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        泰山白首烏根際真菌Penicillium sp. XYR-9活性次級代謝產(chǎn)物研究

        2023-10-20 05:48:28呂甫晉孔大慶屈敬之劉熙瑾李曉玉潘國軍

        呂甫晉 孔大慶 屈敬之 劉熙瑾 李曉玉 潘國軍

        山東第一醫(yī)科大學(xué)(山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院) 生命科學(xué)學(xué)院,山東 泰安 271016

        泰山白首烏(cynanchum bungeidecne)為“泰山四大名藥”之首,具有養(yǎng)血益肝、固精益腎及抗衰老等作用[1]。白首烏生長過程中,根系會(huì)對根際土壤微生物產(chǎn)生重要影響[2],其次級代謝產(chǎn)物具有顯著的藥理活性。

        吲哚是重要的含氮化合物,許多天然化合物和合成藥物的結(jié)構(gòu)中都包含有這類雜環(huán)骨架[3]。吲哚生物堿天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)多樣,研究發(fā)現(xiàn)其具有降脂、抗糖尿病、抗癌、抗菌等多種生物活性,是開發(fā)新型藥物的重要來源[4-9]。萜類天然產(chǎn)物生物活性顯著,是許多藥用植物的活性成分,并為創(chuàng)新藥物研發(fā)提供了大量重要源頭分子或先導(dǎo)化合物,其中許多化合物或其衍生物已被開發(fā)成藥物[10]。萜類化合物往往結(jié)構(gòu)復(fù)雜、手性中心較多,利用化學(xué)合成方法工業(yè)化生產(chǎn)比較困難,因此需要解決萜類化合物來源及高效、低毒新型抗菌先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)問題[11]。

        本研究從泰山白首烏中篩選獲得的根際真菌,選擇最適培養(yǎng)條件,批量發(fā)酵獲得次級代謝產(chǎn)物,分離鑒定單體化合物結(jié)構(gòu)并評價(jià)其生物活性,為新型抗菌藥物先導(dǎo)化合物開發(fā)提供新的研究方向。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品采集 白首烏根際土壤樣品于2021年10 月13 日采自山東省泰安市的泰山(36°19′120.84′′N,117°13′40.53.54′′E),地下5~20 cm白首烏根莖表面土壤。

        1.1.2 分離培養(yǎng)基 馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基;孟加拉紅培養(yǎng)基。

        1.1.3 發(fā)酵培養(yǎng)基 真菌Ⅰ號(hào)培養(yǎng)基、真菌Ⅱ號(hào)培養(yǎng)基、真菌Ⅲ號(hào)培養(yǎng)基、真菌Ⅳ號(hào)培養(yǎng)基、ISP2培養(yǎng)基、大米培養(yǎng)基、馬鈴薯葡萄糖肉湯培養(yǎng)基(potato dextrose broth,PDB)。

        1.1.4 分析培養(yǎng)基 LB 培養(yǎng)基:胰蛋白胨1%,酵母提取物0.5%,氯化鈉1%。

        1.1.5 實(shí)驗(yàn)菌株 抑菌活性實(shí)驗(yàn)采用2 種敏感菌株:金黃色葡萄球菌(Staphyloccocus aureusATCC33591)、大腸桿菌(Escherichia coliATCC25922)。

        1.2 方法

        1.2.1 樣品處理與菌株的分離純化 無菌條件下,配置泰山白首烏根際土壤懸液(1.0 g/L),并通過倍數(shù)稀釋法稀釋成10-1、10-2、10-3、10-4、10-5的濃度,各取100 μL分別涂布于PDA、孟加拉紅培養(yǎng)基,于28 ℃倒置培養(yǎng)2~7 d,通過平板劃線法分離直至獲得單菌落。

        1.2.2 篩選活性菌株 對分離得到的單菌落進(jìn)行大米培養(yǎng)基固體發(fā)酵25 d,等體積乙酸乙酯萃取,減壓濃縮得粗浸膏,并配置成1.0 g/L甲醇溶液。采用藥敏紙片法檢測次級代謝產(chǎn)物粗提物(10 μL)的抑菌活性:選用敏感菌株大腸桿菌和金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株,陽性對照藥為環(huán)丙沙星(0.1 g·L-1),倒置于27 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)1 d后觀察并測量抑菌圈大小。通過篩選獲得具有抑制金黃色葡萄球菌和大腸桿菌活性的4株菌株(抑菌圈直徑 > 5 mm),見表1。

        并通過篩選不同類型培養(yǎng)基(圖1),富集次級代謝產(chǎn)物后,分析次級代謝產(chǎn)物化學(xué)豐富度,最終確定發(fā)酵菌株為XYR-9,最終發(fā)酵條件為大米培養(yǎng)基28 ℃靜置發(fā)酵。

        圖1 Penicillium sp. XYR-9在不同培養(yǎng)基中的生長狀態(tài)

        1.2.3 菌株發(fā)酵與粗提物的富集 無菌條件下,挑取單菌落至PDB培養(yǎng)基,28 ℃搖床培養(yǎng)3 d;隨后按1%接種量,接種至大米固體培養(yǎng)基80 g (共發(fā)酵20 瓶),28 ℃靜置發(fā)酵30 d;發(fā)酵結(jié)束用100 mL 乙酸乙酯浸泡菌絲體過夜,重復(fù)3次后合并濾液,減壓濃縮獲得粗提物。

        1.2.4 單體化合物分離純化 采用不同極性的石油醚∶乙酸乙酯(V/V) 10∶1、8∶1、6∶1、4∶1、2∶1、1∶1、0∶1各800 mL,獲得不同極性段組分,通過薄層色譜(thin layer chromatography,TLC)和高效液相(high performance liquid chromatography,HPLC)指紋圖譜分析,合并相同的組分,獲得5 個(gè)組分F1 ~ F5。其中,組分F3、F4 和F5 利用甲醇∶水(V/V)70%、80%、90%、95%、100%各500 mL 進(jìn)行洗脫,獲得亞組分F3.1-F3.4、F4.1-F4.3 和F5.1-F5.6。采用半制備高效液相甲醇∶水(V/V)90%等度洗脫,通過分離純化亞組分F3.3 得到化合物1(28 mg,tR= 12.450 min);分離純化亞組分F3.4后得到化合物2(20 mg,tR= 15.500 min);分離純化亞組分F4.2后得到化合物3(21 mg,tR= 6.450 min);分離純化亞組分F3.2后得到化合物4 (21 mg,tR= 8.650 min);分離純化亞組分F6.1后得到化合物5(21 mg,tR= 6.600 min)。

        2 結(jié) 果

        2.1 菌株的鑒定

        通過真菌內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)保守序列擴(kuò)增,對Penicilliumsp. XYR-9菌株進(jìn)行了分析鑒定。根據(jù)測序結(jié)果,在GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行Blast 比對,搜索同源系列,選取有代表性菌株序列分析構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2),XYR-9菌株與Penicilliumfructuariae同源性較高,結(jié)合菌株形態(tài)學(xué)(圖3)分析,XYR-9鑒定為青霉素屬真菌。

        圖2 根據(jù)XYR-9序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖3 4株對金黃色葡萄球菌和大腸桿菌有抑制作用的菌株形態(tài)照片

        2.2 活性代謝產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)鑒定

        化 合 物1 ~ 5 經(jīng) 核磁 共振(1H-NMR 和13CNMR)、質(zhì)譜(mass spectrometry,MS)等進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析。

        化合物1:淡黃色固體,ESIMS m/z 421.29 [M+H]+。其13C NMR 和1H NMR 譜圖預(yù)測結(jié)構(gòu)中具有1個(gè) 吲 哚 環(huán)(δ 150.86, 139.98, 130.25, 127.92,125.00,120.42, 119.54, 118.39, 111.45)(表2),5個(gè)甲基、8個(gè)芳香或雙鍵碳(包括4個(gè)次甲基和4個(gè)季碳)和1 個(gè)醇羥基?;衔? 被鑒定為paspaline 3[12]。

        表2 化合物1 ~ 5 13C NMR(100 MHz)在CDCl3中的數(shù)據(jù)

        化合物2:淡黃色固體,ESIMS m/z 569.35 [M+H]+。根據(jù)13C 和1H NMR 譜圖分析其同樣含有吲哚環(huán),同時(shí)具有二萜結(jié)構(gòu)(δ 129.75, 129.39, 129.32,129.00, 125.09, 125.02, 24.55, 24.46, 22.43,20.91, 16.91, 16.58)(表2),8 個(gè)甲基、10 個(gè)芳香或雙鍵碳(包括3 個(gè)次甲基和7 個(gè)季碳)和1 個(gè)醇羥基。化合物1被鑒定為shearinine F[13]。

        化合物3:淡黃色固體,ESIMS m/z 421.26 [M+H]+。與化合物1的紫外吸收譜圖非常相似,提示它們?yōu)橄嗨苹衔铩F?3C 和1H NMR 譜圖顯示有一個(gè)雙鍵碳(δ 121.31)(表2)?;衔? 被鑒定為PC-M6-2[14]。

        化合物4:淡黃色固體,ESIMS m/z 584.34 [M+H]+。根據(jù)13C和1H NMR譜圖分析其同樣含有吲哚環(huán),具有1 個(gè)酮羰基、7 個(gè)甲基、12 個(gè)芳香或雙鍵碳(包括3 個(gè)次甲基和9 個(gè)季碳)和1 個(gè)醇羥基?;衔?被鑒定為shearinines D[13]。

        化合物5:淡黃色固體,ESIMS m/z 420.25 [M+H]+。與化合物1和3的紫外吸收譜圖非常相似,提示它們?yōu)橄嗨苹衔?。對?H NMR譜圖發(fā)現(xiàn)化合物5 中羥基被氧化為羰基。化合物5 被鑒定為13-desoxypaxilline[15]?;衔? ~ 5的結(jié)構(gòu)見圖4。

        圖4 化合物1 ~ 5的結(jié)構(gòu)

        2.3 化合物的抗菌活性評價(jià)

        對化合物1 ~ 5進(jìn)行抗菌活性評價(jià),指示菌株為大腸桿菌(E. coliATCC25922)和金黃色葡萄球菌(S. aureusATCC33591),陽性對照藥為環(huán)丙沙星(0.1 g·L-1)[16]。結(jié)果顯示,化合物1 ~ 5對金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株和大腸桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株的MIC 值如表3所示。

        表3 5種化合物抗菌活性評價(jià)

        3 討 論

        本研究從泰山白首烏中篩選獲得次級代謝產(chǎn)物化學(xué)豐富度高的根際真菌,鑒定并命名為Penicillium sp. XYR-9。通過選擇最適培養(yǎng)條件,確定大米培養(yǎng)基為發(fā)酵培養(yǎng)基,綜合利用正/反相硅膠柱層析、半制備高效液相色譜和波譜檢測,分離鑒定5 個(gè)吲哚二萜類化合物,通過波譜檢測闡明并確定其結(jié)構(gòu)為已知化合物paspaline 3、shearinine F、PC-M6-2、shearinines D 和13-desoxypaxilline[17]。在抗菌活性評價(jià)中化合物1、3和5對金黃色葡萄球菌和大腸桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株均有一定的抑菌活性,從結(jié)構(gòu)分析中發(fā)現(xiàn),縮酮基團(tuán)的存在對抗菌活性具有不利影響。

        由此可見,泰山白首烏根際真菌具有豐富的新型活性天然產(chǎn)物。從中發(fā)現(xiàn)的吲哚二萜類等活性天然產(chǎn)物,可為新型治療藥物先導(dǎo)化合物開發(fā)提供新的研究方向。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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