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        首個(gè)對(duì)葉榕完整基因組發(fā)布

        2024-06-14 00:00:00
        科學(xué)中國(guó)人 2024年5期
        關(guān)鍵詞:亞屬端粒榕樹

        近日,中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)發(fā)布了首個(gè)榕屬植物對(duì)葉榕端粒到端粒完整基因組,修正了原有基因組中存在的大量間隙和組裝錯(cuò)誤,大幅提升了對(duì)葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性。相關(guān)研究成果發(fā)表在《園藝研究》(Horticulture Research)上。

        榕樹是??崎艑?00多種植物的統(tǒng)稱,廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)。榕屬植物包含6個(gè)亞屬,其中有2個(gè)雌雄同株亞屬和4個(gè)功能雌雄異株為主的亞屬。對(duì)葉榕屬于聚果榕亞屬,是一種非常典型的功能雌雄異株植物。研究對(duì)葉榕可以更好地了解榕樹的性別演化機(jī)制。

        由于這種榕樹的葉片通常呈對(duì)生排列,即兩片葉子對(duì)稱地生長(zhǎng)在枝條的相對(duì)位置上,所以取名為對(duì)葉榕。解析對(duì)葉榕基因組對(duì)生物學(xué)性狀解析和基因功能的研究至關(guān)重要,然而,原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯(cuò)誤,阻礙了進(jìn)一步的研究。

        科研團(tuán)隊(duì)綜合利用多種測(cè)序技術(shù),在原有基因組的基礎(chǔ)上重新組裝、完善,發(fā)布了首個(gè)榕屬植物對(duì)葉榕端粒到端粒完整基因組。這個(gè)基因組大小371.8兆,所有序列均掛載到14條染色體上,成功注釋了26642個(gè)編碼蛋白基因。

        經(jīng)評(píng)估,基因組完整度達(dá)98.7%,并且基因組的連續(xù)性和準(zhǔn)確性均得到了大幅提升。在此基礎(chǔ)上,研究進(jìn)一步構(gòu)建了雄性和雌性花不同發(fā)育時(shí)期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并鑒定得到了雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因,為研究榕屬植物的重要特征和性別決定提供了重要資源。

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