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        FABPs 基因家族在動(dòng)物育種領(lǐng)域的研究進(jìn)展

        2024-01-12 12:56:04林彭楚彬孫三山高亞杰嚴(yán)杜建
        畜牧與飼料科學(xué) 2023年6期
        關(guān)鍵詞:研究

        林彭楚彬,孫三山,高亞杰,阮 超,嚴(yán)杜建

        (1.香港都會(huì)大學(xué), 香港 九龍區(qū) 999077;2.阿克蘇職業(yè)技術(shù)學(xué)院/反芻動(dòng)物群發(fā)病防控工作室, 新疆 阿克蘇843000;3.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué),新疆 烏魯木齊 830000)

        脂肪酸結(jié)合蛋白 (fatty acid binding proteins,F(xiàn)ABPs) 屬于細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)結(jié)合蛋白(intracellular lipid binding proteins,iLBPs)超家族的成員,是一類分子量在12~15 kDa 的小分子胞內(nèi)蛋白, 廣泛存在于動(dòng)物各種器官組織當(dāng)中,在不同物種之間的同源性較高, 對(duì)于脂肪酸具有優(yōu)異的結(jié)合能力[1]。目前FABPs 基因家族已發(fā)現(xiàn)了12 種類型, 其中只 有4 種 類 型 (A-FABP、H-FABP、I-FABP、LFABP)被列為主要影響畜禽胴體與肉質(zhì)性狀的候選基因, 其他類型主要在癌癥發(fā)生發(fā)展機(jī)制及代謝病方面研究較為深入,因此,畜禽的大多數(shù)生產(chǎn)表型與4 種FABPs 基因家族成員的表達(dá)有關(guān)。 近年來(lái),F(xiàn)ABPs 基因在提升畜禽胴體與肉質(zhì)方面的多態(tài)性研究成為分子育種改良的熱點(diǎn), 有效推動(dòng)了畜禽生產(chǎn)提質(zhì)增效的進(jìn)程[2-3]。 筆者介紹了FABPs 基因家族主要成員在動(dòng)物組織器官中的分布情況和主要功能, 綜述了該基因家族代表性成員H-FABP 基因和A-FABP 基因在畜禽育種領(lǐng)域的研究進(jìn)展, 以期為利用該基因家族開(kāi)展畜禽分子標(biāo)記輔助育種、改善畜禽生產(chǎn)性狀提供參考。

        1 FABPs 基因家族的功能及分布

        1.1 主要功能及作用

        FABPs 作為一種進(jìn)化高度保守的蛋白質(zhì),在動(dòng)物組織器官的脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝反應(yīng)中起著核心作用,F(xiàn)ABPs 基因家族由至少9 個(gè)具有相似三級(jí)結(jié)構(gòu)和分布在特定組織細(xì)胞的同源蛋白組成,由于氨基酸序列的差異,不同類型的FABPs 對(duì)脂肪酸結(jié)合均存在較為顯著的功能特異性,因此,可以通過(guò)其功能特異性反映其在不同組織細(xì)胞表達(dá)的獨(dú)特環(huán)境[4]。 FABPs 的主要作用如下:①調(diào)控脂肪酸的運(yùn)輸和代謝;②與各種膜蛋白和胞內(nèi)蛋白(如血清可溶性轉(zhuǎn)鐵蛋白受體、脂肪甘油三酯脂肪酶)相互作用;③調(diào)節(jié)組織和細(xì)胞特異性脂質(zhì)反應(yīng)[5]。

        1.2 在機(jī)體內(nèi)的分布

        FABPs 在心臟、腸道、肝臟、腦、肌肉、髓鞘、視網(wǎng)膜、上皮組織、脂肪組織等多個(gè)組織器官中廣泛存在,但同一物種并非包含所有FABPs 基因家族成員,單個(gè)FABPs 基因家族成員僅在特定組織器官中顯著表達(dá), 例如A-FABP 基因主要在脂肪組織表達(dá)、H-FABP 基因主要在心臟和肌肉表達(dá)[6]。根據(jù)在不同組織中的分布特點(diǎn)及表達(dá)差異,F(xiàn)ABPs 基因家族成員主要以第一次被發(fā)現(xiàn)的組織器官命名, 截至目前已在不同的物種及其組織器官上發(fā)現(xiàn)12 種類型(見(jiàn)表1),其中,有10 種類型主要在哺乳類動(dòng)物中表達(dá),2 種類型發(fā)現(xiàn)于非哺乳動(dòng)物,但主要表達(dá)部位定義仍未明確[4,7-8]。

        表1 FABPs 基因家族的類型及分布

        2 FABPs 基因家族常見(jiàn)的成員

        2.1 H-FABP 基因

        目前H-FABP 基因的研究在豬和禽類上報(bào)道較多,在其他物種的報(bào)道上較少。 Gerbens 等[9]通過(guò)對(duì)兩個(gè)約克夏豬群體進(jìn)行研究, 建議H-FABP基因作為肌內(nèi)脂肪沉積的候選基因。 Mao 等[10]研究發(fā)現(xiàn),鴿子H-FABP 基因的mRNA 表達(dá)水平與肌內(nèi)脂肪含量密切相關(guān), 認(rèn)為該基因可以作為標(biāo)記輔助優(yōu)質(zhì)肉選擇的候選基因。 曹健[11]研究發(fā)現(xiàn)H-FABP 基因檢測(cè)區(qū)域的突變會(huì)影響甘南閹牦牛的眼肌面積和胴體重,AA 型閹牦牛個(gè)體眼肌面積最小,BC 型個(gè)體胴體重最小, 而AB 型個(gè)體眼肌面積最大。 H-FABP 基因多態(tài)性位點(diǎn)在一定程度上會(huì)影響畜禽的產(chǎn)肉性狀, 可以作為提高產(chǎn)肉性狀的候選基因。

        2.2 A-FABP 基因

        A-FABP 基因主要參與肌內(nèi)脂肪代謝相關(guān)過(guò)程,對(duì)調(diào)控肌內(nèi)脂肪沉積具有重要作用。劉艷妍[12]對(duì)秦川牛A-FABP 基因的多態(tài)性及其與肉用性狀的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行研究, 發(fā)現(xiàn)A-FABP 基因5′側(cè)翼區(qū)的突變對(duì)產(chǎn)肉性狀影響較大, 外顯子3 的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與眼肌面積有相關(guān)性,A-FABP 基因的3′側(cè)翼區(qū)突變與胴體有相關(guān)性,外顯子2 的SNP 與屠宰率、肌肉嫩度、 胴體長(zhǎng)和眼肌面積有相關(guān)性, 從而確定

        A-FABP 基因多態(tài)性與肉用性狀顯著相關(guān)。 Cho等[13]研究發(fā)現(xiàn)A-FABP 基因多態(tài)性與牛的背部脂肪厚度也呈現(xiàn)顯著相關(guān)。Yin 等[14]研究表明延邊黃牛后腿肌肉組織中A-FABP 基因的mRNA 相對(duì)表達(dá)量與肌內(nèi)脂肪含量呈顯著正相關(guān), 與背最長(zhǎng)肌組織中肌內(nèi)脂肪含量呈極顯著正相關(guān)。A-FABP基因可作為肉質(zhì)性狀的輔助標(biāo)記基因。

        2.3 L-FABP 基因

        目前關(guān)于L-FABP 基因的研究主要集中在雞和鴨的肉質(zhì)性狀改良方面。 Mentari 等[15]通過(guò)研究Cihateup 鴨的L-FABP 基因多態(tài)性與脂肪酸組成、胴體和肉質(zhì)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)L-FABP 基因與胴體率極顯著相關(guān), 并顯著影響肌肉中月桂酸和棕櫚酸等飽和脂肪酸的含量。Wang 等[16]通過(guò)研究肝臟脂肪酸結(jié)合蛋白與雞腹部脂肪沉積的關(guān)聯(lián)性,揭示了L-FABP 的組織表達(dá)特性及L-FABP 基因?qū)ιL(zhǎng)和體組成性狀具有重要影響, 推測(cè)L-FABP基因可能是影響雞脂肪沉積性狀的一個(gè)候選位點(diǎn)或與某些決定該性狀的主效基因有關(guān)。L-FABP 基因可作為雞鴨脂肪沉積及肉質(zhì)改良的候選基因[17], 同時(shí)圍繞該基因開(kāi)展研究可為明晰禽類脂質(zhì)代謝調(diào)控機(jī)制提供參考。

        2.4 I-FABP 基因

        I-FABP 基因主要在空腸組織中表達(dá),而不是在十二指腸、回腸、近端和遠(yuǎn)端結(jié)腸等部位。 通過(guò)免疫熒光定位技術(shù)發(fā)現(xiàn),相較于L-FABP、I-FABP在細(xì)胞質(zhì)、 小腸微絨毛和基底外側(cè)膜中分布更為均勻, 因此,I-FABP 基因的表達(dá)產(chǎn)物更適用于動(dòng)物腸道疾病的檢測(cè)[18]。 Niewold 等[19]參考人類IFABP 的研究結(jié)果,通過(guò)人I-FABP 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)對(duì)豬血液樣本進(jìn)行研究, 認(rèn)為豬的血漿IFABP 濃度可作為腸黏膜輕度損傷的敏感標(biāo)記物。Cahyaningsih 等[20]通過(guò)研究感染不同劑量柔嫩艾美耳球蟲(chóng)卵囊的雞血清中I-FABP 的濃度變化,發(fā)現(xiàn)I-FABP 與機(jī)體巨噬細(xì)胞和脂肪組織中的關(guān)鍵脂質(zhì)敏感途徑密切相關(guān),從而參與腸道炎癥的調(diào)控。 也有研究表明,I-FABP 基因可為探究魚(yú)腸道的發(fā)育機(jī)制提供有效標(biāo)記[21]。 在生物醫(yī)學(xué)上,I-FABP 濃度可作為早期檢測(cè)胃腸道損傷的參考指標(biāo)。

        2.5 M-FABP 基因

        M-FABP 在肌肉細(xì)胞中發(fā)揮作用, 與肌肉能量代謝和脂肪酸氧化等過(guò)程有關(guān), 對(duì)于生物機(jī)體脂肪酸代謝、 肌肉生長(zhǎng)以及能量平衡均具有重要的生理作用。 目前關(guān)于M-FABP 的功能表達(dá)在脊椎動(dòng)物的耐力及運(yùn)動(dòng)研究方面較為突出, 尤其是在長(zhǎng)期遷徙的候鳥(niǎo)肌肉組織中表達(dá)水平最高 (約占胸肌細(xì)胞胞漿蛋白的14%~21%), 而在非遷徙階段的候鳥(niǎo)體內(nèi)表達(dá)水平減少。 由此可知,MFABP 基因表達(dá)的季節(jié)性變化可能與候鳥(niǎo)遷移過(guò)程中肌肉組織能量供應(yīng)有關(guān), 特別是在脂肪酸供應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用[22]。 M-FABP 可作為改善動(dòng)物運(yùn)動(dòng)及耐力性能的候選基因。

        2.6 其他基因

        相較于前幾種FABPs 基因家族成員,其他成員的功能主要在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域被關(guān)注,如癌癥研究,多數(shù)成員的主要功能暫不明確,因此,在畜牧領(lǐng)域研究進(jìn)展緩慢。 在畜禽育種領(lǐng)域,針對(duì)FABPs 基因家族成員的研究主要聚焦于其在脂肪酸調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮的作用, 例如:E-FABP 基因和Ex-FABP基因主要與雞的腹脂重、腹脂率等表型相關(guān)[23-24],T-FABP 基因的表達(dá)產(chǎn)物在不同溫度下會(huì)影響虹鱒魚(yú)肝臟、腸道和脾臟的脂質(zhì)調(diào)節(jié)平衡[25]。綜上所述,不同種類的FABPs 家族成員在畜禽群體及個(gè)體中的遺傳多樣性及其與生產(chǎn)性狀表達(dá)的關(guān)系是今后研究的重點(diǎn)方向。

        3 FABPs 基因家族代表性成員在動(dòng)物育種領(lǐng)域的研究進(jìn)展

        在畜禽遺傳改良及品種選育領(lǐng)域, 對(duì)FABPs基因家族成員的研究主要以H-FABP 基因和AFABP 基因?yàn)閷?duì)象, 對(duì)其他成員的深入研究較少。目前H-FABP 基因和A-FABP 基因的研究主要集中在對(duì)動(dòng)物生產(chǎn)性能的影響,包括生長(zhǎng)速度、肉質(zhì)和繁殖性能等[26]。 例如,H-FABP 基因的表達(dá)量與畜禽的生長(zhǎng)速度和繁殖性能有關(guān), 而A-FABP 基因的表達(dá)量則與畜禽的肉質(zhì)性狀有關(guān)。 深入研究H-FABP 基因和A-FABP 基因的多態(tài)性、 表達(dá)特征、 作用機(jī)制及影響因素將有助于提高畜禽生產(chǎn)性能。

        3.1 牛

        A-FABP 基因被定位在牛的14 號(hào)染色體上,全長(zhǎng)4 391 bp, 有4 個(gè)外顯子;H-FABP 基因被定位于2 號(hào)染色體上, 由4 個(gè)外顯子和3 個(gè)內(nèi)含子組成。 王卓等[27]研究發(fā)現(xiàn)秦川牛H-FABP 基因第1 外顯子上存在SNP 位點(diǎn)且與肉用性狀有較強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性。 Ye 等[28]研究表明棕櫚酸和硬脂酸處理可調(diào)節(jié)水牛乳腺上皮細(xì)胞中大部分FABPs 的表達(dá),從而影響水牛產(chǎn)奶量,為進(jìn)一步研究FABPs 基因家族在水牛奶合成調(diào)控中的潛在作用提供了參考。Ardicli 等[29]使用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析 (polymerase chain reaction followed by restriction fragment length polymorphism assay,PCR-RFLP) 對(duì)荷斯坦公牛12 個(gè)育肥性狀候選基因進(jìn)行了基因分型, 最終確定A-FABP 基因多態(tài)性影響飼料轉(zhuǎn)化率與平均日增重等重要經(jīng)濟(jì)性狀。Al-Janabi 等[30]研究發(fā)現(xiàn)FABP3 基因多態(tài)性可用于奶牛遺傳改良策略的制定, 通過(guò)選擇和雜交可獲得最佳繁殖性能的基因型。通過(guò)研究HFABP 基因和A-FABP 的基因多態(tài)性與體型、眼肌面積、 產(chǎn)奶量和繁殖能力等性狀的關(guān)聯(lián)性可以為牛的遺傳育種改良提供一定的理論依據(jù)。

        3.2 羊

        H-FABP 基因被定位在綿羊和山羊的2 號(hào)染色體上,均有5 個(gè)外顯子;A-FABP 基因被定位于山羊的14 號(hào)染色體上,有4 個(gè)外顯子。 Ibrahim 等[31]通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析(polymerase chain reaction-single-stranded conformational polymorphism,PCR-SSCP)對(duì)Sfakia 綿羊HFABP 基因分型后發(fā)現(xiàn),H-FABP 基因型變異與產(chǎn)奶性狀之間存在相關(guān)性。 Eer 等[32]研究發(fā)現(xiàn)HFABP 基因的2 個(gè)SNP 位點(diǎn)在湖羊和灘羊的生長(zhǎng)繁殖性狀之間存在顯著相關(guān)性,可以作為灘羊育種的分子標(biāo)記。 艾錦新等[33]在黔北麻羊群體中H-FABP 基因第5 外顯子和3′非翻譯區(qū)篩選出1 個(gè)對(duì)體型性狀有極顯著影響的SNP 位點(diǎn)g.13665051C>T,并產(chǎn)生3 種基因型,將其與體型性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析得出該位點(diǎn)對(duì)體高、體斜長(zhǎng)、胸寬、體深、胸圍和管圍等均有顯著影響,在小尾寒羊、巴什拜羊等群體中均得出了相似的結(jié)果。熱依拉·普拉提等[34]通過(guò)研究巴什拜羊發(fā)現(xiàn)A-FABP基因的GA 型個(gè)體的胸圍、體重、體長(zhǎng)均顯著高于GG 型個(gè)體,可作為巴什拜羊育種的分子標(biāo)記。 通過(guò)進(jìn)一步挖掘H-FABP 基因和A-FABP 基因與羊的生長(zhǎng)性狀之間的關(guān)聯(lián)性, 可以為羊的育種及遺傳改良提供參考。

        3.3 豬

        H-FABP 基因被定位在豬的6 號(hào)染色體上,有4 個(gè)外顯子;A-FABP 基因被定位于4 號(hào)染色體上,有4 個(gè)外顯子。 Tyra 等[35]研究發(fā)現(xiàn)H-FABP基因在豬肌肉組織中的表達(dá)不隨年齡或品種變化, 并且H-FABP 基因與豬脂肪組織的發(fā)育和功能存在關(guān)聯(lián)性。Shang 等[36]比較了高肌內(nèi)脂肪的藏豬和低肌內(nèi)脂肪的大白豬H-FABP 基因的mRNA和蛋白表達(dá)量, 并基于PCR-RFLP 對(duì)其進(jìn)行基因分型,結(jié)果表明,C-1375G 位點(diǎn)可能與豬肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)。 Zhu 等[37]研究表明,肥育豬飼糧中添加二丁酰環(huán)腺苷酸降低了A-FABP 基因的表達(dá)水平,抑制了前脂肪細(xì)胞的增殖和分化,從而減少了脂肪沉積。 目前關(guān)于A-FABP 基因和H-FABP 基因的研究主要涉及豬脂肪組織代謝, 通過(guò)調(diào)節(jié)脂肪組織中脂肪沉積和分解之間的平衡可以為提升豬生產(chǎn)性狀及品種改良提供依據(jù)。

        3.4 雞

        H-FABP 基因被定位于雞的23 號(hào)染色體上,有4 個(gè)外顯子;A-FABP 基因被定位于2 號(hào)染色體上,有4 個(gè)外顯子。 Wang 等[38]通過(guò)研究拜城油雞胸肌和腿肌中A-FABP 基因多態(tài)性和mRNA量與肌內(nèi)脂肪含量之間的關(guān)聯(lián)性, 表明A-FABP基因是進(jìn)一步研究雞肌內(nèi)脂肪沉積機(jī)制的合理候選基因。 Wang 等[2]利用全基因組分析手段研究發(fā)現(xiàn)雞FABPs 基因家族成員與哺乳動(dòng)物具有相似的功能域、基因結(jié)構(gòu)和進(jìn)化歷史,但表現(xiàn)出不同的表達(dá)譜和調(diào)控機(jī)制。 通過(guò)進(jìn)一步了解A-FABP 基因和H-FABP 基因?qū)﹄u肌內(nèi)脂肪沉積作用機(jī)制,可為加快雞品種選育及改良進(jìn)展提供支持。

        4 小結(jié)與展望

        目前已鑒定出12 種FABPs 基因家族成員,有9 種在畜禽中較為常見(jiàn)。 FABPs 基因主要參與調(diào)控不同器官組織脂肪酸的轉(zhuǎn)運(yùn)代謝, 通過(guò)影響肌內(nèi)脂肪含量來(lái)改善肉質(zhì)的嫩度、風(fēng)味和多汁性。近年來(lái),F(xiàn)ABPs 基因家族成為提高動(dòng)物肉質(zhì)、胴體等表型的重要研究對(duì)象, 其基因多態(tài)性也成為動(dòng)物肌內(nèi)脂肪性狀分子育種改良的熱點(diǎn)[39-41]。

        探索新興生物技術(shù)在動(dòng)物育種領(lǐng)域的應(yīng)用,通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析、基因敲除、基因轉(zhuǎn)染等現(xiàn)代分子生物學(xué)方法,進(jìn)一步了解FABPs 基因家族成員在不同細(xì)胞和組織中調(diào)節(jié)脂肪酸代謝的機(jī)制,挖掘FABPs 基因家族成員在育種領(lǐng)域的應(yīng)用潛力, 可為畜禽分子育種發(fā)現(xiàn)新的候選基因提供技術(shù)支撐。

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