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        高角量子數(shù)原子軌道的可視化—原子結(jié)構(gòu)教學(xué)研究

        2024-05-12 03:06:34王裕平
        當(dāng)代化工研究 2024年7期

        *王裕平

        (貴州應(yīng)用技術(shù)職業(yè)學(xué)院 黔南州計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)與分子模擬重點(diǎn)實(shí)驗(yàn) 貴州 558000)

        眾所周知,物質(zhì)是由原子、分子或者離子構(gòu)成的。在化學(xué)反應(yīng)中,原子是保持物質(zhì)化學(xué)性質(zhì)的最小微粒。故在化學(xué)教學(xué)中,“原子”是一個非常重要的概念;使學(xué)生深入理解原子的概念與結(jié)構(gòu)是一件至關(guān)重要的任務(wù),同時也是學(xué)生學(xué)好化學(xué)的基礎(chǔ)。若要使得學(xué)生深入理解原子的概念,就必須熟悉原子模型的發(fā)展及近代化學(xué)對原子結(jié)構(gòu)的描述。

        早在公元前5—4 世紀(jì),古希臘哲學(xué)家Δημ?κριτο?、Λε?κιππο? 等人就已提出物質(zhì)是由大量、不可分割的細(xì)小微粒構(gòu)成的觀點(diǎn),這些微粒也就是所謂的“原子”。原子種類、狀況及結(jié)合力的不同,形成了豐富多彩的物質(zhì)世界。中世紀(jì)期間,由于受宗教和神學(xué)的壓制,未得到繼續(xù)發(fā)展。1803 年,英國化學(xué)家Dalton 發(fā)展了原子論,他認(rèn)為原子是一個堅(jiān)實(shí)、不可再分的實(shí)心球;同類原子的屬性也是一樣的,在化學(xué)變化中保持穩(wěn)定的狀態(tài)與性質(zhì);Dalton 原子論為近代化學(xué)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。直到1897 年,John Thomson 在真空放電時,發(fā)現(xiàn)了電子,為我們進(jìn)一步揭示原子結(jié)構(gòu)提供了有力線索,從而形成了原子結(jié)構(gòu)的“棗糕模型”。

        隨后Ernest Rutherford 在1911 年設(shè)計(jì)了24He散射實(shí)驗(yàn),并進(jìn)行了長時間觀察;實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)24He 穿過金箔后,依然保持原有的速度或出現(xiàn)極小偏轉(zhuǎn),也有一些偏轉(zhuǎn)比較大,個別被反彈了回來。從而證明原子內(nèi)部是空的,其質(zhì)量基本集中在一個點(diǎn)上,占據(jù)總質(zhì)量99.9%以上,電子在其周圍像行星繞太陽運(yùn)動一樣(太陽質(zhì)量同樣也占據(jù)了整個太陽系總質(zhì)量的99.98%)。但是該原子結(jié)構(gòu)模型與經(jīng)典電磁學(xué)理論是沖突的,它不能解釋原子的穩(wěn)定性,也不能說明原子光譜的分立性。

        因此,1913 年,丹麥物理學(xué)家Bohr 做出原子定態(tài)、基態(tài)及激發(fā)態(tài)的假設(shè),并首次引入能量、軌道半徑的“量子化”觀點(diǎn)。該觀點(diǎn)不僅能解釋原子的穩(wěn)定性,也可說明H 原子光譜的分立性。但依然存在缺陷,對于稍復(fù)雜一點(diǎn)的原子,比如He,都會出現(xiàn)嚴(yán)重的問題。因此,Bohr 的原子理論依然不是最佳模型。主要原因在于它保留了所謂的“經(jīng)典軌道”概念,并沒有完全摒棄經(jīng)典力學(xué)的觀點(diǎn)。直到量子力學(xué)完全建立,在該力學(xué)體系下,原子結(jié)構(gòu)有了至今為止最為完美的解釋—電子云模型,而且現(xiàn)在已經(jīng)可以通過掃描隧道顯微鏡觀察到原子的模樣。

        1.原子軌道知識點(diǎn)教學(xué)淺談

        (1)概念理解。目前,以近代物理學(xué)的觀點(diǎn)來看,原子軌道只是一個形象上的概念;學(xué)習(xí)者絕不可望文生義。在量子力學(xué)的描述中,一切微觀粒子的運(yùn)動并沒有確定的軌道和能量。微觀粒子具有波粒二象性,它的運(yùn)動行為是通過波函數(shù)來表達(dá)的。所以,原子軌道是指用于描述原子中,某個單電子運(yùn)動的波函數(shù),它并不是一條形象的軌道,如拋物線、圓等,它是通過求解薛定諤方程所得到的一個函數(shù)式。其次,原子中,各個電子之間并不是相互獨(dú)立的,存在各種相互作用,如Coulomb 相關(guān)、Fermi 相關(guān)等;因此,這里所謂的單電子波函數(shù)也是在一系列近似條件下而求解得到的。

        化學(xué)教學(xué)中,為更加象形描述原子軌道,一般將原子軌道分解為角度分布函數(shù)和徑向分布函數(shù)的乘積來表達(dá)?;瘜W(xué)教材中常見的原子軌道輪廓圖即為角度分布函數(shù)在球坐標(biāo)下的圖像,光譜學(xué)標(biāo)記為s、p、d、f、g、h、i、j……軌道;能夠正確表達(dá)相關(guān)圖像也是化學(xué)教學(xué)中極其重要的一環(huán)。除此之外,還有等值線圖、電子密度等表達(dá)方式[1-2]。

        (2)化學(xué)史的作用。在化學(xué)基礎(chǔ)知識教學(xué)中,也應(yīng)該充分重視化學(xué)史的應(yīng)用,原子結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)知識教學(xué)是化學(xué)中的重點(diǎn)也是難點(diǎn)。但該部分知識具有完整的化學(xué)史材料,因此可以充分利用化學(xué)史進(jìn)行原子結(jié)構(gòu)知識教學(xué),從而促進(jìn)學(xué)生對知識、科學(xué)本質(zhì)的理解以及概念轉(zhuǎn)變。統(tǒng)計(jì)研究表明,結(jié)合化學(xué)史進(jìn)行教學(xué),可以提高學(xué)生對科學(xué)本質(zhì)的理解及學(xué)習(xí)興趣,從而加深學(xué)生對原子結(jié)構(gòu)知識的理解[3-4]。

        (3)Bohr 原子模型的重要性。Bohr 原子模型是近代原子結(jié)構(gòu)理論的開端,首次提出了軌道與能量的量子化概念,是化學(xué)相關(guān)專業(yè)學(xué)生進(jìn)一步學(xué)習(xí)量子力學(xué)概念的基礎(chǔ)。在此方面,相關(guān)研究者還提出以發(fā)散思維為主、收斂思維為輔及有所為有所不為、張弛有度的哲學(xué)方法進(jìn)行教學(xué)。通過對該內(nèi)容的學(xué)習(xí),可以使得學(xué)生在獲得基礎(chǔ)知識的同時,也能學(xué)到許多科學(xué)的思想方法、學(xué)習(xí)方法和研究方法[5]。

        (4)化學(xué)模型教學(xué)策略。模型思維在數(shù)學(xué)、物理中是一種至關(guān)重要的研究方法,比如學(xué)習(xí)者經(jīng)常聽到數(shù)學(xué)模型、物理模型等概念。但是隨著近代化學(xué)的發(fā)展,尤其是量子化學(xué)及計(jì)算機(jī)的高速發(fā)展使得模型思維、模型認(rèn)知在化學(xué)學(xué)習(xí)或教學(xué)中也變得越來越重要,從而形成了本教學(xué)研究中的化學(xué)模型教學(xué)方法。物質(zhì)結(jié)構(gòu)決定性質(zhì),故原子結(jié)構(gòu)知識點(diǎn)幾乎貫穿整個基礎(chǔ)化學(xué)教學(xué)或?qū)W習(xí)的始終;其次,該知識點(diǎn)也是最能體現(xiàn)模型思維的典型案例之一。從模型認(rèn)知視角來探討原子結(jié)構(gòu)教學(xué),對于提高原子結(jié)構(gòu)的教學(xué)效果以及開展模型認(rèn)知教學(xué)都有一定的參考意義[6]。

        通過原子結(jié)構(gòu)模型知識的學(xué)習(xí),還可以引發(fā)學(xué)生的認(rèn)知沖突,從而激發(fā)學(xué)生進(jìn)一步探索原子結(jié)構(gòu)的興趣,引導(dǎo)學(xué)生構(gòu)建新的原子結(jié)構(gòu)模型去進(jìn)一步探索原子結(jié)構(gòu),實(shí)現(xiàn)化學(xué)素養(yǎng)的提升[7]。同時,也可以避免形成陳述式課堂。

        除此之外,也有教師在課堂上通過自行設(shè)計(jì)分光鏡,來分析有關(guān)元素的光譜進(jìn)行教學(xué)。但是,該方法在一般條件的課堂很難實(shí)現(xiàn)[8]。

        針對此問題,有些教師借助量子化學(xué)密度泛函方法來建立相關(guān)分子軌道模型的計(jì)算,并繪制相關(guān)分子軌道輪廓圖、能級圖或借助Orbital Viewer 軟件,進(jìn)行互動性課堂教學(xué);將學(xué)生較難理解的內(nèi)容定量、直觀地呈現(xiàn)出來。以此來激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)的主動性和積極性,從而達(dá)到提高教學(xué)質(zhì)量的目的[9-10]。

        2.Gaussian軟件輔助教學(xué)

        (1)原子軌道模型的Gaussian計(jì)算

        雖然最近研究中,有給出過g 軌道在Matlab 中的可視化,但前提是要知道原子軌道的具體表達(dá)式[11]。這些表達(dá)式往往較長,書寫代碼極不方便,很難處理更高角量子數(shù)的原子軌道。因此,在該教學(xué)研究中,將借助Gaussian、Gauss view 等軟件來解決這一問題;并一次性輸出s-i 軌道的角度分布函數(shù)圖。

        由于教學(xué)目的是畫出s-i 軌道角度分布圖;故只需保證Gaussian 計(jì)算結(jié)果的各個分子軌道與期望的原子軌道之間嚴(yán)格一一對應(yīng)即可。

        所以,在輸入文件中先使用自定義基組gen 關(guān)鍵詞將s-i 軌道表示出來。此時軌道初猜不可用程序默認(rèn)數(shù)據(jù),否則結(jié)果將把以上定義的各軌道混合到一起,無法區(qū)分。因此,需要用關(guān)鍵詞cards 指定初始猜測,具體可參見guess 關(guān)鍵詞中cards、save、only 等選項(xiàng)的使用。

        為實(shí)現(xiàn)分子軌道與所期望的原子軌道一對一,在指定初始猜測時,還需將每一行中除了期望得到的軌道,其余所有系數(shù)都指為0,目標(biāo)軌道系數(shù)指為1。由于s-i 共有49 個原子軌道,所以初始猜測系數(shù)將形成以上的[49×49 單位矩陣]。

        (2)Gauss view可視化處理

        將上述Gaussian 軟件計(jì)算產(chǎn)生的atom-orbital.chk 文件用Gauss view 軟件打開,與查看普通分子軌道一樣的操作,即可得到角量子數(shù)為s-i 的49 個原子軌道角度分布函數(shù)圖像。

        由于s-g 軌道圖像基本已比較熟悉[11],以下將列出11 個h 軌道和13 個i 軌道的角度分布函數(shù)圖;圖1為11 個h 軌道的角度分布函數(shù)圖。

        圖1 11 個h 原子軌道的角度分布函數(shù)圖

        圖2 為13 個i 軌道的角度分布函數(shù)圖。

        圖2 13 個i 原子軌道的角度分布函數(shù)圖

        由以上可知在s-i 軌道中,隨著角量子數(shù)的增加,圖像中的節(jié)面也越來越多,花瓣數(shù)也逐漸增加。如有涉及到的成鍵方式或雜化軌道,必然也更加復(fù)雜。整個計(jì)算、處理過程學(xué)生需要全程參與,如此一來,學(xué)生明白了原子軌道概念的同時,也知道了教材中軌道圖像的具體來源;勢必加深對原子結(jié)構(gòu)知識的理解,為以后學(xué)習(xí)化學(xué)打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        3.教學(xué)研究總結(jié)

        在對原子結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)知識教學(xué)中,充分利用化學(xué)史素材有助于提高課堂氣氛及學(xué)生對概念的理解,同時也有利于核心概念的轉(zhuǎn)換與提高。再者就是應(yīng)該重視對Bohr 原子結(jié)構(gòu)模型的講解,該模型初步引入了原子軌道半徑與能量的“量子化”及定態(tài)、基態(tài)、激發(fā)態(tài)等觀點(diǎn);為以后深入學(xué)習(xí)、理解化學(xué)基礎(chǔ)知識打下堅(jiān)定的基礎(chǔ)。其次,在化學(xué)基礎(chǔ)知識教學(xué)中,適當(dāng)使用化學(xué)模型也是一種提高學(xué)生科學(xué)素養(yǎng)及獨(dú)立思考的有效方法。

        在該教學(xué)中,我們有效使用了簡單、方便的Gaussian 與Gauss View 軟件作為輔助工具;通過建立正確的“化學(xué)模型”—原子軌道計(jì)算模型,讓學(xué)生親身體驗(yàn)原子軌道角度分布函數(shù)圖像的繪制,并且還給出了目前所有教材中都未曾介紹的高角量子數(shù)原子軌道,如h、i 軌道等;從而進(jìn)一步提高了學(xué)生對知識的理解,在提高學(xué)習(xí)成績的同時也鍛煉了學(xué)生的化學(xué)模型思維、數(shù)據(jù)處理能力及科學(xué)素養(yǎng)。

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