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        基于MaxEnt模型預測梅的潛在適生區(qū)分布

        2024-02-26 03:07:26陳伊能劉志剛于婷廖海周嘉裕
        中國野生植物資源 2024年1期
        關鍵詞:環(huán)境模型

        陳伊能,劉志剛,于婷,廖海*,周嘉裕**

        (1.西南交通大學 生命科學與工程學院,四川 成都 610031;2.馬邊彝族自治縣林業(yè)局,四川 樂山 614600)

        梅(Prunus mumeSieb. et Zucc.)隸屬于薔薇科(Rosaceae)李屬(PrunusL.),是傳統(tǒng)中藥烏梅的基原植物,以近成熟果實入藥[1]。烏梅入藥最初于《神農本草經》中有記載,其富含檸檬酸、維生素、黃酮類等化學成分,具有生津止渴、調節(jié)腸胃、增進食欲、治療寒熱、增強免疫力等功效[2-3],廣泛用于食品與醫(yī)藥領域。本草中記載的梅栽培地分布較為廣泛,魏晉時期《名醫(yī)別錄》記錄梅原產于湖北西北部,并引種至陜西南部,四川北部;晉代《蜀都賦》記述四川是梅的重要產地;宋代《本朝圖經》及明代《本草綱目》記載襄漢、川蜀、江淮、嶺南等南方地區(qū)均為梅的分布產地[1]。梅產地的不斷擴大能夠滿足臨床需要,但若盲目進行引種和種植區(qū)擴大,將對梅生產的合理布局產生不利影響,甚至破壞梅的道地性而導致烏梅品質不佳。由此,對梅開展生態(tài)環(huán)境適應性研究,并以此指導其合理種植具有重大現(xiàn)實意義。

        以MaxEnt等為代表的生態(tài)位模型是利用物種現(xiàn)有分布點信息,對物種潛在分布區(qū)進行預測,從而能夠更好地建立物種保護區(qū)以及進行合理的人工栽培地域規(guī)劃,現(xiàn)已應用于多種植物的適生區(qū)分析與引種指導工作[4-8]。項目組于2020年6月開始進行了野外實地考察,在此期間進行文獻查閱以及植物數據庫查詢,整理出梅在中國的現(xiàn)有分布信息資料,利用最大熵(MaxEnt 3.4.1)模型和地理信息系統(tǒng)ArcGIS 10.8軟件確定影響梅地理分布的主導環(huán)境因子及其影響程度,以此為依據預測梅不同程度適生區(qū),分析其潛在地理分布格局,并預測未來氣候模式下梅適生區(qū)分布的變化,以期為梅資源的可持續(xù)利用提供參考。

        1 數據來源與方法

        1.1 梅分布數據

        梅的分布點數據分別來源于3個部分:①實地考察梅生長地,通過經緯度查詢-坐標拾取系統(tǒng)(https://jingweidu.bmcx.com/)輸入分布點地名初步得到經緯度數據;②通過查閱“梅、青梅、酸梅、梅子與烏梅”等關鍵詞閱讀相關文獻,記錄經緯度或對已知地名進行經緯度查詢并記錄;③于中國植物數字標本館CVH(https://www.cvh.ac.cn/)、全球生物多樣性信息平臺GBIF(https://www.gbif.org/)、中國植物圖像庫PPBC多平臺(http://ppbc.iplant.cn/)搜索查詢梅在中國境內的分布點和具體相關經緯度數據?;谝陨戏椒?,獲得1980 ~ 2022年間348份原始分布數據(同時包含野生資源與人工種植分布數據),除去重復采樣和采集地不詳的標本信息(例如樣本的位置信息為**省份),收集具體到縣的地理信息,篩選得到172個具有明確經緯度信息的梅分布點,分布于22個不同省市自治區(qū)(表1)。

        表1 梅分布數據Tab.1 Distribution occurrences of Prunus mume in China

        1.2 環(huán)境變量數據

        利用世界氣象數據庫WorldClim(https://worldclim.org/)下載32個環(huán)境因子變量(表2)。

        表2 32個環(huán)境因子對梅的初步預測Tab.2 Preliminary prediction of 32 environmental factors for Prunus mume

        選用3個時期:當前(1970 ~ 2000年)及未來2個時期(2021 ~ 2040年和2041 ~ 2060年)環(huán)境數據,分辨率均為2.5’。未來氣候情景采用CMIP6發(fā)布的BCC-CSM2-MR氣候變化模型,其中SSP1-2.6(SSP126)代表低強迫情景,即2100年輻射強迫約穩(wěn)定在2.6 W·m-2;SSP5-8.5(SSP585)代表高強迫情景,即2100年輻射強迫約穩(wěn)定在8.5 W·m-2。通常認為,較SSP126模式,SSP585模式下的溫室氣體濃度和排放量均較高,未來環(huán)境溫度越高[6];同時,SSP585的碳排放強度也更強[7]。利用國家基礎地理信息系統(tǒng)網站(http://nfgis.ns-di.gov.cn)下載1 : 100萬全國矢量地圖數據,描繪梅在中國境內的分布點,并進行當前與未來時期的適生區(qū)分析。

        1.3 數據處理

        1.3.1 經緯度信息數據處理

        將172個分布點的經緯度數據信息導入到Arc-GIS中進行數據分析,首先刪除重復的經緯度數據記錄,隨后用SDM Toolbox v2.5工具去除自相關點,再通過“緩沖區(qū)”工具進行空間過濾檢驗(緩沖半徑為10 km)[8],最終篩選確定154個梅分布點的經緯度數據信息。

        1.3.2 環(huán)境因子優(yōu)化

        由于環(huán)境因子的高相關性可能導致模型的過擬合現(xiàn)象,刪除相關性高的環(huán)境因子有助于提高模型的準確性。通過對154個分布點的32種環(huán)境變量開展SPSS分析,參考鄒萌等[5]的篩選方法,選用SPSS 20.0軟件編制32種環(huán)境因子的相關矩陣,評價兩兩之間的Spearman系數,若Spearman系數 ≥0.8,則視作環(huán)境因子之間具有高相關性。如果環(huán)境因子間的Spearman系數 ≥ 0.8,則保留貢獻率更高的環(huán)境因子;同時,刪除貢獻率 < 0.3的環(huán)境因子(表2)。最終從中刪除bio17、bio4與tmin1等23種環(huán)境變量,從而形成優(yōu)化后的環(huán)境因子集合。最后,通過ArcGIS提取優(yōu)化后的環(huán)境因子數據,以ASCⅡ格式儲存,為后續(xù)導入MaxEnt中運算做準備。

        1.3.3 MaxEnt模型預測

        優(yōu)化后的環(huán)境因子數據添加于MaxEnt 3.4.1軟件,采用不同的訓練/測試集(80/20、75/25和70/30),運算次數為500次,輸出格式為 .asc,輸出類型選擇Logistic,重復運算10次,其余參數默認設置[5,9-10]。

        采用3種指標(AUC值、KAPPA值與TSS值)評估MaxEnt模型的準確性[11]。AUC值為受試者工作特征曲線(Receiver operating characteristic curve,ROC)下包圍的面積,范圍為0 ~ 1,AUC值越大說明模型準確性越高,即所選取的環(huán)境因子與梅的地理分布呈高度正相關。AUC值分為5個等級:不合格(0 ~ 0.6)、較差(0.6 ~ 0.7)、中等(0.7 ~ 0.8)、良好(0.8 ~ 0.9)和優(yōu)秀(0.9 ~ 1)[8]。KAPPA值反映其預測與事實匹配的程度,即通過預期準確度控制隨機準確度。取值范圍為-1 ~ 1,當KAPPA統(tǒng)計量為1表明預測模型理想,小于或等于0表示模型預測效果弱于隨機模型[11]。TSS值為真實技能統(tǒng)計量,范圍為-1 ~ 1,其值越接近于1表示完全有能力區(qū)分適宜和不適宜的棲息地,而小于或等于0表明表現(xiàn)不優(yōu)于隨機。最后,在最優(yōu)模型下,刀切法確定不同環(huán)境因子的貢獻率大小,及得到各環(huán)境因子的響應曲線圖。

        1.4 適應性分布區(qū)劃分

        將MaxEnt模型預測結果導入ArcGIS 10.8軟件,采用人工方法對梅適生區(qū)進行分級,將適生等級分為非適生區(qū)、低適生區(qū)、中適生區(qū)與高適生區(qū)等4類,其適應指數分別為:0 ~ 0.06、0.06 ~ 0.23、0.23 ~ 0.51與0.51 ~ 1.00[5]。

        2 結果與分析

        2.1 數據及環(huán)境變量篩選

        項目組通過實地考察調研,獲知梅在四川省馬邊、大邑與巴中等地區(qū)分布較廣,其中在馬邊的大風頂山區(qū)發(fā)現(xiàn)了一株樹齡超過200年的梅古樹,表明梅在四川省有較長的種植歷史。最終確定的154個梅分布點集中于長江以南地區(qū),這與梅的本草考證及當前種植區(qū)域相吻合。

        2.2 預測的有效性

        為了獲得最好的MaxEnt模型,我們利用bio14等9種環(huán)境變量,分別選擇3種訓練/測試組合,并分別用AUC,KAPPA與TSS等3種不同指標評價模型的預測精度。AUC測試結果顯示,3種不同的訓練測試集均能取得較高的AUC值(≥ 0.909),初步表明構建的MaxEnt模型具有較高的可信度。其中,當訓練/測試組合為75/25時AUC值最高,達到0.915;而當訓練/測試組合為70/30與80/20時,AUC值分別為0.909與0.913(表3)。

        表3 3種訓練/測試組合的模型評價Tab.3 Model evaluation metrics under three gradient training/test sets

        通常認為,當KAPPA值大于0.6時,模型即具有顯著一致性,且該值越大,模型的預測精度越高[12]。分析結果顯示,3種訓練/測試組合均能取得較高的KAPPA值(≥ 0.764),其中75/25組合的KAPPA值最高(0.841)。而當TSS值大于0.8時,模型對數據的區(qū)分能力達到較高水平[13-14]。比較3種訓練/測試組合,只有80/20組合的TSS小于0.8(TSS = 0.799),70/30與75/25組合均超過0.8,其中75/25組合的TSS值最高,為0.871(表3)。綜合3種訓練/測試組合的分析結果,由于75/25組合均能夠取得最高的AUC,KAPPA與TSS值,因此被選擇構建MaxEnt模型,以用于梅的適生區(qū)預測。

        2.3 環(huán)境因子貢獻率分析

        利用刀切法確定各環(huán)境因子對物種潛在分布適生區(qū)的影響程度大小,從中找到影響物種分布的關鍵環(huán)境因子[5]。如圖1所示,不同環(huán)境因子對梅分布產生不同程度的影響。最冷月最低氣溫bio6的訓練得分最高,超過了1.20,表明該環(huán)境變量是影響梅分布的最重要環(huán)境因子;年降水量bio12、最暖季降水量bio18與年溫差bio7的訓練得分分別為1.13、1.07與1.07,說明它們對梅分布影響為次重要;而最干月降水量bio14與平均晝夜溫差bio2的訓練得分分別為0.98與0.96,表明相較于其它環(huán)境因子,這兩種也是較為重要的環(huán)境因子。

        圖1 環(huán)境因子的刀切圖Fig.1 Prediction of Prunus mume distribution by environmental factors

        圖1顯示,當不存在bio7時,正規(guī)化訓練增益下降最大,從側面反映該因子是影響梅分布的關鍵因子之一。綜上,bio6、bio12、bio18、bio7、bio14與bio2是影響梅分布的關鍵環(huán)境因子。

        隨后,計算不同環(huán)境因子對梅分布的貢獻率,確定共有5個環(huán)境因子的貢獻率大于3%,即最干燥月降水量bio14(35.0%)、年降水量bio12(35.0%)、最冷月最低氣溫bio6(14.5%)、年溫差bio7(6.8%)與最暖季降水量bio18(3.3%),該結果與刀切法結果基本吻合,表明降水量與溫度是影響梅分布的重要環(huán)境因素(表4)。

        表4 9個環(huán)境因子對梅的潛在分布貢獻率Tab.4 Potential distributional contribution rate of nine environmental factors to Prunus mume

        2.4 主要環(huán)境因子

        分析單環(huán)境因子的響應曲線,明晰各環(huán)境因子與梅生存概率之間的相關性,從而確定物種的適宜生境范圍。選擇0.5為存在概率的閾值[4],重點分析bio14、bio12、bio6、bio7和bio18等貢獻率最高的5種關鍵環(huán)境因子(圖2)。

        圖2 生物氣候變量響應曲線Fig.2 Response curves of environmental variables

        對梅而言,最冷月最低氣溫bio6(圖2A)的適生范圍為1.4 ~ 12.1℃;當其為10.1℃時,梅適生概率最大,達到71.47%,說明溫度對梅生長有較大的影響。年降水量bio12(圖2B)的變化在1 020.8 ~4 125.0 mm之間;當其為2 416.7 mm時,梅適生概率最大,達到66.62%,這說明降水充裕對梅生長是有利的。當最干燥月降水量bio14(圖2C)在11.3 ~104.0 mm之間梅生長良好;當其為14.1 mm時,梅可能處于最佳生長狀態(tài),生長概率達到60.40%。

        最暖季降水量bio18(圖2D)適生閾值為510.8 ~ 2 043.0 mm;當其為715.1 mm時,梅適生概率最大,達到67.20%,說明在高溫季節(jié)降水充裕對梅生長有利。梅傾向較低的年溫差值bio7(圖2E),該閾值為29.1℃以下時生長良好,當其為22.4℃時,梅適生概率最大,可達到62.35%。

        2.5 梅的適應性劃分

        按照4級分類,統(tǒng)計梅在各省的潛在分布,結果見表5。梅的高適生區(qū)分布在長江以南地區(qū),主要集中于四川、重慶、貴州、廣西、廣東、云南等地區(qū),另外在浙江、臺灣等區(qū)域也有分布,其面積為746 968 km2,占全國總面積的7.78%。梅的中適生區(qū)分布較廣,面積為1 632 507 km2,集中于云南、湖南、湖北、江西、四川等地區(qū),占全國總面積的17.01%。梅的低適生區(qū)面積為741 588 km2,占全國總面積的7.73%。

        表5 梅在各省的潛在分布區(qū)域面積Tab.5 Potential distribution area of Prunus mume in each province

        2.6 未來適宜生境地區(qū)的變化

        在SSP126氣候情景下(表6),梅的潛在適生區(qū)呈現(xiàn)波浪式增加的趨勢。相較于當前適生區(qū),高適生區(qū)面積于2021 ~ 2040年間下降74 451 km2,其中四川、貴州、西藏、廣西和云南縮減面積最多,分別為37 233 km2、42 404 km2、13 680 km2、12 733 km2和12 388 km2,而江西南部、江蘇南部、上海、湖南南部、福建中部和浙江東部面積增加分別為6 962 km2、4 951 km2、3 118 km2、4 863 km2、29 485 km2和4 301 km2,但總體增加面積幅度不大,可見高適生區(qū)有向我國東南部轉移的趨勢,低適生區(qū)與適生區(qū)面積分別下降7 952 km2和60 602 km2。因西南地區(qū)部分高適生區(qū)轉為中適生區(qū),中適生區(qū)面積少量增加為8 442 km2。到2041 ~ 2060年間,云南、貴州進一步大規(guī)??s減46 310 km2與28 246 km2,貴州、河北、安徽、江蘇、上海的高適生區(qū)幾近消失,高適生區(qū)面積下降高達141 012 km2,低適生區(qū)下降了23 496 km2。值得關注的是,在北京、河北、天津與山東等地出現(xiàn)了大量的潛在中適生區(qū),即中適生區(qū)面積增加185 061 km2,從而適生區(qū)面積增加了44 049 km2。

        表6 不同氣候情景下梅在中國的潛在適生區(qū)面積Tab.6 Prediction of suitable growing areas of Prunus mume in China under different climate scenarios

        在SSP585氣候情景下(表6),梅的潛在適生區(qū)呈現(xiàn)與SSP126相似的變化趨勢。2021 ~ 2040年間,因西藏、云南與貴州分別減少11 146 km2、45 627 km2、56 352 km2,整體高適生區(qū)面積下降71 954 km2,且其面積位置變化規(guī)律與SSP126同時期的高適生區(qū)遷移位置相似,而中適生區(qū)和總適生區(qū)面積下降26 182 km2與98 137 km2,僅低適生區(qū)面積增加57 990 km2,這是由于河南中部、安徽和江蘇北部有部分中適生區(qū)轉為低適生區(qū)。2041 ~ 2060年間,因云南與貴州高適生區(qū)面積大規(guī)?;謴停噍^于當前的高適生區(qū)(746 968 km2),面積增加了37 312 km2。中適生區(qū)和適生區(qū)面積也分別增加17 001 km2與54 313 km2,僅低適生區(qū)面積下降42 583 km2,因為2021~ 2040年間的低適生區(qū)更新為中適生區(qū),且中適生區(qū)出現(xiàn)向北拓展的趨勢,特別是山東南部、北京、河北與天津等部分地區(qū)新增了中適生區(qū)??傮w而言,2種氣候情景下,到2041 ~2060年間,適生區(qū)面積均出現(xiàn)波浪式不同程度增加以及北移的趨勢,分別為當前的101.85%和102.28%。

        3 討論

        3.1 當前適生區(qū)預測的分析

        項目組在前期收集較完整的梅分布點信息,這有助于提高MaxEnt模型的預測準確性;同時,為了避免過擬合現(xiàn)象,刪除了重復的分布點,并設置緩沖過濾,有助于降低樣本的空間自相關[15-16];第三,對環(huán)境變量開展相關性分析與篩選,減少相關性較強的環(huán)境變量,降低機器學習模型的復雜性[17];最后,采用AUC、KAPPA和TSS等3個評價指標綜合判斷預測結果,獲得最優(yōu)模型。結果表明,75/25的集合能夠取得最優(yōu)的預測效果。預測結果顯示,四川、云南、貴州、廣西與廣東等地區(qū)是梅的高適宜種植區(qū)域。這些地區(qū)與梅的現(xiàn)有分布信息較為吻合,例如,四川與廣東地區(qū)均為梅種植大省,出產的梅品質最好。值得注意的是,西藏、重慶、臺灣、香港、福建與海南等地區(qū)的部分區(qū)域,也被劃歸為梅的高適宜區(qū),這將為梅的引種提供理論基礎。

        3.2 氣候變量與梅的關系

        在環(huán)境變量中,降水和溫度對梅的分布影響最大,表明氣候因素是影響梅生長的關鍵因素。溫度變量中,最冷月最低氣溫bio6扮演最重要的角色,當其為10.1℃時,梅的適生概率最大。考慮到梅分布區(qū)域的最冷月主要在1月和2月,此時梅處于盛花期,適宜的溫度有利于梅花器官的形成,促進營養(yǎng)生長向生殖生長的轉換[18]。另外,當年溫差bio7約22.4℃時,梅適生概率達到62.35%,這與梅適生區(qū)分布信息是吻合的。梅主要集中在長江以南地區(qū),該區(qū)域具有明顯的季節(jié)變化,但溫度變化較溫和[1]。降水變量中,當年降水量bio12約2 416.7 mm時,梅適生概率達到66.62%;最干燥月降水量bio14約14.1 mm時,梅適生概率達到60.40%;當最暖季降水量bio18約715.1 mm時,梅適生概率達到67.20%,以上結果表明,梅喜光喜暖濕潤氣候,怕旱又怕澇,所以降水量充足但不過量的條件對梅生長十分有利[19],若溫度過低又常為陰雨天,將會影響梅花芽和胚的發(fā)育,影響花粉散發(fā),最終嚴重影響梅坐果率[21]。

        3.3 未來氣候情景下梅在中國適生區(qū)的變化

        在SSP126和SSP585等2種氣候情景下,分別對2021 ~ 2040年和2041 ~ 2060年這2個時期進行梅適生區(qū)預測分析。結果表明,在未來40年內,梅分布范圍均呈現(xiàn)先減少再增加的趨勢,并在2060年達到最大,推測溫度對梅生長有著關鍵影響,溫度適當升高可加快物候過程,增加土壤養(yǎng)分提高梅的生長速度和大小。該結果也與貢獻率分析結果相吻合,即溫度是影響梅生長的關鍵因子,溫度升高會導致適生區(qū)的范圍增加。相似結果也出現(xiàn)在川貝母(Fritillaria cirrhosaD. Don)[8]、紫斑牡丹[Paeonia rockii(S. G. Haw & Lauener) T. Hong & J. J.Li][21]、獼猴桃(Actinidia chinensisPlanch.)[22]與檳榔(Areca catechuL.)[23]等植物的研究中,它們在溫室氣體排放增加的情景下,適生區(qū)面積增加。

        在未來氣候模式下,梅適生區(qū)出現(xiàn)北擴的趨勢,其中,北京、河北、天津與山東等長江以北地區(qū)新增中適生區(qū),遼寧出現(xiàn)了低適生區(qū)。由此,到本世紀中葉,這些區(qū)域可能出現(xiàn)新的梅種植區(qū)。潘浪波等[7]與Zhang等[21]研究也發(fā)現(xiàn)類似北移現(xiàn)象,隨著未來氣溫的升高,薄殼山核桃[Carya illinoinensis(Wangenheim) K. Koch]、滇牡丹(Paeonia delavayiFranch.)和紫斑牡丹等一些物種會移向高緯度或高海拔,推測這可能是物種的一種適應機制,但具體原因有待進一步闡明。

        4 總結

        本文基于梅現(xiàn)有分布區(qū)的環(huán)境因子數據,通過MaxEnt 3.4.1和ArcGIS 10.8等工具,成功篩選影響梅生長的關鍵環(huán)境因子,并預測梅的現(xiàn)有及未來潛在適生區(qū),以上研究成果對梅資源的可持續(xù)利用以及為梅種植的合理規(guī)劃布局奠定了理論基礎。

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