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        人參酚酸類自毒物質(zhì)降解菌的篩選鑒定及生防研究

        2024-12-31 00:00:00謝勇俊潘小卓陳福慧尹凱波金嘉悅王一兵

        摘要:隨著人參種植年限的增加,土壤中自毒物質(zhì)的積累會導(dǎo)致連作障礙的發(fā)生,極大地影響人參種植業(yè)的健康發(fā)展。生物降解土壤中自毒物質(zhì)是緩解連作障礙的有效途徑。以酚酸類自毒物質(zhì)為篩選指標(biāo),從人參根際土壤中分離、篩選酚酸類自毒物質(zhì)降解細(xì)菌,結(jié)合16S rRNA基因測序及生理生化試驗對降解菌株進(jìn)行分類鑒定,采用紫外分光光度法測定其降解能力,并進(jìn)一步采用單因素試驗對其培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,利用降解菌對酚酸脅迫下的人參種子進(jìn)行生防研究。結(jié)果表明,從人參根際土壤中分離出10株自毒物質(zhì)降解菌,以假單胞菌屬(Pseudomonas)為主。初步降解試驗顯示菌株S1對水楊酸的降解率最高,達(dá)65.32%,經(jīng)鑒定該菌株為伯克霍爾德屬(Burkholderia)細(xì)菌。單因素試驗結(jié)果表明,以硝酸鈣作為氮源,培養(yǎng)溫度30 ℃,500 mg·L?1自毒物質(zhì)下,菌株S1的降解率達(dá)88.58%,較優(yōu)化前明顯提升。生防試驗結(jié)果表明,菌株S1可緩解水楊酸對人參種子生長的抑制作用,促生效率達(dá)12.56%。綜上所述,從土壤中分離出可降解水楊酸的伯克霍爾德屬菌株S1具有較好的生防效果,對于解決連作障礙問題具有潛在生防應(yīng)用價值。

        關(guān)鍵詞:酚酸降解菌;自毒物質(zhì);人參;連作障礙;條件優(yōu)化

        doi:10.13304/j.nykjdb.2023.0651

        中圖分類號:S47 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1008?0864(2024)07?0147?09

        五加科多年生植物人參(Panax ginseng C. A.Meyer)屬名貴中藥材,具有極高的藥用和經(jīng)濟(jì)價值[1?2]。人參在種植過程中存在嚴(yán)重的連作障礙現(xiàn)象,采收后10~20年內(nèi)不能再次栽種,否則會出現(xiàn)燒須、爛根、病害多發(fā)、產(chǎn)量降低等,嚴(yán)重制約人參產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。導(dǎo)致連作障礙的原因主要是土壤理化性質(zhì)的改變、土壤微生物群落結(jié)構(gòu)失衡和自毒物質(zhì)的積累,其中自毒物質(zhì)被視為連作障礙的主要誘因[3]。人參在生長過程中,枯枝殘葉和根系分泌產(chǎn)生的自毒物質(zhì)極易在土壤中積累,并產(chǎn)生化感作用,從而抑制種子萌發(fā)、破壞根系或其他分生組織,影響植物、土壤和微生物之間的相互作用,導(dǎo)致植物產(chǎn)生連作障礙[4?5]。李自博[6]從人參根際土壤中共收集鑒定出水楊酸、沒食子酸、苯甲酸、3-苯基丙酸和肉桂酸5種酚酸物質(zhì),被證明是人參連作障礙中根系分泌的主要化感物質(zhì),其中水楊酸含量最高,為0.519 mmol·L?1。He等[7]從西洋參土壤中分離出9種酚酸類化合物,土壤中約含1 200 mg·kg?1酚酸物質(zhì)。本課題組前期在林下連作種植參根際土壤中檢測出苯甲酸、阿魏酸、水楊酸、香草酸、丁香酸、肉桂酸、對羥基苯甲酸、沒食子酸共8種酚酸類自毒物質(zhì)[8]。

        目前,解決連作障礙的主要防治手段是化學(xué)防治,依靠農(nóng)藥進(jìn)行土壤消毒。該方法存在化學(xué)藥劑毒性高、殘留超標(biāo)等問題,嚴(yán)重影響生態(tài)環(huán)境安全[9]。因此,生物防治成了解決連作障礙的突破點。國內(nèi)對于藥用植物自毒物質(zhì)降解的研究主要集中在三七上,向維等[10]從三七根際土壤中成功分離出8株自毒物質(zhì)降解細(xì)菌,其中編號SC3 的寡養(yǎng)單胞菌屬菌株具有消除連作土壤中皂苷類自毒物質(zhì)的潛力;王羅濤等[11]發(fā)現(xiàn),蒙氏假單胞菌PM-41 既能有效降解三七皂苷類自毒物質(zhì),又能有效拮抗三七銹腐病菌毀滅柱孢菌。在其他作物如花生(Arachis hypogaea L.)[12]、番茄(Solanum lycopersicum L.)[12]等中也發(fā)現(xiàn)有降解菌。毛寧等[14]發(fā)現(xiàn)了4 株對對羥基苯甲酸有明顯降解作用的放線菌,可有效降低草莓的死亡率和發(fā)病率。肖蓉等[15]發(fā)現(xiàn),綠針假單胞菌(Pseudomonas chlororaphis)能有效緩解羥基苯甲酸對黃瓜生長的抑制作用。但目前篩選得到的具有降解人參自毒物質(zhì)功能菌的數(shù)量有限,且對于降解水楊酸等在土壤中積累含量較多的酚酸類自毒物質(zhì)的降解菌研究還不夠透徹,其菌種資源有待進(jìn)一步開發(fā)。

        本研究根據(jù)前期試驗結(jié)果[8],以土壤中檢測到的苯甲酸、阿魏酸、水楊酸、香草酸、丁香酸、肉桂酸、對羥基苯甲酸、沒食子酸8種酚酸類自毒物質(zhì)作為研究目標(biāo),以人參連作土壤為材料,篩選具有降解能力的微生物菌株,確定降解菌的系統(tǒng)分類學(xué)地位,并優(yōu)化高效降解菌的培養(yǎng)條件,考察自毒物質(zhì)對人參種子的抑制作用及其高效降解菌的解毒能力,為綠色菌肥的研發(fā)應(yīng)用提供新的思路。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 土壤

        供試土壤采自吉林省臨江市螞蟻河鄉(xiāng)三棚湖村(41°51′02.80\"N,127°6′21.81\"E,海拔833 m),采用五點采樣法,所選區(qū)域去表層10 cm土后,采集人參根際土并混勻。

        1.1.2 供試種子

        供試的人參種子購買于遼寧省沈陽市長白山參鄉(xiāng)產(chǎn)地,品種為長白山人參。選取顆粒飽滿、大小一致、無機械損傷的種粒備用。

        1.1.3 主要試劑和儀器

        水楊酸、阿魏酸、香草酸、丁香酸、肉桂酸、沒食子酸、鄰苯二甲酸、對羥基苯甲酸、瓊脂粉購自上海麥克林生化科技有限公司。CaCl2、K2HPO4、(NH4)2SO4、NaH2PO4、MgSO4·7H2O購自廣東光華科技股份有限公司。生理生化試劑盒及草酸銨結(jié)晶紫染液、草酸銨、盧戈氏碘液、沙黃復(fù)染液、對二甲基氨基苯甲醛、體積分?jǐn)?shù)為95%酒精、濃鹽酸、甲基紅、質(zhì)量濃度為40%的KOH 溶液、體積分?jǐn)?shù)為6%的α?奈酚酒精溶液、對氨基苯磺酸、α?萘胺、乙酸購自杭州微生物試劑有限公司。試驗所需培養(yǎng)基及其配方如表1所示。

        主要儀器包括ZHJH-C1106B 型超凈工作臺(上海智城分析儀器制造有限公司)、G154DP型全自動立式高壓滅菌鍋[致微(廈門)儀器有限公司]、SP-1920紫外可見分光光度計(上海光譜儀器有限公司)、RE-2000B 旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(上海亞榮生化儀器廠)。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 降解菌分離篩選及分子鑒定

        分別稱取3個采樣點各10 g土壤樣品混合,加入90 mL無菌水,置于恒溫?fù)u床(220 r·min?1,28 ℃)振蕩過夜。分別在100、500和1 000 mg·L?1 酚酸作為單一碳源的篩選培養(yǎng)基中加入5 mL 土壤懸液,28 ℃、220 r·min?1 搖床培養(yǎng)3 d,連續(xù)培養(yǎng)3 個周期共9 d,接種量為2%。富集培養(yǎng)的菌液進(jìn)行梯度稀釋(10?3、10?4、10?5),涂布于篩選培養(yǎng)基(酚酸物質(zhì)1 000 mg·L?1)固體平板上,在分離篩選過程中設(shè)置空白組對照。挑選在以酚酸作為單一碳源的培養(yǎng)基上生長,而在其他培養(yǎng)條件相同卻無酚酸的培養(yǎng)基上不生長的菌株,初步確定為具有降解能力的降解菌株。反復(fù)劃線以得到菌株純培養(yǎng)物,純化后的單菌落收集于30%甘油中,置于?20 ℃冰箱保存。

        形態(tài)學(xué)觀察:將降解菌株在LB培養(yǎng)基上劃線,28 ℃下培養(yǎng)24 h,觀察記錄菌落形態(tài)、顏色及透明度等特征。降解菌株的生理生化反應(yīng)測定參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》[16]和《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》[17]。

        基因測序:超凈臺收集單菌落于1.5 mL離心管中,然后加入100 μL 10% 的Chelex-100 溶液,提取DNA。以基因組DNA 為模板,使用引物27F和1492R擴(kuò)增16S rRNA基因片段。使用通用引物Eu-27F(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’)和Eu-1492R(5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’)分別擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA基因序列。PCR體系50 μL,包含 DNA模板2 μL、2×Taq Mastr Mix 25 μL、上下游引物各1 μL、ddH2O 21 μL。PCR程序: 95 ℃預(yù)變性4 min;95 ℃變性1 min,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,32個循環(huán);72 ℃充分延伸2 min,于4 ℃保存。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序。將測序結(jié)果在EzBioCloud(https://www.ezbiocloud.net/)進(jìn)行序列比對。用MEGA 6.0中的neighbor-joining算法(自展數(shù)為1 000)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

        1.2.2 降解菌降解能力測定

        采用紫外分光光度計測定降解率,設(shè)置0~640 mg·L?1 酚酸等梯度含量,以酚酸含量為橫坐標(biāo)、吸光度值為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。種子液在搖床(28 ℃,220 r·min?1)培養(yǎng)3 d后,放入50 mL離心管10 000 r·min?1離心10 min,棄上清收集菌體,用無菌水重懸至OD600=1.0。按重懸液2%的體積接種到篩選培養(yǎng)基(酚酸含量為1 000 mg·L?1)中搖床(28 ℃, 220 r·min?1)培養(yǎng)3 d。將發(fā)酵液裝入分液漏斗中,用二氯甲烷按照1∶2比例萃取3次,收集有機液相于旋蒸瓶中,在旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(30 ℃,80 r·min?1)上進(jìn)行旋蒸濃縮后,將濃縮物轉(zhuǎn)移至樣品瓶內(nèi),用75%無水乙醇定容于5 mL。采用紫外分光光度儀測定,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得出剩余酚酸物質(zhì)的量,按公式(1)計算降解率(degradation rate,DR)。

        DR =( D - M/D) ×100% (1)

        式中,D 為經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線計算得出對照組剩余酚酸物質(zhì)的質(zhì)量;M 為經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)曲線計算得出試驗組剩余酚酸物質(zhì)的質(zhì)量。

        1.2.3 單因素試驗

        選取溫度、酚酸含量、氮源3種因素進(jìn)行單因素試驗,其他培養(yǎng)條件不變。溫度單因素試驗中將溫度分別設(shè)置為25、30、35、40 ℃;酚酸含量單因素試驗中將化感物質(zhì)初始含量分別設(shè)置為100、500、1 000、1 500、2 000 mg·L?1;氮源單因素試驗中將氮源分別設(shè)置為磷酸二氫鈉(NaH2PO4)、硝酸鉀(KNO3)、硫酸銨[(NH4)2SO4]、氯化銨(NH4Cl)、硝酸鈣[(Ca(NO3)2]。降解率的測定方法同1.2.2。

        1.2.4 種子萌發(fā)試驗

        分別選用無菌水(CK)、250 mg·L?1 水楊酸溶液(SA250)、2.5 mg·L?1 水楊酸溶液(SA2.5)、0.025 mg·L?1 水楊酸溶液(SA0.025)、降解菌液(SA250+S1)處理人參種子,處理液用量均為4 mL,共計5種處理。其中降解菌液處理為降解菌和250 mg·L?1 水楊酸(1∶3)的混合液4 mL?;旌弦褐械慕到饩鸀榍捌诤Y選得到,經(jīng)液體搖床發(fā)酵(1.2.3優(yōu)化后的發(fā)酵條件)培養(yǎng)3 d后,去除上清液,采用去離子水稀釋至OD600=1,即成降解菌液。

        培養(yǎng)皿法: 在9 cm 玻璃培養(yǎng)皿的底部鋪2層濾紙,將濾紙片用無菌水浸透固定,高壓蒸汽滅菌(121 ℃、10 min)。選取顆粒飽滿、大小均一的裂口人參種子,用4%的次氯酸鈉消毒5 min,再用無菌水反復(fù)沖洗數(shù)次后移至超凈工作臺,每個培養(yǎng)皿放入10粒人參種子和4 mL處理液,每組設(shè)置2組重復(fù)。

        種子萌發(fā)形態(tài)指標(biāo)測定: 放入種子記作第1天,之后每天觀察生長情況。于第7天統(tǒng)計并測量記錄各處理種子的生長情況。種子平鋪于透明硬塑料膜上,用游標(biāo)卡尺準(zhǔn)確測量胚根長度和胚軸長度,并計算化感作用效應(yīng)指數(shù)(responseindex,RI)[18]。當(dāng)Tgt;C 時,采用公式(3)計算RI;當(dāng)T

        胚根(胚軸)生長值=7 d后的胚根(胚軸)長-剛種植的胚根長(胚軸)長(2)

        RI = 1 - C/T(3)

        RI = T/C- 1 (4)

        式中,C 為空白組生長值,T 為處理組生長值;當(dāng)RIgt;0時,表現(xiàn)為促進(jìn)作用;當(dāng)RIlt;0時,表現(xiàn)為抑制作用;絕對值的大小表示自毒作用強度。

        1.3 數(shù)據(jù)處理

        采用Excel 2018軟件進(jìn)行試驗數(shù)據(jù)的整理;采用SPSS對數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析及最小顯著差異性檢驗。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 降解菌分離篩選結(jié)果

        以水楊酸、阿魏酸、香草酸、丁香酸、肉桂酸、沒食子酸、鄰苯二甲酸、對羥基苯甲酸為單一碳源,從土壤樣品中共分離得到10株細(xì)菌,包含1株放線菌。各菌株的外觀形態(tài)如圖1所示。MSZ為放線菌,呈白纖毛球狀;其余均為細(xì)菌,顏色大都為黃白色,表面光滑,粘稠狀。14XC、BH2XC在香草酸篩選培養(yǎng)基上生長;19AW、BH1AW在阿魏酸篩選培養(yǎng)基上生長;D2在對羥基苯甲酸篩選培養(yǎng)基上生長;DXH1在丁香酸篩選培養(yǎng)基上生長;L1在鄰苯二甲酸篩選培養(yǎng)基上生長;RG1在肉桂酸篩選培養(yǎng)基上生長;S1在水楊酸篩選培養(yǎng)基上生長;放線菌MSZ 在沒食子酸篩選培養(yǎng)基上生長?;?6SrRNA序列比對結(jié)果如表2所示。S1與伯克霍爾德菌(Burkholderia FNTGs)的相似度達(dá)100%。

        降解能力測定結(jié)果(表3)表明,S1為高效降解水楊酸菌株。對S1 進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察發(fā)現(xiàn),其在篩選培養(yǎng)基上的生長狀況良好,具有粘度、外觀呈圓形有閃光;革蘭氏染色結(jié)果為陰性;甲基紅試驗、V-P 試驗、氧化?發(fā)酵試驗、尿素酶試驗反應(yīng)呈陽性;革蘭氏染色、吲哚試驗、硝酸鹽還原試驗、明膠液化試驗反應(yīng)呈陰性。

        以降解菌株S1的DNA為模板,利用細(xì)菌16SrRNA 基因通用引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,其產(chǎn)物為1 120 bp 的基因片段。將其通過EzBioCloud 和NCBI進(jìn)行比對,結(jié)果(圖2)顯示,降解菌株S1與伯克霍爾德菌(Burkholderia FNTGs)處于同一分支,最大相似度為99%,結(jié)合菌株形態(tài)學(xué)特征和生理生化檢測,將菌株S1鑒定為伯克霍爾德菌屬。

        2.2 降解能力測定結(jié)果

        經(jīng)搖床發(fā)酵,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線分別計算菌株S1對酚酸類物質(zhì)的降解能力,結(jié)果(表4)表明,有6株表現(xiàn)出較好的降解能力,其中菌株S1對水楊酸的降解效果最強,平均降解率達(dá)65.32%。由于人參連作土壤中水楊酸的含量較高[3],而S1對水楊酸的降解能力最優(yōu),因此選取菌株S1進(jìn)行后續(xù)應(yīng)用研究。

        2.3 菌株S1 培養(yǎng)條件的優(yōu)化

        考察在以水楊酸為單一碳源的篩選培養(yǎng)基中,不同氮源。培養(yǎng)溫度和自毒物質(zhì)含量對菌株S1降解水楊酸的影響。結(jié)果表明,不同因素對降解率影響存在顯著差異。不同氮源培養(yǎng)條件下,硝酸鈣[Ca(NO3)2]的效果最好,菌株S1對水楊酸的降解率達(dá)到81.4%(圖3),顯著高于其他氮源。菌株S1對培養(yǎng)溫度具有良好的耐受性,在25~30 ℃之間,對水楊酸的降解率均大于60%,降解效果顯著優(yōu)于其他溫度,最高達(dá)78.7%(圖4);當(dāng)溫度高于30 ℃時,降解效果逐漸降低。在化感物質(zhì)含量為500 mg·L?1時,菌株S1的降解率達(dá)88.58%,顯著高于其他處理(圖5)。各因素降解率峰值均在設(shè)置的培養(yǎng)條件范圍內(nèi),說明單因素試驗條件設(shè)置合理。

        2.4 菌株S1 對人參種子萌發(fā)的影響

        由圖4和表5可知,對照組種子的胚根長度平均為53.42 mm。0.025和2.500 mg·L?1水楊酸處理對人參種子胚根的抑制作用較弱,而250.000 mg·L?1水楊酸處理的胚根長度顯著低于對照組。RI代表自毒物質(zhì)對種子的化感作用程度。在水楊酸處理下,胚根長度的RI均為負(fù)值,表明水楊酸對人參種子胚根的生長具有一定的抑制作用,且在高水平處理下抑制作用最強。經(jīng)菌株S1處理后,人參種子的胚根長度平均為60.13 mm,較對照組增加6.71 mm,促生效果達(dá)12.56%,且RI為正值(0.154),說明菌株S1不僅緩解了水楊酸對胚根生長的抑制作用,同時對人參種子的胚根發(fā)育具有一定促生作用。

        對照組種子的胚軸長度平均為27.95 mm。水楊酸處理下人參種子的胚軸長度顯著小于對照,且水楊酸對人參種子胚軸生長的抑制作用隨質(zhì)量濃度的升高而逐漸增強。菌株S1降解液能在一定程度上緩解水楊酸對人參種子胚軸生長的抑制作用,但其胚軸長度仍顯著小于對照,而胚根長度與對照組無差異顯著,說明胚根對水楊酸的耐受性較胚軸強;胚軸長度的RI為負(fù)值,說明在S1降解液處理中還有一定的水楊酸殘留,或是某些代謝產(chǎn)物仍具有自毒性,致使胚軸生長受到抑制。

        3 討論

        篩選及應(yīng)用自毒物質(zhì)降解菌是有效解決連作障礙的措施之一,對抗重茬病害的防治技術(shù)和人參產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展都具有一定的推動作用。本研究在人參連作土壤中發(fā)現(xiàn)了10株可降解不同酚酸物質(zhì)的降解菌,主要以假單胞菌屬為主。研究表明,假單胞菌屬對植物根際自毒物質(zhì)的降解能力較強,具有促生、固氮和生物防治等功能特性[19]。為了減少試驗因素的影響,明確降解菌對于特定酚酸的降解效率,本研究選取具有高效降解水楊酸能力的菌株S1 進(jìn)行生防研究,根據(jù)形態(tài)、生理生化特征、系統(tǒng)發(fā)育樹分析,菌株S1鑒定為伯克霍爾德菌屬。研究表明,該菌屬最早在腐爛的洋蔥表面中分離,該屬多種菌株都具有生物修復(fù)和植物促生功能[20]。許玉[21]和Han等[22]研究發(fā)現(xiàn),該菌屬的菌株可誘導(dǎo)植物的生長、細(xì)胞壁修復(fù)酶、植物防御和抗逆、營養(yǎng)物質(zhì)攝取與積累等代謝途徑。但對于伯克霍爾德菌屬降解自毒物質(zhì)的研究還鮮有報道。

        本研究對菌株S1的培養(yǎng)條件進(jìn)行了優(yōu)化,在培養(yǎng)溫度為30 ℃、氮源為硝酸鈣、初始水楊酸含量為500 mg·L?1時降解率達(dá)到88.58%,較優(yōu)化前提高23.26%。田間連作土壤中自毒物質(zhì)具有積累效應(yīng),隨著栽培時間的增長根際土中自毒物質(zhì)的種類和含量均呈現(xiàn)增多趨勢[23]。因此,提升菌種的降解能力尤為重要。本研究單因素試驗的酚酸含量設(shè)置高于土壤,后續(xù)還會進(jìn)一步考察該菌株對酚酸混合物的降解以及與其他微生物的協(xié)同作用。

        水楊酸即鄰羥基苯甲酸,其芳香環(huán)上帶有活性羧基,是抑制種子萌發(fā)、降低根系活力的主要原因[24]。本研究表明,菌株S1能緩解水楊酸對人參種子的生長脅迫,對胚根促生效率達(dá)12.56%。推測S1降解水楊酸的代謝過程與李敏等[25]研究的微生物降解苯甲酸類酚酸的過程可能一致,既微生物生理代謝過程中首先將苯酚羥基化形成鄰苯二酚,再經(jīng)過鄰位裂解或間位裂解將苯環(huán)開環(huán),降解為低碳化合物或者通過三羧酸循環(huán)降解為二氧化碳和水。在自然界中,植物根際分泌的酚酸自毒物質(zhì)會迅速吸附到礦物質(zhì)和有機質(zhì)的表面,降低其有效性,使植物不能充分利用土壤中的營養(yǎng)元素,從而限制植物生長[26]。微生物能降解自毒物質(zhì),促進(jìn)土壤中有機碳礦化,進(jìn)而為植物及土壤微生物的生長提供養(yǎng)分[27]。因此,利用降解菌株S1作為微生物菌劑進(jìn)行連作障礙防治,對于解決連作障礙問題具有潛在生防應(yīng)用價值,為緩解連作障礙的生物有機菌劑研制及完善人參土壤管理技術(shù)體系提供了理論依據(jù)。

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