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        生鮮食品致腐假單胞菌生物被膜形成及其調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展

        2023-10-17 07:02:56劉靜聰吳詩(shī)媛馮立芳朱軍莉
        食品科學(xué) 2023年17期
        關(guān)鍵詞:生鮮食品銅綠單胞菌

        魯 重,劉靜聰,吳詩(shī)媛,馮立芳,陳 劍,朱軍莉*

        (浙江工商大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,浙江省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 杭州 310018)

        我國(guó)生鮮食品資源豐富,如生鮮肉蛋奶、水產(chǎn)品和果蔬都是備受大眾青睞的食品種類,消費(fèi)量巨大。然而,生鮮食品水分含量高、具有季節(jié)性和地域性的特點(diǎn)使其收獲后在冷鏈貯運(yùn)過程中的腐損率較高,這造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。微生物是導(dǎo)致食品腐敗變質(zhì)的重要因素,特別是假單胞菌(Pseudomonas)。由于獨(dú)特的生物學(xué)特性和代謝功能,假單胞菌被公認(rèn)為導(dǎo)致魚類、肉類及乳制品等生鮮食品腐敗的最常見菌屬之一[1]。假單胞菌為假單胞菌科(Pseudomonadaceae),1984年由德國(guó)科學(xué)家Migula首次提出,按照rRNA和DNA的同源性將假單胞菌分為5 個(gè)亞群(RNA I、II、III、IV、V群)和未確定群[2]。假單胞菌屬中參與生鮮食品腐敗的熒光假單胞菌(P.fluorescens)、莓實(shí)假單胞菌(P.fragi)、銅綠假單胞菌(P.aeruginosa)等多屬于RNA I群。致腐假單胞菌有較強(qiáng)的新陳代謝活性,可以分泌多種蛋白質(zhì)酶和脂肪酶,而該菌屬的耐冷特性使其成為在冷藏條件下導(dǎo)致生鮮食品腐敗的優(yōu)勢(shì)菌。

        近年來,生物被膜作為致腐菌重要的致腐因子引起廣泛的關(guān)注。生物被膜是細(xì)菌由單個(gè)細(xì)胞的浮游狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)槎嗉?xì)胞群集狀態(tài)時(shí),依附于接觸表面所形成的由胞外多糖、纖維蛋白、脫氧核糖核酸等構(gòu)成的多聚體復(fù)合物[3]。生物被膜不僅存在食品表面,還可以在食品加工設(shè)備表面擴(kuò)散,使肉類、乳制品、水產(chǎn)品等食品加工環(huán)境產(chǎn)生持續(xù)性污染,造成經(jīng)濟(jì)損失。因此,生物被膜細(xì)菌是食品污染的潛在來源,能夠?qū)е率称纷冑|(zhì)或傳播食源性病原體,威脅人類健康。

        1 生鮮食品中致腐假單胞菌的污染

        食品生產(chǎn)、儲(chǔ)存和運(yùn)輸過程中,低溫冷鏈?zhǔn)怯行б种粕r食品微生物污染和繁殖的主要方式。致腐菌附著在食物表面并繁殖到一定數(shù)量會(huì)導(dǎo)致食物腐敗變質(zhì)或交叉污染。在需氧冷藏的多種生鮮食品中,假單胞菌被公認(rèn)為主要的優(yōu)勢(shì)腐敗菌屬,包括莓實(shí)假單胞菌、熒光假單胞菌和隆德假單胞菌(P.lundensis)等。

        1.1 污染肉類及肉制品

        多項(xiàng)研究表明,從雞肉、豬肉、牛肉等肉品中都能夠分離出多種致腐假單胞菌,肉類及其制品中的致腐假單胞菌主要以莓實(shí)假單胞菌、熒光假單胞菌和隆德假單胞菌為主[4]。Xu Yi等[5]從腐敗雞肉中分離出莓實(shí)假單胞菌、熒光假單胞菌、嗜冷假單胞菌(P.psychrophila)以及蓋氏假單胞菌(P.gessardii)4 種假單胞菌;Wang Guangyu等[6]在變質(zhì)的冷鮮雞肉中分離出熒光假單胞菌和莓實(shí)假單胞菌,并發(fā)現(xiàn)莓實(shí)假單胞菌生長(zhǎng)迅速,是冷鮮雞肉的主要致腐菌;Wickramasinghe等[7]通過熒光染色和共聚焦顯微鏡觀察莓實(shí)假單胞菌在冷藏牛肉表面的生物被膜,發(fā)現(xiàn)莓實(shí)假單胞菌易在肉表面形成生物被膜并與肉類滲出液相結(jié)合形成黏液,導(dǎo)致肉品腐敗。本課題組在冷鮮牛肉中分離出致腐性較強(qiáng)的隆德假單胞菌,并發(fā)現(xiàn)該菌與熱索環(huán)絲菌發(fā)生相互作用,導(dǎo)致肉品產(chǎn)生不良感官性狀和品質(zhì)劣變[8]。

        1.2 污染水產(chǎn)品

        假單胞菌是引起溫水域養(yǎng)殖水產(chǎn)品腐敗的重要細(xì)菌種類,其中惡臭假單胞菌(P.putida)、熒光假單胞菌、產(chǎn)氮假單胞菌(P.azotoformans)較為常見。惡臭假單胞菌是淡水魚的重要腐敗菌之一,Zhuang Shuai等[9]在草魚魚片中分離出惡臭假單胞菌,發(fā)現(xiàn)該菌有較強(qiáng)的吸收和代謝游離氨基酸能力,能夠促進(jìn)草魚的腐敗。嚴(yán)羽萍等[10]在養(yǎng)殖的海產(chǎn)魚冷藏過程中也分離到了熒光假單胞菌,其在大黃魚和大菱鲆中發(fā)現(xiàn)5 株具有較高蛋白酶活性和產(chǎn)嗜鐵素活性的熒光假單胞菌。另外,研究表明從雜交石斑魚中分離出的假單胞菌中,64.85%為產(chǎn)氮假單胞菌,其對(duì)冷藏石斑魚的氣味和風(fēng)味產(chǎn)生較大的不良影響[11]。Jeyasekaran等[12]發(fā)現(xiàn)假單胞菌不僅是養(yǎng)殖魚類的優(yōu)勢(shì)腐敗菌,而且在冷藏蝦產(chǎn)品中也優(yōu)勢(shì)生長(zhǎng)。

        1.3 污染乳及乳制品

        耐冷假單胞菌在冷藏乳及其制品的微生物污染和品質(zhì)劣變中占據(jù)主導(dǎo)作用,也是引起巴氏殺菌乳變質(zhì)的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌。研究表明,大多數(shù)熒光假單胞菌具有胞外蛋白酶、脂肪酶和卵磷脂酶活性,是加工乳制品中的主要腐敗菌[13]。Zarei等[14]在冷生乳中分離出假單胞菌復(fù)合菌群,包括熒光假單胞菌、莓實(shí)假單胞菌、蓋氏假單胞菌、維氏假單胞菌(P.veronii)等,該混合群體提高了生物被膜形成的能力,并能產(chǎn)多種蛋白酶以破壞奶制品穩(wěn)定性。研究發(fā)現(xiàn),乳制品中不同分離株間的蛋白水解酶活性差異較大,在山羊、水牛、駱駝和牦牛乳中分離出的假單胞菌群中,牦牛乳分離株的蛋白水解活性最高[15]。假單胞菌種屬間因其差異特性對(duì)牛奶品質(zhì)劣變產(chǎn)生不同的感官影響。從冷藏的原料乳中篩選出的熒光假單胞菌、莓實(shí)假單胞菌、惡臭假單胞菌等7 株假單胞菌表現(xiàn)出不同的蛋白水解和脂解活性,耐冷菌數(shù)量及蛋白水解酶和脂解酶的性質(zhì)影響牛奶色澤和風(fēng)味品質(zhì)[16]。此外,耐冷假單胞菌也會(huì)引起冷鮮奶酪的變質(zhì)并縮短其貨架期。

        1.4 污染果蔬

        果蔬產(chǎn)品營(yíng)養(yǎng)豐富、含水量高,經(jīng)過鮮切和即食加工后,因表皮等天然屏障被破壞、汁液外流等因素,易出現(xiàn)腐敗變質(zhì)的現(xiàn)象。假單胞菌是能夠引起果蔬腐敗的重要腐敗細(xì)菌之一。研究表明,在即食生菜中分離出的13 種腐敗細(xì)菌中,假單胞菌屬和泛細(xì)菌屬比例最高[17],進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)假單胞菌主要通過代謝產(chǎn)生亞硝酸鹽和消耗營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)等方式導(dǎo)致西蘭花的腐敗與變質(zhì)[18]。除能夠引起果蔬腐敗,假單胞菌還作為果蔬作物的致病菌受到關(guān)注,如菊苣假單胞菌(P.cichorii)是導(dǎo)致番茄壞死和生菜葉腐爛的關(guān)鍵致病菌[19]。

        部分食品中污染的假單胞菌和致腐特性如表1所示。

        表1 部分食品中污染的假單胞菌和致腐特性Table 1 Contamination of Pseudomonas in some foods and its spoilage characteristics

        2 假單胞菌生物被膜形成過程

        生物被膜是微生物生存的重要策略,也是假單胞菌的重要致腐因素。生物被膜的形成是一個(gè)動(dòng)態(tài)循環(huán)的過程,包括初期黏附、微菌落形成、生物被膜成熟和被膜散播4 個(gè)階段[3]。首先,浮游細(xì)菌黏附至實(shí)體表面進(jìn)行分裂繁殖,合成與分泌生物被膜基質(zhì),形成微菌落;隨后多個(gè)微菌落互相融合形成成熟的生物被膜,最后成熟的生物被膜釋放出浮游細(xì)菌來擴(kuò)展和播散。實(shí)際上,冷鏈環(huán)境中肉類表面腐敗過程中產(chǎn)生的黏液層就是生物被膜,當(dāng)黏液層被膜菌數(shù)量高達(dá)108CFU/cm2時(shí),肉就會(huì)形成不良的風(fēng)味,縮短貨架期[4]。前期研究已發(fā)現(xiàn)熒光假單胞菌和隆德假單胞菌的肉源分離株在氣-液交接面處容易形成薄膜[23]。假單胞菌的生物被膜還表現(xiàn)出種間的易變性,肉和乳中33 株假單胞菌分離株在不銹鋼和塑料表面黏附的特性表現(xiàn)菌株依賴性,菌株間生物膜形成具有異質(zhì)性[22]。另外,環(huán)境因素也是菌體生存方式轉(zhuǎn)變的重要信號(hào)[18],如溫度、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、滲透壓、pH值等。研究表明,低溫環(huán)境能有效促進(jìn)熒光假單胞菌、莓實(shí)假單胞菌和隆德假單胞菌多株致腐菌的生物被膜形成胞外聚合物(extracellular polymeric substances,EPS)分泌[8,20,23]。加工器具接觸面性質(zhì)、食物基質(zhì)及加工應(yīng)激都會(huì)影響假單胞菌的生物膜形成,而被膜發(fā)育過程中假單胞菌也會(huì)與表面的多種微生物相互作用,形成更復(fù)雜的混合生物被膜,導(dǎo)致食品連續(xù)和交叉污染,對(duì)食品安全性造成威脅[4]。

        3 假單胞菌生物被膜胞外基質(zhì)的組成

        在成熟的生物被膜中,微生物只占其質(zhì)量的約10%,而生物被膜基質(zhì)占到90%以上[31]。生物被膜基質(zhì)是細(xì)胞外物質(zhì),由微生物自身產(chǎn)生并輸送至胞外,將細(xì)胞嵌入其中。生物被膜基質(zhì)由不同類型的EPS組成,包括多糖、蛋白質(zhì)、核酸和脂質(zhì)等物質(zhì)。這些成分能維持生物被膜穩(wěn)定性,介導(dǎo)細(xì)菌與固體表面的黏附,并形成穩(wěn)定的三維聚合物網(wǎng)絡(luò)[32]。EPS作為生物被膜三維結(jié)構(gòu)的支架,保證了微生物群落營(yíng)養(yǎng)代謝功能和毒力特性,并對(duì)抗菌劑、pH值、紫外線等外界環(huán)境刺激具有抵抗作用。

        3.1 胞外多糖

        胞外多糖是EPS的主要組成成分。根據(jù)化學(xué)組成不同,胞外多糖分為雜多糖和均多糖。大多數(shù)假單胞菌的胞外多糖是由中性和帶電糖殘基混合物組成的雜多糖,如假單胞菌的藻酸鹽。而假單胞菌的胞外多糖還包含少量的均多糖,即由一種糖分子縮合而成的多糖,如纖維素。研究表明,假單胞菌中與生物被膜形成直接相關(guān)的胞外多糖至少有3 種——藻酸鹽、Pel、Psl,在生物被膜形成過程中發(fā)揮著不同的作用[33]。藻酸鹽是由β-D-甘露糖醛酸和α-L-古洛糖醛酸2 種單體組成,參與生物被膜形成的初期黏附和微菌落形成,也在生物被膜成熟后維持生物被膜的穩(wěn)定性[34]。Pel是由葡萄糖組成的多聚物,由合酶依賴性多糖分泌途徑產(chǎn)生,主要作為生物被膜的結(jié)構(gòu)支架并發(fā)揮保護(hù)作用[35]。而Psl是由D-甘露糖、D-葡萄糖和L-鼠李糖組成的戊多糖,參與細(xì)菌對(duì)生物或非生物表面的黏附作用,是不依賴藻酸鹽的非黏液型菌株產(chǎn)生生物被膜所必需的多糖[36]。研究發(fā)現(xiàn),惡臭假單胞菌中胞外多糖A(putida exopolysaccharide A,Pea)、胞外多糖B(putida exopolysaccharide B,Peb)和纖維素是重要的EPS組成成分,尤其Pea是褶皺菌落形態(tài)和生物被膜形成所必需的[37]。因此,多種致腐假單胞菌生物被膜EPS中胞外多糖所占比例很高,胞外多糖合成受阻的細(xì)菌生物被膜形成受到顯著抑制,甚至無法形成。

        3.2 胞外蛋白質(zhì)

        生物被膜中存在多種細(xì)胞外酶,大部分細(xì)胞外酶參與生物聚合物的降解,如多糖、蛋白質(zhì)、核酸和脂質(zhì)等[38]。這些細(xì)胞外酶可將生物聚合物分解成低分子物質(zhì),被細(xì)菌吸收并用作能量來源。細(xì)胞外酶通過與多糖的相互作用存在于生物膜基質(zhì),銅綠假單胞菌中的胞外內(nèi)酯化脂肪酶LipA與藻酸鹽結(jié)合,從而保證了胞外酶位于細(xì)胞表面并防止酶的變性和水解[39]。同時(shí),EPS中存在大量非酶類蛋白,參與組成細(xì)菌生物被膜的支架。凝集素(lectin,Lec)是EPS中一種重要的結(jié)構(gòu)蛋白,由銅綠假單胞菌分泌合成的LecB對(duì)生物被膜起穩(wěn)定作用。假單胞菌EPS中普遍存在的蛋白質(zhì)成分還有Fap功能性淀粉樣蛋白,介導(dǎo)細(xì)菌在固體表面的黏附作用,并為成熟的生物被膜提供穩(wěn)定性。Wickramasinghe等[20]曾報(bào)道,相比于25 ℃,4 株肉源假單胞菌在10 ℃時(shí)分泌的胞外蛋白質(zhì)含量顯著增加。胞外蛋白與胞外多糖等EPS組分共同參與細(xì)菌生物被膜從初期黏附到三維結(jié)構(gòu)的形成。

        3.3 脫氧核糖核酸

        在假單胞菌等多種細(xì)菌產(chǎn)生的生物被膜中都檢測(cè)到了胞外脫氧核糖核酸(extracellular DNA,eDNA)。研究表明,eDNA作為細(xì)菌生物被膜的重要成分,能夠維持生物被膜穩(wěn)定性和細(xì)胞間連接[40]。銅綠假單胞菌的eDNA對(duì)于菌體生物被膜形成的初期黏附階段至關(guān)重要,eDNA降解后細(xì)菌會(huì)停止表面附著作用[41]。在惡臭假單胞菌形成的生物被膜中,eDNA在鉻的吸附和絡(luò)合過程中起關(guān)鍵作用[42]。在莓實(shí)假單胞菌和隆德假單胞菌的生物被膜中檢測(cè)到eDNA,其含量存在菌株差異性,且與培養(yǎng)溫度無相關(guān)性[40]。另外,研究表明eDNA還具有一定的抗菌活性,能通過螯合脂多糖和細(xì)菌外膜陽(yáng)離子引起細(xì)胞裂解[43]。研究發(fā)現(xiàn),EPS中多個(gè)組分能夠幫助假單胞菌抵抗消毒劑、抗生素和宿主免疫防御等外界不良因素的影響[44]。

        4 生物被膜形成的調(diào)控因子及通路

        微生物生物被膜發(fā)育和發(fā)展存在復(fù)雜的協(xié)調(diào)機(jī)制,包括非生物因素和生物因素,從而影響菌體從浮游態(tài)向被膜態(tài)生長(zhǎng)模式的轉(zhuǎn)變。在生物因素層面,已發(fā)現(xiàn)假單胞菌屬水平內(nèi)存在多種對(duì)生物被膜形成發(fā)揮重要調(diào)控作用的調(diào)控系統(tǒng)和調(diào)控因子。

        4.1 C-di-GMP調(diào)控通路

        環(huán)鳥苷二磷酸(cyclic di-guanylate monophosphate,c-di-GMP)是細(xì)菌胞內(nèi)普遍存在的第二信使,對(duì)革蘭氏陰性菌生物被膜的形成有重要的調(diào)控作用。C-di-GMP由含有GGD(/E)EF結(jié)構(gòu)域的雙鳥苷酸環(huán)化酶(diguanylate cyclases,DGCs)催化2分子三磷酸鳥苷(guanosine triphosphate,GTP)合成,并被含有EAL/HD-GYP結(jié)構(gòu)域的磷酸二酯酶(phosphodiesterases,PDEs)催化降解為5’-磷酸鳥苷酸-(3’,5’)-鳥苷(5’-phosphoguanylyl-(3’,5’)-guanosine,pGpG)或鳥苷酸(guanosine monophosphate,GMP)[45]。GGD(/E)EF和EAL結(jié)構(gòu)域可以同時(shí)存在于同一個(gè)蛋白質(zhì)中,通常僅有1 個(gè)結(jié)構(gòu)域具有催化活性,或者存在第3個(gè)活性結(jié)構(gòu)域破壞GGD(/E)EF和EAL結(jié)構(gòu)域[46]。C-di-GMP參與調(diào)控細(xì)菌中多種生理生化過程,如調(diào)節(jié)細(xì)胞周期、生物被膜的合成與降解、鞭毛運(yùn)動(dòng)和毒性等[47]。而c-di-GMP調(diào)控系統(tǒng)是一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),當(dāng)細(xì)菌胞內(nèi)處于高濃度的c-di-GMP時(shí),黏附素和胞外多糖等生物被膜基質(zhì)成分大量合成以促進(jìn)細(xì)菌生物被膜的形成;另一方面c-di-GMP可以抑制細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)性,也有利于細(xì)菌生物被膜的形成。近年來,已發(fā)現(xiàn)假單胞菌有多個(gè)c-di-GMP代謝酶參與生物被膜形成的調(diào)控[45]。

        銅綠假單胞菌生物被膜的形成依賴于DGCs合成c-di-GMP,其中最具代表性的是WspR。WspR是銅綠假單胞菌中Wsp趨化性調(diào)節(jié)系統(tǒng)的一部分。WspR的寡聚化增強(qiáng)了DGCs的活性,使胞內(nèi)c-di-GMP顯著升高,生物被膜形成量也顯著增加[48]。生物被膜形成的主調(diào)節(jié)因子FleQ和PelD是c-di-GMP的效應(yīng)蛋白,F(xiàn)leQ可以感知c-di-GMP水平增加,并與c-di-GMP結(jié)合,從而激活pel和psl操縱子的轉(zhuǎn)錄[49]。除調(diào)控Pel和Psl的表達(dá),c-di-GMP和FleQ還調(diào)控多個(gè)EPS相關(guān)基因的表達(dá),如cdrA編碼黏附素CdrA[50]。此外,F(xiàn)leQ可以抑制銅綠假單胞菌的鞭毛運(yùn)動(dòng),有利于細(xì)菌生物被膜的形成。

        惡臭假單胞菌和熒光假單胞菌中LapA是重要的EPS成分,周質(zhì)蛋白酶LapG切割LapA的N端,使LapA脫離細(xì)胞外膜,導(dǎo)致細(xì)菌的黏附能力降低;而LapG的活性由具有GGDEF和EAL結(jié)構(gòu)域的內(nèi)膜蛋白LapD調(diào)節(jié)[51]。當(dāng)胞內(nèi)c-di-GMP水平降低時(shí),LapG從LapD中釋放出來,LapA進(jìn)而被LapG切割,破壞其生物被膜結(jié)構(gòu)的完整性[52]。

        4.2 群體感應(yīng)系統(tǒng)

        群體感應(yīng)(quorum sensing,QS)是發(fā)生在細(xì)菌種內(nèi)及種間的一種信息交流機(jī)制,細(xì)菌會(huì)釋放被稱為自誘導(dǎo)劑(autoinducer,AI)的小型可擴(kuò)散信號(hào)分子到外部環(huán)境中,而當(dāng)外界環(huán)境中積累的信號(hào)分子達(dá)到某一閾值水平時(shí),信號(hào)分子與受體結(jié)合,激活或抑制細(xì)菌胞內(nèi)多個(gè)靶基因的表達(dá),使細(xì)菌對(duì)環(huán)境刺激做出反應(yīng)[53]。大多數(shù)革蘭氏陰性細(xì)菌在QS系統(tǒng)中使用N-酰基-高絲氨酸內(nèi)酯(N-acylhomoserine lactone,AHL)作為信號(hào)分子。AHLs能夠調(diào)控假單胞菌等腐敗菌脂解、蛋白水解和幾丁質(zhì)分解酶活性等表型特征,導(dǎo)致多種食物的腐敗劣變[54]。

        假單胞菌中AHLs介導(dǎo)的I型信號(hào)系統(tǒng)有Lux、Las和Rhl信號(hào)系統(tǒng)。而這些信號(hào)系統(tǒng)主要由3 個(gè)基本部分組成:1)信號(hào)合成酶(I基因),負(fù)責(zé)AI信號(hào)分子的合成;2)AIs;3)受體分子(R基因),是編碼轉(zhuǎn)錄激活蛋白(R蛋白)所必需的。當(dāng)胞內(nèi)的AHLs濃度達(dá)到臨界閾值時(shí),AHLs與LuxR結(jié)合,啟動(dòng)下游基因的表達(dá)[55]。QS系統(tǒng)可以通過影響細(xì)菌的胞外多糖相關(guān)基因表達(dá)來調(diào)控生物被膜的形成,然而不同假單胞菌對(duì)生物被膜形成的QS調(diào)控有差異。惡臭假單胞菌生物被膜表面蛋白基因的轉(zhuǎn)錄譜分析表明,AHLs介導(dǎo)的QS系統(tǒng)由LuxIR型信號(hào)分子組成,并對(duì)其生物被膜產(chǎn)生負(fù)調(diào)控作用[56]。從冷藏淡水魚分離的嗜冷假單胞菌PSPF19中AHLs信號(hào)分子促進(jìn)了蛋白水解酶和脂肪分解酶的合成以及生物被膜形成,而添加QS抑制劑減弱了該菌生物被膜的形成和附著能力[57]。在魚源熒光假單胞菌PF07中也發(fā)現(xiàn)了LuxIR蛋白以及高含量的C4-HSL,敲除luxIR能顯著降低生物被膜的形成和蛋白酶等致腐因子的表達(dá)[58]。此外,部分假單胞菌能通過QS對(duì)外源AHLs作出反應(yīng),以調(diào)節(jié)其腐敗特征。Dai Jinyue等[59]發(fā)現(xiàn)添加外源C6-HSL提高了韓國(guó)假單胞菌PS1的脂肪酶和蛋白酶活性,加速腐敗豬肉中糖類、蛋白質(zhì)和脂肪分解。然而,并非所有假單胞菌都使用AHLs作為信號(hào)分子,從新鮮和變質(zhì)肉類中分離的72 株莓實(shí)假單胞菌中都未能檢測(cè)到AHL活性[60]。

        4.3 sRNAs

        近期研究發(fā)現(xiàn),小RNA分子(sRNAs)在調(diào)節(jié)假單胞菌的生物被膜形成中發(fā)揮了重要作用。銅綠假單胞菌的retS基因缺失會(huì)導(dǎo)致生物被膜形成量顯著增加,RetS作為銅綠假單胞菌的傳感器激酶,在急性與慢性感染所需毒力因子的相互調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用,并與另外兩種傳感器激酶GacS和LadS協(xié)同作用,共同組成一個(gè)調(diào)節(jié)系統(tǒng)[61]。GacS可以磷酸化GacA,這種活性被RetS拮抗和LadS刺激;磷酸化的GacA能夠促進(jìn)rsmZ和rsmY的轉(zhuǎn)錄[62]。rsm編碼2 個(gè)小RNA分子——RsmY和RsmZ,其表達(dá)水平與細(xì)菌在浮游狀態(tài)和生物被膜狀態(tài)間的轉(zhuǎn)換密切相關(guān)[63]。另一方面,RsmA對(duì)生物被膜形成相關(guān)的Psl和QS基因產(chǎn)生負(fù)調(diào)控,而RsmZ和RsmY可以降低RsmA的活性[64]。同樣地,在惡臭假單胞菌和熒光假單胞菌中也發(fā)現(xiàn)GacA/S系統(tǒng)影響生物被膜形成,其通過正向調(diào)節(jié)LuxI型AHL合酶,與AHLs介導(dǎo)的QS相關(guān)聯(lián)[65-66]。

        4.4 其他調(diào)控因子

        假單胞菌生物被膜的形成除了受到c-di-GMP、QS系統(tǒng)和sRNAs調(diào)節(jié)外,在不同的假單胞菌中還存在其他多種調(diào)控因子。如銅綠假單胞菌存在喹諾酮信號(hào)(Pseudomonasquinolone signal,PQS)系統(tǒng),由3,4-二羥基-2-庚基-喹諾酮和2-庚基-4喹諾酮2 種信號(hào)分子組成,參與毒力因子的表達(dá)、生物被膜形成以及運(yùn)動(dòng)等生理過程[67]。此外,脂肪酸介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)可能在銅綠假單胞菌生物被膜的擴(kuò)散期發(fā)揮作用[68]。在熒光假單胞菌中,SadB是獨(dú)立于以上幾個(gè)調(diào)控系統(tǒng)的蛋白,它通過影響調(diào)控因子AlgU、AmrZ和FleQ對(duì)熒光假單胞菌生物被膜形成和運(yùn)動(dòng)性發(fā)揮調(diào)控作用[69]。另有研究發(fā)現(xiàn),sigma因子對(duì)于轉(zhuǎn)錄控制不同功能的基因表達(dá)必不可少,在銅綠假單胞菌中sigma因子RpoS是psl表達(dá)的正轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子。

        假單胞菌生物被膜形成的調(diào)控機(jī)制如圖1所示。

        圖1 假單胞菌生物被膜形成的調(diào)控機(jī)制示意圖[70]Fig.1 Schematic diagram of the regulatory mechanism of biofilm formation in Pseudomonas[70]

        5 結(jié) 語(yǔ)

        微生物是導(dǎo)致生鮮食品腐敗變質(zhì)的重要因素,其中假單胞菌起主導(dǎo)作用。莓實(shí)假單胞菌、惡臭假單胞菌、熒光假單胞菌、銅綠假單胞菌等多種致腐假單胞菌表現(xiàn)出很強(qiáng)的代謝分解底物能力,能夠引起肉與肉制品、乳與乳制品、水產(chǎn)品及果蔬等生鮮食品的品質(zhì)劣變和腐敗,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。生物被膜形成是假單胞菌的重要致腐特性之一,能增強(qiáng)細(xì)菌對(duì)外界環(huán)境脅迫、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)匱乏和加工殺菌等惡劣條件的適應(yīng)性。盡管研究人員已開發(fā)了控制生物被膜形成和清除生物被膜的多種物理、化學(xué)和生物技術(shù),然而假單胞菌生物被膜調(diào)控系統(tǒng)的存在,會(huì)合成新的保護(hù)性EPS屏障,導(dǎo)致細(xì)菌生物被膜再次形成,加大了有效控制食品生產(chǎn)、加工、運(yùn)輸環(huán)境中持續(xù)性污染的難度。

        微生物生物被膜的形成機(jī)制復(fù)雜,目前已發(fā)現(xiàn)假單胞菌生物被膜的調(diào)控系統(tǒng)包括c-di-GMP、QS、sRNAs調(diào)控因子。隨著基因組、轉(zhuǎn)錄組、微生物組等多組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,未來將更深入地探究生物被膜形成的調(diào)控機(jī)制,這有助于阻斷生物被膜的形成以及闡明細(xì)菌被膜的耐脅迫和耐藥性機(jī)理,并為靶向控制生物被膜的新技術(shù)研發(fā)提供理論基礎(chǔ),從而有效降低由細(xì)菌生物被膜帶來的污染和安全風(fēng)險(xiǎn)。

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