珠江所在斑鳠基因組開發(fā)方面取得進(jìn)展
2024-01-01 00:00:00
水產(chǎn)科技情報(bào) 2024年4期
近日，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在珠江土著魚類斑鳠基因資源研究方面取得新進(jìn)展，獲得了斑鳠雌雄端粒到端粒基因組，為進(jìn)一步開展其繁育和雌雄鑒定研究提供了基因資源。相關(guān)研究論文發(fā)表于期刊Scientific Data。
斑鳠是珠江四鮮之一。因其肉質(zhì)鮮美、無肌間骨等特征，素稱淡水之王，是我國重要的經(jīng)濟(jì)魚類。由于過度捕撈和水壩建設(shè)，中國南方的斑鳠數(shù)量急劇減少，其野生種群被列為國家重點(diǎn)保護(hù)野生動物（二級）。為加快斑鳠人工繁育和解決早期雌雄鑒別等產(chǎn)業(yè)問題，該研究結(jié)合HiFi、Hi-C和轉(zhuǎn)錄組測序，分別獲得了斑鳠雄性和雌性的端粒到端?；蚪M。雄性基因組大小約為749.1 Mb，BUSCO評估的完整性為94.2%；雌性基因組大小約為747.8 Mb，BUSCO評估的完整性為95.0%。雄性和雌性個(gè)體中分別獲得了35 277個(gè)和34 571個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因集。
本研究中組裝的兩個(gè)基因組將為后續(xù)斑鳠的種群遺傳學(xué)、繁育及性別鑒定分子標(biāo)記的開發(fā)提供數(shù)據(jù)資源。
（來源：珠江水產(chǎn)研究所）
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