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        葡萄致腐菌灰葡萄孢及其拮抗菌貝萊斯芽孢桿菌的分離鑒定

        2024-09-27 00:00:00劉萍牛新湘管力慧楊紅梅楚敏包慧芳王寧詹發(fā)強(qiáng)林青楊蓉龍宣杞婁愷史應(yīng)武
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年15期

        摘要:分離篩選出對(duì)葡萄致腐菌灰葡萄孢有較強(qiáng)拮抗作用的拮抗菌,豐富葡萄采后保鮮拮抗菌資源,以期為葡萄灰霉病的生物防治提供理論依據(jù)和奠定應(yīng)用基礎(chǔ)。利用組織塊分離法在腐爛的葡萄果實(shí)中分離得到灰葡萄孢,梯度稀釋法從葡萄園土壤中分離得到潛力拮抗菌,通過(guò)平板對(duì)峙及瓊脂擴(kuò)散法篩選出拮抗作用較強(qiáng)的生防菌,并通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察、生理生化測(cè)定、生物學(xué)鑒定確定其種屬。通過(guò)對(duì)拮抗菌進(jìn)行溶血性測(cè)定初步探索其是否對(duì)人體有溶血作用。分離得到的葡萄致腐菌通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察,病原菌PH-23菌絲初期呈灰白色,繼續(xù)培養(yǎng)會(huì)逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)榈那嗷液稚?,菌絲繁盛,孢子眾多。對(duì)病原菌PH-23 進(jìn)行ITS、β-tub序列分析,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征確定其為灰葡萄孢。致病力測(cè)定結(jié)果表明,PH-23接種后葡萄癥狀與葡萄灰霉病癥狀相符,腐爛嚴(yán)重。篩選得到對(duì)葡萄致腐菌PH-23拮抗作用較強(qiáng)的生防菌TP-1,抑菌圈直徑為22.49 mm。通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察,菌體為桿狀,芽孢呈橢圓形,大小為0.62 μm×2.35 μm。TP-1革蘭氏染色陽(yáng)性。生理生化鑒定結(jié)果初步認(rèn)為T(mén)P-1為芽孢桿菌?;?6S rDNA基因、rpoB基因、gyrB基因序列分析確定其為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。拮抗菌TP-1的溶血性測(cè)定顯示其對(duì)人體無(wú)溶血作用。拮抗菌TP-1對(duì)灰葡萄孢有較強(qiáng)的拮抗作用,在葡萄采后貯藏及生物保鮮中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

        關(guān)鍵詞:葡萄灰霉病;灰葡萄孢;生物防治;生理生化鑒定;拮抗菌

        中圖分類(lèi)號(hào):S436.631.1+9 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2024)15-0144-09

        收稿日期:2023-09-04

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金地區(qū)科學(xué)基金(編號(hào):31860024);新疆維吾爾自治區(qū)重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目(編號(hào):2021B02004、2022B02053-2、2022A02005);國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(編號(hào):2022YFD1400304)。

        作者簡(jiǎn)介:劉 萍(1995—),女,河南信陽(yáng)人,碩士研究生,從事食品生物技術(shù)研究。E-mail:1105898118@qq.com。

        通信作者:史應(yīng)武,博士,研究員,從事微生物生態(tài)與植物健康研究。E-mail:syw1973@126.com。

        葡萄是我國(guó)重要的水果,營(yíng)養(yǎng)與經(jīng)濟(jì)價(jià)值頗高,果實(shí)汁多味美,且含有多種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)及生物活性物質(zhì)[1]。我國(guó)生產(chǎn)的葡萄主要以鮮食為主,相比其他生產(chǎn)大國(guó)20%的鮮食率,我國(guó)基本上有70%用于鮮食[2]。早在2002年我國(guó)鮮食葡萄的產(chǎn)量就突破200萬(wàn)t,一躍成為世界第一的鮮食葡萄生產(chǎn)大國(guó)。但葡萄由于具有鮮嫩柔軟,皮薄肉厚,美味多汁,含水量、含糖量較高的特點(diǎn),在采收及貯運(yùn)銷(xiāo)售過(guò)程中非常容易遭受病原菌侵染引起腐爛[3]。其中,由灰葡萄孢(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是葡萄會(huì)面臨的嚴(yán)重病害,因?yàn)榕c其他致腐菌相比,Botrytis cinerea不僅具備適應(yīng)性強(qiáng)、增殖速度快以及遺傳變異大的特點(diǎn),還擁有低溫致病與潛伏侵染的優(yōu)勢(shì)[4]。Botrytis cinerea在-5 ℃的低溫下仍可存活生長(zhǎng),并產(chǎn)生較多的分生孢子,傳播、繁殖,因此在適宜貯藏果實(shí)的溫度0 ℃中葡萄依然存在因Botrytis cinerea而腐爛變質(zhì)的風(fēng)險(xiǎn),葡萄一旦被Botrytis cinerea感染,通過(guò)分生孢子的傳播,腐爛會(huì)迅速擴(kuò)散,難以控制,進(jìn)而導(dǎo)致葡萄產(chǎn)量損失嚴(yán)重[2]。

        目前,主要是以農(nóng)業(yè)和化學(xué)防治的辦法來(lái)預(yù)防控制葡萄灰霉病,但這些辦法都存在一些缺陷。而利用拮抗菌進(jìn)行生物防治,能夠大大降低化學(xué)農(nóng)藥的使用率,治理農(nóng)藥殘留的問(wèn)題,與此同時(shí)還可預(yù)防病菌形成耐藥性。尤其對(duì)已形成抗藥性的病菌進(jìn)行拮抗菌防治,不失為是一種有效解決抗藥性的辦法[5]。因此,從玫瑰香葡萄腐爛的果實(shí)中分離得到致腐菌灰葡萄孢,并在從葡萄園土壤中分離得到的細(xì)菌中,利用平板對(duì)峙法篩選出對(duì)灰葡萄孢具有較好拮抗作用的拮抗菌,對(duì)其通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察、生理生化測(cè)定、生物學(xué)鑒定進(jìn)行菌種鑒定,以期豐富葡萄灰霉病優(yōu)良拮抗菌資源,為今后的菌劑研發(fā)提供選擇,擴(kuò)大葡萄灰霉病的防治途徑。

        1 材料與方法

        1.1 試供材料

        1.1.1 試供葡萄

        玫瑰香葡萄,購(gòu)自烏魯木齊市沙依巴克區(qū)北園春水果市場(chǎng)。

        1.1.2 試供土樣

        選擇新疆石河子、昌吉、五家渠、博樂(lè)、庫(kù)爾勒、哈密為采樣點(diǎn)。于各采樣點(diǎn)的葡萄園中使用5點(diǎn)取樣法,用鏟子將表層土移開(kāi),于距土壤表面5~20 cm處采樣,將同一地區(qū)采集的土樣混勻,裝入采樣袋帶回。

        將采集的土樣分別過(guò)直徑2 mm的篩網(wǎng)去除石塊與雜根,將過(guò)篩后的各土樣裝入密封袋,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.3 培養(yǎng)基

        NA培養(yǎng)基:氯化鈉1.5 g,牛肉浸粉0.9 g,蛋白胨3.0 g,瓊脂4.5 g,pH值為7.3±0.1(25 ℃),蒸餾水溶解,加熱玻璃棒攪拌以便充分溶解,終體積為300 mL,121 ℃滅菌15 min,備用。

        NB培養(yǎng)基:氯化鈉1.5 g,牛肉浸粉0.9 g,蛋白胨3 g,pH值為7.2±0.2(25 ℃),蒸餾水溶解,加熱玻璃棒攪拌以便充分溶解,終體積為300 mL,121 ℃ 滅菌15 min,備用。

        PDB培養(yǎng)基:葡萄糖6.0 g,馬鈴薯浸粉1.8 g,蒸餾水溶解,加熱玻璃棒攪拌以便充分溶解,終體積為300 mL,121 ℃滅菌20 min,備用。

        PDA培養(yǎng)基:葡萄糖6.0 g,馬鈴薯浸粉1.8 g,瓊脂6.0 g,pH值為5.6±0.2(25 ℃),蒸餾水溶解,加熱玻璃棒攪拌以便充分溶解,終體積為300 mL,121 ℃滅菌20 min,備用。

        1.1.4 其他材料

        Ezup柱式真菌基因組DNA抽提試劑盒、Ezup柱式細(xì)菌基因組DNA抽提試劑盒、0.22 μm有機(jī)濾膜、直徑6 mm打孔器、玻璃珠、接種環(huán)、竹簽。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 病原菌的分離純化

        將玫瑰香葡萄置于溫度為25 ℃,相對(duì)濕度為85%的恒溫氣候箱中,自然發(fā)病。粗篩:采用組織塊分離法。用75%乙醇對(duì)腐爛變質(zhì)的葡萄處理30 s進(jìn)行表面消毒。消毒后無(wú)菌水沖洗去除乙醇?xì)埩簦瑹o(wú)菌濾紙吸除表面水分。使用無(wú)菌鑷子及刀片將葡萄果皮與果肉分離,分別取0.5 cm2果皮與果肉置于PDA平板中,24 ℃恒溫培養(yǎng)2~5 d。純化培養(yǎng):無(wú)菌接種環(huán)取少量粗篩單菌落菌絲以無(wú)菌水稀釋?zhuān)∠♂屢和坎加赑DA平板,24 ℃恒溫培養(yǎng)2~5 d,重復(fù)以上操作至每PDA平板均為形態(tài)一致的單菌落。

        1.2.2 病原菌形態(tài)學(xué)觀察及致病力測(cè)定

        用6 mm無(wú)菌打孔器于病原菌平板中選取單菌落打孔,獲得病原菌菌餅,將菌餅倒置(培養(yǎng)基在上方)緊貼于PDA平板中央,24 ℃恒溫培養(yǎng)2~5 d。觀察病原菌的形態(tài)特征。

        對(duì)新鮮玫瑰香葡萄果實(shí)進(jìn)行表面消毒,75%乙醇處理1 min,2%次氯酸鈉處理30 s,自然晾干。將分離得到的病原菌返接到葡萄果實(shí)上,觀察發(fā)病癥狀。

        1.2.3 病原菌基因組DNA提取及分子生物學(xué)鑒定

        病原菌基因組DNA的提?。河脽o(wú)菌打孔器(6 mm)對(duì)病原菌平板進(jìn)行打孔,得到病原菌菌餅,取15個(gè)病原菌菌餅接種于PDB培養(yǎng)基中,容量為500 mL、裝液量為100 mL,25 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)2 d,此為病原菌種子液。取病原菌種子液1 mL,轉(zhuǎn)接于PDB培養(yǎng)基中,容量為500 mL、裝液量為200 mL,25 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)5 d,此為病原菌菌液。取病原菌菌液于50 mL離心管中,9 000 r/min 室溫離心20 min,收集病原菌菌體。將菌體用無(wú)菌濾紙充分吸除水分,利用液氮將病原菌菌體快速研磨至細(xì)膩均一的粉末狀,取適量于1.5 mL無(wú)菌離心管中。按照Ezup柱式真菌基因組DNA抽提試劑盒的指示說(shuō)明提取DNA,-20 ℃保存。

        對(duì)病原菌的ITS基因片段進(jìn)行擴(kuò)增:引物序列為ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)、ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)。PCR反應(yīng)體系為25 μL:2×Taq PCR Green Mix 12.5 μL,上、下游引物各0.5 μL,病原菌DNA 1 μL,ddH2O 10.5 μL。擴(kuò)增條件為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,48 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存[6]。

        對(duì)病原菌的β-tub基因片段進(jìn)行擴(kuò)增:引物序列為β-tub-F1(5′-GGTAACCAAATCGGTGCTGCvTTTC-3′)、β-tub-R1(5′-ACCCTCCGTGTAGTGACCCTTGGC-3′)。PCR反應(yīng)體系為25 μL:2×Taq PCR Green Mix 12.5 μL,上、下游引物各 0.5 μL,病原菌DNA 1 μL,ddH2O 10.5 μL。擴(kuò)增條件為:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性1 min,53 ℃退火1 min,72 ℃延伸45 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 10 min,4 ℃保存[7]。

        擴(kuò)增片段的序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建:將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳,觀察擴(kuò)增片段大小。所用瓊脂糖凝膠濃度為1.5%,取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物 5 μL,以等量ddH2O為空白對(duì)照,Maker E為參照標(biāo)準(zhǔn),設(shè)定電壓90 V。電泳結(jié)束后于EB染料中染色15 min,自來(lái)水淋去染料殘留,凝膠成像分析儀觀察擴(kuò)增片段大小。將產(chǎn)生明顯條帶的PCR產(chǎn)物委托上海生工生物工程股份有限公司測(cè)序。利用SepMan軟件對(duì)結(jié)果進(jìn)行序列拼接,然后在NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì),再利用MEGA 6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        1.2.4 拮抗菌的分離純化及篩選

        將采集的土樣以無(wú)菌水稀釋至合適梯度,取100 μL涂布于NA平板,37 ℃恒溫培養(yǎng)14~24 h。純化培養(yǎng):無(wú)菌接種環(huán)取單菌落以無(wú)菌水稀釋后,取稀釋液涂布于NA平板,37 ℃恒溫培養(yǎng)14~24 h,純化至每NA平板均為形態(tài)一致的單菌落。

        采用平板對(duì)峙法進(jìn)行拮抗菌的初篩。用無(wú)菌接種環(huán)取少量灰葡萄孢菌絲以無(wú)菌水稀釋?zhuān)∠♂屢和坎加赑DA平板。待充分吸收后,十字交叉選取4點(diǎn),均距平板中央2.5 cm,將純化的單菌落點(diǎn)接于4點(diǎn),24 ℃恒溫培養(yǎng),選出可產(chǎn)生明顯抑菌圈的拮抗菌。

        采用瓊脂擴(kuò)散法復(fù)篩拮抗菌。將初篩的拮抗菌接種于100 mL NB培養(yǎng)基中,37 ℃,180 r/min振蕩培養(yǎng) 14~20 h,取菌液于1.5 mL離心管中,12 000 r/min 室溫離心10 min,上清液用0.22 μm有機(jī)濾膜過(guò)濾,即獲得拮抗菌的無(wú)菌濾液。無(wú)菌接種環(huán)取少量病原菌以無(wú)菌水稀釋?zhuān)∠♂屢和坎加赑DA平板。待稀釋液充分吸收后,十字交叉選取4點(diǎn),均距平板中央2.5 cm處用6 mm無(wú)菌打孔器打孔,取 80 μL 拮抗菌無(wú)菌濾液注入孔中,24 ℃恒溫培養(yǎng),觀察拮抗菌對(duì)病原菌的拮抗作用。

        1.2.5 拮抗菌形態(tài)學(xué)觀察及生理生化測(cè)定 形態(tài)學(xué)觀察:用無(wú)菌接種環(huán)取單菌落以無(wú)菌水稀釋?zhuān)∠♂屢和坎加贜A平板,37 ℃恒溫培養(yǎng)14~24 h,觀察其形態(tài)特征。革蘭氏染色,顯微鏡下查看其菌體形態(tài)特征。

        生理生化測(cè)定:參考《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》進(jìn)行[8]。鑒定項(xiàng)目有:氧化酶試驗(yàn)、V-P試驗(yàn)、苯丙氨酸、酪蛋白水解、接觸酶試驗(yàn)、酪氨酸、D-甘露糖、淀粉水解、D-阿拉伯糖、D-甘露醇、H2S產(chǎn)氣試驗(yàn)、明膠液化、檸檬酸鹽、甲基紅反應(yīng)、L-阿拉伯糖、吲哚試驗(yàn)、D-木糖、硝酸鹽還原、葡萄糖等。

        1.2.6 拮抗菌基因組DNA提取及分子生物學(xué)鑒定

        拮抗菌基因組DNA的提取:用無(wú)菌接種環(huán)取拮抗菌單菌落,接種于100 mL NB培養(yǎng)基中,37 ℃,180 r/min 振蕩培養(yǎng)14~20 h,獲得拮抗菌菌液。取1 mL菌液于1.5 mL離心管中,按照Ezup柱式細(xì)菌基因組DNA抽提試劑盒的指示說(shuō)明提取DNA,-20 ℃保存。

        對(duì)拮抗菌的16S rDNA基因片段進(jìn)行擴(kuò)增:引物序列為27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)。PCR反應(yīng)體系為25 μL:2×Taq PCR Green Mix 12.5 μL,上、下游引物各0.5 μL,拮抗菌DNA 1 μL,ddH2O 10.5 μL。擴(kuò)增條件為:95 ℃預(yù)變性 5 min;95 ℃變性30 s,55 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 2 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存[9]。

        對(duì)拮抗菌的rpoB基因片段進(jìn)行擴(kuò)增:引物序列為rpoB-f(5′-AGGTCAACTAGTTCAGTATGGAC-3′),rpoB-r(5′-AAGAACCGTAACCGGCAACTT-3′)。PCR反應(yīng)體系為25 μL:2×Taq PCR Green Mix 12.5 μL,上、下游引物各0.5 μL,模板DNA 1 μL,ddH2O 10.5 μL。擴(kuò)增條件為:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性1 min,51 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存[10]。

        對(duì)拮抗菌的gyrB基因片段進(jìn)行擴(kuò)增:引物序列為gyrB UP-1(5′-GAAGTCATCATGACCGTTCTGCAYGCNGGNGGNAARTTYGA-3′),gyrB UP-2r(5′-AGCAGGGTACGGATGTGCGAGCCRTCNACRTCNGCRTCNGTCAT-3′)。PCR反應(yīng)體系為25 μL:2×Taq PCR Green Mix 12.5 μL,上、下游引物各 0.5 μL,拮抗菌DNA 1 μL,ddH2O 10.5 μL。擴(kuò)增條件為:95 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,54 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 10 min,4 ℃保存[11]。擴(kuò)增片段的序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建同“1.2.3”節(jié)。

        1.2.7 拮抗菌溶血性測(cè)定

        將拮抗菌與金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)用無(wú)菌接種環(huán)同時(shí)于血平板上劃線,34 ℃過(guò)夜培養(yǎng)。觀察拮抗菌與金黃色葡萄球菌的生長(zhǎng)情況,以此判斷拮抗菌是否具有溶血性:菌落周?chē)霈F(xiàn)透明溶血圈為β溶血,對(duì)人體有強(qiáng)致病力;菌落周?chē)霈F(xiàn)綠色暈圈為α溶血,對(duì)人體致病力弱;若菌株正常生長(zhǎng)無(wú)反應(yīng),則為γ溶血,無(wú)溶血性。金黃色葡萄球菌為陽(yáng)性對(duì)照菌株,對(duì)人體有強(qiáng)致病力,菌落周?chē)鷷?huì)出現(xiàn)透明溶血圈。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 病原菌形態(tài)學(xué)特征及致病力測(cè)定

        由圖1可知,在PDA平板中,病原菌菌絲初期呈灰白色,繼續(xù)培養(yǎng)會(huì)逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)榈那嗷液稚?,菌絲繁盛,孢子眾多?;颐共∈瞧咸奄A藏期間易發(fā)且危害嚴(yán)重的腐爛病害,初步篩選出與灰葡萄孢相似的病原菌,將其命名為PH-23。

        將PH-23接種到健康玫瑰香葡萄后,葡萄表皮出現(xiàn)白色絲絨狀菌絲,后期菌絲轉(zhuǎn)變?yōu)橥粱疑?,孢子豐富易振落,果實(shí)皺縮凹陷,散發(fā)出土腥味。癥狀與葡萄灰霉病癥狀相符。

        2.2 病原菌分子生物學(xué)鑒定

        病原菌ITS片段鑒定結(jié)果見(jiàn)圖2的Ⅰ-a與 Ⅰ-b,測(cè)序片段經(jīng)比對(duì)后確定其ITS片段大小為517 bp,與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳圖譜保持一致,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果可靠?;贗TS基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中病原菌PH-23與Botrytis cinerea CLR15 (MK370693)相似性為100%。病原菌β-tub片段鑒定結(jié)果見(jiàn)圖2的Ⅱ-a與Ⅱ-b,測(cè)序片段經(jīng)比對(duì)后確定其β-tub片段大小為477 bp,與PCR擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳圖譜保持一致,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果可靠?;讦?tub基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中病原菌PH-23與Botrytis cinerea ASF-Bc8 (MH208281)相似性為100%。綜合以上試驗(yàn)結(jié)果最終將病原菌鑒定為灰葡萄孢(Botrytis cinerea)。

        2.3 拮抗菌的分離篩選

        采用稀釋涂布平板法與平板對(duì)峙法結(jié)合篩選出對(duì)PH-23有拮抗作用的菌株81株,瓊脂擴(kuò)散法復(fù)篩得到拮抗菌46株。由表1可知,據(jù)抑菌圈直徑大小將拮抗菌劃分為5個(gè)等級(jí),其中抑菌圈直徑 0~5 mm 表示拮抗效果很弱,共19株;6~10 mm表示拮抗效果弱,共6株;11~15 mm表示拮抗效果中等,共10株;16~20 mm表示拮抗效果強(qiáng),共9株;21~25 mm表示拮抗效果很強(qiáng),共2株。其中,拮抗效果很弱的菌株最多,占總菌株的41.3%,拮抗效果很強(qiáng)的菌株僅占總菌株的4.3%。

        將拮抗效果很強(qiáng)的2株拮抗菌命名為T(mén)P-1、TP-2,選用拮抗能力最強(qiáng)的TP-1開(kāi)展后續(xù)試驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)圖3,TP-1對(duì)PH-23拮抗作用明顯,抑菌圈直徑為22.49 mm。

        2.4 拮抗菌的形態(tài)學(xué)特征及生理生化特征

        由圖4可知,TP-1在NA平板中菌落近圓形,表面自中間向四周呈花瓣?duì)?,光滑干燥,整體乳白色,不透明;其菌體為桿狀,芽孢呈橢圓形,大小為0.62 μm×2.35 μm;革蘭氏染色陽(yáng)性。拮抗菌TP-1及模式菌株生理生化鑒定結(jié)果見(jiàn)表2,通過(guò)和枯草芽孢桿菌對(duì)比,初步認(rèn)為T(mén)P-1為芽孢桿菌。

        2.5 拮抗菌分子生物學(xué)鑒定

        拮抗菌16S rDNA基因片段序列分析結(jié)果見(jiàn)圖5的Ⅲ-a與Ⅲ-b,擴(kuò)增片段經(jīng)比對(duì)后大小為 1 442 bp,與凝膠電泳圖譜保持一致,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果可靠?;?6S rDNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中拮抗菌與Bacillus velezensis PgBe186(MH211277)相似性為99.93%。拮抗菌rpoB基因片段序列分析結(jié)果見(jiàn)圖5的Ⅳ-a與Ⅳ-b,擴(kuò)增片段經(jīng)比對(duì)后大小為1 195 bp,與凝膠電泳圖譜保持一致,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果可靠?;趓poB基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中拮抗菌與Bacillus velezensis WLYS23 (CP055160) 相似性為99.93%。拮抗菌gyrB基因片段序列分析結(jié)果見(jiàn)圖5的Ⅴ-a與Ⅴ-b,擴(kuò)增片段經(jīng)比對(duì)后大小為1 148 bp,與凝膠電泳圖譜保持一致,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果可靠?;趃yrB基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中拮抗菌與Bacillus velezensis NN05 (MT119758)相似性為98.25%。綜上,基于16S rDNA基因、rpoB基因、gyrB基因序列分析確定拮抗菌為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。

        2.6 拮抗菌溶血性測(cè)定

        由圖6可知,在相同條件與時(shí)間培養(yǎng)下,金黃色葡萄球菌周?chē)霈F(xiàn)明顯溶血圈,為β溶血,與金黃色葡萄球菌性質(zhì)一致。而拮抗菌周?chē)鸁o(wú)變化,為γ溶血,說(shuō)明拮抗菌對(duì)人體無(wú)溶血作用。

        3 討論與結(jié)論

        葡萄在運(yùn)輸和銷(xiāo)售過(guò)程中由于自身特性,極易受到外界的機(jī)械損傷及致腐菌感染帶來(lái)嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,因此采后做好葡萄的防腐保鮮工作是必不可少的。葡萄灰霉病是葡萄最為常見(jiàn)且危害極大的采后病害之一,病原菌灰葡萄孢(Botrytis cinerea)不僅能夠感染葡萄,還同樣能夠作用于菜品、樹(shù)類(lèi)以及花草[12-13],危害極大?;移咸焰吣軌蛐纬删伺c分生孢子 使其傳播迅速且可在作物殘留物中長(zhǎng)時(shí)間存活,加之可低溫生存使其有效防治變得困難[14]。當(dāng)前人們常用的化學(xué)試劑防控葡萄灰霉病雖然有效,但長(zhǎng)期使用化學(xué)試劑所帶來(lái)的的農(nóng)藥殘留、農(nóng)藥抗性以及環(huán)境的污染問(wèn)題不容忽視[15]。因此采用生物防治的辦法“以菌治菌”備受人們的青睞,相較于以往的化學(xué)農(nóng)藥,生物防治從大自然甚至植物本身分離出拮抗菌,不僅具有對(duì)人與環(huán)境友好、不易產(chǎn)生抗性、來(lái)源廣泛、毒性低、有助于保護(hù)生物多樣性等多種優(yōu)點(diǎn),且可靶向性防治,高效安全[16-18]。因此,積極擴(kuò)充拮抗菌資源對(duì)高效的生物防治菌劑的開(kāi)發(fā)應(yīng)用有重要的基礎(chǔ)意義。

        本研究從貯藏腐爛的玫瑰香葡萄中以組織塊分離法得到致腐真菌,將其命名為PH-23,通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察與致病力測(cè)定初步確認(rèn)其為灰葡萄孢,而后通過(guò)ITS、β-tub基因片段進(jìn)行序列分析將其鑒定為灰葡萄孢(Botrytis cinerea),ITS序列在種內(nèi)不同菌株之間會(huì)高度保守,但是在種間則會(huì)表現(xiàn)出較大差異,因此ITS序列對(duì)于屬內(nèi)種間的系統(tǒng)學(xué)研究有較大的應(yīng)用價(jià)值。β-tub則是一種重要的管家基因,常被用作種系發(fā)育的深層分析標(biāo)記[19]。從不同葡萄園土壤中以稀釋涂布平板法與瓊脂擴(kuò)散法結(jié)合分離篩選出對(duì)PH-23有明顯拮抗作用的一株拮抗菌,抑菌圈直徑為22.49 mm,并將其命名為 TP-1。通過(guò)形態(tài)特征、生理生化特性初步認(rèn)定其為芽孢桿菌,再通過(guò)16S rDNA、rpoB和gyrB等3個(gè)基因的序列結(jié)合分析將其鑒定為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。16S rDNA基因是細(xì)菌分離鑒定常用的通用型引物,可在所有細(xì)菌中穩(wěn)定表達(dá),具有高度保守性。但也存在一定不足,對(duì)于親緣關(guān)系較近細(xì)菌之間的鑒定,16S rDNA分辨率不高,可能會(huì)出現(xiàn)不精確的鑒定結(jié)果[20-24]。將16S rDNA基因序列分析手段與其他核酸分析技術(shù)結(jié)合使用可更精準(zhǔn)地鑒別菌株,現(xiàn)今常用蛋白編碼基因輔助芽孢桿菌屬的分類(lèi)鑒定,如gyrB是促旋酶(gyrase)的β亞單位基因,是管家基因,在細(xì)菌的近緣物種區(qū)分鑒定方面,比16S rDNA更有分辨率,常用于細(xì)菌種水平的鑒定[25-28]。王天力等將16S rRNA基因序列與gyrB基因序列進(jìn)行比較分析,結(jié)果顯示屬于枯草芽孢桿菌群的各種、亞種的gyrB基因相似性為 75%~95%,區(qū)分效果要比16S rRNA更好[29]。而rpoB基因是編碼RNA聚合酶的β亞基,負(fù)責(zé)RNA的合成。2009年,Ki等分離得到20個(gè)芽孢桿菌,分別來(lái)自不同的海洋環(huán)境,利用16S rDNA與rpoB基因分析鑒定其多樣性,分析結(jié)果顯示以rpoB基因分析構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)比16S rDNA基因分析構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)大4.5倍[30],說(shuō)明rpoB基因可以很好地區(qū)分鑒定芽孢桿菌菌種。

        本研究分離篩選所得的TP-1對(duì)PH-23有較好的拮抗作用,抑菌圈直徑為22.49 mm,溶血性試驗(yàn)表明對(duì)人體無(wú)溶血作用,說(shuō)明TP-1具有發(fā)展為高效防治葡萄灰霉病生物菌劑的潛力。前人的研究表明,芽孢桿菌屬是極具研究開(kāi)發(fā)潛力的生防菌,主要是由于該屬可以產(chǎn)生多種抑制植物病原菌的抗生素和形成抗藥性強(qiáng)的內(nèi)生孢子[31]。貝萊斯芽孢桿菌的代謝產(chǎn)物中就包含多種抗菌物質(zhì),如淀粉環(huán)素、桿菌素、蜂毒素、表面蛋白活性劑等物質(zhì),可抑制多種病原菌生長(zhǎng),拮抗作用明顯,具有較大的研究?jī)r(jià)值[32]。如孫平平等研究發(fā)現(xiàn),貝萊斯芽孢桿菌L-1對(duì)梨灰霉及青霉病菌有較好的抑制作用[33];楊勝清研究發(fā)現(xiàn),貝萊斯芽孢桿菌S6對(duì)番茄早疫病原菌和灰霉病原菌有明顯的拮抗作用且對(duì)常見(jiàn)病原菌有較廣的抑制作用[34]。前人的研究充分展現(xiàn)了貝萊斯芽孢桿菌的生防潛力,而本研究?jī)H僅開(kāi)始了第1步,TP-1對(duì)PH-23詳細(xì)的拮抗機(jī)理及其防治效果尚未開(kāi)展研究,有待進(jìn)一步試驗(yàn),積極探索安全、有效、可持續(xù)的葡萄灰霉病生物防治之路。

        綜上所述,本研究從貯藏腐爛的葡萄果實(shí)中分離得到致腐真菌PH-23,通過(guò)觀察形態(tài)特征及ITS、β-tub基因序列分析將其鑒定為灰葡萄孢。從21份葡萄園土壤中分離篩選出對(duì)PH-23有明顯拮抗作用的拮抗菌TP-1,通過(guò)觀察形態(tài)特征、生理生化特性及16S rDNA、rpoB、gyrB基因序列分析將其鑒定為貝萊斯芽孢桿菌。溶血性試驗(yàn)表明拮抗菌TP-1不具備溶血作用,在葡萄采后貯藏及生物保鮮中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

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