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        N6-甲基腺苷修飾在腫瘤程序性細(xì)胞死亡中的作用*

        2024-04-24 02:03:40談元郡王霞黃靜綜述張百紅審校
        中國(guó)腫瘤臨床 2024年2期

        談元郡 王霞 黃靜 綜述 張百紅 審校

        腫瘤細(xì)胞的關(guān)鍵特征之一為非突變表觀遺傳重編程,是動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性的驅(qū)動(dòng)力。在人類腫瘤中,表觀遺傳學(xué)改變?nèi)鏒NA 甲基化、組蛋白修飾、RNA修飾、微小RNA 和核小體重塑等均控制機(jī)體關(guān)鍵基因及蛋白表達(dá),調(diào)節(jié)機(jī)體的生理或病理過(guò)程。N6-甲基腺苷修飾(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物體內(nèi)最豐富的轉(zhuǎn)錄后表觀遺傳修飾方式,mRNA 在m6A甲基轉(zhuǎn)移酶作用下發(fā)生腺苷酸第六位N 原子甲基化,甲基化腺苷也可在m6A 去甲基化酶作用下還原為腺苷,m6A 結(jié)合蛋白識(shí)別經(jīng)m6A 修飾的mRNA 并調(diào)節(jié)mRNA 的可變性剪接、衰變和翻譯等,進(jìn)而調(diào)節(jié)機(jī)體一系列生理及病理過(guò)程。

        抵抗程序性細(xì)胞死亡是腫瘤另一關(guān)鍵特征,抵抗程序性細(xì)胞死亡使得腫瘤細(xì)胞獲得持續(xù)惡性增殖的能力。不同于物理、化學(xué)或生物損傷導(dǎo)致的非程序性細(xì)胞壞死,程序性細(xì)胞死亡依賴于復(fù)雜的分子調(diào)控機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),m6A 修飾參與凋亡、自噬、焦亡、鐵死亡、壞死性凋亡、銅死亡等腫瘤程序性細(xì)胞死亡形式的調(diào)節(jié)。本文就m6A 修飾對(duì)常見(jiàn)的腫瘤程序性細(xì)胞死亡方式的調(diào)節(jié)進(jìn)行闡述。了解腫瘤細(xì)胞程序性死亡的調(diào)節(jié)機(jī)制有助于進(jìn)一步闡明腫瘤進(jìn)展的機(jī)制,也可為臨床腫瘤治療提供新的策略。

        1 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞凋亡

        凋亡是細(xì)胞在接觸生理性或病理性刺激后為維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定而發(fā)生的程序性細(xì)胞死亡過(guò)程,主要是由內(nèi)在線粒體外膜透化啟動(dòng)或外在細(xì)胞表面死亡受體與其死亡誘導(dǎo)配體結(jié)合激活caspase 蛋白酶觸發(fā)。目前研究表明m6A 修飾通過(guò)抑制或促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡在腫瘤細(xì)胞凋亡調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮雙重作用。

        1.1 抑制腫瘤細(xì)胞凋亡

        Wang 等[1]發(fā)現(xiàn)m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶甲基轉(zhuǎn)移酶樣3(methyltransferase-like protein 3,METTL3)介導(dǎo)胃癌細(xì)胞中長(zhǎng)鏈非編碼RNA ABL 的m6A 修飾,維持ABL穩(wěn)定性。ABL 與凋亡蛋白酶激活因子1 的WD1/WD2結(jié)構(gòu)域結(jié)合競(jìng)爭(zhēng)性地阻止細(xì)胞色素C 與凋亡蛋白酶激活因子1 的相互作用,阻斷細(xì)胞凋亡體的組裝和caspase 3/9 的激活,抑制腫瘤細(xì)胞凋亡。m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶RNA 結(jié)合基序蛋白15(RNA binding motif protein 15,RBM15)介導(dǎo)的m6A 修飾上調(diào)宮頸癌中OTU 結(jié)構(gòu)域的泛素醛結(jié)合蛋白2(OTU domain-containing ubiquitin aldehyde-binding protein 2,OTUB2)表達(dá),高表達(dá)的OTUB2 通過(guò)刺激AKT/mTOR 信號(hào)通路抑制腫瘤細(xì)胞凋亡[2]。m6A 去甲基化酶脂肪量和肥胖相關(guān)蛋白(fat mass and obesity-associated protein,F(xiàn)TO)介導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞中Bcl-2 家族促凋亡蛋白Bcl-2/腺病毒E1B19kD 相互作用蛋白3(Bcl-2/adenovirus E1B-19 kDa-interacting protein 3,BNIP3)mRNA的m6A 甲基化腺苷去甲基化,并誘導(dǎo)BNIP3 mRNA降解,下調(diào)BNIP3 的表達(dá)進(jìn)而抑制腫瘤細(xì)胞凋亡[3]。FTO 介導(dǎo)的m6A 去甲基化降低結(jié)直腸癌中凋亡誘導(dǎo)因子SIVA1 的表達(dá),下調(diào)SIVA1 對(duì)caspase3 的激活作用,進(jìn)而抑制腫瘤細(xì)胞凋亡,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[4]。m6A去甲基化酶AlkB 同源蛋白5(Alk B homologue 5,ALKBH5)介導(dǎo)的m6A 去甲基化增強(qiáng)了食管鱗狀細(xì)胞癌中長(zhǎng)鏈非編碼RNA CASC8 轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性,上調(diào)CASC8 表達(dá),高表達(dá)的CASC8 與核不均一核糖核蛋白L(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L,HNRNPL)相互作用激活Bcl-2/caspase3 通路,抑制腫瘤細(xì)胞凋亡,促進(jìn)食管鱗狀細(xì)胞癌進(jìn)展[5]。在急性髓系白血病中ALKBH5 介導(dǎo)的去甲基化降低了mTOR 相關(guān)蛋白MLS8/真核翻譯起始因子4E 結(jié)合蛋白1(eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1,EIF4EBP1)mRNA 的m6A 修飾水平,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄本穩(wěn)定性下降,下調(diào)caspase3/7 活性,抑制腫瘤細(xì)胞凋亡[6]。逆轉(zhuǎn)凋亡抑制信號(hào)的異常m6A 修飾可促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡,抑制腫瘤進(jìn)展。Zhang 等[7]發(fā)現(xiàn)龍膽草75%的乙醇提取物通過(guò)下調(diào)METTL3 的表達(dá)降低METTL3與抗凋亡蛋白Survivin mRNA 的結(jié)合率,抑制Survivin mRNA 中的m6A 修飾,下調(diào)抗凋亡蛋白Survivin 的表達(dá),進(jìn)而誘導(dǎo)caspase3 和Poly 聚合酶等凋亡執(zhí)行蛋白的裂解激活,誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡。此外,也有研究發(fā)現(xiàn)二甲雙胍可通過(guò)抑制多發(fā)骨髓瘤中METTL3 介導(dǎo)的m6A 修飾來(lái)抑制USP4 的表達(dá),從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡,阻礙細(xì)胞惡性增殖[8]。

        1.2 促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡

        Li 等[9]發(fā)現(xiàn)METTL3 介導(dǎo)膀胱癌中長(zhǎng)鏈非編碼RNA LNPPS 的m6A 修飾,增加LNPPS 的穩(wěn)定性,上調(diào)其表達(dá),高表達(dá)的LNPPS 作為膀胱癌中凋亡促進(jìn)信號(hào)PDCD5 和P53 的支架,阻斷PDCD5 K20 位點(diǎn)泛素化并破壞雙微體2 介導(dǎo)的P53 泛素化,增強(qiáng)與P53 相關(guān)的細(xì)胞凋亡信號(hào),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡。雌激素受體陽(yáng)性HER2 陰性乳腺癌細(xì)胞中METTL3 以m6A 依賴性方式促進(jìn)caspase 蛋白酶的上游因子BAX 表達(dá),進(jìn)而上調(diào)caspase 家族活性,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡[10]。三陰性乳腺癌中YT521-B 同源性域家族2(YT521-B homology domain family proteins 2,YTHDF2)與絲裂原活化蛋白激酶MAPK 途徑中編碼蛋白的mRNA 相互作用穩(wěn)定MAPK 途徑中的靶標(biāo)mRNA,促進(jìn)未折疊蛋白積累,進(jìn)而引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡[11]。ALKBH5 通過(guò)降低胰腺癌中CUGBP Elav 樣家族成員2(CUGBP Elav-like family member 2,CELF2)的m6A 修飾水平上調(diào)CELF2 的表達(dá),進(jìn)而抑制Bcl-2 家族抗凋亡蛋白Mcl-1 表達(dá),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡,抑制胰腺癌惡性進(jìn)展[12]。逆轉(zhuǎn)凋亡促進(jìn)信號(hào)的異常m6A 修飾也可促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡,抑制腫瘤進(jìn)展。Zhang 等[6]發(fā)現(xiàn)生物活性肽通過(guò)下調(diào)ALKBH5 抑制mTOR 相關(guān)蛋白MLS8/EIF4EBP1 mRNA的m6A 去甲基化,促進(jìn)EIF4EBP1 表達(dá)及其促凋亡活性發(fā)揮抗腫瘤作用(表1)。

        表1 腫瘤細(xì)胞凋亡中的m6A 甲基化調(diào)控

        2 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞自噬

        自噬是一種細(xì)胞內(nèi)自我降解機(jī)制,在腫瘤發(fā)展的不同階段起著動(dòng)態(tài)的腫瘤抑制或促進(jìn)作用。早期腫瘤細(xì)胞自噬可清除受損的蛋白質(zhì)和細(xì)胞器,維持基因組的穩(wěn)定性,抑制腫瘤進(jìn)展。中晚期的腫瘤細(xì)胞因受到環(huán)境壓力的影響,將自噬作為一種細(xì)胞保護(hù)機(jī)制,以維持腫瘤細(xì)胞線粒體的功能,減少DNA 損傷,提高腫瘤細(xì)胞的存活率和抗應(yīng)激(如營(yíng)養(yǎng)剝奪、缺氧等)能力,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展。機(jī)體對(duì)細(xì)胞自噬的調(diào)控涉及多種自噬相關(guān)蛋白和通路,研究表明,m6A 甲基化修飾介導(dǎo)這些關(guān)鍵蛋白和信號(hào)通路傳導(dǎo)因子的異常表達(dá)在腫瘤細(xì)胞自噬中發(fā)揮重要作用。

        2.1 抑制腫瘤細(xì)胞自噬

        2.1.1 抑制mTOR 通路依賴性腫瘤細(xì)胞自噬 自噬分為自噬啟動(dòng)、自噬膜延伸和自噬溶酶體形成三個(gè)過(guò)程。自噬啟動(dòng)的標(biāo)志是自噬體的形成,啟動(dòng)過(guò)程依賴于UNC-5 類似自噬激活激酶(UNC-5 like autophagy activating kinase,ULK)復(fù)合物,ULK 復(fù)合物上游信號(hào)通路主要涉及mTOR 依賴性途徑和非mTOR 依賴性途徑。mTOR 通過(guò)磷酸化包括自噬相關(guān)蛋白13(autophagy-related 13,ATG13)和ULK1/2 在內(nèi)的復(fù)合物成分,抑制ULK 復(fù)合物介導(dǎo)的自噬啟動(dòng)過(guò)程。此外,mTOR 也可通過(guò)抑制Beclin1 調(diào)節(jié)因子1 的磷酸化抑制ULK 穩(wěn)定性。m6A 修飾通過(guò)調(diào)節(jié)mTOR 介導(dǎo)的自噬抑制信號(hào)促進(jìn)多種腫瘤進(jìn)展。非小細(xì)胞肺癌中ALKBH5 的上調(diào)使癌基因泛素結(jié)合酶E2C(ubiquitinconjugating enzyme E2C,UBE2C)mRNA 維持在較低的m6A 修飾水平,增加了UBE2C mRNA 的穩(wěn)定性,上調(diào)UBE2C 在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá),高表達(dá)的UBE2C 促進(jìn)含DEP 結(jié)構(gòu)域的mTOR 相互作用蛋白DEPTOR 的泛素化和降解,從而促進(jìn)mTOR 信號(hào)的激活,進(jìn)而選擇性抑制非小細(xì)胞肺癌自噬,誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞侵襲性生長(zhǎng)[13]。上皮性卵巢癌組織中過(guò)表達(dá)的ALKBH5 介導(dǎo)的m6A 修飾去甲基化激活EGFR/PIK3CA/AKT/mTOR 信號(hào)通路抑制上皮性卵巢癌細(xì)胞自噬,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖[14]。m6A 識(shí)別蛋白胰島素樣生長(zhǎng)因子2 信使RNA 結(jié)合蛋白3(insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 3,IGF2BP3)結(jié)合喉鱗狀細(xì)胞癌中經(jīng)m6A 修飾的機(jī)械翻譯相關(guān)蛋白同源物7(translation machinery associated 7 homolog,TMA7)并促進(jìn)TMA7 的表達(dá),TMA7 上調(diào)通過(guò)激活P13K/mTOR 通路抑制腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)喉鱗狀細(xì)胞癌進(jìn)展[15]。此外,METTL3 以m6A 依賴性方式促進(jìn)急性髓系白血病長(zhǎng)鏈非編碼RNA PSMA3 反義RNA1 表達(dá),進(jìn)而激活mTOR 信號(hào)上游P13K/AKT 通路,抑制腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)急性髓系白血病進(jìn)展;介導(dǎo)慢性粒細(xì)胞白血病中PTEN mRNA 的m6A 修飾,降低PTEN穩(wěn)定性,增加mTOR 上游信號(hào)通路P13K/AKT 活性,抑制腫瘤細(xì)胞自噬并促進(jìn)慢性粒細(xì)胞白血病進(jìn)展[16]。

        2.1.2 抑制非mTOR 通路依賴性腫瘤細(xì)胞自噬 近年研究發(fā)現(xiàn)m6A 修飾不僅參與了mTOR 通路依賴性自噬抑制信號(hào),在獨(dú)立于mTOR 通路的自噬抑制信號(hào)中同樣發(fā)揮作用。m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶Wilms 瘤1-相關(guān)蛋白(Wilms' tumor 1-associating protein,WTAP)在肝細(xì)胞癌中介導(dǎo)的m6A 修飾降低肝激酶基因B1(liver kinase B1,LKB1)mRNA 的穩(wěn)定性,下調(diào)LKB1 表達(dá),抑制AMP 活化蛋白激酶磷酸化水平進(jìn)而下調(diào)肝細(xì)胞癌的AMP 激活蛋白激酶信號(hào)傳導(dǎo),抑制腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)肝細(xì)胞癌進(jìn)展[17]。FTO 介導(dǎo)的m6A 修飾去甲基化在口腔鱗狀細(xì)胞癌中通過(guò)靶向真核翻譯起始因子4G1(eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1,eIF4G1)的轉(zhuǎn)錄本,上調(diào)eIF4G1 表達(dá),抑制腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)口腔鱗狀細(xì)胞癌進(jìn)展。敲低口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞系中FTO 的表達(dá)后eIF4G1 下調(diào),腫瘤細(xì)胞自噬通量增強(qiáng)[18]。乳腺癌細(xì)胞中,eIF4G1 表達(dá)也因FTO 的m6A 去甲基化酶活性上調(diào),高表達(dá)的eIF4G1 抑制了乳腺癌細(xì)胞自噬,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[19]。鹽誘導(dǎo)激酶2(salt-inducible kinase 2,SIK2)屬于AMP 激活蛋白激酶家族成員,通過(guò)磷酸化Ser317 和Ser777 直接激活ULK1,促進(jìn)自噬體加工成熟,F(xiàn)TO 通過(guò)m6A 依賴性方式降低腎透明細(xì)胞癌中SIK2 mRNA 的穩(wěn)定性,抑制腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[20]。此外,m6A 結(jié)合蛋白核不均一核糖核蛋白A2/B1(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2-B1,HNRNPA2B1)通過(guò)識(shí)別下游自噬相關(guān)蛋白ATG4B 轉(zhuǎn)錄本3’UTR 中的m6A 位點(diǎn)促進(jìn)ATG4B m-RNA 衰變,繼而下調(diào)乳腺癌細(xì)胞系的自噬通量,促進(jìn)惡性細(xì)胞增殖[21]。

        2.2 促進(jìn)腫瘤細(xì)胞自噬

        2.2.1 促進(jìn)mTOR 通路依賴性腫瘤細(xì)胞自噬 DNA損傷誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子4(DNA damage inducible transcript 4,DDIT4)通過(guò)激活TSC1/2 復(fù)合物抑制mTOR 信號(hào)通路激活自噬,ALKBH5 介導(dǎo)頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中DDIT4 的m6A 修飾去甲基化,降低DDIT4 轉(zhuǎn)錄本m6A 水平并提高DDIT4 mRNA 的穩(wěn)定性,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞自噬,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[22]。FTO 介導(dǎo)結(jié)直腸癌中轉(zhuǎn)錄激活因子4(activating transcription factor 4,ATF4)mRNA 的m6A 去甲基化,降低ATF4 轉(zhuǎn)錄本的m6A 修飾水平,阻止ATF4 在結(jié)腸癌細(xì)胞中的降解延長(zhǎng)半衰期,高表達(dá)的ATF4 激活DDIT4 的轉(zhuǎn)錄使mTOR 信號(hào)失活,誘導(dǎo)利于腫瘤細(xì)胞生存的自噬過(guò)程,促進(jìn)腫瘤惡性進(jìn)展[23]。

        2.2.2 促進(jìn)非mTOR 通路依賴性腫瘤細(xì)胞自噬 RB1-誘導(dǎo)卷曲蛋白1(RB1-inducible coiled-coil 1,RB1CC1)和ULK1 為自噬啟動(dòng)復(fù)合物的組成亞基,METTL14以m6A 依賴性方式促進(jìn)口腔鱗狀細(xì)胞癌自噬相關(guān)基因RB1CC1 的表達(dá),促進(jìn)自噬溶酶體形成,提高自噬通量,抑制口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞增殖[24]。METTL3 以m6A 依賴性方式增強(qiáng)泛素特異性肽酶13(ubiquitin specific protease,USP13)mRNA 的穩(wěn)定性,USP13 通過(guò)去泛素化穩(wěn)定ATG5,進(jìn)而促進(jìn)胃腸道間質(zhì)瘤細(xì)胞自噬以及腫瘤細(xì)胞對(duì)伊馬替尼的抗性,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[25]。非小細(xì)胞肺癌中高表達(dá)的FTO 通過(guò)降低生長(zhǎng)停滯特異性轉(zhuǎn)錄本5(growth arrest-specific transcript 5,GAS5)m6A 甲基化水平抑制GAS5 的表達(dá),促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌的自噬性死亡,抑制腫瘤進(jìn)展[26]。順鉑耐藥胃癌細(xì)胞中FTO 介導(dǎo)的m6A 去甲基化上調(diào)順鉑耐藥胃癌細(xì)胞中ULK1 的表達(dá),ULK1 通過(guò)募集其他自噬相關(guān)蛋白啟動(dòng)自噬體形成,促進(jìn)細(xì)胞自噬及自噬誘導(dǎo)的順鉑耐藥,F(xiàn)TO 敲低后ULK1 mRNA 水平顯著下調(diào),F(xiàn)TO 沉默可以通過(guò)滅活體內(nèi)ULK1 依賴性自噬來(lái)增加胃癌細(xì)胞對(duì)順鉑的敏感性[27]。缺氧誘導(dǎo)因子-1α 在缺氧狀態(tài)下通過(guò)直接結(jié)合m6A 結(jié)合蛋白YTH家族蛋白1(YTH domain family protein 1,YTHDF1)啟動(dòng)子區(qū)域調(diào)節(jié)YTHDF1 轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而促進(jìn)YTHDF1與m6A 修飾的ATG2A 和ATG14 mRNA 結(jié)合,促進(jìn)ATG2A 和ATG14 的翻譯繼而促進(jìn)肝細(xì)胞癌缺氧誘導(dǎo)的自噬,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[28](表2)。

        表2 腫瘤細(xì)胞自噬中的m6A 甲基化調(diào)控

        3 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞焦亡

        焦亡是一種新發(fā)現(xiàn)的程序性細(xì)胞死亡形式,Nod樣受體蛋白3(Nod-like receptor protein 3,NLRP3)等炎性小體的激活誘導(dǎo)caspase1 裂解并分離Gasdermin D(GSDMD)的N 端和C 端以觸發(fā)經(jīng)典的焦亡途徑。此外,caspase4/5/11 也可通過(guò)非炎性小體途徑直接識(shí)別細(xì)胞內(nèi)LPS 受體并與之結(jié)合介導(dǎo)GSDMD 切割,誘導(dǎo)細(xì)胞焦亡。焦亡在腫瘤發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮雙重作用,腫瘤中央缺氧區(qū)腫瘤細(xì)胞焦亡引起的慢性腫瘤細(xì)胞壞死抑制了機(jī)體抗腫瘤免疫,加速腫瘤進(jìn)展,而腫瘤微環(huán)境中細(xì)胞焦亡誘導(dǎo)的急性炎癥增強(qiáng)免疫反應(yīng)并抑制腫瘤的進(jìn)展。目前研究表明m6A 修飾參與了腫瘤細(xì)胞經(jīng)典焦亡途徑(表3)。在下咽鱗狀細(xì)胞癌中METTL3 介導(dǎo)環(huán)狀RNACUX1 的m6A 修飾并穩(wěn)定其表達(dá),環(huán)狀RNACUX1 與caspase1 結(jié)合并抑制其表達(dá),抑制經(jīng)典焦亡途徑,誘導(dǎo)了腫瘤細(xì)胞對(duì)放療的耐受性[29]。在非小細(xì)胞肺癌中METTL3 以m6A/YTHDF2依賴性轉(zhuǎn)錄后修飾方式調(diào)控NLRP3 的m6A 水平,從而抑制NLRP3 的表達(dá),抑制NLRP3/caspase1/GSDMD相關(guān)經(jīng)典細(xì)胞焦亡信號(hào)通路的激活,這一過(guò)程賦予了肺癌抗細(xì)胞焦亡表型并促進(jìn)酪氨酸激酶抑制劑耐藥[30]。

        表3 腫瘤細(xì)胞焦亡中的m6A 甲基化調(diào)控

        4 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞鐵死亡

        鐵死亡(ferroptosis)是一種鐵依賴性程序性細(xì)胞死亡調(diào)控形式,細(xì)胞內(nèi)鐵依賴性的脂質(zhì)過(guò)氧化物的堆積誘導(dǎo)細(xì)胞質(zhì)內(nèi)的ROS 聚集進(jìn)而誘導(dǎo)細(xì)胞鐵死亡。目前已知的鐵死亡抑制途徑包括細(xì)胞內(nèi)谷胱甘肽過(guò)氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)-GSH 系統(tǒng)、鐵死亡抑制蛋白1(ferroptosis suppressor protein,F(xiàn)SP1)-CoQ10 系統(tǒng)、二氫乳清酸脫氫酶(dihydroorotate dehydrogenase,DHODH)-CoQH2 系統(tǒng)和GTP 環(huán)化酶1(GTP cyclohydrolase 1,GCH1)-四氫生物蝶呤(tetrahydrobiopterin,BH4)系統(tǒng)。研究表明m6A 修飾通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)抑制鐵死亡的GPX4-GSH 系統(tǒng)、FSP1-CoQ10 系統(tǒng)及其他鐵死亡抑制信號(hào)活性參與腫瘤細(xì)胞鐵死亡過(guò)程(表4)。

        表4 腫瘤細(xì)胞鐵死亡中的m6A 甲基化調(diào)控

        4.1 抑制腫瘤細(xì)胞鐵死亡

        4.1.1 調(diào)節(jié)GPX4-GSH 系統(tǒng)抑制鐵死亡 GPX4 和細(xì)胞膜上的胱氨酸/谷氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)受體(SystemXc-)通過(guò)影響脂質(zhì)和ROS 代謝抑制鐵死亡過(guò)程,溶質(zhì)運(yùn)載家族7 成員11(solute carrier family 7 member 11,SLC7-A11)作為谷胱甘肽生物合成的胱氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)體通過(guò)GPX4-GSH 系統(tǒng)參與鐵死亡抑制。在肺腺癌、肝母細(xì)胞瘤及膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中SLC7A11 是METTL3 的直接靶標(biāo),METTL3 介導(dǎo)的m6A 修飾可穩(wěn)定SLC7A11 mRNA 并促進(jìn)其翻譯,進(jìn)而抑制腫瘤細(xì)胞鐵死亡并促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[31]。在甲狀腺癌中FTO 介導(dǎo)SLC7A11 的去甲基化,腫瘤細(xì)胞中低表達(dá)的FTO 增強(qiáng)了SLC7A11 mRNA 的m6A 修飾,刺激SLC7A11 的表觀遺傳激活,進(jìn)而抑制腫瘤細(xì)胞鐵死亡,在甲狀腺癌中上調(diào)FTO 可促進(jìn)甲狀腺癌中的鐵死亡并抑制甲狀腺癌的生長(zhǎng)[32]。此外,F(xiàn)TO 介導(dǎo)鼻咽癌中OTUB1 mRNA 的m6A 去甲基化,促進(jìn)OTUB1 表達(dá),OTUB1 通過(guò)穩(wěn)定SLC7A11 抑制輻射誘導(dǎo)的細(xì)胞鐵死亡,誘發(fā)鼻咽癌的輻射抗性[33]。

        4.1.2 調(diào)節(jié)FSP1-CoQ10 系統(tǒng)抑制鐵死亡 鐵死亡抑制蛋白(ferroptosis suppressor protein 1,F(xiàn)SP1)具有煙酰胺腺嘌呤二核苷酸-泛醌氧化還原活性,不僅能夠催化泛醌還原為泛醇來(lái)抑制脂質(zhì)過(guò)氧化,還能恢復(fù)維生素E 的抗氧化活性而終止脂質(zhì)過(guò)氧化反應(yīng),抑制鐵死亡。YTHDF2 以m6A 依賴性方式增加了肝細(xì)胞癌中鐵死亡相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA FAL 的剪接,上調(diào)肝細(xì)胞癌中FAL 表達(dá),F(xiàn)AL 通過(guò)直接與FSP1 結(jié)合競(jìng)爭(zhēng)性地消除三結(jié)構(gòu)域家族蛋白TRIM69 依賴性FSP1 多泛素化降解來(lái)降低鐵死亡的脆弱性[34]。非小細(xì)胞肺癌組織來(lái)源的外泌體miR-4 443 通過(guò)靶向抑制METTL3降低順鉑耐藥腫瘤細(xì)胞中FSP1 的m6A 甲基化水平,在mRNA 和蛋白質(zhì)水平上增強(qiáng)FSP1 的表達(dá),抑制順鉑誘導(dǎo)的鐵死亡,誘導(dǎo)非小細(xì)胞肺癌順鉑耐藥[35]。

        4.1.3 調(diào)節(jié)其他鐵死亡抑制信號(hào) 核因子E2 相關(guān)因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,NRF2)控制并調(diào)節(jié)谷胱甘肽合成酶、SLC7A11、GPX4、谷氨酸/半胱氨酸連接酶催化亞基以及谷氨酸/半胱氨酸連接酶調(diào)節(jié)亞基的表達(dá),是脂質(zhì)過(guò)氧化的關(guān)鍵抑制因子,NRF2 mRNA 的3’UTR 發(fā)生的m6A 修飾與mRNA的穩(wěn)定性密切相關(guān)。膠質(zhì)瘤中長(zhǎng)鏈非編碼RNA SNAI3-AS1 干擾m6A 閱讀蛋白葡萄球菌核酸酶樣結(jié)構(gòu)蛋白1(staphylococcal nuclease domain-containing 1,SND1)對(duì)NRF2 轉(zhuǎn)錄本3’UTR 的m6A 識(shí)別,降低NRF2 的mRNA 穩(wěn)定性,從而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的鐵死亡[36]。膀胱癌中WTAP 介導(dǎo)NRF2 mRNA 的m6A 甲基化修飾,經(jīng)YTHDF1 識(shí)別后增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄本穩(wěn)定性,抑制腫瘤細(xì)胞鐵死亡[37]。在甲狀腺癌中過(guò)表達(dá)ALKBH5 可通過(guò)降低T 淋巴瘤侵襲轉(zhuǎn)移誘導(dǎo)基因1(T lymphoma invasion and metastasis inducing factor 1,TIAM1)轉(zhuǎn)錄本的m6A 水平抑制TIAM1 的表達(dá),進(jìn)而抑制TIAM1通過(guò)調(diào)控下游NRF2/血紅素加氧酶1 軸誘導(dǎo)的腫瘤細(xì)胞鐵死亡過(guò)程[38]。

        5 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞壞死性凋亡

        壞死性凋亡,又稱細(xì)胞程序性壞死,是一種受調(diào)控的壞死類型,其信號(hào)級(jí)聯(lián)導(dǎo)致形成二硫鍵依賴性的混合系激酶結(jié)構(gòu)域樣蛋白淀粉樣聚合物,從而導(dǎo)致炎性細(xì)胞膜的破壞,激活炎性細(xì)胞死亡機(jī)制。m6A 修飾可調(diào)節(jié)機(jī)體細(xì)胞壞死性凋亡過(guò)程,研究發(fā)現(xiàn)核不均一核糖核蛋白C(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C,HNRNPC)促進(jìn)ATF4 mRNA 的m6A 修飾,刺激甲狀腺濾泡上皮細(xì)胞的壞死性凋亡,進(jìn)而介導(dǎo)自身免疫性甲狀腺疾病的發(fā)生[39]。在腹主動(dòng)脈瘤中,METTL3/METTL14 復(fù)合物介導(dǎo)受體相互作用蛋白3(receptor interacting protein 3,RIP3)mRNA 的m6A修飾,經(jīng)m6A 修飾的RIP3 轉(zhuǎn)錄本與YTHDF3 結(jié)合后增加RIP3 蛋白表達(dá)水平,誘導(dǎo)血管平滑肌細(xì)胞壞死性凋亡[40]。目前研究證實(shí)壞死性凋亡信號(hào)在促進(jìn)腫瘤發(fā)展、腫瘤轉(zhuǎn)移等方面發(fā)揮重要作用且腫瘤細(xì)胞壞死性凋亡的激活可增強(qiáng)機(jī)體抗腫瘤免疫,m6A 修飾同樣參與腫瘤細(xì)胞壞死性凋亡過(guò)程。Lan 等[41]發(fā)現(xiàn)METTL3通過(guò)m6A 依賴性方式抑制執(zhí)行壞死性凋亡的關(guān)鍵亞基腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子5(tumor necrosis factor receptor-associated factor 5,TRAF5)介導(dǎo)體內(nèi)外結(jié)腸癌細(xì)胞的壞死性凋亡,進(jìn)而誘導(dǎo)結(jié)直腸癌細(xì)胞對(duì)奧沙利鉑的耐藥性。

        6 m6A 修飾與腫瘤細(xì)胞銅死亡

        銅死亡是一種新發(fā)現(xiàn)的由過(guò)量銅引發(fā)的程序性細(xì)胞死亡形式,該過(guò)程是由線粒體中Cu2+與脂?;鞍装邢蚪Y(jié)合,導(dǎo)致靶蛋白聚集,干擾線粒體呼吸鏈的正常運(yùn)行,最終誘導(dǎo)細(xì)胞死亡。銅死亡參與了腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的大部分機(jī)制,并調(diào)節(jié)腫瘤免疫逃逸。鐵氧還蛋白1(ferredoxin 1,F(xiàn)DX1)是蛋白脂?;纳嫌握{(diào)節(jié)因子,可以促進(jìn)二氫脂酰胺S-乙酰轉(zhuǎn)移酶和二氫硫代酰胺S-琥珀?;D(zhuǎn)移酶的脂質(zhì)?;?,是線粒體呼吸鏈的關(guān)鍵因素,F(xiàn)DX1 基因敲除導(dǎo)致蛋白質(zhì)脂?;耆珕适?,細(xì)胞銅死亡抗性明顯增強(qiáng)。研究發(fā)現(xiàn),C-MYC 可以靶向與YTHDF1 結(jié)合,促進(jìn)YTHDF1對(duì)FDX1 轉(zhuǎn)錄本m6A 甲基化的識(shí)別,上調(diào)FDX1 表達(dá),這與膠質(zhì)瘤細(xì)胞對(duì)銅死亡的敏感性高度相關(guān)。銅死亡相關(guān)基因SLC31A1 同樣參與銅死亡過(guò)程,目前被認(rèn)為是預(yù)測(cè)乳腺癌診斷、預(yù)后的治療反應(yīng)的潛在指標(biāo)。Lian 等[42]使用數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn)SLC31A1 的表達(dá)與YTHDF3、YTHDF2、RBM15 和YTHDF1 呈強(qiáng)正相關(guān),YTHDF3 可能通過(guò)m6A 依賴性方式上調(diào)SLC-31A1 表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)乳腺癌腦轉(zhuǎn)移,但該過(guò)程仍待進(jìn)一步研究證實(shí)。

        7 結(jié)語(yǔ)與展望

        隨著各類腫瘤發(fā)病率的上升,腫瘤治療一直是臨床發(fā)展的重點(diǎn)。隨著腫瘤基因譜的完善,腫瘤治療已從放化療發(fā)展到靶向治療、免疫治療和其他個(gè)性化的治療方法。早期腫瘤的治療方法主要是阻止腫瘤細(xì)胞的生物合成,降低其繁殖和轉(zhuǎn)移能力。隨著研究的深入,人們逐漸意識(shí)到促進(jìn)腫瘤細(xì)胞死亡也是治療腫瘤的可行的方法,并且與不受機(jī)體調(diào)控的意外細(xì)胞死亡相比,程序性細(xì)胞死亡可以通過(guò)藥物干預(yù)調(diào)節(jié)。目前已有誘導(dǎo)程序性細(xì)胞死亡的表觀遺傳調(diào)節(jié)劑應(yīng)用于臨床。Vorinostat(伏立諾他)是一種廣譜組蛋白去乙酰化酶抑制劑,可抑制關(guān)鍵自噬標(biāo)志物的去乙?;?,從而干擾腫瘤細(xì)胞自噬;Panobinostat(帕比司他)抑制組蛋白乙?;?,重建腫瘤細(xì)胞中的正常基因表達(dá)并有助于驅(qū)動(dòng)多種信號(hào)通路,包括誘導(dǎo)組蛋白乙酰化,促進(jìn)caspase3/7 活性、降低抗凋亡因子(Bcl-2、Bcl-XL)水平等促進(jìn)細(xì)胞凋亡的外在和內(nèi)在途徑。作為真核生物體內(nèi)最豐富的轉(zhuǎn)錄后表觀遺傳調(diào)控方式,m6A 修飾在腫瘤細(xì)胞凋亡、自噬、焦亡、鐵死亡、壞死性凋亡、銅死亡中發(fā)揮重要作用,通過(guò)調(diào)節(jié)m6A 修飾水平誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞死亡是潛在的腫瘤治療策略。

        根據(jù)程序性細(xì)胞死亡分子機(jī)制,除凋亡、自噬、焦亡、鐵死亡、壞死性凋亡、銅死亡外還有內(nèi)源性細(xì)胞死亡、網(wǎng)狀細(xì)胞死亡、PARP-1 依賴性細(xì)胞死亡、溶酶體依賴性細(xì)胞死亡、細(xì)胞內(nèi)堿化死亡、氧自由基誘導(dǎo)死亡等程序性細(xì)胞死亡方式。這些程序性細(xì)胞死亡方式同樣受表觀遺傳調(diào)控,例如:賴氨酸去甲基化酶6B介導(dǎo)DNA 損傷誘導(dǎo)的PARP-1 依賴性細(xì)胞死亡;組蛋白H3 賴氨酸27 特異性甲基轉(zhuǎn)移酶Zeste 增強(qiáng)子同源物2 介導(dǎo)巨噬細(xì)胞誘導(dǎo)的間皮瘤細(xì)胞氧自由基誘導(dǎo)死亡,但其與m6A 修飾的相互聯(lián)系仍待挖掘。進(jìn)一步探索m6A 修飾在誘導(dǎo)程序性細(xì)胞死亡中的作用機(jī)制,構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò),開(kāi)發(fā)針對(duì)異常m6A 修飾的表觀遺傳調(diào)節(jié)劑,進(jìn)而精準(zhǔn)調(diào)控腫瘤程序性細(xì)胞死亡途徑介導(dǎo)細(xì)胞死亡是腫瘤治療的潛在研究方向。

        本文無(wú)影響其科學(xué)性與可信度的經(jīng)濟(jì)利益沖突。

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