唐孝富,孟銀銀,杜瑩,蒲靖,王苗,田錕,鄧群仙,張慧芬
(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院,成都 611130)
休眠是高等植物經(jīng)過長(zhǎng)期演化而獲得的一種對(duì)環(huán)境條件及季節(jié)變化的生物學(xué)適應(yīng)性,直接與開花、萌芽相關(guān)[1-2]。Lang G.A.等[3]于1987年對(duì)休眠進(jìn)行了重新定義和分類,基于引起休眠的因素將其分為三大類:類休眠,指休眠結(jié)構(gòu)以外的生理因素(如頂端優(yōu)勢(shì)、激素等)誘導(dǎo)產(chǎn)生的生長(zhǎng)停滯現(xiàn)象;內(nèi)休眠,指休眠結(jié)構(gòu)本身的因素(如冷溫需求、光周期影響)控制的生長(zhǎng)停滯現(xiàn)象;生態(tài)休眠,是指由環(huán)境因子(如溫度、水分脅迫、營(yíng)養(yǎng)虧缺等)引起的休眠,一旦環(huán)境條件適宜,植物便可重新恢復(fù)生長(zhǎng)。多年生果樹通過芽休眠抵御自然界不利環(huán)境,而芽一般需要達(dá)到一定低溫需冷量才能解除休眠進(jìn)行正常生長(zhǎng)發(fā)育[4-6]。陳茂銓等[7]對(duì)12個(gè)桃品種的花芽休眠需冷量進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),不同品種需冷量差異較大,其中高需冷量品種在猶他模型下達(dá)900~950 CU。近幾年,湯志洪[8]、陳登文等[9]研究歐李冬季休眠特性發(fā)現(xiàn),歐李花芽的需冷量低于葉芽,花芽與葉芽自然休眠過程中對(duì)有效低溫的累積要求存在差異。
休眠是多基因協(xié)同控制的過程,近年來,關(guān)于芽休眠相關(guān)基因的研究較多。D.G.Blelenberg等[10]最早在桃的休眠障礙型突變體上發(fā)現(xiàn)MIKC-type MADS-box轉(zhuǎn)錄因子控制了芽休眠和分生組織生長(zhǎng),將其命名為dormancy associated MADS-box gene(DAM)[11-12]。DAM基因與植物體的開花及花器官的形成有密切關(guān)系,在桃、梨等薔薇科果樹中研究廣泛[13-15],李海炎等[16]在桃的DAM基因調(diào)控需冷量的研究中發(fā)現(xiàn),不同需冷量的桃在休眠過程中DAM基因的表達(dá)模式一致,隨休眠解除DAM表達(dá)逐漸下降,且DAM基因在高需冷量的品種的表達(dá)量高于低需冷量品種的表達(dá)。楊高宇等[17]利用PacBio和high-c技術(shù)構(gòu)建低需冷量梨品種的基因組組合,進(jìn)一步確定梨的DAM基因?qū)ρ棵葎?dòng)的抑制作用。楊依維等[18]對(duì)歐李休眠誘導(dǎo)的分子機(jī)制研究發(fā)現(xiàn),DAM5基因的表達(dá)隨著休眠誘導(dǎo)進(jìn)程逐漸升高,DAM5基因在誘導(dǎo)歐李芽休眠中發(fā)揮關(guān)鍵作用。近年來有研究者針對(duì)李的花芽休眠相關(guān)MADS-box基因的克隆及其對(duì)花芽發(fā)育和休眠的影響進(jìn)行研究,結(jié)果表明,DAM轉(zhuǎn)錄因子在溫暖季節(jié)開始積累,且隨著溫度的降低逐漸增加,從而誘導(dǎo)芽休眠[19]。
李為薔薇科李屬植物,作為一種重要的經(jīng)濟(jì)果樹,在我國(guó)廣泛種植,其中四川省主栽品種主要為‘羌脆李’和‘脆紅李’。李樹需冷量與芽休眠的解除是影響開花坐果的重要因素。本研究以‘脆紅李’‘羌脆李’及‘羌脆李’的晚熟變異材料“晚熟羌脆李”為研究材料,對(duì)花芽與葉芽需冷量的進(jìn)行比較,并用生物信息學(xué)方法對(duì)李DAM基因的序列結(jié)構(gòu)和芽不同休眠狀態(tài)的表達(dá)量分析,為四川李栽培生產(chǎn)中芽休眠調(diào)控奠定理論基礎(chǔ)。
‘羌脆李’‘脆紅李’及“晚熟羌脆李”枝條與芽均采樣自四川省阿壩藏族羌族自治州汶川縣茅嶺村(31°28′ N,103°33′ E)果園?!巴硎烨即嗬睢睘橐N定植的100株‘羌脆李’中發(fā)現(xiàn)的芽變優(yōu)株,該優(yōu)株和同一批定植的‘羌脆李’相比,果實(shí)晚成熟約30 d左右。成熟期與當(dāng)?shù)亍嗉t李’基本一致?!巴硎烨即嗬睢薄即嗬睢约啊嗉t李’芽休眠狀態(tài)觀察于2020年11月李全樹落葉后開始,至2021年1月全部觀察芽解除芽休眠,觀察期間每間隔14 d從掛牌李樹上選取生長(zhǎng)發(fā)育良好、芽體飽滿的1年生枝條5枝,用于花芽、葉芽取樣,在液氮中預(yù)冷后立即放入-80 ℃超低溫冰箱中保存用于RNA提取。
在NCBI網(wǎng)站下載與李相近的同源物種桃的DAM1-6基因序列,本地Blast在歐李基因組中查找到6個(gè)李DAM基因,分別命名為PdDAM1、PdDAM2、PdDAM3、PdDAM4、PdDAM5和PdDAM6。
2020年11月—2021年1月芽休眠觀察期間,每隔14 d從3個(gè)品種(系)李樹上各選取生長(zhǎng)發(fā)育良好、芽體飽滿的1年生枝條6枝,用于人工培養(yǎng),統(tǒng)計(jì)萌芽率[20-21],每次采樣各品種(系)用于觀察統(tǒng)計(jì)的花芽與葉芽數(shù)量均為60個(gè)以上。將采回的枝條基部斜剪45°,放在盛有清水的燒杯中,以淹沒枝條基部,立即放入人工氣候箱培養(yǎng)。培養(yǎng)條件為:光照12 h,光照強(qiáng)度320 μmol/(m2·s),黑暗12 h;溫度為(25±1.0)℃/(18±1.0)℃;空氣相對(duì)濕度為75%;每2 d換1次水,每次換水剪除枝條基部少許。培養(yǎng)21 d時(shí)統(tǒng)計(jì)萌芽率,以芽頂端開裂露綠為萌芽標(biāo)準(zhǔn),以萌芽率>50%時(shí)的觀測(cè)日期為解除內(nèi)休眠的日期[22-23]。參照Lang G.A.等[3]的方法[3],確定休眠的階段:以萌芽率為0時(shí),芽完全處于內(nèi)休眠階段;萌芽率為0~50%時(shí),芽處于內(nèi)生態(tài)休眠轉(zhuǎn)換階段;萌芽率為≥50%時(shí),即認(rèn)定芽解除內(nèi)休眠進(jìn)入生態(tài)休眠階段。
觀察期間于田間裝置溫濕度計(jì),設(shè)置為每隔15 min讀數(shù)1次,實(shí)時(shí)記錄田間溫濕度。分別統(tǒng)計(jì)7.2 ℃模型、0~7.2 ℃模型和猶他模型的低溫累積數(shù)。
7.2 ℃模型[24]:低溫積累量以日平均溫度穩(wěn)定通過7.2 ℃的日期為起點(diǎn),計(jì)算小于7.2 ℃低溫小時(shí)數(shù)(chilling hour,CH),當(dāng)每小時(shí)溫度≤7.2 ℃時(shí),計(jì)1個(gè)低溫小時(shí)數(shù)。
0~7.2 ℃模型[25]:低溫積累量以日平均溫度穩(wěn)定通過7.2 ℃的日期為起點(diǎn),計(jì)算0~7.2 ℃的低溫小時(shí)數(shù)(chilling hour,CH),當(dāng)每小時(shí)溫度處于0~7.2 ℃范圍內(nèi),計(jì)1個(gè)低溫小時(shí)數(shù)。
猶他模型[26]:低溫積累量以負(fù)累積低溫達(dá)到最大值時(shí)的日期為起點(diǎn)計(jì)算積累的冷溫單位(chilling unit,CU),每小時(shí)溫度與冷溫單位轉(zhuǎn)化如表1所示。
表1 溫度冷溫單位轉(zhuǎn)化表Table 1 Transformation of temperature and chilling unit
利用MEMEM在線軟件對(duì)李DAM蛋白的保守基序進(jìn)行分析,基序的最大數(shù)目設(shè)置為10,TBtools軟件[27]對(duì)DAM基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析與作圖。利用Clusta1X進(jìn)行氨基酸序列比對(duì),MEGA11對(duì)李與其他植物的DAM氨基酸序列構(gòu)建進(jìn)化樹。
3個(gè)品種(系)李花芽、葉芽RNA的提取參照宣繼萍等[28]的CTAB法[28]。cDNA的合成使用Goldenstar?RT 6 cDNA Synthesis Ver.2(北京擎科生物公司)反轉(zhuǎn)錄試劑盒,具體操作參照說明書。引物設(shè)計(jì)采用Beacon Designer 7 (Version 7.9, Premier Biosoft, San Francisco, USA),具體引物信息見表2。以李TUB3為內(nèi)參基因。使用BIO-RAD CFX96定量PCR儀進(jìn)行qRTPCR 反應(yīng):體系為10 μL,包含2× TSINGKE?Master qPCR Mix (SYBR GreenⅠ) 5 μL,上下游引物(10 μmol/L)各0.4 μL,cDNA2 μL,ddH2O 2.2 μL。2步法擴(kuò)增條件為:95 ℃預(yù)變性1 min,95 ℃變性10 s,60 ℃退火及延伸30 s,共40個(gè)循環(huán),每個(gè)處理包含3個(gè)重復(fù)。采用2-??Ct法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量。
表2 DAM 基因qRT-PCR 引物序列Table 2 Primer sequences of DAM gene for real-time quantitative PCR
使用Microsoft Excel 2021和Graph Pad Prism 8進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和作圖。
由圖1可知,“晚熟羌脆李”與‘羌脆李’‘脆紅李’的花芽萌芽率差異較大,“晚熟羌脆李”花芽從11月5日—12月5日萌芽率未達(dá)到50%,為內(nèi)休眠狀態(tài),12月20日時(shí)為生態(tài)休眠階段,萌芽率為84.0%。‘羌脆李’‘脆紅李’花芽萌芽率較一致,在11月5日到11月20日萌芽率小于50%,該階段處于內(nèi)休眠狀態(tài),12月5日開始萌芽率大于50%并且之后逐漸上升,達(dá)到解除內(nèi)休眠的標(biāo)準(zhǔn),處于生態(tài)休眠階段,12月5日萌芽率高低依次為‘羌脆李’>‘脆紅李’>“晚熟羌脆李”,“晚熟羌脆李”花芽的內(nèi)休眠時(shí)間最長(zhǎng)。3個(gè)品種(系)葉芽萌芽率相似,均表現(xiàn)為11月5日萌芽率小于50%,處于內(nèi)休眠狀態(tài),從11月20日開始葉芽萌芽率大于50%內(nèi)休眠狀態(tài)解除。3個(gè)品種(系)葉芽休眠解除臨界期均為11月5日—11月20日。3個(gè)品種(系)花芽休眠解除臨界期不同,“晚熟羌脆李”為12月5日至12月20日,‘羌脆李’和‘脆紅李’均為11月20日至12月5日,3個(gè)品種(系)葉芽解除臨界期相同,為11月5日至11月20日。
圖1 花芽、葉芽不同時(shí)期萌芽率Figure 1 Germination rate of flower buds and leaf buds at different periods
結(jié)合田間溫濕度記錄儀溫度記錄與室內(nèi)培養(yǎng)箱萌芽率統(tǒng)計(jì),使用7.2 ℃模型、0~7.2 ℃模型和猶他模型分別計(jì)算3個(gè)李品種(系)的低溫需冷量(表3)。結(jié)果表明,3種計(jì)算模型下,‘羌脆李’與‘脆紅李’需冷量均相同且低于“晚熟羌脆李”,7.2 ℃模型下花芽需冷量最高,“晚熟羌脆李”需冷量為943 CH,‘羌脆李’與‘脆紅李’需冷量為630 CH。同一模型下3個(gè)品種(系)葉芽需冷量均相同?!巴硎烨即嗬睢?、‘羌脆李’和‘脆紅李’的花芽、葉芽解除休眠的低溫需冷量所反映的物候?qū)W模型與三者芽休眠狀態(tài)調(diào)查結(jié)果一致。
表3 3 個(gè)李品種(系)低溫需冷量Table 3 Low temperature chilling requirement of 3 plum materialsCH
利用李(Prunus domestica)、桃(Prunus persica)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、杏(Prunus armeniaca)、梅(Prunus mume)、蘋果(Malus pumila)、葡萄(Vitis vinifera)和楊樹(Populus talassica)DAM蛋白序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)現(xiàn),8個(gè)物種35個(gè)蛋白可聚類為3個(gè)亞族,李6個(gè)DAM在3個(gè)亞族內(nèi)均有分布。將李DAM家族的保守基序及其系統(tǒng)進(jìn)化樹使用TBtools軟件進(jìn)行整/合可視化作圖(圖2)。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),李的PdDAM1、PdDAM2、PdDAM3、Pd-DAM4、PdDAM5、PdDAM6分別與PpDAM6、Par-DAM5、PtMADS5、PmDAM3、PpDAM1、MdDAM1進(jìn)化關(guān)系最近,序列相似性最高。MEME 網(wǎng)站在線分析預(yù)測(cè)35個(gè)DAM蛋白的保守motif,除蘋果3個(gè)DAM與梅PmDAM5外,其他序列均含4個(gè)相對(duì)保守的motif: motif9-motif1-motif3-motif2,且motif之間的排列具有一定的規(guī)律性,6個(gè)李DAM蛋白序列motif排列順序均為: motif9-motif1-motif3-motif5-motif2-motif6-motif4-motif8-motif7-motif10,而Pd-DAM4缺少motif8和motif7,PdDAM2基因缺少1個(gè)motif6。這些結(jié)果表明李DAM家族成員在序列較相似,PdDAM4與PdDAM2出現(xiàn)1~2個(gè)基因出現(xiàn)保守基序缺失或增加的現(xiàn)象,可能是進(jìn)化過程中出現(xiàn)了序列結(jié)構(gòu)差異。
圖2 李DAM基因進(jìn)化樹及保守基序Figure 2 Prunus DAM gene evolutionary tree and conserved motif order
休眠相關(guān)基因DAM在“晚熟羌脆李”‘羌脆李’和‘脆紅李’休眠期花芽與葉芽的相對(duì)表達(dá)量的變化如(圖3)所示,3個(gè)李品種(系)的花芽與葉芽?jī)?nèi)休眠解除臨界期表達(dá)基因相同,且在內(nèi)休眠解除臨界期DAM基因的相對(duì)表達(dá)量基本呈下降趨勢(shì)?!巴硎烨即嗬睢被ㄑ颗c葉芽?jī)?nèi)休眠解除臨界期均表現(xiàn)為DAM4和DAM5表達(dá)最高,其中DAM5在花芽與葉芽中的表達(dá)均呈下降趨勢(shì),而DAM4在花芽中為下降趨勢(shì),在葉芽中卻呈緩慢上升趨勢(shì);‘羌脆李’花芽與葉芽?jī)?nèi)休眠解除臨界期內(nèi)隨著休眠的解除DAM1和DAM5表達(dá)最高,呈逐漸下降趨勢(shì);‘脆紅李’休眠解除臨界期DAM2和DAM5表達(dá)最高,且呈逐漸下降趨勢(shì)??傮w而言,無(wú)論是“晚熟羌脆李”‘羌脆李’還是‘脆紅李’的花芽還是葉芽在達(dá)到解除內(nèi)休眠的過渡階段均有DAM5為主要的調(diào)控基因,而在內(nèi)休眠轉(zhuǎn)變?yōu)樯鷳B(tài)休眠的階段,DAM基因表達(dá)量均顯著下調(diào),DAM基因表達(dá)下降與休眠解除密切相關(guān)。
圖3 “晚熟羌脆李”花芽(A1)、“晚熟羌脆李”葉芽(A2)、‘羌脆李’花芽(B1)、‘羌脆李’葉芽(B2)、‘脆紅李’花芽(C1)、‘脆紅李’葉芽(C2)中DAM基因的表達(dá)分析Figure 3 Expression analysis of DAM genes of "Wanshuqiangcuili" flower buds (A1), "Wanshuqiangcuili" leaf buds (A2),'Qiangcuili' flower buds (B1), 'Qiangcuili' leaf buds (B2), 'Cuihongli' flower buds (C1), and 'Cuihongli' leaf buds (C2)
落葉果樹具有明顯的季節(jié)性生長(zhǎng)規(guī)律,休眠為果樹生長(zhǎng)發(fā)育過程中的重要時(shí)期[29-30]。休眠除了受外界環(huán)境的影響之外,通常還受解除休眠需冷量、休眠相關(guān)DAM基因的多重控制[31]。一般不同的樹種,或者同一樹種不同品種品系的低溫需冷量不同,休眠期時(shí)間長(zhǎng)短也不一致,如柿、蘋果等樹種之間休眠不同[32-35]。棗樹研究中,低溫需冷量較小的“京棗39”在12月上旬結(jié)束休眠,“辣椒棗”“七月鮮”等低溫需冷量中等的在1月下旬結(jié)束休眠,低溫需冷量較大的“大樹冬棗”在2月初結(jié)束休眠[36]。本研究中3個(gè)李品種(系)花芽需冷量不同,“晚熟羌脆李”較‘羌脆李’需冷量高,果實(shí)成熟期也延遲。陳菲菲[37]在桑葚休眠與果實(shí)熟期的研究結(jié)果也表明,不同休眠時(shí)期對(duì)產(chǎn)量無(wú)顯著影響,但休眠提前解除,果實(shí)熟期也提前。因此在生產(chǎn)上利用休眠期的合理管理來進(jìn)行產(chǎn)期的調(diào)控。本研究對(duì)3個(gè)不同李品種(系)的花芽和葉芽的休眠狀態(tài)、低溫需冷量分析發(fā)現(xiàn),“晚熟羌脆李”花芽從12月20日萌芽率大于50%,解除了內(nèi)休眠,‘羌脆李’和‘脆紅李’在12月5日處于解除深休眠狀態(tài);對(duì)于葉芽,3個(gè)品種(系)均在11月20日達(dá)到解除內(nèi)休/眠狀態(tài)。需冷量的差異與休眠狀態(tài)一致,且3者葉芽需冷量無(wú)差異,而解除休眠最晚的“晚熟羌脆李”花芽的需冷量最高。
DAM基因是果樹休眠變化的重要調(diào)控基因,在桃樹中發(fā)現(xiàn)存在6個(gè)DAM基因[10],中國(guó)櫻桃中發(fā)現(xiàn)3個(gè)DAM基因[13],本研究通過與李近緣物種桃的DAM1-6比對(duì),以歐李基因組為參考查找到6個(gè)李DAM基因。H.Yamane等[38-39]研究了需冷量高低的不同品種的桃,結(jié)果表明,休眠期PpDAM5和Pp-DAM6均存在相對(duì)較高的表達(dá)。本研究發(fā)現(xiàn),無(wú)論是“晚熟羌脆李”‘羌脆李’還是‘脆紅李’,均表現(xiàn)為隨休眠狀態(tài)解除DAM的相對(duì)表達(dá)逐漸下調(diào),在休眠解除臨界期表達(dá)下調(diào)最顯著,且DAM5可能是3個(gè)品種(系)中共有的調(diào)控休眠的關(guān)鍵基因,這與歐李DAM5促進(jìn)休眠,抑制萌發(fā)[18]研究結(jié)果一致?!巴硎烨即嗬睢被ㄑ恐械腄AM基因表達(dá)高峰均晚于‘羌脆李’與‘脆紅李’,與花芽需冷量及休眠觀察結(jié)果一致。需冷量與DAM表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),“晚熟羌脆李”的內(nèi)休眠解除要晚于‘羌脆李’,這也可能是“晚熟羌脆李”較‘羌脆李’果實(shí)熟期推遲的原因之一,休眠解除較遲,萌動(dòng)也會(huì)相應(yīng)有所推遲,同時(shí)樹體所消耗的營(yíng)養(yǎng)也隨之增多,體內(nèi)提供生長(zhǎng)養(yǎng)分變少,影響花期、坐果甚至果實(shí)熟期[40]。
四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)2024年1期