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        她為中國(guó)人“尋找祖先”

        2024-04-24 08:27:24尹潔
        時(shí)代郵刊 2024年7期
        關(guān)鍵詞:現(xiàn)代人基因組人類(lèi)

        ● 尹潔

        如果將地球歷史壓縮成24小時(shí),人類(lèi)直到倒數(shù)38秒才會(huì)出現(xiàn),人類(lèi)文明則是在最后0.1秒建立的。

        從誕生到有文明,人類(lèi)經(jīng)歷了怎樣的演化過(guò)程?遠(yuǎn)古人類(lèi)又是如何演變?yōu)榻裉旆植加诟鞔笾?、各地區(qū)的不同群體的?

        十多年前,中國(guó)在古遺傳學(xué)研究領(lǐng)域與西方發(fā)達(dá)國(guó)家還有很大的差距,尤其是在古DNA研究方面,幾乎是空白的。

        但現(xiàn)在,中國(guó)的科學(xué)家們已經(jīng)取得了許多突破性成果。付巧妹就是其中的代表之一。

        2024年3月8日,全國(guó)三八紅旗手標(biāo)兵付巧妹光榮入選2024年“最美巾幗奮斗者”。

        “考不上就找工作”

        作為中國(guó)科學(xué)院古脊椎動(dòng)物與古人類(lèi)研究所(簡(jiǎn)稱(chēng)中科院古脊椎所)研究員、脊椎動(dòng)物演化與人類(lèi)起源重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任、分子古生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室主任,付巧妹的學(xué)術(shù)道路頗有些戲劇性。

        她從小就對(duì)生物感興趣,但在西北大學(xué)讀本科時(shí),機(jī)緣巧合之下學(xué)的是文物保護(hù)技術(shù)專(zhuān)業(yè)。這是一個(gè)文理交叉的學(xué)科,以化學(xué)為主,同時(shí)也學(xué)考古、文物鑒定等方面的知識(shí)。本科畢業(yè)時(shí),付巧妹的成績(jī)?cè)究梢员Q斜拘?,但她放棄了,?jiān)定地報(bào)考了中科院,希望讀自己喜歡的生物相關(guān)專(zhuān)業(yè)?!爱?dāng)時(shí),我是抱著考不上就去找工作的想法?!备肚擅没貞?。抱著背水一戰(zhàn)的決心,她考了專(zhuān)業(yè)成績(jī)第一。

        兩年后,碩士生導(dǎo)師推薦她去德國(guó)進(jìn)修,起初并不是讀博士,而是一次為期半年的學(xué)術(shù)交流,也相當(dāng)于一次考核,讓德國(guó)專(zhuān)家衡量一下,這名中國(guó)學(xué)生是否適合從事古DNA領(lǐng)域的研究。

        德國(guó)導(dǎo)師是古DNA研究的開(kāi)創(chuàng)者之一,整個(gè)課題組都是世界頂級(jí)的。付巧妹一邊上課,一邊參加組內(nèi)討論和實(shí)驗(yàn)。

        剛開(kāi)始,她對(duì)同事們展示和討論的內(nèi)容感覺(jué)很吃力。

        “比如尼安德特人(已經(jīng)滅絕的古人類(lèi))基因組序列草圖,基本上是遺傳學(xué)的內(nèi)容,而我僅有文物保護(hù)技術(shù)和體質(zhì)人類(lèi)學(xué)背景,完全理解不了?!备肚擅没貞浾f(shuō):“當(dāng)時(shí)國(guó)內(nèi)的碩士生課程還沒(méi)讀完,在那半年里,我既要完成碩士畢業(yè)論文,又要接受德國(guó)導(dǎo)師的考核,壓力非常大。我就給自己打氣:把壓力轉(zhuǎn)化為動(dòng)力,只要盡力就好!”

        她成摞成摞地讀文獻(xiàn),做實(shí)驗(yàn),每天腦子里像過(guò)電影一樣回溯組會(huì)討論的內(nèi)容,自學(xué)編程,做生物信息分析,尋找一些問(wèn)題的解決辦法……

        負(fù)責(zé)指導(dǎo)付巧妹的助理導(dǎo)師很認(rèn)可她的能力。慢慢地,付巧妹建立了信心,發(fā)現(xiàn)自己學(xué)過(guò)的數(shù)理化和計(jì)算機(jī)知識(shí)都能派上用場(chǎng),很快捅破了心理上的窗戶紙。

        幾個(gè)月后,付巧妹通過(guò)了德國(guó)導(dǎo)師的考核,也拿到了國(guó)內(nèi)的碩士學(xué)位。于是她又留在德國(guó)讀博士、做博士后。之后,付巧妹去了美國(guó),在哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳系繼續(xù)做博士后工作,工作一結(jié)束就回國(guó)了?!叭サ聡?guó)之前,我就沒(méi)想過(guò)定居國(guó)外,也說(shuō)不清為什么,反正就是想回來(lái)?!备肚擅谜f(shuō)。

        剛回國(guó)的時(shí)候,她的收入與國(guó)外有很大的落差,也面對(duì)著很多外界誘惑。

        “有一些機(jī)構(gòu)找過(guò)我,開(kāi)出很高的工資。但我覺(jué)得人這一輩子,如果只是為了錢(qián),沒(méi)什么意思。一輩子的時(shí)間很長(zhǎng),不能只看眼前的得失,最重要的還是做一些自己想做的事。我也很幸運(yùn),工作是自己感興趣的,只要堅(jiān)持做下去,慢慢都會(huì)好的?!备肚擅谜f(shuō)。

        在付巧妹看來(lái),不太計(jì)較一些事,反而能專(zhuān)注在更有價(jià)值的事上,最后有所收獲:“我是跟著自己的研究領(lǐng)域一起成長(zhǎng)的,也遇到過(guò)很多次失敗。但科研就像人生一樣,是有不確定性的,本身就是一個(gè)螺旋式上升的過(guò)程。”

        從4萬(wàn)年前的骨骼里找答案

        古DNA研究出現(xiàn)于20世紀(jì)80年代,但早期技術(shù)存在一些局限性。

        生物骨骸樣本長(zhǎng)期在地下埋藏,因?yàn)樽匀唤到?、環(huán)境微生物侵入、出土后外界皮屑污染等原因,當(dāng)時(shí)的技術(shù)很難從相關(guān)樣本中獲得古代人類(lèi)有效的遺傳信息。

        “受技術(shù)條件的限制,早年科學(xué)家們主要是做古代動(dòng)物的基因組研究,對(duì)于人類(lèi)古基因組,尤其是核基因組的研究特別少?!备肚擅谜f(shuō)。

        21世紀(jì)初,二代測(cè)序技術(shù)問(wèn)世,不僅降低了測(cè)序成本,還可以獲得大量數(shù)據(jù),為古DNA研究提供了重要支持。這段時(shí)間,付巧妹正在德國(guó)攻讀演化遺傳學(xué)博士,獲得了一個(gè)極為珍貴的研究樣本——在羅馬尼亞,人們發(fā)現(xiàn)了一塊距今4萬(wàn)多年的現(xiàn)代人下顎骨,但由于年代久遠(yuǎn),這塊骨骼里的人類(lèi)基因含量極低。

        “在一些樣本中,微生物DNA比例能達(dá)到99.98%,人類(lèi)基因只有0.02%,提取難度很大?!备肚擅谜f(shuō)。為了解決這個(gè)問(wèn)題,她主導(dǎo)開(kāi)發(fā)了一種新技術(shù):用現(xiàn)代人的DNA作為“誘餌”,像釣魚(yú)一樣,將具有相似性的古代人類(lèi)DNA“釣”取出來(lái)。

        經(jīng)過(guò)反復(fù)試驗(yàn),這項(xiàng)技術(shù)獲得了成功,付巧妹不僅提取出那塊骨骼里的古代人類(lèi)DNA,還發(fā)現(xiàn)該個(gè)體含有6%—9%的尼安德特人基因,證明現(xiàn)代人和尼安德特人發(fā)生過(guò)不止一次基因交流。

        “從遺傳學(xué)上講,尼安德特人相當(dāng)于現(xiàn)代人的堂兄弟,在幾萬(wàn)年前與現(xiàn)代人的祖先通過(guò)婚。今天的人類(lèi),除了非洲人外,體內(nèi)都含有尼安德特人的基因成分,我們所做的就是通過(guò)分析樣本,確定了更多、更精確的細(xì)節(jié)?!备肚擅媒榻B。

        這些成果引發(fā)了廣泛的國(guó)際關(guān)注。尤其是由付巧妹主導(dǎo)開(kāi)發(fā)的“古核基因組捕獲技術(shù)”,實(shí)現(xiàn)了把極其微量的人類(lèi)DNA從大量環(huán)境微生物DNA中吸附、分離、富集、捕獲出來(lái),這讓很多之前無(wú)法提取古DNA的樣本重回研究視野,有了新的科研價(jià)值。

        付巧妹是2015年底回國(guó)的,從2016年1月起便擔(dān)任中科院古脊椎所古DNA實(shí)驗(yàn)室(現(xiàn)為分子古生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室)主任。

        她將研究重心放在了東亞人群多樣性及演化歷程方面,用她自己的話說(shuō),“中國(guó)人有責(zé)任弄清楚生活在這片大陸上的人是怎么演變的”。

        2017年以前,人類(lèi)古基因組數(shù)據(jù)及相關(guān)研究主要集中在歐洲和北亞,而東亞地區(qū),尤其是中國(guó)的人類(lèi)古基因組數(shù)據(jù)相對(duì)空白,相關(guān)研究極度匱乏,東亞人群遺傳演化和遷徙融合的歷史,成為整個(gè)人類(lèi)演化進(jìn)程里的“缺口”。

        付巧妹帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)填補(bǔ)了這個(gè)空白。2017年,她和團(tuán)隊(duì)將中國(guó)第一例人類(lèi)古基因組,也是東亞迄今最早的現(xiàn)代人基因組的研究成果,在國(guó)際核心期刊上發(fā)表,被《科學(xué)》雜志評(píng)價(jià)為“填補(bǔ)了東亞在地理和時(shí)間尺度上的巨大空白”。

        付巧妹表示,這例人類(lèi)古基因組來(lái)自“田園洞人”,其骨骸化石是在北京周口店地區(qū)發(fā)現(xiàn)的,距今約4萬(wàn)年,比山頂洞人還早。

        “從田園洞人的樣本上,我們明確看到了東亞人特有的遺傳信息,因此可以確定,東亞人至少在4萬(wàn)年前就已經(jīng)存在了。這是非常重要的。因?yàn)樵谕粫r(shí)期,歐洲也存在過(guò)一些早期人類(lèi)群體,但不具備現(xiàn)代歐洲人的遺傳信息。”

        換句話說(shuō),在遠(yuǎn)古時(shí)期,某個(gè)地區(qū)可能生活著一些古代人類(lèi)群體,但他們不一定有直接后代延續(xù)下來(lái)、形成如今的現(xiàn)代人。通過(guò)研究古DNA,科學(xué)家可以判斷他們與今天在這片土地上生活的人類(lèi)之間的遺傳關(guān)系,以證明今天生活在這個(gè)地區(qū)的人群是否是他們所繁衍的后代。

        “希望為中國(guó)贏得話語(yǔ)權(quán)”

        在人類(lèi)演化研究領(lǐng)域,付巧妹是無(wú)數(shù)中國(guó)科學(xué)家的一個(gè)縮影。

        十多年來(lái),他們?cè)谙鄬?duì)落后的情況下奮起直追,不僅填補(bǔ)了中國(guó)在相關(guān)研究領(lǐng)域的空白,也為國(guó)家贏得了國(guó)際同行的尊重。

        在付巧妹看來(lái),德國(guó)、美國(guó)、丹麥的研究團(tuán)隊(duì)都是頂尖級(jí)別,她和國(guó)內(nèi)同事努力在古DNA技術(shù)創(chuàng)新和自主研究方面取得突破,除了科研本身帶來(lái)的成就感外,還有一種“為國(guó)家贏得話語(yǔ)權(quán)”的使命感。

        “目前,我們團(tuán)隊(duì)的技術(shù)水平在國(guó)際上躋身第一梯隊(duì)是沒(méi)有問(wèn)題的,但還有很多工作要繼續(xù)推進(jìn),希望把各個(gè)突破點(diǎn)連接起來(lái),變成一張網(wǎng)?!备肚擅谜f(shuō)。

        每當(dāng)實(shí)驗(yàn)到了關(guān)鍵階段,她一般要連續(xù)工作10小時(shí)甚至12小時(shí),深夜一兩點(diǎn)下班是常事,但所獲得的科研回報(bào)也是豐厚的。

        2020年,付巧妹團(tuán)隊(duì)在《科學(xué)》雜志發(fā)表了關(guān)于中國(guó)南北方人群古基因組的研究成果,發(fā)現(xiàn)我國(guó)近萬(wàn)年來(lái)主體人群的遺傳連續(xù)性,且首次從遺傳學(xué)角度證實(shí)以臺(tái)灣島阿美族和泰雅族、太平洋西南部島民為代表的南島語(yǔ)族,與萬(wàn)年前福建等南方沿海大陸人群直接相關(guān)。同年,付巧妹團(tuán)隊(duì)又從青藏高原10萬(wàn)年前的“土”里,獲得了東亞首例丹尼索瓦古人類(lèi)DNA,在東亞已滅絕古人類(lèi)研究上取得新突破。

        2021年,付巧妹團(tuán)隊(duì)通過(guò)解析黑龍江、廣西和福建等地區(qū)4萬(wàn)年來(lái)的人類(lèi)古基因組,揭示了東亞長(zhǎng)時(shí)間尺度下人群的動(dòng)態(tài)遺傳圖譜,發(fā)現(xiàn)了新的早期現(xiàn)代人支系。

        2022年4月,《科學(xué)》雜志發(fā)表了付巧妹團(tuán)隊(duì)的又一項(xiàng)重要研究成果——團(tuán)隊(duì)成功獲得了201例新疆古代人類(lèi)的基因組,系統(tǒng)還原了新疆五千年以來(lái)古人群的遺傳演化與交流互動(dòng)歷史。

        這些突破性進(jìn)展,顯示出中國(guó)在古基因組學(xué)領(lǐng)域,尤其是在東亞人類(lèi)演化研究領(lǐng)域的快速發(fā)展。

        2021年和2022年,付巧妹相繼收到《自然》和《細(xì)胞》雜志邀請(qǐng),就人類(lèi)演化領(lǐng)域的研究發(fā)表綜述和評(píng)述,系統(tǒng)梳理了十余年來(lái)人類(lèi)古基因組學(xué)研究的發(fā)展,并指出古DNA技術(shù)的未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)。

        如今,中國(guó)已在古基因組學(xué)領(lǐng)域凸顯出重要的國(guó)際影響力和話語(yǔ)權(quán),曾經(jīng)的學(xué)術(shù)滯后局面已經(jīng)扭轉(zhuǎn),國(guó)際地位日益提高。

        為了解答中國(guó)人關(guān)于“我是誰(shuí)”“我從哪里來(lái)”“我們的祖先怎樣生活”等問(wèn)題,付巧妹和她的同事們,正推動(dòng)著中國(guó)向世界最高峰攀登。

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