近日,中國科學(xué)院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,聯(lián)合北京基因組研究所張維綺研究組,在《細(xì)胞干細(xì)胞》(Cell Stem Cell)上在線發(fā)表題為“Decoding aging-dependent regenerative decline across tissues at single-cell resolution”的研究論文。該研究通過在年輕和年老小鼠中構(gòu)建八種組織器官損傷后再生修復(fù)模型,首次在單細(xì)胞分辨率系統(tǒng)比較了不同組織中參與再生修復(fù)過程的分子動態(tài)變化規(guī)律,揭示了干細(xì)胞響應(yīng)和血管生成能力降低是年老組織再生功能障礙的關(guān)鍵因素,并鑒定出年輕器官強(qiáng)再生能力相關(guān)的巨噬細(xì)胞新亞群。該成果有助于增加科學(xué)家對增齡伴隨的再生異常及器官退行規(guī)律的認(rèn)知,為發(fā)展促進(jìn)組織再生、延緩衰老的干預(yù)策略提供了新的線索和思路。
該研究利用小鼠作為模式動物構(gòu)建了八種組織損傷后的再生修復(fù)模型,包括肝臟部分切除損傷、骨骼肌冷凍損傷、皮膚缺損損傷、后肢缺血損傷、小腸輻照損傷、肺臟化學(xué)損傷、骨髓輻照損傷及心肌缺血損傷。研究通過一系列生理功能檢測和組織學(xué)分析發(fā)現(xiàn),在年輕的小鼠個體中,除了心肌再生能力極低外,其他的組織均具備一定的損傷后修復(fù)能力,且這些組織的再生修復(fù)能力均伴隨機(jī)體衰老發(fā)生顯著下調(diào)。
相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),年輕人的皮膚受傷后會迅速修復(fù)自愈,而老年人的傷口愈合卻較為緩慢;同樣,相較年輕人,老年人其他組織在受到損傷后所需要的修復(fù)時間也更長,且恢復(fù)效果往往更差。這些現(xiàn)象說明衰老可引起組織再生功能降低,阻礙組織損傷的有效修復(fù)。
“什么控制著器官再生”“我們可以阻止自己衰老嗎”是《科學(xué)》雜志公布的全球頗具挑戰(zhàn)性的科學(xué)問題?!霸偕笔菣C(jī)體組織應(yīng)對損傷進(jìn)行修復(fù)及重塑的生物學(xué)過程,對維持器官功能穩(wěn)態(tài)具有重要作用,體現(xiàn)了生命自我修復(fù)與組織重建的能力。而衰老是隨著時間的推移,生物體功能逐漸下降、身體結(jié)構(gòu)逐漸受損的生物學(xué)過程,表明生命的有限性與定向性?!霸偕焙汀八ダ稀本歉叨葟?fù)雜的系統(tǒng)生物學(xué)過程,二者既相互對立,又緊密聯(lián)系。然而,目前仍然缺少從系統(tǒng)水平解碼衰老伴隨的組織再生障礙和衰老過程中再生能力變化規(guī)律的研究。同時,由于組織的異質(zhì)性,不同組織器官再生是否遵循共同的調(diào)控規(guī)律;能否通過挖掘再生障礙相關(guān)的生物標(biāo)志物及關(guān)鍵調(diào)控基因,發(fā)展調(diào)控再生、干預(yù)衰老及其相關(guān)疾病的新策略,這些關(guān)鍵科學(xué)問題亟待探明。
為了解析衰老導(dǎo)致再生功能障礙的分子機(jī)制,科研人員繪制了跨年齡、跨組織的損傷修復(fù)動態(tài)時序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄譜,并建立了三套分析模式來比較年輕和年老組織對于損傷的響應(yīng)機(jī)制,即損傷后的急性響應(yīng)期的異同,損傷后不同階段的轉(zhuǎn)錄組差異以及再生全過程的基因表達(dá)動態(tài)變化。研究發(fā)現(xiàn),組織炎癥異常、細(xì)胞死亡增加和血管新生能力降低是導(dǎo)致衰老組織再生功能障礙的重要因素。
該研究進(jìn)一步對跨越不同器官普遍存在的細(xì)胞類型(如免疫細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞及成體組織干細(xì)胞)進(jìn)行比較分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),再生過程中年輕的免疫細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞會高水平表達(dá)促進(jìn)損傷修復(fù)和血管生成相關(guān)基因,這提示了它們可能是賦能年輕機(jī)體更強(qiáng)損傷修復(fù)活性的關(guān)鍵細(xì)胞類型。此外,年輕和年老的組織損傷后激活的干細(xì)胞亞群不同,年老特異的干細(xì)胞亞群低表達(dá)分化相關(guān)的基因,同時高表達(dá)細(xì)胞衰老基因,說明衰老組織中的干細(xì)胞處于低活性狀態(tài)。
此外,該工作還鑒定出一群高表達(dá)Arg1的巨噬細(xì)胞(Arg1+巨噬細(xì)胞),這群細(xì)胞表現(xiàn)出組織修復(fù)相關(guān)的分子特征,并高表達(dá)與內(nèi)皮細(xì)胞增殖、生長因子產(chǎn)生、傷口愈合和血管生成調(diào)節(jié)相關(guān)的基因。結(jié)合進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),這群細(xì)胞可能通過與內(nèi)皮細(xì)胞相互作用,促進(jìn)血管新生。Arg1+巨噬細(xì)胞的數(shù)量在年輕組織的再生修復(fù)過程中受到精密調(diào)控,在再生修復(fù)早期顯著增加,并很快恢復(fù)至損傷前水平。而在年老組織中,這群細(xì)胞的數(shù)量在穩(wěn)態(tài)階段高于年輕組織,但損傷修復(fù)過程中并未出現(xiàn)劇烈變化。這提示衰老組織中的再生相關(guān)免疫細(xì)胞處于一種“脫敏”的“低彈性”狀態(tài),可能阻礙了器官組織損傷后的及時重塑和修復(fù)。
綜上所述,該研究首次在系統(tǒng)水平解碼了不同組織再生過程中的動態(tài)變化規(guī)律,闡明了增齡所致組織再生能力減損的細(xì)胞和分子機(jī)制,建立了再生和衰老的全新關(guān)聯(lián),揭示了調(diào)控哺乳動物再生的潛在細(xì)胞和分子靶標(biāo),為探討多組織再生規(guī)律、剖析增齡導(dǎo)致的再生障礙,提供了寶貴的資源。此外,該研究鑒定出一類新型Arg1+巨噬細(xì)胞亞群,可能通過促進(jìn)血管生成,參與促進(jìn)組織損傷后的重塑和修復(fù),提示靶向特定巨噬細(xì)胞有望干預(yù)衰老相關(guān)的再生障礙,為發(fā)展延緩衰老的新策略提供了思路。該研究為實(shí)現(xiàn)組織器官修復(fù)、預(yù)防和治療衰老相關(guān)疾病奠定了重要的理論基礎(chǔ)。
該研究由中國科學(xué)院動物所、北京基因組所、北京干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究院、首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院等合作完成。研究工作得到科學(xué)技術(shù)部、國家自然科學(xué)基金委員會、中國科學(xué)院等的支持。