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        實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測(cè)鼠源性成分的定性方法驗(yàn)證

        2024-05-06 12:44:08張從黨王均華王亞平張維益包靜云
        現(xiàn)代食品 2024年4期
        關(guān)鍵詞:源性探針特異性

        ◎ 張從黨,王均華,王亞平,張維益,包靜云

        (江陰市食品安全檢測(cè)中心,江蘇 無錫 214400)

        隨著生活質(zhì)量的不斷提升,人們對(duì)優(yōu)質(zhì)肉類及產(chǎn)品的需求逐年上升。然而,僅通過肉眼觀察難以分辨各類肉質(zhì)的好壞[1-2],一些經(jīng)營(yíng)者為牟取暴利,采取摻雜低廉肉品、注膠注水等手段,嚴(yán)重影響了食品安全[3-5]。鼠肉價(jià)格低廉,通常是不法商家的首選。然而,鼠肉攜帶多種病菌,含鉛、砷等有毒有害物質(zhì)較高,食用后會(huì)對(duì)人類健康造成嚴(yán)重危害,并增加疫病傳播風(fēng)險(xiǎn)[5]。因此,對(duì)肉類及其制品中鼠源性成分的檢測(cè),是保障食品安全的重要環(huán)節(jié)[6]。對(duì)于鼠源性成分的檢測(cè)方法,目前國(guó)內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)主要有GB/T 38164—2019《常見畜禽動(dòng)物源性成分檢測(cè)方法 實(shí)時(shí)熒光PCR 法》和BJS 201904 《食品中多種動(dòng)物源性成分檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光PCR 法》[7-8]。

        本研究旨在驗(yàn)證GB/T 38164—2019《常見畜禽動(dòng)物源性成分檢測(cè)方法 實(shí)時(shí)熒光PCR 法》在肉類食品中鼠源性成分檢測(cè)上的適用性,并將其與其他鼠源成分PCR 鑒定方法進(jìn)行對(duì)比,以提供肉類摻假鑒別的方法依據(jù)和技術(shù)支撐。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        本次實(shí)驗(yàn)所用鼠DNA 樣品分別來自:1 號(hào)鼠DNA樣品由中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院饋贈(zèng)(褐家鼠);2 號(hào)鼠DNA 樣品由南京市食品藥品監(jiān)督檢驗(yàn)院饋贈(zèng)(Balb/c 小鼠)。小家鼠新鮮組織樣本由本實(shí)驗(yàn)采購(gòu)。

        1.2 儀器與試劑

        ①儀器:熒光定量PCR 儀(CFX-96,BIORAD,美國(guó)),紫外分光光度計(jì)(SHIMADZU) ;Dneasy mericon 食物核酸提取試劑盒(QIAGEN,德國(guó))。②試劑:鼠種特異性基因測(cè)定試劑盒(熒光 PCR 法,北京良潤(rùn));TaKaRa Taqman Real Time PCR 預(yù)混液(日本TAKARA 公司);引物與熒光探針均由南京金斯瑞生物科技公司完成。

        1.3 樣本處理及總 DNA 提取

        生鮮肉組織用滅菌水進(jìn)行簡(jiǎn)單沖洗,稱取適量樣品,并使用組織研磨儀進(jìn)行研磨。采用離心柱型Dneasy mericon 食物核酸提取試劑盒,按照說明書操作,提取200 mg 肉制品中的總DNA,并命名為3 號(hào)鼠。

        1.4 引物和探針

        分別依據(jù)標(biāo)準(zhǔn)GB/T 38164—2019《常見畜禽動(dòng)物源性成分檢測(cè)方法 實(shí)時(shí)熒光PCR法》、BJS 201904《食品中多種動(dòng)物源性成分檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光PCR 法》合成鼠成分熒光PCR 檢測(cè)相應(yīng)的引物及探針,序列見表1。

        表1 引物探針序列表

        1.5 有效性實(shí)驗(yàn)

        根據(jù)GB/T 38164—2019 的實(shí)驗(yàn)方法,以3 號(hào)鼠的DNA 為模板,使用GBT 引物和探針進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,以評(píng)價(jià)國(guó)標(biāo)方法的有效性。PCR 反應(yīng)體系如下:DNA模板2 μL(濃度為50 ng·μL-1),引物GBT 鼠-F/GBT 鼠-R 和 探針GBT 鼠-P 各1 μL,2×Premix Ex Taq 12.5 μL,滅菌雙蒸水補(bǔ)足至25 μL。PCR 擴(kuò)增條件分別為:95 ℃、30 s;95 ℃、5s;62 ℃、40 s,共40 個(gè)循環(huán),在62 ℃時(shí),采集熒光信號(hào)。

        1.6 對(duì)比實(shí)驗(yàn)

        根據(jù)BJS 201904《食品中多種動(dòng)物源性成分檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光PCR 法》,以及鼠種特異性實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測(cè)試劑盒的實(shí)驗(yàn)方法,以3 號(hào)鼠DNA 為模板,進(jìn)行相應(yīng)的熒光PCR 擴(kuò)增。通過對(duì)比2 種方法的擴(kuò)增曲線和Ct 值,評(píng)估GB/T 38164—2019 方法的特異性。BJS 201904 方法使用BJS 引物和探針進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,除了反應(yīng)退火溫度和時(shí)間外,PCR 反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件與步驟1.6 相同。試劑盒的熒光PCR 反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件,按照試劑盒說明書進(jìn)行操作。

        1.7 溫度梯度實(shí)驗(yàn)

        根據(jù)GB/T 38164—2019 實(shí)驗(yàn)方法,以3 號(hào)鼠DNA為模板進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。為了分析不同退火溫度對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,本研究設(shè)置了6 種不同的退火溫度。除了退火溫度不同外,PCR 反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件與步驟1.6相同。

        1.8 適用性評(píng)估實(shí)驗(yàn)

        根據(jù)GB/T 38164—2019 實(shí)驗(yàn)方法,分別以1 號(hào)鼠、2 號(hào)鼠和3 號(hào)鼠的DNA 為模板,使用GBT 引物和探針進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,以評(píng)估國(guó)標(biāo)方法在檢測(cè)不同鼠源性成分上的局限性。PCR 反應(yīng)體系和擴(kuò)增條件與步驟1.6相同。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 有效性實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        根據(jù)GB/T 38164—2019 的實(shí)驗(yàn)方法,以3 號(hào)鼠的DNA 為模板,使用GBT 引物和探針進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)果見圖1。從結(jié)果可知,GBT 引物和探針對(duì)目標(biāo)基因無明顯的特異性擴(kuò)增曲線,說明GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)中的引物探針不具有良好的物種特異性,不適用于小鼠物種的鑒別。

        圖1 3 號(hào)鼠成分?jǐn)U增曲線圖

        2.2 對(duì)比實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        分別用BJS 引物和探針及商品化的鼠源特異性PCR 試劑盒對(duì)3 號(hào)鼠DNA 進(jìn)行熒光PCR 擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)果見圖2、圖3。結(jié)果顯示,BJS 引物和探針以及商業(yè)化的試劑盒,均出現(xiàn)了特異性的擴(kuò)增曲線,進(jìn)一步確認(rèn)了實(shí)驗(yàn)室自提的3 號(hào)鼠樣本中存在鼠成分。由此說明,GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)中的鼠引物及探針,不具有良好的物種特異性,不適用于小鼠物種的鑒別。

        圖2 BJS 201904 方法檢測(cè)3 號(hào)鼠熒光PCR 的擴(kuò)增曲線圖

        圖3 商品化試劑盒檢測(cè)3 號(hào)鼠熒光PCR 的擴(kuò)增曲線圖

        2.3 溫度梯度實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        根據(jù)GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)方法設(shè)置6 種退火溫度,分別為54、56、58、60、62、64 ℃,進(jìn)行熒光PCR 擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)果見圖4。從結(jié)果可知,退火溫度在54、56、58 ℃時(shí),均有出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,高于58 ℃以后,就沒有明顯的擴(kuò)增曲線。盡管如此,根據(jù)GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)要求,鼠的熒光PCR 退火溫度應(yīng)為62 ℃。

        圖4 不同退火溫度對(duì)PCR 結(jié)果的影響圖

        2.4 適用性評(píng)估實(shí)驗(yàn)

        采用GBT 引物和探針,根據(jù)GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定的鼠退火溫度,對(duì)1 號(hào)鼠、2 號(hào)鼠和3 號(hào)鼠的DNA 進(jìn)行熒光PCR 擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)果如圖5 所示。分析結(jié)果表明,僅有1 號(hào)鼠表現(xiàn)出特異性擴(kuò)增曲線,2 號(hào)鼠和3 號(hào)鼠的DNA 未出現(xiàn)特異性擴(kuò)增曲線,說明GB/T 38164—2019 標(biāo)準(zhǔn)中的鼠引物探針不具有良好的物種特異性,僅對(duì)大鼠有特異性擴(kuò)增,不適用于小鼠物種的鑒別。

        圖5 不同鼠源性樣本的熒光PCR 結(jié)果圖

        3 結(jié)論

        本研究旨在驗(yàn)證GB/T 38164—2019《常見畜禽動(dòng)物源性成分檢測(cè)方法 實(shí)時(shí)熒光PCR 法》,并評(píng)估其在肉類食品鼠源性成分檢測(cè)中的適用性。通過對(duì)不同來源的鼠樣品進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測(cè),并結(jié)合其他實(shí)驗(yàn)方法,本研究證實(shí)了該方法能夠準(zhǔn)確檢測(cè)肉類食品中的大鼠成分。但驗(yàn)證結(jié)果亦表明,該方法在檢測(cè)不同鼠源性成分上存在局限性,僅能檢測(cè)大鼠成分,不適用小鼠成分的檢測(cè),從而限制了其通用性。

        此外,本研究也存在一定局限性。例如,鼠類樣本種類較少,未涉及豚鼠、竹鼠、海貍鼠等常見鼠類動(dòng)物的驗(yàn)證。因此,為提高鼠類成分實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測(cè)方法的通用性,未來的研究應(yīng)進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量,分析不同鼠類間的基因多態(tài)性差異,設(shè)計(jì)適用于鼠類的通用引物和探針,并優(yōu)化反應(yīng)條件,以同時(shí)覆蓋其他常見鼠類品種的熒光PCR 檢測(cè)。

        總之,本研究為相關(guān)檢測(cè)機(jī)構(gòu)提供了驗(yàn)證方法的借鑒,并為肉類食品中鼠源性成分的熒光PCR 檢測(cè)提供了有益參考。未來,隨著實(shí)驗(yàn)方法的不斷完善和優(yōu)化,實(shí)時(shí)熒光PCR 技術(shù)將在肉類食品中鼠源性成分檢測(cè)方面展現(xiàn)更加廣闊的應(yīng)用前景。

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