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        寧夏某醫(yī)院300 例肺炎病例病原譜分析

        2023-10-17 07:10:04楊麗娟郭邦成

        劉 翔, 楊麗娟, 沈 梅, 郝 瓊, 郭邦成, 李 剛

        (1.寧夏回族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心,銀川 750004; 2.寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院,銀川 750004)

        肺炎是臨床常見的一種下呼吸道感染性疾病,主要臨床表現(xiàn)為呼吸急促、乏力、高熱、咳嗽等癥狀,通常病情較重,嚴(yán)重危害人類健康,位居感染性疾病病死率之首,在人類總病死率中排第5~6 位[1]。引起肺炎的病原主要有細(xì)菌、病毒、支原體和衣原體等[2]。為了解寧夏銀川地區(qū)某醫(yī)院肺炎病例病原譜構(gòu)成,本研究收集2019 年1 月至2020 年12 月寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院300 例住院肺炎病例的肺泡灌洗液進(jìn)行檢測,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 材料

        2019 年1 月至2020 年12 月,收集在寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院就診,有急性感染和呼吸道臨床癥狀,且胸部X 線片提示肺部炎性改變,臨床診斷為肺炎患者的支氣管肺泡灌洗液樣本300 份。

        1.2 主要試劑和儀器

        病毒總RNA/DNA 和細(xì)菌DNA 提取試劑盒購自德國凱杰公司,呼吸道病原體多重?zé)晒釶CR檢測試劑盒購自北京卓誠惠生生物科技股份有限公司,熒光PCR 儀使用美國ABI 公司Q7 Pro和瑞士羅氏制藥公司Roch 480Ⅱ。

        1.3 方法

        參照《發(fā)熱呼吸道癥候群病原學(xué)監(jiān)測與檢測技術(shù)》[3]中的病原種類,手工提取肺泡灌洗液樣本總RNA 和DNA,采用熒光PCR 法對流感病毒、鼻病毒、冠狀病毒、副流感病毒、偏肺病毒、博卡病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、腸道病毒、肺炎支原體、肺炎衣原體、嗜肺軍團(tuán)菌、肺炎克雷伯菌、百日咳鮑特菌、流感嗜血桿菌、銅綠假單胞菌、A 組乙型鏈球菌、金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌共19 種病原體進(jìn)行檢測。實(shí)驗(yàn)過程設(shè)置內(nèi)標(biāo)、陽性對照和空白對照,檢測結(jié)果CT 值<35 且擴(kuò)增曲線呈典型的S 形曲線判定為陽性,按照北京卓誠惠生生物科技股份有限公司產(chǎn)品說明書判定結(jié)果。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法

        病例數(shù)據(jù)使用SPSS 21.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,樣本陽性率用率(%)表示,圖表制作均用Excel 2013 完成,對樣本陽性率進(jìn)行χ2檢驗(yàn)。P≤0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 病原譜

        共檢測300 份病例樣本,檢出15 種病原,陽性樣本123 份,陽性率為41.00%,其中僅病毒感染樣本29 份,陽性率為9.67%(29/300),占陽性樣本的23.58%(29/123);僅細(xì)菌感染樣本68份,陽性率為22.67%(68/300),占陽性樣本的55.28%(68/123);細(xì)菌病毒合并感染樣本26 份,陽性率為8.67%(26/300),占陽性樣本的21.14%(26/123),各類病原陽性率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=31.02,P<0.01)。病毒感染病例以冠狀病毒、鼻病毒、博卡病毒和腺病毒為主,共占病毒陽性病例的80%以上,呼吸道合胞病毒和腸道病毒未檢出;細(xì)菌感染病例以肺炎支原體、流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和銅綠假單胞菌為主,共占細(xì)菌陽性病例的85%以上,嗜肺軍團(tuán)菌和肺炎衣原體未檢出,見圖1。

        圖1 陽性樣本分類病原譜分析

        2.2 年度病原譜

        123 例陽性樣本中,2019 年74 例,陽性率59.68%(74/124),2020 年49 例,陽性率為27.84%(49/176),兩年度間樣本陽性率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=30.481,P<0.01)。2019 年感染病原以肺炎支原體、博卡病毒、冠狀病毒和流感嗜血桿菌為主,2020 年感染病原以流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌、銅綠假單胞菌和鼻病毒為主。肺炎支原體、博卡病毒、百日咳鮑特菌、流感病毒和偏肺病毒僅在2019 年檢出,見圖2。

        圖2 不同年度病原譜分析

        2.3 年齡組病原譜

        各年齡組中,細(xì)菌和病毒均有檢出,且細(xì)菌感染均高于病毒感染。5 歲以下嬰幼兒和5~15歲兒童陽性率較高,分別達(dá)到86.67%和88.89%,其余年齡組陽性樣本檢出率均在40%以下,各年齡組陽性樣本檢出率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=45.235,P<0.01)。從整體來看,65 歲以上老人病原譜最為多樣,16~35 歲青少年和36~50 歲青壯年檢出病原種類相對較少,肺炎支原體和流感嗜血桿菌在各年齡組均有檢出,但肺炎支原體主要在15 歲及以下年齡組檢出,陽性率達(dá)到71.43%(30/42),流感嗜血桿菌主要在36 歲及以上年齡組檢出。肺炎鏈球菌除了16~35 歲年齡組,在其他年齡組均有檢出,肺炎支原體和博卡病毒在5~15 歲年齡組占比較高,流感嗜血桿菌和冠狀病毒在36 歲及以上年齡組占比較高,肺炎克雷伯菌和鼻病毒主要在51 歲及以上老年人群中檢出,見圖3。

        圖3 不同年齡組病原譜分析

        2.4 混合感染病原譜

        123 份陽性樣本中,僅細(xì)菌或病毒單一感染84 例,混合感染病例39 例。混合感染病例中,2種病原感染30 例,3 種病原感染8 例,4 種病原感染1 例,其中細(xì)菌病毒合并感染和細(xì)菌間混合感染病例占97.44%(38/39),病毒間混合感染僅占2.56%(1/39)。2 種病原感染的病例中檢出的病原以肺炎支原體、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、博卡病毒和冠狀病毒為主;3 種及以上病原感染的病例中檢出的病原以流感嗜血桿菌、鼻病毒、肺炎鏈球菌和肺炎支原體為主,見圖4。

        圖4 陽性樣本混合感染病原譜分析

        3 討論

        目前,國內(nèi)多數(shù)研究僅作細(xì)菌或病毒單一種類病原的感染調(diào)查和病原譜研究[4-8],或者僅作兒童、老人的肺炎病例病原譜[9-10],檢測病原種類和年齡組覆蓋不全,不能完整反映肺炎病例感染的真實(shí)病原譜情況,寧夏地區(qū)也未見呼吸道病原譜相關(guān)的研究和報道。本研究對300 份肺炎病例的肺泡灌洗液樣本同時進(jìn)行了常見引起肺炎的共19 種細(xì)菌和病毒的病原檢測,覆蓋了絕大部分引起呼吸道感染的病原,樣本總陽性率為41%,檢出最多的病原是肺炎支原體,與石鑫等[11]在黑龍江省的研究結(jié)果一致。此次研究中,有177 例病例未檢出明確感染源,占總病例數(shù)的59.00%,分析可能有以下原因:一是,陰性病例中存在非感染性原因引發(fā)的肺炎病例;二是,受目前國內(nèi)呼吸道多重病原檢測方法和試劑的限制,此次研究未涵蓋所有引起肺炎的病原;三是,住院病歷顯示大多使用抗生素和抗病毒藥物治療,致使患者體內(nèi)病原感染量降低,受核酸提取試劑盒效率和檢測方法、試劑盒靈敏度的限制,出現(xiàn)假陰性結(jié)果。

        從整體病原譜來看,細(xì)菌性病原感染高于病毒性感染,單一病原感染高于多病原合并感染,細(xì)菌感染病例以肺炎支原體、流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和銅綠假單胞菌為主,病毒感染病例以冠狀病毒、鼻病毒、博卡病毒和腺病毒為主,各類病原陽性率差異有統(tǒng)計學(xué)意義。上述結(jié)果說明,下呼吸道感染的肺炎病例主要感染源是細(xì)菌,這與黎孟楓等[3]的結(jié)論(上呼吸道感染70%~80%由病毒感染引起,下呼吸道感染多由細(xì)菌引起)一致。

        從年齡分布來看,各年齡組陽性病例中,細(xì)菌構(gòu)成比均高于病毒,5 歲以下嬰幼兒和5~15歲兒童陽性率較高,感染的主要病原體是肺炎支原體。其次為65 歲以上老人,病原譜呈現(xiàn)多樣化,各病原檢出情況差異無統(tǒng)計學(xué)意義。研究結(jié)果表明,肺炎支原體更容易誘發(fā)15 歲及以下兒童和嬰幼兒肺炎;中老年人群由于機(jī)體免疫力衰退,對各類病原均易感。

        從年度分布來看,2019 年感染病原體以肺炎支原體、博卡病毒、冠狀病毒和流感嗜血桿菌為主,2020 年感染病原以流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌、銅綠假單胞菌和鼻病毒為主,年度間陽性率差異有統(tǒng)計學(xué)意義。所有肺炎支原體陽性病例均分布于2019 年,結(jié)合2019—2020 年各年度病例數(shù)和年齡病原譜分布數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),肺炎支原體主要從學(xué)齡兒童中檢出,而2020 年15 歲及以下病例僅有5 例,均未檢出肺炎支原體。由此推斷,學(xué)齡兒童可能既是肺炎支原體的易感人群,也是主要的傳染源。2019 年和2020 年采取的防控措施是肺炎支原體感染差異明顯的直接原因。

        從混合感染來看,混合感染病例大多數(shù)伴有細(xì)菌感染,其中細(xì)菌病毒合并感染和細(xì)菌間混合感染病例占比超過97%,病毒間混合感染僅占2.56%,在2 種病原、3 種病原、4 種病原感染的病例中,肺炎支原體、流感嗜血桿菌和肺炎鏈球菌占比較高。

        綜上所述,本次研究從病原類別、年度、年齡組和多重感染4 個方面系統(tǒng)闡述了寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院肺炎感染病原譜分布情況,均是以細(xì)菌感染為主、病毒感染為輔,提示在肺炎住院患者的臨床治療過程中,可以優(yōu)先考慮抗生素治療方案,同時做好院內(nèi)感染的防控,避免交叉感染,以提升臨床治愈效果,減輕患者疾病負(fù)擔(dān)。

        本研究中,采用熒光PCR 方法對同一樣本進(jìn)行了19 種病原的檢測,受檢測試劑費(fèi)用和項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)的限制,未收集2019 年1 月至2020 年12月該院所有住院的肺炎病例進(jìn)行檢測,但所檢測項(xiàng)目覆蓋了大部分引起肺炎的病原,結(jié)果對臨床肺炎病例診治有一定的幫助。

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