李心珠,谷春梅*,于寒松,董鵬超,鮑云翔
(1.吉林農(nóng)業(yè)大學食品科學與工程學院,吉林長春 130118)(2.國家大豆產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系加工研究室,吉林長春 130118)
大豆含有豐富的蛋白質(zhì)和各種必需氨基酸,是主要的工業(yè)原材料及經(jīng)濟作物。同時富含多種抗營養(yǎng)因子,其中大豆胰蛋白酶抑制因子(Soybean Trypisin Inhibitor,STI)是一種很重要的抗營養(yǎng)因子,包括Kunitz 胰蛋白酶抑制因子(Kunitz Trypsin Ihhibitor,KTI )和 Bowman-Birk 胰蛋白酶抑制因子(Bowman-Birk Inhibitor,BBI)[1]。一方面,其與胰蛋白酶、糜蛋白酶相互作用,形成一種不易降解的穩(wěn)定復(fù)合體,導致蛋白質(zhì)的消化吸收與利用減弱。另外,因為人體蛋白酶降低,造成體內(nèi)含硫氨基酸降低,引起胰腺腫大、免疫功能下降等,危害人類及動物健康,制約各行業(yè)大豆利用率[2],因此對其檢測勢在必行。目前對于KTI 的檢測有脲酶檢測、酶化學檢測法,酶聯(lián)免疫吸附試驗是目前最廣泛的一種免疫檢測法,用于大豆抗營養(yǎng)成分測定[3,4],通過酶高效催化作用,使抗體的特異性結(jié)果放大。由于抗體合成成本高以及本身易受到外界環(huán)境的干擾,因此,有必要建立高效的KTI 檢測技術(shù)。
作為一種新型信號分子,核酸適配體具有高親和力、易于合成修飾、成本低、靶標范圍大等優(yōu)點[5-8],使其在蛋白質(zhì)作用研究[9-11]、環(huán)境監(jiān)控[12-14]、食品安全檢測[15-17]等眾多領(lǐng)域受到了廣泛重視[18]。核酸適配體作為寡核苷酸片段與靶分子結(jié)合,通過構(gòu)建適配體生物傳感器將結(jié)合信號轉(zhuǎn)化為易于檢測的信號[19],分為熒光適配體傳感器[20-22]、比色適配體傳感器[23,24]、電化學適配體傳感器[25,26]等。目前納米材料被用于多種方面[27],由于其靈敏、操作簡單等被作為輔助元件[28]。CNPs 為其中一種,具有價格低廉、生物相容性好、無毒害等優(yōu)點[29]。由于CNPs 具有納米尺度和碳物質(zhì)特性,對平面型染料分子的作用強,利用π-π堆積作用,可以使單鏈DNA 在其表面產(chǎn)生強烈的吸附,吸附在CNPs 表面上的熒光團通過電子或能量轉(zhuǎn)移被有效淬滅,因此CNPs 作為熒光淬滅劑,將為生物分子熒光識別技術(shù)的發(fā)展奠定基礎(chǔ)[30]。
近年來,核酸信號放大技術(shù)廣泛用于不同物質(zhì)的分析檢測,其中ExoIII能不斷催化降解雙鏈DNA,并特異性催化其從3’末端水解[31],其信號放大不需要特定的識別序列,適用于生物傳感平臺的構(gòu)建,已被用于核酸[32,33]、金屬離子[34]、有機物[35]等的檢測。本研究構(gòu)建一種ExoIII信號放大技術(shù)與CNPs 結(jié)合的方法,實驗原理如圖1 所示,由KTI 適配體、cDNA、SP、ExoIII和CNPs 5 個部分組成。不存在KTI 時,APT 與cDNA 產(chǎn)生互補雙鏈,SP 為單鏈結(jié)構(gòu),加入CNPs 后,SP 被CNPs 吸附淬滅;當KTI 存在時,KTI與APT 結(jié)合,cDNA 和SP 互補成雙鏈,無法被CNPs吸附,SP 依然呈現(xiàn)熒光態(tài),同時ExoIII在3’末端對其進行降解,并通過ExoIII的周期性切割釋放出大量熒光團,使熒光強度得到明顯提高,基于此可對KTI進行靈敏檢測。
圖1 熒光適配體生物傳感器檢測原理圖Fig.1 Fluorescence aptamer biosensor detection schematic
KTI、BBI、SBA標準品,均購于美國Sigma-Aldrich公司;碳納米顆粒,購于北京德科島金;核酸外切酶III,購于蘇州近岸蛋白質(zhì)科技股份有限公司;豆?jié){;DNA 序列,均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。據(jù)文獻報道,在3’-端的雙鏈DNA 必須至少有4 個不匹配的堿基,以阻止ExoIII的水解[36]。因此將4 個胸腺嘧啶T 添加到APT 與cDNA 的3’-端,以阻止ExoIII的DNA 水解,表1 是用于實驗的所有序列。
表1 DNA 序列Table 1 DNA sequences
MB-102 恒溫金屬振蕩浴,杭州博日科技有限公司;YHZ-112B 恒溫振蕩培養(yǎng)搖床,蘇州市國飛儀器有限公司;infinitieM200型多功能酶標儀,Nano Quant;TGL-16 型高速臺式離心機,上海安亭儀器廠。
1.3.1 熒光適配體生物傳感器檢測KTI
首先,將APT、cDNA、SP 的濃度分別配置為0.2、0.2、1 μmol/L,取50 μL APT 與50 μL 的KTI 溶液進行混合,其中KTI 的質(zhì)量濃度為200 ng/mL,室溫反應(yīng)1 h;然后分別取50 μL cDNA 和50 μL SP 加入到上述混合物中,在室溫下反應(yīng)30 min;最后,添加含40 U ExoIII的緩沖液100 μL,對SP進行消化,在37 ℃條件下反應(yīng)2 h;當酶解結(jié)束以后,將體系加熱到75 ℃進行5 min 后停止反應(yīng);然后,在反應(yīng)混合物中添加200 μL 的CNPs 溶液,最后的體積是500 μL,并在37 ℃黑暗的條件下培養(yǎng)該混合物30 min[37]。熒光發(fā)射光譜測試條件為:激發(fā)波長為490 nm,發(fā)射波長范圍為500~640 nm,入射狹縫以及出射狹縫寬度為5 nm。依照523 nm 處的峰值強度對KTI 的濃度做定量分析。
1.3.2 CNPs 質(zhì)量濃度的優(yōu)化
CNPs 在本研究中用作檢測平臺,它的質(zhì)量濃度是影響檢測結(jié)果的主要因素。如果系統(tǒng)中CNPs 質(zhì)量濃度太低,無法有效地消除未被水解的信號探針SP的熒光,從而使背景熒光強度太高影響檢測限;在質(zhì)量高濃度下淬滅過大會使測定結(jié)果不精確,所以必須優(yōu)化CNPs 的質(zhì)量濃度。CNPs 的添加質(zhì)量濃度為20、40、60、80、100 μg/mL,采用與上述1.3.1 熒光適配體生物傳感器檢測KTI 相同的方法進行測定。
1.3.3 可行性試驗
核酸外切酶III作為一種切割酶,具有高效的酶催化活性,對靶標循環(huán)有促進作用[38]。為了增加檢測的靈敏度,使用ExoIII對熒光信號進行輔助放大,為了驗證該方法是否可行需對其進行試驗分析,試驗共分為a、b、c、d 四組,試劑組合如下表2 所示,其中沒有添加的試劑被ddH2O 取代,KTI 的質(zhì)量濃度是200 ng/mL,最終體積為500 μL,反應(yīng)過程同1.3.1。
表2 試劑及組合Table 2 Reagent and combination
1.3.4 特異性研究
為了檢驗該方法對KTI 的特異性,分別加入質(zhì)量濃度為200 ng/mL 的KTI、BBI、SBA 標準溶液,其余操作與1.3.1 相同。通過比較不同種類的KTI 類似物存在時,體系的相對熒光強度大小來判斷本方法的選擇性。
1.3.5 豆?jié){樣品中KTI 加標回收測定
取豆?jié){樣品作為檢測對象,驗證體系在實際樣品中的實用性,具體方法如下:用ddH2O 將豆?jié){配置為φ=1%的緩沖體系,加入不同量的KTI 溶液,KTI 的質(zhì)量濃度為50、100、500 ng/mL,獲得了一系列濃度的加標KTI 標準溶液。將APT、cDNA、SP 的濃度分別配置為0.2、0.2、1 μmol/L,取50 μL APT 與50 μL 加標KTI 溶液進行混合,室溫反應(yīng)1 h;分別取50 μL cDNA 和50 μL SP 加入到上述混合物中,在室溫下反應(yīng)30 min;然后,添加含40 U ExoIII的緩沖液100 μL,消化SP,在37 ℃條件下反應(yīng)2 h;當酶解結(jié)束以后,將體系加熱到75 ℃進行5 min 后停止反應(yīng);最后,在反應(yīng)混合物中添加200 μL 的CNPs 溶液,反應(yīng)總體積為500 μL,并在37 ℃黑暗的條件下培養(yǎng)該混合物30 min,測試條件同1.3.1。
1.3.6 數(shù)據(jù)分析
試驗中的分析數(shù)值均采用三次平行試驗進行處理,以“平均值±標準差”表示;采用Origin 2021 和GraphPad Prism 8 軟件繪圖;采用Excel 2010 進行數(shù)據(jù)處理。
CNPs 是傳感器的檢測平臺,其質(zhì)量濃度對檢測結(jié)果有重要影響[39],因此需要對其質(zhì)量濃度進行優(yōu)化。圖2 為體系中加入不同濃度的CNPs,KTI 是否存在的條件下熒光強度值的變化,其中紅色柱狀為添加KTI 溶液時的熒光強度,黃色柱狀為未添加KTI 時的熒光強度。從圖2 中可以看到,CNPs 質(zhì)量濃度越來越高,系統(tǒng)的熒光強度逐漸降低,CNPs 質(zhì)量濃度為40 μg/mL 時,熒光強度顯著高于其他更高質(zhì)量濃度(P<0.05),當CNPs 質(zhì)量濃度達到60 μg/mL 后,質(zhì)量濃度增大對熒光強度的變化影響不顯著,逐漸趨于平穩(wěn)。是因為隨著CNPs 質(zhì)量濃度的增加,熒光信號被大量淬滅。
圖2 CNPs 在不同質(zhì)量濃度下的熒光強度對照圖Fig.2 Comparison of fluorescence intensity of CNPs at different mass concentrations
如圖3 所示為體系的相對熒光強度,呈現(xiàn)先升高后下降趨勢,當CNPs 質(zhì)量濃度為60 μg/mL 時,相對熒光強度值最高,為1.0 左右,與其他數(shù)據(jù)之間具有顯著差異(P<0.05),之后的相對熒光強度沒有顯著差異(P>0.05),因此選擇60 μg/mL 作為最終的優(yōu)化結(jié)果。與馮婷婷等[40]基于CNPs 傳感器檢測腺苷脫氨酶實驗結(jié)果相比,CNPs 優(yōu)化質(zhì)量濃度相似。
圖3 CNPs 在不同質(zhì)量濃度下的相對熒光強度Fig.3 The relative fluorescence intensity of CNPs at different mass concentrations
為了考察實驗方法的有效性,該實驗采用了檢測體系中是否出現(xiàn)ExoIII時對熒光強度的影響來檢驗實驗方法的準確性,如圖4 所示。在體系中不具有ExoIII時,加入KTI 與不加入KTI 的熒光強度對比有較小范圍的不同(圖4 中的b、c),但KTI 的引入使適配體與KTI 結(jié)合,cDNA 與信號探針SP 互補,由此產(chǎn)生了雙鏈DNA,不能完全被CNPs 吸附,從而增加了溶液的熒光強度;當體系中加入ExoIII時,體系與CNPs 進行酶促切割,從而使檢測信號放大,熒光強度顯著增加(圖4 中的a、d),但是體系的背景熒光沒有太大變化,此時的熒光信號是背景信號的3 倍左右。相對于沒有ExoIII的情況下,添加之后熒光信號增加約80%(圖4 中的b、d)。實驗結(jié)果顯示,利用ExoIII循環(huán)放大技術(shù)可以提高熒光信號的強度,與趙陽陽[41]實驗關(guān)于適配體生物傳感器檢測赭曲霉毒素A的可行性分析中的結(jié)果基本相同,說明此方法可行。
圖4 不同體系的熒光光譜圖Fig.4 Fluorescence spectra of different systems
方法可行性和CNPs 質(zhì)量濃度優(yōu)化試驗條件確定后,將不同質(zhì)量濃度的KTI(100~600 ng/mL)加入到檢測體系,以研究適配體生物傳感器對于KTI 檢測的靈敏度。如圖5 所示,實驗結(jié)果表明,隨著KTI 濃度的增加熒光強度逐漸增加,在此范圍內(nèi)呈線性相關(guān),線性相關(guān)系數(shù)R2=0.999 1,檢測限(LOD)設(shè)定為三倍空白溶液的熒光信號的標準偏差,因此得出適配體生物傳感器檢測限(LOD)為12.59 ng/mL。對照現(xiàn)有KTI 檢測技術(shù),如表3 所示,本方法對于KTI 的檢測優(yōu)于文獻報道[42],具有更低的檢測限,靈敏度較高。
表3 本方法與現(xiàn)有檢測技術(shù)對比Table 3 This method is compared with existing detection techniques
圖5 傳感器在不同KTI 質(zhì)量濃度下的標準曲線Fig.5 The standard curve of the sensor at different KTI mass concentrations
選擇以下兩種KTI 類似物BBI、SBA 進行特異性試驗,通過對KTI 適配體生物傳感器的特異檢測,是測定其可靠性的一個重要參數(shù)。主要在于檢測其能特異性結(jié)合KTI 外,是否還與其他KTI 結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì)結(jié)合。如圖6 所示,實驗結(jié)果表明,與其他兩種類似物BBI、SBA 相比,KTI 體系中相對熒光強度最高,為0.9 左右,與其他兩組數(shù)據(jù)之間存在顯著性差異(P<0.05),兩種類似物的相對熒光強度較小,核酸適配體不能識別,兩者數(shù)據(jù)間沒有顯著性差異(P>0.05)。結(jié)果表明,KTI 適配體能夠進行KTI 的特異性識別,因此驗證了該適配體生物傳感器對KTI具有良好的選擇性和特異性。
圖6 KTI 的特異性試驗Fig.6 Specificity test of KTI
基于這種適配體生物傳感器具有良好的檢測能力和良好的選擇性,在實際樣本中評價其檢測方法的可行性。用ddH2O 將豆?jié){配置為1%的緩沖體系,加入不同量的KTI 溶液用于分析測定,KTI 的質(zhì)量濃度分別為50、100、500 ng/mL,采用加標回收法對三種不同KTI 質(zhì)量濃度的回收率進行測定,如表4 所示。回收率介于97.42%~102.85%范圍內(nèi),數(shù)據(jù)之間沒有顯著性差異(P>0.05),相對標準偏差(RSD)在0.61%~2.36%之間,檢測準確度良好。結(jié)果表明ExoIII輔助放大信號檢測法對于實際樣品中的KTI表現(xiàn)出良好的檢測性能,能有效用于實際樣品的檢測。
表4 適配體生物傳感器用于豆?jié){樣品中KTI 的測定Table 4 Aptamer biosensor for the determination of KTI in soybean milk samples
開發(fā)了一種以核酸適配體作為識別單元,核酸外切酶III作為信號放大元件以及碳納米顆粒作為信號開關(guān)的熒光型適配體生物傳感器,利用ExoIII不斷降解-雜交循環(huán),結(jié)合CNPs 的熒光淬滅效果對檢測信號進行放大,可以有效提高KTI 檢測的靈敏度。KTI 的熒光強度與KTI 濃度之間存在著一定的線性關(guān)系,線性相關(guān)系數(shù)R2=0.999 1,檢測限(LOD)為12.59 ng/mL,所設(shè)計的核酸適配體生物傳感器顯示出良好的選擇性。以豆?jié){作為樣品,采用加標回收法測得回收率為97.42%~102.85%,相對標準偏差(RSD)在0.61%~2.36%之間。相對于常規(guī)的測定方法,該方法具有操作簡便、靈敏度高、專一性良好等優(yōu)點,可以作為一種新的測定方法用于實際樣品中KTI 的檢測。