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        基于轉(zhuǎn)錄組篩選脹果甘草根系鹽脅迫響應(yīng)關(guān)鍵基因

        2024-09-19 00:00:00努日曼古麗·艾尼陳靜胡媛媛方志剛馬劉峰
        關(guān)鍵詞:差異表達基因鹽脅迫

        摘 要: 脹果甘草是種植面積最廣且適宜新疆氣候的一種甘草品種。鹽脅迫條件會特異性誘導(dǎo)脹果甘草中部分基因的表達,在轉(zhuǎn)錄組水平上研究差異表達基因應(yīng)對脅迫的表達模式,更有利于闡明抗逆調(diào)控的分子機制。本研究利用高通量測序技術(shù)Illumina2000 對鹽脅迫處理后的脹果甘草根系進行轉(zhuǎn)錄組測序,鑒定到2 866 個誘導(dǎo)上調(diào)表達的基因,1 321 個誘導(dǎo)下調(diào)表達的基因。對所有差異表達基因進行GO分析發(fā)現(xiàn),這些基因主要參與酶活性變化、離子結(jié)合、氧化還原過程、防御反應(yīng)等。此外,通過KEGG分析發(fā)現(xiàn),差異表達基因主要富集在核糖體、氧化磷酸化、疾病調(diào)控等代謝通路。本研究對脹果甘草抗鹽基因挖掘和今后采用分子生物學(xué)手段培育甘草新品種具有重要意義。

        關(guān)鍵詞: 脹果甘草;鹽脅迫;差異表達基因

        中圖法分類號: S 文獻標(biāo)識碼: A 文章編號: 1000-2324(2024)04-0605-08

        甘草屬于豆科(Leguimnosae)甘草屬(Glycyrrhiza L.),是多年生草本植物,具有很高的藥用價值,在水土資源保護和工業(yè)領(lǐng)域也發(fā)揮著重要的作用[1]。甘草是干旱地區(qū)的自然資源之一,具有良好的抗逆性,廣泛分布在北緯N36°~N57°、東經(jīng)0~E126°、從低于海平面90 米到3 000多米的北半球。新疆作為重點產(chǎn)區(qū)之一,主要種植烏拉爾草(Glycyrrhiza uralensis)、光果甘草(Glycyrrhiza glabra)、脹果甘草(Glycyrrhizainflata)[2],其中喀什、阿克蘇等南疆地區(qū)的甘草產(chǎn)量占全疆甘草產(chǎn)量的70%左右[3]。脹果甘草生長環(huán)境年降水量達到4-70 mm,年蒸發(fā)量在2 200-3 000 mm左右[4]。新疆的脹果甘草不僅是一種傳統(tǒng)藥材,同時還對調(diào)節(jié)新疆的干旱氣候和保護荒漠性地表具有重要作用。全球有7%左右的土地受鹽漬化威脅,我國是土壤鹽漬化水平比較嚴(yán)重的國家[5]。其中,新疆灌區(qū)鹽漬化耕地面積占新疆灌區(qū)耕地總面積的32.07%[6]。鹽脅迫會嚴(yán)重?fù)p害細(xì)胞膜的完整性,影響植物的次級代謝產(chǎn)物和內(nèi)源激素的含量以及植物的正常光合作用[7],減緩植物生長過程并加速植物衰老過程,造成農(nóng)作物產(chǎn)量和質(zhì)量下降,制約農(nóng)產(chǎn)品及經(jīng)濟的發(fā)展。為應(yīng)對不良環(huán)境的影響,植物自身往往形成一系列防御措施來緩解外界脅迫造成的傷害,包括改變滲透調(diào)節(jié)物的含量、調(diào)控促分裂原活化蛋白激酶級聯(lián)途徑中的相關(guān)酶類及代謝產(chǎn)物、形成離子區(qū)域隔離、調(diào)控耐鹽信號傳導(dǎo)途徑中的相關(guān)酶類、調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子在脅迫應(yīng)答過程中的表達等。

        隨著轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的不斷成熟,諸多動植物、微生物均通過轉(zhuǎn)錄組測序獲得物種的基因信息。在本研究中,我們利用鹽脅迫處理后的脹果甘草進行轉(zhuǎn)錄組測序,挖掘多個抗逆基因,通過對脅迫條件下的基因變化情況進行分析,揭示脹果甘草應(yīng)對鹽脅迫的調(diào)控機制。這項研究為挖掘脹果甘草抗鹽相關(guān)基因及其在植物分子育種中的應(yīng)用提供理論依據(jù)。

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