湯騰躍,余柯達,王佳淇,范超洋
(1.金華市婺城區(qū)雅畈鎮(zhèn)人民政府,浙江 金華 321000;2.浙江師范大學(xué),浙江 金華 321004;3.上海新紀元武義高級中學(xué),浙江 金華 321017;4.金華先實大農(nóng)業(yè)科技有限公司,浙江 金華 321004)
三葉木通和五葉木通同屬木通科(Lardizabalaceae)木通屬(Akebia),是營養(yǎng)價值和藥用價值極高的藤本植物[1]。五葉木通屬落葉或半常綠木質(zhì)藤本,俗稱木通,在我國野生資源豐富,是我國的傳統(tǒng)中草藥,具有抗癌、抗炎、抗菌、利尿、止痛、抗風濕等功效。三葉木通俗稱八月炸、金腎果、野香蕉,果實是中藥預(yù)知子。在我國分布廣泛,其果實味香甘甜,風味獨特,營養(yǎng)豐富,富含維生素C(VC)、17種氨基酸、礦物質(zhì)、脂肪酸、蛋白質(zhì)、糖和微量元素等,是名副其實的第3代保健型野生水果[2]。然而野生木通資源匱乏,人工培育顯得尤為重要。
目前的研究[3-5]表明,溫度是影響三葉木通生長的第一要素,光照是次要因素,海拔和坡度是決定三葉木通群落分布的主要因子,土壤性質(zhì)對三葉木通的生長也存在著一定的影響。有關(guān)木通的遺傳多樣性研究相對較少,其中席在星[6]建立了三葉木通隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)最佳反應(yīng)體系;田宗城等[7]用RAPD技術(shù)對木通屬4個種進行研究,發(fā)現(xiàn)七葉木通與三葉木通種的親緣關(guān)系較遠,而白木通與三葉木通的親緣關(guān)系較近;Kitaoka等[8]以三葉木通葉片為材料,建立適合三葉木通種質(zhì)資源遺傳多樣性研究的優(yōu)化AFLP反應(yīng)體系。目前還沒有關(guān)于生態(tài)因子影響木通遺傳多樣性的研究。
nrDNA的轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)承受的選擇壓力較小,具有很高的可變性,且在核基因組中高度重復(fù)。ITS區(qū)的可變性為物種鑒定提供了豐富的變異位點和信息位點。Zietkiewicz等[9]發(fā)現(xiàn),五葉木通ITS序列不具有獨立性。ISSR標記是1994年開始發(fā)展起來的一種分子標記技術(shù)[10],結(jié)合了SSR和RAPD的優(yōu)點,目前已廣泛應(yīng)用于遺傳多樣性、進化及分子生態(tài)學(xué)等研究中。本實驗結(jié)合ITS序列分析和ISSR標記2種方法探究生態(tài)因子對三葉木通和五葉木通遺傳多樣性的影響,為保護浙江三葉木通和五葉木通種質(zhì)資源,提供基礎(chǔ)資料和科學(xué)依據(jù),也為三葉木通和五葉木通的人工培育提供了借鑒。
本研究對浙江省三葉木通和五葉木通主分布區(qū)內(nèi)的天然種群做了采樣分析,包括金華北山(Bs)、開化古田山(Gt)、磐安大盤山(Pa)、泰順烏巖嶺(Wy)、杭州西天目山(Xt)、溫州雁蕩山(Yd)和麗水龍泉市(Zs)7個地區(qū)的三葉木通、五葉木通樣本,共34個樣品,各樣地的三葉木通和五葉木通種群之間呈相對隔離狀態(tài)。采樣時,采摘三葉木通和五葉木通的嫩葉放于保鮮袋中,封口,置于樣品貯藏箱(用冰塊保持冷藏條件)帶回實驗室,-80 ℃低溫冰箱保存。同時采集各種群距地表2~10 cm深的土壤,供土壤分析用。樣品采集地點、樣品編號等具體信息見表1。
表1 樣品采集具體信息Table 1 Sample collection information
表2 五葉木通不同居群ITS序列的遺傳距離Table 2 Genetic distance of ITS sequences in different populations of Akebia quinata
1.2.1 基因組DNA提取
參考張錚等[10]改良CTAB法提取基因組DNA,用1%的瓊脂糖凝膠電泳法檢測提取的樣本基因組DNA質(zhì)量,并置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 ITS序列擴增和測序
采用引物ITF1(5′-GCTCCTACCGATTGAATGGT-3′)和ITR1(5′-GTAAGTTTCTTCTCCTCCGC-3′),擴增木通樣本的ITS序列。PCR擴增程序為:94 ℃預(yù)變性3 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共30個循環(huán)。擴增反應(yīng)體系為25 μL,含2.5 μL 10×ExTaqPCR Buffer、70 ng模板DNA、0.2 mmol·L-1dNTP、0.4 μmol·L-1ITF1、0.4 μmol·L-1ITR1、0.75 U ExTaqDNA聚合酶(寶生物工程大連有限公司)。PCR產(chǎn)物采用上海生工DNA柱式通用回收試劑盒進行回收,10 μL回收產(chǎn)物送至生工生物(上海)公司進行測序,對所有序列均進行雙向測序。
1.2.3 ISSR擴增及電泳分析
根據(jù)加拿大哥倫比亞大學(xué)公布的ISSR引物序列設(shè)計,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。對木通屬ISSR-PCR反應(yīng)體系進行了優(yōu)化,確定了最佳的反應(yīng)條件為:反應(yīng)體系為25 μL,其中2.5 μL 10×PCR Buffer(Mg2+Plus)、70 ng模板DNA、0.15 mmol·L-1dNTP、引物濃度0.4 μmol·L-1、0.5 mmol·L-1Mg2+、0.75 U rTaqDNA聚合酶(寶生物工程大連有限公司);PCR擴增程序為:94 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性30 s,退火45 s(退火溫度隨引物而定),72 ℃延伸90 s,共35個循環(huán)。PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠進行電泳,用凝膠成像分析系統(tǒng)拍照保存。
1.3.1 ITS數(shù)據(jù)分析
對測序公司返回的ITS序列,用ClustalW 2軟件進行序列比對。序列使用MEGA 5.0分子進化遺傳分析軟件構(gòu)建發(fā)育樹,發(fā)育樹各分支的置信度用自舉檢驗法檢驗,共進行500次循環(huán),以評價各分支的系統(tǒng)學(xué)意義與可靠性。
1.3.2 ISSR數(shù)據(jù)分析
在電泳圖譜上的每一個條帶均視為一個分子標記,代表1個引物的結(jié)合位點。按凝膠同一個位置上DNA帶的有無進行統(tǒng)計,有帶的記為1,無帶的記為0,生成0/1 Excel統(tǒng)計表。采用POPGEN 32軟件計算多態(tài)位點百分數(shù)(P)、Shannon′s信息指數(shù)(I)和Nei′s基因多樣性指數(shù)(h)來估算基因多樣性[11]。利用SPSS 16.0軟件導(dǎo)入0/1 Excel統(tǒng)計表計算樣品遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,并按UPGMA法(非加權(quán)配對算術(shù)平均法)對所有樣品進行聚類分析,構(gòu)建親緣關(guān)系圖。
2.1.1 ITS聚類分析
用最大似然法(ML法)構(gòu)建ML系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1),用bootstrap自舉法檢驗發(fā)育樹,重復(fù)500次,判斷各分支處的可信度。
圖1 基于ITS序列構(gòu)建的27個樣本ML系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1 A phylogenetic tree of 27 samples of ML based on ITS sequences
在聚類圖中,三葉木通和五葉木通大致各自聚為一支,而Pa6w樣本與三葉木通聚為一類,在三葉木通一類中與其他樣本遺傳距離較遠。由葉形觀察知,Pa6w樣本為五小葉復(fù)葉,而葉片大小、葉緣和長寬比與三葉木通相近,因此推斷,Pa6w樣本可能是三葉木通和五葉木通的過渡類型。從ML聚類圖看出,三葉木通樣本間的聚類結(jié)果支持率十分低,其聚類結(jié)果可信度不高,說明不同地區(qū)三葉木通的ITS序列間變異不大,遺傳距離過小,不適合采用ITS序列來分析它們之間的親緣關(guān)系。相反,五葉木通的聚類結(jié)果支持率較高,可以采用ITS序列來分析樣品之間的親緣關(guān)系。
2.1.2 海拔與五葉木通遺傳多樣性具有明顯相關(guān)性
五葉木通某些樣品無法采集土樣,未能測定其pH值和有機質(zhì)含量。利用MEGA 5.0軟件計算遺傳距離(表2)可知,五葉木通不同居群間ITS堿基序列的遺傳距離在0~0.007 8,與其他物種相比,種內(nèi)ITS序列的變異范圍較小。在ML系統(tǒng)發(fā)育樹中,Xt6w和Xt9w的海拔高度差距最小,兩者之間的遺傳距離也最短,而Xt5-2w雖然也采自西天目山地區(qū),但并沒有與Xt6w和Xt9w聚為一支,可能是由于其海拔較高。計算海拔與樣本遺傳距離間的相關(guān)系數(shù),得出r海拔=0.96,遠大于0.8,相關(guān)性顯著。總體而言,隨著居群之間海拔高度差距的增加,其遺傳距離也相應(yīng)增大,說明海拔對五葉木通的遺傳多樣性產(chǎn)生一定的影響。
2.2.1 ISSR引物篩選結(jié)果
通過ISSR技術(shù)對三葉木通進行遺傳多樣性分析,從75對引物中篩選出15對擴增條帶多、清晰且重復(fù)性好的引物用于ISSR-PCR反應(yīng)(表3)。經(jīng)統(tǒng)計,這15對引物擴增共得到265條帶,其中多態(tài)性條帶為261條,占比98.49%。擴增的DNA片段長度介于200~2 000 bp。
表3 篩選出的15條ISSR引物Table 3 Fifteen screened ISSR primers
2.2.2 三葉木通遺傳多樣性
各地區(qū)樣本的多態(tài)位點百分率存在著差異,古田山地區(qū)最高,北山地區(qū)最低,變化范圍在49.26%~70.32%,平均為61.42%。各地區(qū)三葉木通的Shannon′s信息指數(shù)(I)變化范圍在0.212 2~0.605 9之間,平均為0.394 0。Nei′s基因多樣性指數(shù)(h)的大小為0.250 0~0.367 3(表4)。P、h和I都顯示出三葉木通樣本具有較高的遺傳多樣性(圖2)。
圖2 UBC818 ISSR-PCR擴增電泳圖Fig.2 ISSR-PCR amplification electropherogram of UBC818
表4 不同地區(qū)三葉木通的遺傳多樣性Table 4 Genetic diversity of Akebia trifoliata in different regions
2.2.3 ISSR聚類分析
運用SPSS 16.0對6個地區(qū)的23個三葉木通樣本進行UPGMA聚類分析,得到樹狀聚類分析圖(圖3)。從圖3可以得出,當遺傳距離為13時,每個地區(qū)的三葉木通樣本各自聚為一類;當遺傳距離為18時,烏巖嶺、西天目山、雁蕩山的樣品和北山、古田山、大盤山的樣品區(qū)分開來;當遺傳距離為25時,三葉木通和參照樣本(鷹爪楓)區(qū)分開來。這表明同一個地區(qū)三葉木通其遺傳差異小于不同地區(qū)間三葉木通的差異。
圖3 23個三葉木通樣本UPGMA聚類樹狀圖Fig.3 UPGMA cluster dendrogram of 23 Akebia trifoliata samples
2.2.4 海拔、土壤有機質(zhì)含量和pH值與三葉木通遺傳多樣性的相關(guān)性不顯著
從三葉木通的聚類分析結(jié)果可知,三葉木通的聚類與區(qū)域有關(guān),每個地區(qū)的三葉木通各自聚為一類。三葉木通樣本取自浙江省6個不同的地區(qū),所生長的生境有著一定的差異,結(jié)合生境中的土壤pH值、有機質(zhì)含量和海拔這3個生態(tài)因子,計算三者與遺傳距離的相關(guān)系數(shù),得出r海拔=0.03,rpH值=0.22,r有機質(zhì)含量=0.02,相關(guān)系數(shù)r遠小于0.8,這表明海拔、土壤的酸堿度和有機質(zhì)含量對三葉木通的遺傳多樣性影響不大。
研究結(jié)果表明,海拔與五葉木通的遺傳多樣性有一定的相關(guān)性。五葉木通性喜溫暖濕潤氣候,不耐嚴寒,多生長在海拔50~1 200 m的山地灌叢、林緣和溝谷中,其中又以海拔200~900 m分布較為豐富[12],推測該海拔高度范圍較適宜五葉木通生長,受到的生境選擇壓力較小,從而影響其遺傳多樣性。
海拔因素對五葉木通遺傳多樣性的影響,初步說明了海拔對基因交流存在一定的阻礙作用;而海拔相近的五葉木通居群,如Xt6w和Xt9w遺傳距離較小,可能是小范圍內(nèi)生境類型大致相同造成的。由于海拔差距的存在,導(dǎo)致物種不同居群間親緣關(guān)系發(fā)生變化的現(xiàn)象,在皮樺[13]和水稻[14]中也有報道。海拔的變化常常是決定物種生境差異的主導(dǎo)因子,可能還伴隨著溫度、降水、光照和土壤等生態(tài)因子的改變,進而影響植物的分布和遺傳多樣性[15]。
利用ISSR技術(shù)對浙江省6個不同地域的三葉木通種群遺傳多樣性進行分析,其物種水平的多態(tài)位點百分率(P)高達98.49%,Nei′s基因多樣性指數(shù)(h)為0.503 3,Shannon′s信息指數(shù)(I)為0.689 0,反映出三葉木通的遺傳多樣性較高。影響種群遺傳分化的因素很多,如繁育系統(tǒng)、分布范圍、種子傳播機制和演替階段等[16-19]。在UPGMA方法構(gòu)建的系統(tǒng)樹狀圖中,各三葉木通間是按照浙江省內(nèi)的金華北山、開化古田山、磐安大盤山、泰順烏巖嶺、臨安西天目山和溫州雁蕩山6個地區(qū)進行聚類的,說明三葉木通間的遺傳變異程度與地域分布有一定相關(guān)性,其原因可能是地理阻隔導(dǎo)致遺傳組成發(fā)生了變異,地理環(huán)境是造成該植物遺傳多樣性的重要因素[20]。