該基因的表達(dá)受Pb脅迫的誘導(dǎo),參與木薯對(duì)Pb脅迫的響應(yīng)。

        在酵母細(xì)胞中進(jìn)行異源表達(dá)是驗(yàn)證植物重金屬脅迫響應(yīng)相關(guān)基因功能的有效手段。水稻金屬伴侶OsHIPP17、OsHIPP19可增強(qiáng)酵母對(duì)Cd的耐受性[20];苦蕎麥FtPCS、FtMTPC2、FtPCSL、FtVCE1a、FtNramp3可增強(qiáng)酵母對(duì)Pb的耐受性[21]。本研究將MePCS1基因克隆到pYES2酵母表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化到酵母菌株BY4741,分析轉(zhuǎn)基因酵母對(duì)Pb脅迫(50"mmol/L)的耐受性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)MePCS1基因可提高酵母對(duì)金屬Pb的耐受能力,因此推測(cè)MePCS1基因可提高木薯對(duì)Pb脅迫的抗性。在未來(lái)的研究工作中,將利用過(guò)量表達(dá)和基因編輯技術(shù),進(jìn)一步鑒定MePCS1基因功能特性,并篩選低Pb積累的木薯新種質(zhì),以提高木薯食用的安全性。

        參考文獻(xiàn)

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